The use of diatom assemblages to determine paleotrophic changes in lakes

The purpose of this study was to develop a classifi cation scheme for l ake trophic status based on the relative abundance of l ake sediment diatom trophic indicator species. A total of 600 diatom frustules were counted from the surface sediments of e a ch of 30 lakes selected to repr e seni~ a continuum from u.lt ra-oligotrophic t,o fairly eutrophic but not hype r-' eutrophic conditions. Published autecological information was used to determine the trophic indicator status of each of the s pecies. A quotieht was derived by dividing the s um of all the e utrophic indicator species by the sum of all oligotrophic indicai.-:.or species. Oligo'- mesotrophic. mesotrophic and meso-eutrophic species were added to both the numerator and denomina tor. Five categories of diatom i.nferred trophic status were recognized : ultra-oligotrophic - 0'-0.2:3, oligotrophic::: 0.24-0 . 70, mesotrophic :: 0.'71 -0.99, meso-elxtrophic :: 1. 00-1. '78 and eutrophic:: 1.. 79-2. 43. But only three of these (oligotrophic:: 0-0.69, mesotrophic ::: 0 . 70'-1.69 j and eutrophic:: 1.70-2.50) proved usef ul. The present study of the relationship between diatom inferred trophic status and the literature-derived trophic status of SO lake s (which were purposely chosen to represent a broad spectrum of lakes in Canada) indicated that: 1) Based on diatom species (assemblages ) it is possible to segregate the lakes from which. th",)se diatoms were taken into three basic categories : o ligotrophic, mesotrophic and eutrophic lake types. ~~) It was not possible t,o separate meso-eutrophic and o l igo-mesotrophic lakes f rom mesotrophic l akes as the the degree of overlap betwee n the diat,om species in these lake types was extremely high. 3) Ha d mo r e ul tra-oligotroph,ic lakes been sampled it might have been possible to more a ccurately s eparate them f rom oligotrophic Jakes. 4 ) Had. more humic lakes been sampled in this s tudy I f eel it would have been possible to identify a unique diatom a ssemblage which would h a ve chara cterized t his lake type . Re gression analyses were performed using the aforementioned diatom inferred trophic index as a f unction of 1) log Sec chi transparency (r = - 0.70) 2) total phosphorus (r = 0. 77 ) and 3) chlorophyll-a (r = 0.74). Once e ach of these rel ationships had been established , it was possible to infer paleotrophic (downcore) changes in an oligotrophic lake (Barbara Lake) and in a eutrophic lake (Chemung Lake) . Barbara Llake was dominated by oligotrophic s pecies and remained oligotrophic throughout the 200-·year history r epresented by i t s 32 em long sediment core. Chemung Lake is currently dominated. by eutrophic species but went through a mesotrophic st,age which was associated with a rise in the water level of the lake followi n g dam construction in its watershed in the early 1.900 J ::;. This was followed by its reversion to it,s present day eutrophic stage (dominated by eutrophic species) possibly as a r esult of shallowing process which can be attributed to " silting' up" of the reservoir and the invasion of the l ake by Myriophyllum spjcatum (Eurasian milfoil) i n the 1970's . In addition, nutrient .:r':l.ch run"'offwhich resulted from increased human a.ctivities associated with cottage development along its shores has contribut ed to its eutrophication. There is some evidence that the rat,e o :f its prog ressive eutrophication has declined during the last decade. This was correlated with legislation enacted in the 60's and 70's in Ontario which was aimed at reducing nutrient loading from cottages.

Welland Canal Survey of Lands George Keefer Esquire

Survey map and description of George Keefer's land created by The Welland Canal Company. Included is a written description of the land along with a drawing of the land. Noteable features include; road, road allowance, line between Black and Keefer's land, township line, reservoir, bridges, lock no's. 32, 33, 34, 35, mill. Surveyor notes are seen in pencil on the map. Land is composed of sections of lot no.s 9 and 17 in Thorold. The land is a total of 28 acres, 2 roads, and 12 perches.

Welland Canal Survey of Lands Daniel Shriner 1834

Survey map and description of Daniel Shriner's land created by The Welland Canal Company. Included is a written description of the land along with a drawing of the land. Noteable features include; north and south branch of reservoir, line between Bouke and Shriner's land. Surveyor notes are seen in pencil on the map.

Welland Canal Survey of Lands Luke Carrol 1826

Survey map and description of Luke Carrol's land created by The Welland Canal Company. Included is a written description of the land along with a drawing of the land. Noteable features include; line between Carrol's and Bowman's land, Reservoir, line between Carrol and Vanevery's land. Surveyor notes are seen in pencil on the map.

