Co-infecção HIV e vírus da hepatite B: prevalência e fatores de risco

Este trabalho objetiva estimar a prevalência da infecção pelo vírus da hepatite B e analisar possíveis fatores de risco em 401 pacientes infectados pelo vírus da imunodeficiência humana, atendidos no Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, Universidade de São Paulo. Os participantes responderam a um questionário que visava levantar variáveis gerais e fatores de risco para hepatite B. Os resultados dos exames sorológicos para os marcadores HBsAg, anti-HBcAg total, anti-HBsAg e anti-HCV foram obtidos dos prontuários dos pacientes. A prevalência global dos marcadores para o HBV foi 40,9%, com valores de 8,5% para o HBsAg, 39,7% para o anti-HBcAg total e de 5,5% para o anti-HBsAg. As variáveis que mostraram associação com a infecção pelo HBV foram: idade, nível superior de escolaridade, antecedente de icterícia, tempo passado como presidiário, existência de parceiro homossexual e positividade para o anti-HCV. A co-infecção HBV/HCV esteve presente em 20,4% dos participantes deste estudo.

Evidência do cão como reservatório da leptospirose humana: isolamento de um sorovar, caracterização molecular e utilização em inquérito sorológico

A leptospirose canina é conhecida como enfermidade de Stuttgard desde 1898, sendo os cães, depois dos roedores, considerados como a segunda principal fonte de infecção para o homem. O isolamento de um sorovar patogênico da urina de um cão, laboratorial e clinicamente identificado como tendo leptospirose, e sua utilização para testar amostras de soro de casos de leptospirose humana e canina, evidenciou a sua importância no ecossistema da região sul do Brasil. Os resultados do teste de soroaglutinação microscópica indicaram que 100% das amostras de soro humano de 12 pacientes do banco de soro de 2001 do Centro de Controle de Zoonoses, que haviam reagido com títulos que variaram de 25 a 3.200 para o sorovar canicola, e 72% das amostras de 105 soros caninos do mesmo banco de soro, também reagiram contra o novo isolado. O título médio e mediana dos soros humanos testados com a bateria de antígenos recomendada pela OMS, foi respectivamente 630 e 100, ao passo que os testados com o isolado foi de 1.823 e 400. Nos soros caninos, os títulos foram respectivamente de 347 e 100 para a bateria e de 1.088 e 200 para o isolado.

The Evolution of Function in the Rab family of Small GTPases

Dissertation presented to obtain the PhD degree in Computational Biology.

Co-infecção humana pelo plasmódio e o vírus da hepatite B: aspectos clínicos, sorológicos e imunológicos

A Amazônia é conhecida pela elevada prevalência de infecção pelo vírus da hepatite B, contribui também com mais de 90% dos casos de malária do país. É proposto que a ocorrência de co-infecções seja importante e que na associação ocorram alterações na história natural dessas enfermidades. O estudo avalia 545 pacientes com malária, em Coari, AM: 333 (61,1%) pelo Plasmodium vivax, 193 (35,4%) pelo Plasmodium falciparum e 19 (3,5%) com infecção mista. A prevalência do AgHBs foi 4,2% e a do anti-HBc total 49,7%. Os pacientes sororreativos para o VHB, não apresentaram diferenças clínicas dos outros pacientes com malária, nem associação a sinais clássicos de comprometimento hepático. Apesar de não ter sido detectada associação estatisticamente significativa, os indivíduos AgHBs reativos apresentaram baixas parasitemias e índices de reatividade de anticorpos mais elevados, sugerindo a possibilidade da resposta imune em um indivíduo co-infectado ser diferenciada e favorecer variações em relação à parasitemia e produção de anticorpos.

