SwissBioisostere: a database of molecular replacements for ligand design.

The SwissBioisostere database (http://www.swissbioisostere.ch) contains information on molecular replacements and their performance in biochemical assays. It is meant to provide researchers in drug discovery projects with ideas for bioisosteric modifications of their current lead molecule, as well as to give interested scientists access to the details on particular molecular replacements. As of August 2012, the database contains 21 293 355 datapoints corresponding to 5 586 462 unique replacements that have been measured in 35 039 assays against 1948 molecular targets representing 30 target classes. The accessible data were created through detection of matched molecular pairs and mining bioactivity data in the ChEMBL database. The SwissBioisostere database is hosted by the Swiss Institute of Bioinformatics and available via a web-based interface.

Analysis and Design of a secure WLAN solution for Cobre Las Cruces

Cobre Las Cruces is a renowned copper mining company located in Sevilla, with unexpected problems in wireless communications that have a direct affectation in production. Therefore, the main goals are to improve the WiFi infrastructure, to secure it and to detect and prevent from attacks and from the installation of rogue (and non-authorized) APs. All of that integrated with the current ICT infrastructure.This project has been divided into four phases, although only two of them have been included into the TFC; they are the analysis of the current situation and the design of a WLAN solution.Once the analysis part was finished, some weaknesses were detected. Subjects such as lack of connectivity and control, ignorance about installed WiFi devices and their localization and state and, by and large, the use of weak security mechanisms were some of the problems found. Additionally, due to the fact that the working area became larger and new WiFi infrastructures were added, the first phase took more time than expected.As a result of the detailed analysis, some goals were defined to solve and it was designed a centralized approach able to cope with them. A solution based on 802.11i and 802.1x protocols, digital certificates, a probe system running as IDS/IPS and ligthweight APs in conjunction with a Wireless LAN Controller are the main features.

Enfermeira - a construção de um modelo a partir do discurso médico

O objetivo é traçar traçar um paralelo entre o conteúdo dos discursos médicos e o comportamento esperado e estereotipado das enfermeiras do início do século. É uma abordagem histórico-social que utilizou como fontes os discursos médicos e de enfermeiras pro feridos nas escolas de enfermagem e de medicina. A análise dos discursos médicos comparada aos discursos das enfermeiras refletem a formação de uma mentalidade intrinsecamente modelada e docilizada pelo poder médico que as desejava santa e subserviente.

Design of potent inhibitors of human RAD51 recombinase based on BRC motifs of BRCA2 protein: modeling and experimental validation of a chimera peptide.

We have previously shown that a 28-amino acid peptide derived from the BRC4 motif of BRCA2 tumor suppressor inhibits selectively human RAD51 recombinase (HsRad51). With the aim of designing better inhibitors for cancer treatment, we combined an in silico docking approach with in vitro biochemical testing to construct a highly efficient chimera peptide from eight existing human BRC motifs. We built a molecular model of all BRC motifs complexed with HsRad51 based on the crystal structure of the BRC4 motif-HsRad51 complex, computed the interaction energy of each residue in each BRC motif, and selected the best amino acid residue at each binding position. This analysis enabled us to propose four amino acid substitutions in the BRC4 motif. Three of these increased the inhibitory effect in vitro, and this effect was found to be additive. We thus obtained a peptide that is about 10 times more efficient in inhibiting HsRad51-ssDNA complex formation than the original peptide.

Técnica Delphi: identificando as competências gerais do médico e do enfermeiro que atuam em atenção primária de saúde

Este trabalho tem como objetivo identificar as competências gerais do médico e do enfermeiro que atuam em atenção primária de saúde em Marília, estado de São Paulo. A técnica Delphi foi utilizada para identificação destas competências. Foram identificadas oito (8) competências comunicação, trabalho em equipe, gerência, orientada à comunidade, valores profissionais, tomada de decisão, resolver problemas e habilidades educacionais. A competência referente à gerência foi a única a não apresentar consenso entre os médicos que não a consideram necessária para atuar m medicina.

Ionotropic and metabotropic mechanisms in chemoreception: 'chance or design'?