Welland Canal Survey of Lands Jacob Bowman 1826

Survey map and description of Jacob Bowman's land created by The Welland Canal Company. Included is a written description of the land along with a drawing of the land. Noteable features include; spring, Queenston Road, division of lots, Reservoir. Surveyor notes are seen in pencil on the map.

Welland Canal Survey of Lands George Marlatt 1826, 1831

Two survey maps and descriptions of George Marlatt's land created by The Welland Canal Company. The first is from 1826, as described in the deed of November 21, 1826. The second survey was done on August 29, 1831 by George Keefer. Included is a written description of the land along with a drawing of the land. Noteable features for the first survey (p.85) include; line between Kelly and Marlatt's land, lot division. Noteable features for the second survey (p.87) include; road to Beaverdams, reservoir, bridges, road allowance, lot divisions, line between Kelly and Marlatt's land. Surveyor notes are seen in pencil on the map.See also Page 90-91

Welland Canal Survey of Lands Philip Carrol, 1830, 1846, n.d.

Survey map and description of Philip Carrol's land created by The Welland Canal Company. Included are three written descriptions of the lands along the Northern Reservoir, Southern Reservoir as well as the Canal and Reservoir with a drawing of the aforementioned lands. Noteable features for the Northern Reservoir include; line between Philip Carrol's land and Widow McAlpine's land. The land contains 9 acres, 2 roads and 24 perches of wood land. The survey is dated 1830. Noteable features for the Southern Reservoir include; Road to shorthills, side line North, and Watson's land. This survey is not dated. Noteable features for the Canal and Reservoir include; West line of lot, lot.213. The land contains 9 acres and 5 perches. The surveyor's updates for this survey are dated 1846. Surveyor notes are seen in pencil on the map.See also Pp 109-113

Welland Canal Survey of Lands Jonathan Silverthorn, 1834

Survey map and description of Jonathan Silverthorn's land created by The Welland Canal Company. Included is a written description of the land along with a drawing of the land. The lands surveyed include lots 229 and 230. The land was first surveyed in 1830, then again in 1834, by George Keefer. The original survey only included the feeder and resevoir and wood land, whereas the second survey shows all lands owned by Silverthorn. The land totals 19.2 acres, 2 roads and 32 perches. The land is broken down as follows; 7.6 acres cleared land, canal and towpath, 6.6 acres reservoir - Michael Silverthorn, 5 acres woodland. Surveyor notes are seen in pencil and red pen on the map.See also page 138.

Welland Canal Survey of Lands John Hellems, 1835

Survey map and description of John Hellem's land created by The Welland Canal Company. Included is a written description of the land along with a drawing of the land. Noteable features include; W. Crooks land, concession lines, basin, bridges, guard lock, reservoir, tow path, Lyons Creek. The survey was done on three seperate ocassions by George and Samuel Keefer for Hellems lot #26 in Crowland township. Surveyor notes are seen in pencil and red pen on the map.

Welland Canal Survey of Lands Michael and Jacob Silverthorn, 1834

Survey map and description of Michael and Jacob Silverthorn's land created by The Welland Canal Company. Included is a written description of the land along with a drawing of the land. Noteable features include; line between Burger and Silverthorn's land, reservoir, wood land, road leading to Quaker settlement, line between Jacob and Michael Silverthorn's land. The deeds for both lands are dated September 25, 1834. Surveyor notes are seen in pencil on the map.

Welland Canal Survey of Lands Welland Canal Company Land in Thorold, 1834

Survey map of the lands of the Welland Canal Company in Thorold. Created by The Welland Canal Company. Noteable features include; Company's land, reservoir, channel of canal, bridge, Pine street, Mullen street, lot divisions. The plan is titled "Plan of Lands belonging to the Welland Canal Company being the West half of lot no. 29 and the East half of lot no.30 in the township of Thorold, adjoining Marlats Reservoir laid out in town lots, November 24th, 1834". Surveyor notes are seen in pencil on the map.

Welland Canal Survey of Lands Village of Allanburgh, 1833

Survey map and description of the Village of Allanburgh, created by The Welland Canal Company. Included is a drawing of the land. Noteable features include; lot divisions, Welland Canal, Niagara street, Holland road, lock 36 and 37, foundry, Canal street, mill, Canby street, Dover street, Rose street, Helen street, Water street, Falls street, Centre street, Welland street, Hall street, Clifton street, James street, Mary street, Catherine street, J.G. Stockley's land, reservoir, graveyard. Surveyor notes are seen in pencil on the map.