Clinical and laboratory findings related to a favorable evolution of hantavirus pulmonary syndrome

The medical records of 27 patients with hantavirus pulmonary syndrome were analyzed according to the need for invasive mechanical ventilation in relation to the following data up on hospital admission: age, gender, fever, cough, dyspnea, systolic arterial blood pressure, heart rate, levels of hemoglobin, hematocrit, leukocytes, lymphocytes, platelets, creatinine and arterial blood gases. The volume infused during the first 24 hours after admission, the use of inotropic agents, the use of corticosteroids and the patient outcomes were also evaluated. A favorable outcome was related to systolic blood pressure³ 100mmHg, heart rate lower than 100 beats per minute, creatinine below 1.6mg/dl, arterial blood pH³ 7.35, bicarbonate higher than 15mEq/dl, oxygen saturation higher than 84.1%, lower rehydration volume in the first 24 hours of hospitalization and no use of inotropic agents. Absence of clinical and laboratory signs of circulatory shock up on admission was associated with a favorable outcome of the patients.

A Constructivist perspective on EU'S democracy promotion in Turkey

The European Union, as a regional actor and an example of stability and well-being, has embraced a set of principles it has stood for and which constitute its own identity. The diffusion of these values among third countries is one of the objectives of EU’s External Policy. Democracy can be found among the principles that are sought to be exported through comprehensive and complex strategies within different frameworks, such as neighbourhood relations, trade partnerships and the accession process. Focusing on the latter, candidates are object of an intensive process of Europeanisation that operates through different mechanisms like socialisation and conditionality. Turkey, on the other side, has decided to apply for full membership several decades ago and, ever since, it has been pressured to Europeanise, which includes improving its unstable democracy. This case, however, is different from all other previous enlargements; for its special socio-cultural and civilisational features, Turkey constitutes a more complex novelty for the European Union. Therefore, this thesis aims to study the influence of the European Union on the democratisation process of Turkey, focusing on the period ranging between 1999, the year the European Council recognised Turkey’s candidacy status, and 2009 that marks the 10-year period of that condition. It is the intention of this project to assess the impact of the European Union at that level through the study of the democratic evolution of the country and its co-relation with other variables related to the presence or pressure of the EU. As this is a challenging objective, it will require a deep reflection upon central concepts like democracy and democratic consolidation, and a diversified use of methodological techniques, such as statistical analysis and mathematical co-relations, historical analysis, literature review and in-depth interviews. This study will privilege a Constructivist approach, emphasising the social construction of reality and the role of the ideational aspects – identity, perceptions and the broader socio-cultural dimension – in Turkey-EU relations.

Evolution of Diplodocid Sauropod dinosaurs with emphasis on specimens from Howe Ranch, Wyoming (USA)

