Aphanomycosis of crayfish: crayfish plague

This is the Aphanomycosis of crayfish: crayfish plague report produced by the Environment Agency in 2000. Crayfish plague is an extremely virulent fungal disease of European crayfish species, the white clawed or stone crayfish of Western Europe Austropotamobius pallipes, the Noble crayfish of northern Europe Astacus astacus and the narrow clawed crayfish of Eastern Europe, Astacus leptodactylus. The white claw crayfish A. pallipes is the indigenous native crayfish of the British Isles. Until the early 1980s there were extensive healthy populations of this crayfish in almost all suitable alkaline river and lake environments in England and Wales as far north as Northumberland. The conservation importance of this native crayfish is widely recognised. This report provides a general review of the literature of crayfish plague, including an overview of its spread through the British Isles from CEFAS records. Information on current diagnostic methods from the Office International des Epizooties (OIE) Aquatic Disease Manual is provided. Information on the taxonomy, morphology and physiology of the pathogen is reviewed, together with the pathogenicity and pathology of the disease and current means of prevention and control.

Uso da calibração multivariada para a predição de propriedades físico-químicas de misturas de óleo de soja e biodiesel

O objetivo deste trabalho foi estabelecer um modelo empregando-se ferramentas de regressão multivariada para a previsão do teor em ésteres metílicos e, simultaneamente, de propriedades físico-químicas de misturas de óleo de soja e biodiesel de soja. O modelo foi proposto a partir da correlação das propriedades de interesse com os espectros de reflectância total atenuada no infravermelho médio das misturas. Para a determinação dos teores de ésteres metílicos foi utilizada a cromatografia líquida de alta eficiência (HPLC), podendo esta ser uma técnica alternativa aos método de referência que utilizam a cromatografia em fase gasosa (EN 14103 e EN 14105). As propriedades físico-químicas selecionadas foram índice de refração, massa específica e viscosidade. Para o estudo, foram preparadas 11 misturas com diferentes proporções de biodiesel de soja e de óleo de soja (0-100 % em massa de biodiesel de soja), em quintuplicata, totalizando 55 amostras. A região do infravermelho estudada foi a faixa de 3801 a 650 cm-1. Os espectros foram submetidos aos pré-tratamentos de correção de sinal multiplicativo (MSC) e, em seguida, à centralização na média (MC). As propriedades de interesse foram submetidas ao autoescalamento. Em seguida foi aplicada análise de componentes principais (PCA) com a finalidade de reduzir a dimensionalidade dos dados e detectar a presença de valores anômalos. Quando estes foram detectados, a amostra era descartada. Os dados originais foram submetidos ao algoritmo de Kennard-Stone dividindo-os em um conjunto de calibração, para a construção do modelo, e um conjunto de validação, para verificar a sua confiabilidade. Os resultados mostraram que o modelo proposto por PLS2 (Mínimos Quadrados Parciais) foi capaz de se ajustar bem os dados de índice de refração e de massa específica, podendo ser observado um comportamento aleatório dos erros, indicando a presença de homocedasticidade nos valores residuais, em outras palavras, o modelo construído apresentou uma capacidade de previsão para as propriedades de massa específica e índice de refração com 95% de confiança. A exatidão do modelo foi também avaliada através da estimativa dos parâmetros de regressão que são a inclinação e o intercepto pela Região Conjunta da Elipse de Confiança (EJCR). Os resultados confirmaram que o modelo MIR-PLS desenvolvido foi capaz de prever, simultaneamente, as propriedades índice de refração e massa específica. Para os teores de éteres metílicos determinados por HPLC, foi também desenvolvido um modelo MIR-PLS para correlacionar estes valores com os espectros de MIR, porém a qualidade do ajuste não foi tão boa. Apesar disso, foi possível mostrar que os dados podem ser modelados e correlacionados com os espectros de infravermelho utilizando calibração multivariada

A nova Jericó maldita: um estudo sobre a Colônia de Iguá em Itaboraí/RJ (1935-1953)