Chronic versus acute ingestion of sodium citrate: a randomized placebo controlled cross-over trial for swimming 200 metres in well-trained swimmers age 13-17

A double-blinded, placebo controlled, cross-over design was used to investigate sodium citrate dihydrate (Na-CIT) supplementation improve 200m swimming performance. Ten well-trained, male swimmers (14.9 ± 0.4y; 63.5 ± 4kg) performed four 200m time trials: acute (ACU) supplementation (0.5g/kg), acute placebo (PLC-A), chronic (CHR) (0.1g/kg for 3 days and 0.3g/kg on the 4th day pre-trial), and chronic placebo (PLC-C). Na-CIT was administered 120min pre-trial in solution with 500mL of flavored water; placebo was flavored water. Blood lactate, base excess (BE), bicarbonate, pH, and PCO2 were analyzed at basal, 100min post-ingestion, and 3min post-trial via finger prick. Time, lactate, and rate of perceived exertion were not different between trials. BE and bicarbonate were significantly higher for the ACU and CHR trials compared to placebo. “Responders” improved by 1.03% (P=0.043) and attained significantly higher post-trial lactate concentrations in the ACU versus PLC-A trials and compared to non-responders in the ACU and CHR trials.

Effet de l'initiation du traitement antirétroviral sur la diversité virale du VIH

L’épidémie du VIH-1 dure maintenant depuis plus de 25 ans. La grande diversité génétique de ce virus est un obstacle majeur en vue de l’éradication de cette pandémie. Au cours des années, le VIH-1 a évolué en plus de cinquante sous-types ou formes recombinantes. Cette diversité génétique est influencée par diverses pressions de sélection, incluant les pressions du système immunitaire de l’hôte et les agents antirétroviraux (ARV). En effet, bien que les ARV aient considérablement réduit les taux de morbidité et de mortalité, en plus d’améliorer la qualité et l’espérance de vie des personnes atteintes du VIH-1, ces traitements sont complexes, dispendieux et amènent leur lot de toxicité pouvant mener à des concentrations plasmatiques sous-optimales pour contrôler la réplication virale. Ceci va permettre l’émergence de variantes virales portant des mutations de résistance aux ARV. Ce phénomène est encore plus complexe lorsque l’on prend en considération l’immense diversité génétique des différents sous-types. De plus, le virus du VIH est capable de persister sous forme latente dans diverses populations cellulaires, rendant ainsi son éradication extrêmement difficile. Des stratégies pouvant restreindre la diversité virale ont donc été préconisées dans le but de favoriser les réponses immunes de l’hôte pour le contrôle de l’infection et d’identifier des variantes virales offrant une meilleure cible pour des stratégies vaccinales ou immunothérapeutiques. Dans cet esprit, nous avons donc étudié, chez des sujets infectés récemment par le VIH-1, l’effet du traitement ARV précoce sur la diversité virale de la région C2V5 du gène enveloppe ainsi que sur la taille des réservoirs. En deuxième lieu, nous avons caractérisé la pression de sélection des ARV sur des souches virales de sous types variés non-B, chez des patients du Mali et du Burkina Faso afin d’évaluer les voies d’échappement viral dans un fond génétique différent du sous-type B largement prévalent en Amérique du Nord. Notre étude a démontré la présence d’une population virale très homogène et peu diversifiée dans les premières semaines suivant l’infection, qui évolue pour atteindre une diversification de +0,23% à la fin de la première année. Cette diversification est plus importante chez les sujets n’ayant pas initié de traitement. De plus, ceci s’accompagne d’un plus grand nombre de particules virales infectieuses dans les réservoirs viraux des cellules mononucléées du sang périphérique (PBMC) chez ces sujets. Ces résultats suggèrent que l’initiation précoce du traitement pourrait avoir un effet bénéfique en retardant l’évolution virale ainsi que la taille des réservoirs, ce qui pourrait supporter une réponse immune mieux ciblée et potentiellement des stratégies immunothérapeutiques permettant d’éradiquer le virus. Nous avons également suivi 801 sujets infectés par des sous-types non-B sur le point de débuter un traitement antirétroviral. Bien que la majorité des sujets ait été à un stade avancé de la maladie, plus de 75% des individus ont obtenu une charge virale indétectable après 6 mois d’ARV, témoignant de l’efficacité comparable des ARV sur les sous-types non-B et B. Toutefois, contrairement aux virus de sous-type B, nous avons observé différentes voies moléculaires de résistance chez les sous type non-B, particulièrement chez les sous-types AGK/AK/K pour lesquels les voies de résistances étaient associées de façon prédominante aux TAM2. De plus, bien que la divergence entre les virus retrouvés chez les patients d’une même région soit faible, nos analyses phylogénétiques ont permis de conclure que ces mutations de résistance se sont produites de novo et non à partir d’un ancêtre commun porteur de résistance. Cependant, notre dernière étude au Mali nous a permis d’évaluer la résistance primaire à près de 10% et des études phylogénétiques seront effectuées afin d’évaluer la circulation de ces souches résistantes dans la population. Ces études suggèrent qu’un contrôle de la réplication virale par les ARV peut freiner la diversité du VIH et ainsi ouvrir la voie à un contrôle immunologique ciblé, utilisant de nouvelles stratégies vaccinales ou immunothérapeutiques. Toutefois, une thérapie antirétrovirale sous-optimale (adhérence, toxicité) peut conduire à l’échappement virologique en favorisant l’émergence et la dissémination de souches résistantes.

