Tocantins river as an effective barrier to gene flow in Saguinus niger populations

The Saguinus represent the basal genus of the Callitrichinae subfamily. Traditionally this genus is divided into three groups: Hairy, Mottled and Bare-face, however, molecular data failed to validate these groups as monophyletic units, as well as raised some subspecies to the species status. This is the case of the former subspecies Saguinus midas midas and S. midas niger, which are now considered as different species. In the present study, we sequenced a portion of the D-loop mtDNA region in populations from the East bank of the Xingu and from both banks of the Tocantins river, in order to test the effectiveness of large rivers as barriers to the gene flow in Saguinus. According to our results, the populations from the East and West banks of the Tocantins river are more divergent than true species like S. mystax and S. imperator. The Tocantins river may be acting as a barrier to gene flow, and consequently these very divergent populations may represent distinct taxonomic entities (species?).

Análise faciológica e estratigráfica da planície costeira de Soure (margem leste da ilha de Marajó-PA), no trecho compreendido entre o canal do Cajuúna e o estuário Paracauari

A planície costeira de Soure, na margem leste da ilha de Marajó (Pará), é constituída por áreas de acumulação lamosa e arenosa, de baixo gradiente, sujeitas a processos gerados por marés e ondas. Suas feições morfológicas são caracterizadas por planícies de maré, estuários, canais de maré e praias-barreiras. A análise faciológica e estratigráfica de seis testemunhos a vibração, com profundidade média de 4 m, e de afloramentos de campo permitiu a caracterização dos ambientes deposicionais, sua sucessão temporal e sua correlação lateral, a elaboração de seções estratigráficas e a definição de uma coluna estratigráfica. Foram identificadas cinco associações de facies: (1) facies de planície de maré, (2) facies de manguezal, (3) facies de barra de canal de maré, (4) facies de praia e (5) facies de duna. A história sedimentar da planície costeira de Soure é representada por duas sucessões estratigráficas: (1) a sucessão progradacional, constituída pelas associações de facies de planície de maré, manguezal e barra de canal de maré; e (2) a sucessão retrogradacional, formada pelas associações de facies de praia e de duna. Essas sucessões retratam uma fase de expansão das planícies de maré e manguezais, com progradação da linha de costa (Holoceno médio a superior), e uma posterior fase de retrogradação, com migração dos ambientes de praias e dunas sobre depósitos lamosos de manguezal e planície de maré, no Holoceno atual. A história deposicional da planície costeira de Soure é condizente com o modelo de evolução holocênica das planícies costeiras do nordeste paraense.

Significant genetic differentiation among populations of Anomalocardia brasiliana (Gmelin, 1791): a bivalve with planktonic larval dispersion

Four Brazilian populations of Anomalocardia brasiliana were tested for mutual genetic homogeneity, using data from 123 sequences of the mtDNA cytochrome oxidase c subunit I gene. A total of 36 haplotypes were identified, those shared being H3 (Canela Island, Prainha and Acupe) and both H5 and H9 (Prainha and Acupe). Haplotype diversity values were high, except for the Camurupim population, whereas nucleotide values were low in all the populations, except for that of Acupe. Only the Prainha population showed a deviation from neutrality and the SSD test did not reject the demographic expansion hypothesis. Fst values showed that the Prainha and Acupe populations represent a single stock, whereas in both the Canela Island and Camurupim stocks, population structures are different and independent. The observed structure at Canela Island may be due to the geographic distance between this population and the remainder. The Camurupim population does not share any haplotype with the remaining populations in northeastern Brazil. The apparent isolation could be due to the rocky barrier located facing the mouth of the Mamanguape River. The results highlight the importance of wide-scale studies to identify and conserve local genetic diversity, especially where migration is restricted.

Efeito da fragmentação e o isolamento da paisagem na riqueza e composição de espécies de lagartos no Reservatório de Tucuruí, Pará