O objetivo da pesquisa que resultou nesta dissertação consiste na análise sobre as origens do primeiro leprosário fluminense, a Colônia de Iguá, em Itaboraí, Estado do Rio de Janeiro. Busco privilegiar não só a análise desta "cidade em miniatura" tal como se pretendeu constituir um leprosário e sua estrutura mas também os impactos político-sociais ocorridos com sua fixação em um município que alimentou, durante a primeira metade do século XX, a ideia de que poderia recuperar a situação de pujança econômica e política que viveu entre os séculos XVIII e XIX, quando ocupou importante papel na economia fluminense e brasileira. Nesta análise focalizamos o movimento de resistência contra a instalação da Colônia neste município originada por aqueles que acreditavam que o leprosário iria prejudicar o reflorescimento da região, bem como as disputas políticas envolvidas em sua fixação na cidade. Também consideramos os relatos de ex-internos do antigo leprosário sobre a experiência do viver em uma colônia de atingidos pela lepra. Algumas de suas memórias foram incorporadas ao trabalho em nossa tentativa de relatar o cotidiano de um sistema que os segregou pela força do ato de internar compulsoriamente. Os marcos cronológicos da pesquisa se referem, respectivamente, ao ano de 1935, quando foi lançada a pedra fundamental para construção da Colônia de Iguá e que é também um período marcado pelo início do Plano Nacional de Combate à Lepra. Tal Plano representou uma aceleração na construção e modernização de instituições dessa natureza em todo país e marcou um momento de consolidação do internamento como profilaxia dos doentes. Como marco final, estabelecemos o ano de 1953 quando a Colônia Tavares de Macedo, como o Iguá ficou denominado a partir de 1942 recebe o novo sistema de abastecimento de água, evidenciando a aliança entre a instituição e o poder local na luta por melhorias do sistema de serviços públicos do município e, portanto, evidenciando a falsa questão de que a presença da Colônia iria prejudicar o município.

Efeito do extrato de Euterpe oleracea Mart.(Açaí) sobre a disfunção endotelial, estresse oxidativo e alterações vasculares e renais associados à hipertensão renovascular dois rins, 1 clip (2R,1C)

Estudos recentes mostram que o açaí é rico em polifenóis e uma dieta rica em polifenóis pode estar envolvida na proteção contra o risco cardiovascular. O objetivo deste estudo foi avaliar o efeito do tratamento crônico de animais hipertensos 2R,1C com extrato hidroalcoólico do caroço do açaí (ASE) sobre o desenvolvimento da hipertensão e disfunção endotelial; estresse oxidativo e sobre as alterações vasculares e renais. Ratos Wistar machos foram utilizados para obtenção da hipertensão renovascular 2R,1C e ratos controles 2R (sham) foram somente submetidos à laparotomia e receberam tratamento diário com veículo ou ASE (200 mg/Kg/dia) durante 40 dias. A pressão arterial sistólica (PAS) foi aferida por pletismografia de cauda e os efeitos vasodilatadores da acetilcolina (ACh) e nitroglicerina (NG) foram estudados em leito arterial mesentérico (LAM) perfundido e pré-contraído com norepinefrina. A atividade das enzimas SOD, CAT, GPx, os níveis de MDA, a carbonilação de proteínas e os níveis de nitrito foram avaliados por espectrofotometria. As expressões de enzimas pró e antioxidantes foram avaliadas por western blot. A atividade de MMP-2 foi avaliada por zimografia. Os níveis séricos de creatinina foram avaliados através de kit, por espectrofotometria. As alterações vasculares e renais foram avaliadas por microscopia de luz. A PAS foi maior nos animais 2R,1C, e o tratamento com ASE preveniu o desenvolvimento da hipertensão. O efeito vasodilatador reduzido da ACh em animais 2R,1C foi recuperado pelo ASE. O efeito vasodilatador da NG não foi diferente entre os grupos. O dano oxidativo avaliado pela peroxidação lipídica e carbonilação de proteínas foi maior nos animais 2R,1C, e reduzido pelo tratamento com ASE. As atividades da SOD, CAT e GPx foram menores em amostras de mesentério, plasma, rim e coração de animais 2R,1C e o tratamento com ASE aumentou estas atividades. A produção de NO foi menor no plasma, mesentério e rim dos animais 2R,1C, e o tratamento com ASE aumentou a produção de NO somente no rim e mesentério destes animais. A expressão de SOD-1, 2, eNOS e TIMP-1 foram menores nos animais 2R,1C e o tratamento com ASE aumentou a expressão destas enzimas. A expressão de NOX-4 e MMP-2 e a atividade de MMP-2 foram maiores nos animais 2R,1C e o tratamento com ASE reduziu a expressão destas enzimas e a atividade de MMP-2. Os animais 2R,1C apresentaram um aumento na espessura da camada média da aorta e artéria mesentérica e um aumento na relação média/lúmen da aorta, e estas alterações foram prevenidas pelo ASE. Os níveis séricos aumentados de creatinina nos animais 2R,1C foram reduzidos por ASE. As alterações morfológicas renais nos animais 2R,1C foram prevenidas pelo ASE. Portanto, o tratamento com ASE previne o desenvolvimento da hipertensão, melhora a disfunção endotelial e previne as alterações vasculares e renais em ratos 2R,1C. A redução da atividade antioxidante e o aumento na peroxidação lipídica e carbonilação de proteínas sugerem o envolvimento de um mecanismo deficiente da defesa antioxidante e de um dano oxidativo aumentado, os quais foram revertidos pelo ASE.