Caractérisation phénotypique et génotypique d’isolats de Salmonella Typhimurium provenant de porcs sains ou septicémiques

Les infections à Salmonella Typhimurium constituent un problème de taille pour l’industrie porcine et la santé publique car cet animal est un réservoir pour les infections chez l’homme. De plus, on observe, chez des souches appartenant au lysotype (LT) 104, des résistances multiples aux antimicrobiens associées à des septicémies chez les porcs en engraissement, ce qui peut contribuer à la contamination des carcasses. Il faut donc contrôler l’infection au niveau du troupeau. Pour ce faire, il importe donc de mieux caractériser ces souches, comprendre la pathogénie de l’infection et identifier des facteurs de virulence. L’objectif principal de cette étude était de caractériser des isolats de S. Typhimurium provenant de porcs septicémiques et de les comparer avec ceux de porcs sains. Une banque d’isolats provenant de porcs septicémiques (ASC) et de porcs sains à l’abattoir (SSC) était constituée. Le lysotype des isolats a été identifié et ceux-ci ont été caractérisés selon le profil de résistance aux antimicrobiens, le SDS-PAGE et l’immunobuvardage et le PFGE. Chez les isolats ASC, LT 104 représentait 36.4% des isolats et chez les isolats SSC la proportion était de 51.5%. Les isolats pouvaient être résistants jusqu’à douze antimicrobiens, peu importe leur origine. Il n’a toutefois pas été possible d’associer une protéine spécifique au groupe d’isolats ASC. Parmi les souches LT 104, plusieurs groupes génétiques ont été identifiés. Les différentes étapes de la pathogénie de Salmonella ont ensuite été évaluées, dont l’adhésion et l’invasion des isolats des deux banques sur des cellules intestinales humaines. Nos résultats ont démontré que les isolats ASC avaient un pouvoir accru d’invasion comparés aux isolats SSC (P=0.003). Pour un sous-groupe d’isolats sélectionnés selon leur taux d’invasion, des tests de phagocytose, d’apoptose et d’adhésion au mucus intestinal ont été effectués en utilisant la cytométrie en flux. La survie des bactéries après la phagocytose a aussi été évaluée et la méthode MATS a été utilisée pour évaluer l'adhésion aux solvants. Les pourcentages de phagocytose chez les isolats SSC par les monocytes porcins étaient plus élevés que chez les isolats ASC à 15 minutes (P=0.02). Nous n’avons trouvé aucune différence significative pour les autres méthodes utilisées. Nous avons ensuite comparé le génome d’un isolat ASC (#36) à celui d’un isolat SSC (#1) par le SSH pour identifier des facteurs de virulence potentiels. Des clones correspondant à des gènes retrouvés sur le chromosome ainsi que sur des plasmides ont été identifiés. Ces résultats nous ont dirigés vers l’analyse des profils plasmidiques de tous les isolats. Les différents profils étaient retrouvés autant chez les isolats ASC que chez les isolats SSC. Deux profils (PL14 et PL20) étaient observés plus fréquemment chez les isolats LT 104 que chez les isolats d’autres lysotypes (P=0.01 et P=0.01, respectivement). Le séquençage d’un des plasmides de l’isolat ASC, démontrait la présence d’informations génétiques codant pour la réplication et une bêta-galactosidase-α. Il serait intéressant de préciser le rôle exact de ces gènes dans l’infection. Nos travaux suggèrent que les isolats de S. Typhimurium provenant de porcs septicémiques se distinguent par un pouvoir d’invasion accru ainsi que par des taux de phagocytose plus faibles dans les phases initiales de l’infection. Cette étude aura donc permis d’accroître les connaissances sur la pathogénie des infections à S. Typhimurium chez le porc.