Identification of sex in Carica papaya L. using RAPD markers

Brazil is currently the worlds largest producer of papaya (Carica papaya L.), producing fruits for both the domestic market and export. Only fruits from hermaphrodite plants are marketed because they have the necessary commercial characteristics, i.e. they are pear-shaped and have thicker flesh and a smaller internal cavity. Increased papaya yield has been limited mainly by the ratio of female to hermaphrodite (1:2) plants normally occurring in orchards. This ratio causes great losses to papaya producers and the identification of the sex of seedlings during the nursery stage would be an important advance. In our study random amplified polymorphic DNA (RAPD) analysis was used to differentiate between the sexual forms of three commercial C. papaya cultivars belonging to the Solo group. RAPD assays using the BC210 primer were able to detect hermaphrodites in all of the cultivars tested. The BC210(438)molecular marker was much better at papaya sex differentiation than other markers described in the literature.

Morphological and molecular characterization of Colletotrichum spp. from citrus orchards affected by postbloom fruit drop in Brazil

Brazilian isolates of Colletotrichum spp. from citrus orchards affected by postbloom fruit drop were examined for colony colour, mycelial growth, benomyl-resistance, pathogenicity, and genetic variability by random amplified polymorphic DNA (RAPD) analysis. All isolates were obtained from flowers and persistent calyxes from different citrus hosts from São Paulo, Brazil. DNA polymorphisms detected after amplification with random 10-mer primers were used to classify the isolates into two groups. Group I isolates grew rapidly on potato-dextrose agar (PDA) and were sensitive to benomyl, and group II isolates grew slowly on PDA and were benomyl-resistant. Colletotrichum acutatum was analyzed by RAPD and had high genetic similarity with group II isolates of Colletotrichum from citrus. Probably, the group I is C, gloeosporioides and group II is C. acutatum.

SEQUENCE OF A CDNA-ENCODING BOTHROPSTOXIN-I, A MYOTOXIN FROM THE VENOM OF BOTHROPS-JARARACUSSU

With the aim of further understanding the structure/function relationships in the membrane-damaging activity of the Lys(49) phospholipase A(2) (Lys(49)-PLA(2)) sub-family, we used PCR (polymerase chain reaction) on total venom gland cDNAs from Bothrops jararacussu with degenerate oligodeoxyribonucleotides encoding the N- and C-termini of myotoxin II, a Lys(49)-PLA(2) from Bothrops asper. A 350-bp cDNA coding for bothropstoxin I (BtxtxI) was amplified. Sequencing of the amplified fragment shows that BtxtxI has a Lys(49), and comparison with the known structure of myotoxin II showed that the amino acids involved in the formation of a novel dimeric structure in this protein were also conserved.

Random amplification of polymorphic DNA reveals clonal relationships among enteropathogenic Escherichia coli isolated from non-human primates and humans

Enteropathogenic Escherichia coli ( EPEC) strains are important agents of infantile diarrhea all over the world, gaining even greater importance in developing countries. EPEC have also been isolated from various animal species, but most isolates belong to serotypes that differ from those recovered from humans. However, it has been demonstrated that several isolates from non- human primates belong to the serogroups and/ or serotypes related to those implicated in human disease. The objective of this study was to evaluate the genetic differences between thirteen strains isolated from non- human primates and the same number of strains isolated from human infections. Human isolates belonged to the same serogroup/ serotype as the monkey strains and the evaluation was done by analysis of random amplified polymorphic DNA. Dendrogram analysis showed that there was no clustering between human and monkey strains. Human and non- human isolates of the EPEC serotypes O127:H40 and O128:H2 shared 90 and 87% of their bands, respectively, indicating strong genomic similarity between the strains, leading to the speculation that they may have arisen from the same pathogenic clone. To our knowledge, this study is the first one comparing genomic similarity between human and non- human primate strains and the results provide further evidence that monkey EPEC strains correlate with human EPEC, as suggested in a previous investigation.