Análise numérica do efeito de sobrecargas assimétricas em estacas: estudo de pontes nas obras do Arco Metropolitano.

O presente trabalho aborda o efeito de sobrecargas assimétricas em estacas, através do estudo de caso de encontros da Ponte do Rio Capivari nas obras do Arco Metropolitano. Neste caso específico as estacas foram construídas previamente a execução de aterros em terra armada e para minimizar o efeito de Tschebotarioff o solo foi reforçado com colunas de brita. Com embasamento na revisão bibliográfica apresentada foi realizada a análise pelo Método dos Elementos Finitos. Esta análise, realizada pelo programa computacional Plaxis, teve como foco principal a obtenção dos deslocamentos e momentos fletores nas estacas para os dois casos analisados: sem colunas de brita e com solo homogêneo equivalente (com colunas de brita). Foi possível verificar a influência da introdução das colunas de brita na redução dos momentos fletores e deslocamentos horizontais nas estacas dos encontros. Realizou-se ainda uma simulação em que as estacas seriam construídas após a realização dos aterros em terra armada onde pode-se constatar que o efeito de sobrecargas assimétricas seria mitigado. Foi efetuada também a comparação entre os deslocamentos provenientes de dados coletados da instrumentação de campo (inclinômetros) e os obtidos pelas análises numéricas, estando os mesmos compatíveis entre si, demonstrando que a metodologia adotada para simulação das colunas de brita no Método dos Elementos finitos foi adequada.

A guide to the deep-water sponges of the Aleutian Island Archipelago

The first dedicated collections of deep-water (>80 m) sponges from the central Aleutian Islands revealed a rich fauna including 28 novel species and geographical range extensions for 53 others. Based on these collections and the published literature, we now confirm the presence of 125 species (or subspecies)of deep-water sponges in the Aleutian Islands. Clearly the deep-water sponge fauna of the Aleutian Islands is extraordinarily rich and largely understudied. Submersible observations revealed that sponges, rather than deep-water corals, are the dominant feature shaping benthic habitats in the region and that they provide important refuge habitat for many species of fish and invertebrates including juvenile rockfish (Sebastes spp.) and king crabs (Lithodes sp). Examination of video footage collected along 127 km of the seafloor further indicate that there are likely hundreds of species still uncollected from the region, and many unknown to science. Furthermore, sponges are extremely fragile and easily damaged by contact with fishing gear. High rates of fishery bycatch clearly indicate a strong interaction between existing fisheries and sponge habitat. Bycatch in fisheries and fisheries-independent surveys can be a major source of information on the location of the sponge fauna, but current monitoring programs are greatly hampered by the inability of deck personnel to identify bycatch. This guide contains detailed species descriptions for 112 sponges collected in Alaska, principally in the central Aleutian Islands. It addresses bycatch identification challenges by providing fisheries observers and scientists with the information necessary to adequately identify sponge fauna. Using that identification data, areas of high abundance can be mapped and the locations of indicator species of vulnerable marine ecosystems can be determined. The guide is also designed for use by scientists making observations of the fauna in situ with submersibles, including remotely operated vehicles and autonomous underwater vehicles.