Apesar de vários trabalhos publicados para a região tropical demonstrando o efeito da fragmentação florestal e o isolamento da paisagem na comunidade biótica, a maioria destes, foi realizada em regiões continentais. Os impactos da fragmentação e o isolamento da paisagem resultante da criação de reservatórios artificiais de usinas hidrelétricas ainda são pouco estudados na Amazônia. Este estudo foi realizado em fragmentos ('ilhas") remanescentes de floresta ombrófila, formadas pela construção da Hidrelétrica de Tucuruí, no estado do Pará com o objetivo de comparar as ilhas nas duas margens do reservatório em relação ao tamanho total, tamanho da área nuclear (core area) , forma geométrica (total de borda balanceado pela área da ilha) e grau de isolamento a fim demonstrar o papel das mesmas para a conservação da biota local e em escala local avaliar a riqueza, abundância e composição de espécies da comunidade de lagartos em 12 "ilhas" do reservatório em relação ao tamanho, grau de isolamento e posição das ilhas no reservatório. Para o estudo em escala da paisagem foram escolhidas 199 ilhas nas duas margens no limite da Área de Proteção Ambiental de Tucuruí usando imagem de satélite de 2005. O tamanho das ilhas analisadas varia de 3 a 1768 hectares , sendo que 40% delas com menos 10 hectares . As ilhas têm uma perda significativa, variando de 22% a 100%, de área total, em função do efeito de borda. Não houve diferença significativa no tamanho total, tamanho da área nuclear e total da borda I')as ilhas em relação á margem do reservatório. Contudo, as ilhas da margem esquerda têm maior grau de isolamento em relação das ilhas da margem direita. A maioria das ilhas analisadas no reservatório de Tucuruí tem tamanhos pequenos, alta perda de área total em função do efeito de borda, formato irregular o que aumenta o potencial do efeito de borda e alto grau de isolamento. Em escala local a comunidade de lagartos foi amostrada em cinco campanhas de campo realizadas entre janeiro e julho de 2005, através de transectos e armadilhas de queda. As áreas inventariadas foram selecionadas com base no tamanho, grau de isolamento e posição na margem do reservatório. Foram registrados 837 indivíduos de lagartos, distribuídos em 16 espécies. As espécies mais abundantes foram Gonatodes humeralis e Coleodactylus amazonicus (Gekkonidae). A amostragem realizada nas cinco campanhas foi suficiente para determinar a riqueza total das ilhas amostradas, correspondendo a 84% do número de espécies de acordo com o estimador Jacknife 1. Houve diferença significativa na riqueza de espécies de lagartos entre as campanhas realizada sendo a riqueza maior obtida a partir da 38 campanha de campo, em abril-maio de 2005. Não houve diferença significativa na riqueza de espécies e no número de indivíduos de lagartos em relação à margem do reservatório. Houve diferença significativa e positiva da riqueza de espécies de lagartos em relação ao tamanho da ilha. Não houve diferença significativa na abundância de lagartos em relação ao tamanho das ilhas. Houve diferença significativa entre a riqueza de lagartos em relação ao isolamento da ilha, sendo esta menor nas ilhas mais isoladas. Não houve diferença significativa entre a abundância de lagartos em relação ao isolamento da ilha. Não houve diferença significativa da riqueza de espécies em relação à abertura do dossel e ao volume de serrapilheira. Houve diferença significativa e positiva entre a riqueza de espécies em relação à densidade de troncos caídos e de árvores vivas. Não houve diferença significativa da abundância de indivíduos em relação aos parâmetros de estrutura da vegetação analisados neste estudo. Não houve diferença na composição de espécies da comunidade de lagartos nas ilhas em relação às margens do reservatório, indicando que o rio Tocantins não é uma barreira geográfica para a distribuição deste grupo.

Identification of human T-cell lymphotropic virus infection in a semi-isolated Afro-Brazilian quilombo located in the Marajó Island (Pará, Brazil)

ABSTRACT: Antibodies to human T-cell lymphotropic virus-1 and 2 (HTLV-1 and 2) were tested in 259 inhabitants (98 males and 161 females) of four villages of the Marajó Island (Pará, Brazil) using enzyme immunoassays (ELISA and Western blot). Types and subtypes of HTLV were determined by nested polymerase chain reaction (PCR) targeting the pX, env and 5´LTR regions. HTLV-1 infection was detected in Santana do Arari (2.06%) and Ponta de Pedras (1%). HTLV-2 was detected only in Santana do Arari (1.06%). Sequencing of the 5´LTR region of HTLV-1 and the phylogenetic analysis identified the virus as a member of the Cosmopolitan Group, subgroup Transcontinental. Santana do Arari is an Afro-Brazilian community and the current results represent the first report of HTLV-1 infection in a mocambo located in the Brazilian Amazon region.