Susceptibilidade antifúngica, produção de biofilme e caracterização do gene ALS3 em isolados de Candida albicans e não-albicans do hospital das clínicas, UNESP, Botucatu

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Aderência aço-concreto: análise numérica dos ensaios pull-out e APULOT

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Biologia estrutural: expressão e caracterização estrutural da proteína 25K do Cole latent virus

Pós-graduação em Microbiologia - IBILCE

Clonagem do gene p28 e análise da expressão da proteína recombinante a partir da amostra Jaboticabal de Ehrlichia canis e sua aplicação no diagnóstico da erliqueose canina

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Zaprionus indianus: uma visão da espécie invasora sob o aspecto genético e evolutivo

Pós-graduação em Genética - IBILCE

Estudo da biologia reprodutiva, diversidade genética e química de populações de Ocimum selloi Benth

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Determinação da idade e crescimento da piramutaba Brachyplatystoma vaillantii (Valenciennes, 1840) (Siluriformes : Pimelodidae) capturada no estuário amazônico

Neste trabalho foram analisados exemplares de piramutaba (Brachyplalystoma vaillantii) provenientes de pescarias experimentais no estuário amazônico. Para o estudo de determinação da idade foram analisados acúleos das nadadeiras peitorais e dorsal, opérculos, otólitos (lapillus) e vértebras. Da análise destas estruturas rígidas foi concluído que a vértebra é a estrutura mais adequada para determinar a idade da piramutaba, pois esta estrutura apresentou 59% de anéis nítidos e uma boa correlação entre o seu raio e o comprimento furcal do peixe (r² = 0,9889 e p<0,05). Os anéis etários das vértebras foram validados pelo método da distribuição de freqüências por classes de comprimento. A piramutaba forma dois anéis etários por ano em suas vértebras. A relação entre o peso total e o comprimento furcal da piramutaba descreve seu crescimento como alométrico e a equação que descreve este crescimento é Wt = 6,1 * 10^-6 * Lf^3,1129. A proporção sexual de piramutaba verificada não foi de 1:1, onde o número de fêmeas foi superior ao de machos. Foi observado um número máximo de dez anéis nítidos nas vértebras de piramutaba. O modelo de crescimento utilizado neste trabalho foi o de von Bertalanffy para as estimativas das equações de crescimento em comprimento e em peso. Os parâmetros de crescimento (k, t₀ e L∞) foram estimados através de quatro diferentes métodos: contagem de anéis nas vértebras, retrocálculo, decomposição dos raios e distribuição de freqüências por classes de comprimento. Os parâmetros de crescimento foram: k = 0,138 ano^-1, t₀ = -0,239 e L∞ = 110,5 cm (contagem de anéis); k = 0,119 ano^-1, t₀ = -0,202 e L∞ = 110,5 cm (retrocálculo); k = 0,096 ano^-1, t₀ = -0,146 e L∞ = 110,5 cm (decomposição dos raios) e k = 0,127 ano^-1, t₀ = -0,236 e L∞ = 110,5 cm (distribuição de freqüências).

Nested-PCR do gene que codifica o antígeno b aplicada ao diagnóstico da tuberculose pulmonar

A reação em cadeia da polimerase usada para amplificação de uma seqüência interna de um fragmento previamente amplificado (nested-PCR) foi investigada como uma alternativa complementar a pesquisa de bacilos álcool ácido resistentes e a cultura do Mycobacterium tuberculosis em meio de Lowenstein-Jensen. Foram investigadas 144 amostras de escarro de pacientes suspeitos de tuberculose encaminhados ao Laboratório de Tuberculose do Instituto Evandro Chagas em Belém, no período de junho de 2002 a dezembro de 2003. Das 144 amostras, 121 foram caracterizadas como tuberculose, 119 foram positivas na cultura, 95 na baciloscopia e 128 na nested-PCR. A sensibilidade da nested-PCR foi 96% (116/121), enquanto a especificidade foi 48% (11/23). A nested-PCR poderá ser uma ferramenta complementar para o diagnóstico da tuberculose, pois apresenta sensibilidade equivalente à cultura, no entanto, necessita de maiores avaliações visando minimizar o número de resultados falso-positivos.

Caracterização genotípica de amaostras de Toxoplasma gondii isoladas de ovinos de abatedouro

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Lipoprotein Lipase and PPAR Alpha Gene Polymorphisms, Increased Very-Low-Density Lipoprotein Levels, and Decreased High-Density Lipoprotein Levels as Risk Markers for the Development of Visceral Leishmaniasis by Leishmania infantum

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Análises isoenzimáticas, moleculares e ultraestruturais em camarões dulcícolas do gênero Macrobrachium

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)