Literature review for a resource characterization of Cape Romain National Wildlife Refuge

Through research aimed at understanding the coastal environment, surveys designed to help manage the resource, and national programs to monitor environmental condition, we see a picture of a dynamic ecosystem that is Cape Romain National Wildlife Refuge (CRNWR). Currently, there are efforts underway to protect threatened species; monitor fish populations; and quantify the biological, physical, and chemical characteristics of this environment. The potential impacts to this system are just now being understood as ecological responses to human modification are observed and explained. As a starting point, this document compiles existing information about Cape Romain NWR in five topic areas and addresses the potential impacts to the Refuge. This review is intended to serve as a stepping stone to developing a research agenda in support of management of the Refuge. There are various sources of information on which to build a framework for monitoring conditions and detecting change to this environment. For instance, information on basic ecological function in estuarine environments has evolved over several decades. Long-term surveys of Southeast fisheries exist, as well as shellfish and sediment contaminants data from estuaries. Environmental monitoring and biological surveys at the Refuge continue. Recently, studies that examine the impacts to similar coastal habitats have been undertaken. This document puts past studies and ongoing work in context for Refuge managers and researchers. This report recommends that the next phase of this resource characterization focus on: • compiling relevant tabular and spatial data, as identified here, into a Geographic Information System (GIS) framework • assessing the abundance and diversity of fisheries utilizing CRNWR • delineating additional data layers, such as intertidal habitats and subtidal clam beds, from low-level aerial photography, hard copy maps, and other sources • continued inventories of plant and animal species dependent on the Refuge • monitoring physical and chemical environmental parameters using the methodology employed at National Estuarine Research Reserve System (NERRS) and other coastal sites, where appropriate • further definition of the potential risks to the Refuge and preparing responses to likely impacts.

Developing alternative shoreline armoring strategies: the living shoreline approach in North Carolina

This paper reviews the scientific data on the ecosystem services provided by shoreline habitats, the evidence for adverse impacts from bulkheading on those habitats and services, and describes alternative approaches to shoreline stabilization, which minimize adverse impacts to the shoreline ecosystem. Alternative shoreline stabilization structures that incorporate natural habitats, also known as living shorelines, have been popularized by environmental groups and state regulatory agencies in the mid-Atlantic. Recent data on living shoreline projects in North Carolina that include a stone sill demonstrate that the sills increase sedimentation rates, that after 3 years marshes behind the sills have slightly reduced biomass, and that the living shoreline projects exhibit similar rates of fishery utilization as nearby natural fringing marshes. Although the current emphasis on shoreline armoring in Puget Sound is on steeper, higher-energy shorelines, armoring of lower-energy shorelines may become an issue in the future with expansion of residential development and projected rates of sea level rise. The implementation of regulatory policy on estuarine shoreline stabilization in North Carolina and elsewhere is presented. The regulatory and public education issues experienced in North Carolina, which have made changes in estuarine shoreline stabilization policy difficult, may inform efforts to adopt a sustainable shoreline armoring strategy in Puget Sound. A necessary foundation for regulatory change in shoreline armoring policy, and public support for that change, is rigorous scientific assessment of the variety of services that natural shoreline habitats provide both to the ecosystem and to coastal communities, and evidence demonstrating that shoreline armoring can adversely impact the provision of those services.