Gobioides broussonnetii (Gobiidae): a new host for Pterobothrium crassicolle (Trypanorhyncha) on Marajó Island, northern Brazil

No presente estudo, o cestóide Pterobothrium crassicolle Diesing, 1850 (Trypanorhyncha) é descrito parasitando espécimes do Peixe-dragão (Gobioides broussonnetii Lacepède, 1800), coletados no estuário do rio Paracauari na Ilha de Marajó no Norte do Estado do Pará, entre janeiro de 2009 e dezembro de 2010. Amostras de tecidos foram analisadas e blastocistos contendo larvas plerocercóides foram identificados. Estas larvas foram processadas para microscopia eletrônica de varredura. Sessenta espécimes de G. broussonnetii foram analisados, e P. crassicolle foi encontrado em 48 indivíduos (80%). Este é o primeiro registro de P. crassicolle parasitando o Peixe-dragão, G. broussonnetii.

Ethnoveterinary knowledge of the inhabitants of Marajó Island, Eastern Amazonia, Brazil

Em várias partes do mundo existem relatos etnoveterinários sobre a utilização de plantas em protocolos terapêuticos, entretanto não existem informações disponíveis sobre a etnoveterinária praticada na Amazônia brasileira. Desta forma, objetivou-se documentar o conhecimento etnoveterinário de habitantes da Ilha do Marajó, Amazônia Oriental. Foram realizadas 50 entrevistas individuais com aplicação de questionários semi-estruturados que foram analisados quantitativamente através de estatística descritiva utilizando freqüência de distribuição. O valor de uso foi calculado para determinar as espécies mais importantes. Amostras de plantas com relatos de uso medicinal foram coletadas e identificadas botanicamente. Cinqüenta plantas, distribuídas em 48 gêneros e 34 famílias, foram indicadas para 21 diferentes usos medicinais. A família Asteraceae foi a que teve maior número de espécies citadas e Carapa guianensis Aubl, Crescentia cujete L., Copaifera martii Hayne, Caesalpinia ferrea Mart., Chenopodium ambrosioides L., Jatropha curcas L. e Momordica charantia L. foram as espécies com maiores valor de uso. As partes das plantas mais utilizadas para preparo dos medicamentos etnoveterinários foram folhas (56%), cascas (18%), raizes (14%), sementes (14%) e frutos (8%). Quanto à forma de uso o chá foi citado por 56% dos entrevistados e a maioria das preparações (90,9%) utiliza uma só planta. Além das plantas medicinais, os entrevistados relataram o uso de produtos de origem animal e mineral. Esse trabalho contribui para realização de um inventário das plantas utilizadas na etnoveterinária marajoara que pode servir de base de dados para futuros estudos de validação científica.

Hepatic steatosis associated with microsporidiosis in teleost fishes from Marajó Island, Brazil

Um total de 40 exemplares do peixe teleósteo Gobioides grahamae Palmer & Wheeler, 1955 foram obtidos a partir do município de Salvaterra na Ilha de Marajó, no estado brasileiro do Pará. Os fígados foram removidos e processados para a microscopia de luz. De modo geral, 90% das amostras apresentavam algum grau de esteatose hepática, a qual foi invariavelmente associada com a presença de Microsporidium sp. O presente estudo confirma a ocorrência de esteatose em G. grahamae associada a infecções parasitárias por Microsporidium. Os resultados indicam que as condições de peixes saudáveis em ambiente natural podem ser afetadas negativamente por parasitas.

Diet of the freshwater stingray Potamotrygon motoro (Chondrichthyes: Potamotrygonidae) on Marajó Island (Pará, Brazil)

O conteúdo estomacal de 137 exemplares de Potamotrygon motoro provenientes de 3 localidades (Muaná, Afuá e Lago Arari) na ilha de Marajó foi analisado. Os valores do Índice Relativo de Importância (IRI) e respectiva porcentagem (%IRI) foram calculados. O nível de repleção 1 (¼ cheio) foi o mais representativo para ambos os sexos, assim como para exemplares imaturos e maduros. A maioria dos itens alimentares analisados encontrava-se bastante digerido. A identificação dos itens alimentares indicou a presença de 15 ordens, incluindo insetos, moluscos, crustáceos, anelídeos e peixes. Diferenças na dieta entre os locais amostrados foram observadas ao se comparar as %IRI, sendo crustáceos o item preferencial em Afuá, peixes no Lago Arari e moluscos em Muaná.