Chemosensory receptors convert an enormous diversity of chemical signals from the external world into a common language of electrical activity in the brain. Mammals and insects use several families of transmembrane receptor proteins to recognize distinct classes of volatile and non-volatile chemicals that are produced by conspecifics or other environmental sources. A comparison of the signalling mechanisms of mammalian and insect receptors has revealed an unexpected functional distinction: mammals rely almost exclusively on metabotropic ligand-binding receptors, which use second messenger signalling cascades to indirectly activate ion channels, whereas insects use ionotropic receptors, which are gated directly by chemical stimuli, thereby leading to neuronal depolarization. In this review, we consider possible reasons for this dichotomy, taking into account biophysical, cell biological, ecological and evolutionary influences on how information is extracted from chemosensory cues by these animal classes.

Registros noticiosos sobre a escola profissional de enfermeiros e enfermeiras na revista "O Brazil-Médico", 1890-1922

Estudo histórico descritivo com o objetivo de identificar registros noticiosos sobre a Escola de Enfermagem Alfredo Pinto, antiga Escola Profissional de Enfermeiros e Enfermeiras (EPEE), veiculadas na revista mencionada no período referido. A metodologia utilizada foi a análise documental como técnica de pesquisa. A revista foi publicada de forma ininterrupta durante esse período de 32 anos e 1.632 exemplares foram consultados. Foram encontradas 16 notícias alusivas à EPEE, ao Hospital Nacional de Alienados, à Enfermagem e Cursos de Enfermagem. Desse total, apenas cinco notícias referiam-se diretamente à EPEE. Analisando seu conteúdo despontam duas idéias fundamentais: 1) a EPEE teve duas inaugurações, em 1897 e 1906, o que ratifica o Decreto de criação em 27/09/1890; e, 2) a dificuldade de operacionalização da EPEE, àquela época, em virtude da baixa qualificação dos candidatos a alunos.

Análise crítica dos rituais no contexto da enfermagem médico-cirúrgica

Neste artigo, apresentamos uma revisão histórica dos significados dos rituais na enfermagem, com o objetivo de analisar criticamente a prática ritualística da enfermagem cirúrgica. As ações ritualísticas da enfermagem e da enfermagem cirúrgica encontram respaldo na história da profissão, na formação dos enfermeiros e nos mitos do contexto organizacional e cultural cirúrgico. Essas ações são criticadas pelos autores, frente ao pensamento teórico profissional atual.

The interior designer : Can the physiological agents of homeostasis create the appearance of design in nature?

Review of the book: The Tinkerer's Accomplice: How Design Emerges From Life Itself by J. Scott TurnerHarvard University Press: 2007. 304 pp.

Eficácia da estufa de Pasteur como equipamento esterilizante em consultórios odontológicos

Este estudo objetivou avaliar a eficácia do uso da estufa de Pasteur, como equipamento esterilizante, em consultórios odontológicos, por meio de monitoramento biológico. Para esta avaliação foram consideradas: adequação no carregamento dos materiais no equipamento, tempo/temperatura utilizados e manutenção preventiva da estufa. Os dados foram coletados em 101 consultórios odontológicos, no Distrito Central de Goiânia-GO, Brasil, por meio de observação, entrevista e realização de teste com indicador biológico. Os resultados demonstraram não-padronização de algumas condutas preconizadas pelo Ministério da Saúde (MS), para esterilização dos artigos em estufa, e positividade do teste biológico em 46 (45,5%) dos ciclos testados. Os fatores intervenientes, com maior significância, relativos às falhas da esterilização foram: ausência do termômetro acessório para o controle da temperatura dos ciclos e a inobservância das relações tempo/temperatura recomendados para o ciclo de esterilização, por calor seco.

Malaria vaccine candidate: design of a multivalent subunit α-helical coiled coil poly-epitope.

A new strategy for the rapid identification of new malaria antigens based on protein structural motifs was previously described. We identified and evaluated the malaria vaccine potential of fragments of several malaria antigens containing α-helical coiled coil protein motifs. By taking advantage of the relatively short size of these structural fragments, we constructed different poly-epitopes in which 3 or 4 of these segments were joined together via a non-immunogenic linker. Only peptides that are targets of human antibodies with anti-parasite in vitro biological activities were incorporated. One of the constructs, P181, was well recognized by sera and peripheral blood mononuclear cells (PBMC) of adults living in malaria-endemic areas. Affinity purified antigen-specific human antibodies and sera from P181-immunized mice recognised native proteins on malaria-infected erythrocytes in both immunofluorescence and western blot assays. In addition, specific antibodies inhibited parasite development in an antibody dependent cellular inhibition (ADCI) assay. Naturally induced antigen-specific human antibodies were at high titers and associated with clinical protection from malaria in longitudinal follow-up studies in Senegal.