Diplodocidae are among the best known sauropod dinosaurs. Several species were described in the late 1800s or early 1900s. Since then, numerous additional specimens were recovered in the USA, Tanzania, Portugal, as well as possibly Spain, England, and Asia. To date, the clade includes about 12 to 15 different species, some of them with questionable taxonomic status (e.g. ‘Diplodocus’ hayi or Dyslocosaurus polyonychius). However, intrageneric relationships of the multi-species, iconic genera Apatosaurus and Diplodocus are still poorly known. The way to resolve this issue is a specimen-based phylogenetic analysis, which was done for Apatosaurus, but is here performed for the first time for the entire clade of Diplodocidae. New material from different localities and stratigraphic levels on the Howe Ranch (Shell,Wyoming, USA) sheds additional light on the evolution of Diplodocidae. Three new specimens are described herein, considerably increasing our knowledge of the anatomy of the group. The new specimens (SMA 0004, SMA 0011, and SMA 0087) represent two, to possibly three new diplodocid species. They preserve material from all parts of the skeleton, including two nearly complete skulls, as well as fairly complete manus and pedes, material which is generally rare in diplodocids. Thereby, they considerably increase anatomical overlap between the sometimes fragmentary holotype specimens of the earlier described diplodocid species, allowing for significant results in a specimenbased phylogenetic analysis. Furthermore, clavicles and interclavicles are identified, the latter for the first time in dinosaurs. Their presence seems restricted to early sauropods, flagellicaudatans, and early Macronaria, and might thus be a retained plesiomorphy, with the loss of these bones being synapomorphic for Titanosauriformes and possibly Rebbachisauridae. The new material allows to test previous hypotheses of diplodocid phylogeny. In order to do so, any type specimen previously proposed to belong to Diplodocidae was included in the study, as are relatively complete referred specimens, in order to increase the degree of overlapping material. For specimens subsequently suggested to be non-diplodocid sauropods, their hypothesized sister taxa were included as outgroups. The current phylogenetic analysis thus includes 76 operational taxonomic units, 45 of which belong to Diplodocidae. The specimens were scored for 477 morphological characters, representing one of the most extensive phylogenetic analyses done within sauropod dinosaurs. The resulting cladogram recovers the classical arrangement of diplodocid relationships. Basing on a newly developed numerical approach to reduce subjectivity in the decision of specific or generic separation, species that have historically been included into well-known genera like Apatosaurus or Diplodocus, were detected to be actually generically different. Thereby, the famous genus Brontosaurus is resuscitated, and evidence further suggests that also Elosaurus parvus (previously referred to Apatosaurus) or ‘Diplodocus’ hayi represent unique genera. The study increases our knowledge about individual variation, and helps to decide how to score multi-species genera. Such a specimen-based phylogenetic analysis thus proves a valuable tool to validate historic species in sauropods, and in paleontology as a whole.

Trypanocide treatment among adults with chronic Chagas disease living in Santa Fe city (Argentina), over a mean follow-up of 21 years: parasitological, serological and clinical evolution

The efficacy of treatment with nifurtimox and/or benznidazole among adults with chronic Chagas disease with no previous electrocardiographic disturbances was evaluated over a mean follow-up of 21 years, by means of conventional serology, xenodiagnosis, clinical examination, electrocardiograms and chest X-ray. One hundred and eleven patients, between 17 and 46 years old, were studied: 54 underwent treatment (nifurtimox 27, benznidazole 27) and 57 remained untreated (control group). Xenodiagnosis was performed on 65% of them: 36/38 of the treated and 9/34 of the untreated patients had previous positive xenodiagnosis. Post-treatment, 133 xenodiagnoses were performed on 41 patients, all resulting negative. In the control group, 29 xenodiagnoses were performed on 14 patients; 2 resulted positive. Sera stored during the follow-up were simultaneously analyzed through conventional serology tests (IHA; DA-2ME; IIF). The serological evolution in the treated group was: a) 37% underwent negative seroconversion (nifurtimox 11, benznidazole 9); b) 27.8% decreased titers (nifurtimox 9, benznidazole 6), 9 showed inconclusive final serology (nifurtimox 7, benznidazole 2); c) 35.2% remained positive with constant titers (nifurtimox 7; benznidazole 12). The control group conserved the initial antibody levels during the follow-up. In the clinical evolution, 2/54 (3.7%) of the treated and 9/57 (15.8%) of the untreated patients showed electrocardiographic disturbances attributable to Chagas myocardiopathy, with a statistically relevant difference (p<0.05). Treatment caused deparasitation in at least 37% of the chronically infected adults and a protective effect on their clinical evolution.