Aedes aegypti on Madeira Island (Portugal): genetic variation of a recently introduced dengue vector

The increasing population of Aedes aegypti mosquitoes on Madeira Island (Portugal) resulted in the first autochthonous dengue outbreak, which occurred in October 2012. Our study establishes the first genetic evaluation based on the mitochondrial DNA (mtDNA) genes [cytochrome oxidase subunit I (COI) and NADH dehydrogenase subunit 4 (ND4)] and knockdown resistance ( kdr ) mutations exploring the colonisation history and the genetic diversity of this insular vector population. We included mosquito populations from Brazil and Venezuela in the analysis as putative geographic sources. The Ae. aegyptipopulation from Madeira showed extremely low mtDNA genetic variability, with a single haplotype for COI and ND4. We also detected the presence of two important kdr mutations and the quasi-fixation of one of these mutations (F1534C). These results are consistent with a unique recent founder event that occurred on the island of Ae. aegyptimosquitoes that carry kdr mutations associated with insecticide resistance. Finally, we also report the presence of the F1534C kdr mutation in the Brazil and Venezuela populations. To our knowledge, this is the first time this mutation has been found in South American Ae. aegypti mosquitoes. Given the present risk of Ae. aegypti re-invading continental Europe from Madeira and the recent dengue outbreaks on the island, this information is important to plan surveillance and control measures.

Treatment of polycarbonate by dielectric barrier discharge (DBD) at atmospheric pressure

Generally most plastic materials are intrinsically hydrophobic, low surface energy materials, and thus do not adhere well to other substances. Surface treatment of polymers by discharge plasmas is of great and increasing industrial application because it can uniformly modify the surface of sample without changing the material bulk properties and is environmentally friendly. The plasma processes that can be conducted under ambient pressure and temperature conditions have attracted special attention because of their easy implementation in industrial processing. Present work deals with surface modification of polycarbonate (PC) by a dielectric barrier discharge (DBD) at atmospheric pressure. The treatment was performed in a parallel plate reactor driven by a 60Hz power supply. The DBD plasmas at atmospheric pressure were generated in air and nitrogen. Material characterization was carried out by contact angle measurements, and X-ray photoelectron spectroscopy (XPS). The surface energy of the polymer surface was calculated from contact angle data by Owens-Wendt method using distilled water and diiodomethane as test liquids. The plasma-induced chemical modifications are associated with incorporation of polar oxygen and nitrogen containing groups on the polymer surface. Due to these surface modifications the DBD-treated polymers become more hydrophilic. Aging behavior of the treated samples revealed that the polymer surfaces were prone to hydrophobic recovery although they did not completely recover their original wetting properties.

Superconducting State of a Disk with a Pentagonal/Hexagonal Trench/Barrier

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Single CpG island methylation is not sufficient to maintain the silenced expression of CASPASE-8 apoptosis-related gene among women with epithelial ovarian cancer

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Characterisation of the methylation pattern in the intragenic CpG island of the IGF2 gene in Bos taurus indicus cumulus cells during in vitro maturation

The aim of this study was to characterise the methylation pattern in a CpG island of the IGF2 gene in cumulus cells from 1-3 mm and a parts per thousand yenaEuro parts per thousand 8.0 mm follicles and to evaluate the effects of in vitro maturation on this pattern.Genomic DNA was treatment with sodium bisulphite. Nested PCR using bisulphite-treated DNA was performed, and DNA methylation patterns have been characterised.There were no differences in the methylation pattern among groups (P > 0.05). Cells of pre-IVM and post-IVM from small follicles showed methylation levels of 78.17 +/- 14.11 % and 82.93 +/- 5.86 %, respectively, and those from large follicles showed methylation levels of 81.81 +/- 10.40 % and 79.64 +/- 13.04 %, respectively. Evaluating only the effect of in vitro maturation, cells of pre-IVM and post-IVM COCs showed methylation levels of 80.17 +/- 12.01 % and 81.19 +/- 10.15 %.In conclusion, the methylation levels of the cumulus cells of all groups were higher than that expected from the imprinted pattern of somatic cells. As the cumulus cells from the pre-IVM follicles were not subjected to any in vitro manipulation, the hypermethylated pattern that was observed may be the actual physiological methylation pattern for this particular locus in these cells. Due the importance of DNA methylation in oogenesis, and to be a non-invasive method for determining oocyte quality, the identification of new epigenetic markers in cumulus cells has great potential to be used to support reproductive biotechniques in humans and other mammals.

Microbial populations and activities of mangrove, restinga and Atlantic forest soils from Cardoso Island, Brazil

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)