Exploring unfrequent events with accelerated molecular dynamics simulations: from photochemistry to drug design

La meva incorporació al grup de recerca del Prof. McCammon (University of California San Diego) en qualitat d’investigador post doctoral amb una beca Beatriu de Pinós, va tenir lloc el passat 1 de desembre de 2010; on vaig dur a terme les meves tasques de recerca fins al darrer 1 d’abril de 2012. El Prof. McCammon és un referent mundial en l’aplicació de simulacions de dinàmica molecular (MD) en sistemes biològics d’interès humà. La contribució més important del Prof. McCammon en la simulació de sistemes biològics és el desenvolupament del mètode de dinàmiques moleculars accelerades (AMD). Les simulacions MD convencionals, les quals estan limitades a l’escala de temps del nanosegon (~10-9s), no son adients per l’estudi de sistemes biològics rellevants a escales de temps mes llargues (μs, ms...). AMD permet explorar fenòmens moleculars poc freqüents però que son clau per l’enteniment de molts sistemes biològics; fenòmens que no podrien ser observats d’un altre manera. Durant la meva estada a la “University of California San Diego”, vaig treballar en diferent aplicacions de les simulacions AMD, incloent fotoquímica i disseny de fàrmacs per ordinador. Concretament, primer vaig desenvolupar amb èxit una combinació dels mètodes AMD i simulacions Car-Parrinello per millorar l’exploració de camins de desactivació (interseccions còniques) en reaccions químiques fotoactivades. En segon lloc, vaig aplicar tècniques estadístiques (Replica Exchange) amb AMD en la descripció d’interaccions proteïna-lligand. Finalment, vaig dur a terme un estudi de disseny de fàrmacs per ordinador en la proteïna-G Rho (involucrada en el desenvolupament de càncer humà) combinant anàlisis estructurals i simulacions AMD. Els projectes en els quals he participat han estat publicats (o estan encara en procés de revisió) en diferents revistes científiques, i han estat presentats en diferents congressos internacionals. La memòria inclosa a continuació conté més detalls de cada projecte esmentat.

Distribuição do tempo das enfermeiras: identificação e análise em Unidade Médico-Cirúrgica

Diante do impacto da distribuição do tempo de trabalho da profissional enfermeira na determinação de parâmetros para a operacionalização do processo de dimensionar pessoal de enfermagem, este estudo teve por objetivo identificar e analisar a distribuição do tempo de trabalho das enfermeiras em uma unidade de internação médico-cirúrgica. Para a consecução dos objetivos da pesquisa considerou-se, como população estatística, as atividades de enfermagem realizadas pelas enfermeiras durante os turnos de trabalho. Verificou-se que 50% do tempo destas profissionais foram dedicados às intervenções de cuidado indireto, 22% às intervenções de cuidado direto, 18% às atividades de tempo pessoal e 10% às atividades associadas. Estes dados corroboram a indicação de pesquisadores que apontam a necessidade de serem considerados o tempo pessoal dos trabalhadores de enfermagem e a realização das atividades associadas nos métodos de dimensionamento de pessoal preconizados pelos órgãos oficiais.

Indicadores de avaliação do processamento de artigos odonto-médico-hospitalares: elaboração e validação

Estudo de desenvolvimento metodológico de elaboração e validação de medidas de avaliação em saúde, com a finalidade de contribuir com sistemas de avaliação de práticas de controle e prevenção de infecção hospitalar, pela elaboração e validação de oito indicadores para avaliação do processamento de artigos odonto-médico-hospitalares. A partir de fundamentação teórico-científica e contemplando avaliações de estrutura, processo e resultado, tais indicadores permitem elaboração de índices de conformidade com relação às melhores práticas esperadas (padrão-ouro). A validação referiu-se à validade de conteúdo, pela técnica de consenso de especialistas para julgamento de representatividade e aplicabilidade. Todos os indicadores foram aprovados. Os julgamentos efetuados, incluindo comentários e sugestões, demonstraram a importância de se realizar validação de processos de avaliação, independentemente da existência de critérios padrão-ouro e/ou relevância na prática assistencial.

Investigation of the Modified Beam-in-Slab Bridge System, Design Guide, 2004, Vol. 3

Design guide