酵母拮抗菌和外源水杨酸对核果类果实抗病相关基因的诱导表达

在果实采后贮藏过程中，病原真菌的侵染会引起果实腐烂，造成巨大的经济损失。利用生物和非生物因子诱导果实抗病性，已经成为采后病害防治领域的一个研究热点。本文主要利用RT-PCR和RACE技术克隆果实抗病相关基因，通过分子杂交和蛋白羰基化免疫检测技术，研究了外源SA和酵母拮抗菌诱导果实抗病性机理，结果表明： 1. 通过优化RNA提取方法，能从含有多糖的冬枣、葡萄、甜樱桃、桃、番茄等果实中提取到质量较好的RNA，用于RT-PCR和Northern杂交。 2. 采用RT-PCR和RACE方法，从甜樱桃果实克隆了两个抗氧化相关基因CAT2（Genbank：EF165590）和GPX（Genbank：EF165591）和两个PR基因GLU-1（Genbank：EF177487）和GLU-3（Genbank：EF177488)。其中CAT2全长cDNA序列为1479 bp，编码492个氨基酸；GPX全长cDNA序列为513 bp，编码170个氨基酸；GLU-1全长cDNA序列为1050 bp，编码349个氨基酸；GLU-3部分cDNA序列为454 bp，编码141个氨基酸。 3. 酵母拮抗菌Pichia membranaefaciens处理不同成熟度的甜樱桃果实，能显著降低果实贮藏期间青霉病（Penicillium expansum）的发生，并且对低成熟度果实的病害防治效果更为明显。酵母拮抗菌的抑病机理与减轻了甜樱桃果实蛋白羰基化程度，诱导了果实抗氧化酶基因（CAT和GPX）和PR基因（GLU-1）的表达和提高了抗氧化酶（CAT和GPX）和β-1,3-葡聚糖酶的活性有关。 4. 四种酵母拮抗菌P. membranaefaciens, Cryptococcus laurentii, Candida guilliermondii和Rhodotorula glutinis处理桃果实，可显著降低贮藏期间的褐腐病（Monilinia fructicola）。这是由于酵母拮抗菌能抑制病原菌侵染造成的氧化胁迫和蛋白羰基化。此外，酵母拮抗菌处理还能显著诱导CAT、POD、几丁质酶、β-1,3-葡聚糖酶活性及相应基因的表达。 5. 水杨酸（SA，2 mM）处理采后不同成熟度的甜樱桃果实，能显著降低青霉病的危害。其抑病机理与SA处理能减轻P. expansum侵染引起的果实蛋白羰基化程度，显著提高CAT、GPX和β-1,3-葡聚糖酶基因的表达和相关的酶的活性有关。而2 mM的SA处理对P. expansum的生长没有直接抑制作用。 6. 水杨酸（SA，2 mM）与P. membranaefaciens（1×108 CFU/ml）配合处理能显著降低低温贮藏期间桃果实的褐腐病，并能提高几丁质酶、β-1,3-葡聚糖酶和POD的活性和相关基因的表达。另外，2 mM的SA对拮抗菌P. membranaefaciens的生长没有影响，但能够抑制病原菌M. fructicola的孢子萌发和菌丝扩展。

Culture of pearl in freshwater mussels (Lamellidens marginalis Lamarck)

A pond trail on pearl culture in freshwater mussels, Lamellidens marginalis was carried out for one year in an artificial perennial pond. Four types of foreign particles of indigenous sources, sand, stone, fish eyeball and beads of artificial pearl nucleus were used as nucleus for pearl production. Among the nuclei inserted mussel highest survival rate (72%) was recorded for stone and lowest survival rate (50%) for artificial pearl by nucleus implantation. Highest pearl production rate (%) was recorded for the insertion of stone and lowest for the sand. All nuclei inserted mussel produced pearl accept the mussel which was inserted beads of pearl nucleus for pearl formation. Growth rate (length and weight) was found higher for uninserted mussel than nuclei inserted mussels.

Studies on the performance of Ovatide on breeding of Indian major carps

The paper deals with the experimental studies on breeding of Indian Major Carps - Catla catla (Valenciennes), Labeo rohita (Hamilton), Cirrhinus mrigala (Hamilton), & Labeo calbasu (Hamilton) with the help of 'Ovatide' which is being used as an alternative inducing agent for commercial seed production. This study has been conducted for six consecutive months (April - September, 2000) in a stone-pitched breeding channels of a farm located at Midnapore District, West Bengal. The doses of 'Ovatide' (0.5 ml/kg of fish weight) remained same for each female species during the entire study period and males were released without any dose. The physicochemical parameters of water during different months were estimated. The latency period and fertilization percentage varied in different months and species. The results confirmed that 'Ovatide' can be used successfully in a much more cost-effective way for induced breeding of carps, even in rural fish farms with morrum-pitched breeding channels.

Spiny lobsters resources

Investigations into the resources of spiny lobsters in Ceylon waters were first begun in 1958 and consisted initially of skin-diving surveys of sand-stone and rocky areas at night. The surveys revealed the presence of lobsters in appreciable quantities in these reefs. Experiments were then carried out to decide on the most effective method of capturing them. Lobster traps of different design were placed in the reefs and rocky areas and the most efficient design was selected for use. This design was used thereafter to assess the spiny lobster resources. However, traps proved ineffective on the east coast as the particular species present there did not enter traps. Where traps failed the resources were assessed using skin-divers. These operations revealed the presence of lobsters in large concentrations in particular areas around Ceylon, especially on the south-west, south and west coasts. (De Bruin, 1960 and 1962). This discontinuity in distribution is discussed in greater detail in a previous publication (De Bruin, 1969. The ecology of spiny lobsters, Panulirus spp., of Ceylon waters. Bulletin of the Fisheries Research Station, Ceylon, 20(2), pp. 171-189).