Prevalência da co-infecção HIV-sífilis em um hospital universitário da cidade do Rio de Janeiro no ano de 2005

Estudo de prevalência da co-infecção HIV-sífilis realizado com 830 pacientes em acompanhamento ambulatorial para HIV/aids entre janeiro e maio de 2005 no Hospital na cidade do Rio de Janeiro. Os participantes realizaram exames de VDRL (veneral disease research laboratory), contagens de células CD4+/CD8+ e de carga viral e responderam perguntas sobre características sócio-demográficas e história prévia de sífilis. A prevalência da sífilis foi de 2,7% (22), a relação entre homens e mulheres co-infectados foi de 4:1, aproximadamente. Homossexuais masculinos foram os mais acometidos e não encontramos associação entre co-infecção e idade, escolaridade e parâmetros laboratoriais testados. Do total de casos com sífilis, 73% (16) relataram tratamento prévio; destes, 14 (88%) pacientes foram re-infectados, enquanto 2 (12%) pacientes realizaram tratamento inapropriado. A presença de co-infecção HIV-sífilis em pacientes em acompanhamento rotineiro alerta-nos para necessidade de aconselhá-los a adotar práticas sexuais seguras durante os seus atendimentos ambulatoriais.

O utilizador como co-criador de serviços e conteúdos

A temática proposta apresenta uma análise ao comportamento do utilizador enquanto cocriador de serviços e conteúdos de informação. Para tal, foi realizado um estudo à comunidade do Instituto de Estudos Superiores Militares e ao seu Repositório, alojado no Repositório Comum e agregado na plataforma dos repositórios científicos nacionais – o Repositório Científico em Acesso Aberto de Portugal (RCAAP). Assim, foi possível verificar a fraca adesão por parte da comunidade do instituto ao sistema de informação, implementado com a finalidade de preservar e disponibilizar em acesso aberto a produção científica daquela instituição. Deste modo, é exposto o desenvolvimento da investigação sobre o comportamento dos utilizadores, que teve por base o levantamento de dados estatísticos do repositório e os resultados das respostas às entrevistas a uma amostra da comunidade académica do IESM. Para contextualização teórica são abordados aspetos relativos ao atual contexto de transição influenciado pelo movimento Open Access e a dinâmicas que se estabelecem evidenciando alguns dos stakeholders que fazem parte integrante do contexto. O aprofundamento das teorias referidas, em consonância com o contexto académico onde o repositório se insere, permitiu a elaboração de um plano de marketing e um conjunto de recomendações que visam a publicitação do repositório e a sensibilização da comunidade, tanto para o seu importante papel como cocriadores de conteúdos, bem como, para a relevância destes sistemas de informação na disseminação do conhecimento científico de qualidade produzido no IESM.

Evolução fatal da co-infecção doença de Chagas/Aids: dificuldades diagnósticas entre a reagudização da miocardite e a miocardiopatia chagásica crônica

A doença de Chagas é uma parasitose causada pelo protozoário Trypanosoma cruzi, transmitido por insetos triatomíneos. A doença ocorre desde o sul dos Estados Unidos da América do Norte até a Argentina, sendo que, aproximadamente, 14 milhões de pessoas devam estar infectados na América Latina, predominantemente na forma crônica da doença. A reagudização da doença de Chagas pode ocorrer em imunossuprimidos, como tem sido observado em pacientes com aids. Verificou-se descompensação cardíaca em um destes casos, com grave disfunção ventricular e arritmias sendo considerada a possibilidade de reagudização da doença de Chagas no miocárdio, uma vez que o xenodiagnóstico foi positivo. Face a gravidade foi tratado especificamente para o Trypanosoma cruzi com benznidazol, porém sem completar o tempo estipulado para este fim, vindo a falecer em conseqüência de complicações da cardiopatia. A necropsia apresentou os estigmas habituais da cardiopatia chagásica crônica como miocardite fibrosante e redução do número de neurônios no tubo digestório, não sendo encontradas formas amastigotas do Trypanosoma cruzi em nenhum dos tecidos examinados. Assim, não ficou demonstrada a reagudização da doença de Chagas, mas sim evolução natural da cardiopatia chagásica crônica.

Morphological diversification through the evolution of developmental hierarchies

Changes in development impact the final form of organisms and compose the natural variation that is the raw material for evolution. Development is hierarchically structured in progressive series of cell fate determination and differentiation. How does variation in different stages of development contribute to morphological diversification?