Fish lost at sea: the effect of soak time on pelagic longline catches

Our analyses of observer records reveal that abundance estimates are strongly influenced by the timing of longline operations in relation to dawn and dusk and soak time— the amount of time that baited hooks are available in the water. Catch data will underestimate the total mortality of several species because hooked animals are “lost at sea.” They fall off, are removed, or escape from the hook before the longline is retrieved. For example, longline segments with soak times of 20 hours were retrieved with fewer skipjack tuna and seabirds than segments with soak times of 5 hours. The mortality of some seabird species is up to 45% higher than previously estimated. The effects of soak time and timing vary considerably between species. Soak time and exposure to dusk periods have strong positive effects on the catch rates of many species. In particular, the catch rates of most shark and billfish species increase with soak time. At the end of longline retrieval, for example, expected catch rates for broadbill swordfish are four times those at the beginning of retrieval. Survival of the animal while it is hooked on the longline appears to be an important factor determining whether it is eventually brought on board the vessel. Catch rates of species that survive being hooked (e.g. blue shark) increase with soak time. In contrast, skipjack tuna and seabirds are usually dead at the time of retrieval. Their catch rates decline with time, perhaps because scavengers can easily remove hooked animals that are dead. The results of our study have important implications for fishery management and assessments that rely on longline catch data. A reduction in soak time since longlining commenced in the 1950s has introduced a systematic bias in estimates of mortality levels and abundance. The abundance of species like seabirds has been over-estimated in recent years. Simple modifications to procedures for data collection, such as recording the number of hooks retrieved without baits, would greatly improve mortality estimates.

酵母拮抗菌的抑病效力、规模化培养及相关机理研究

我们实验室从果实表面分离获得的酵母拮抗菌已经证明能有效防治各种果实采后主要病害，为了加快生物拮抗菌的商业化应用，本文在完善拮抗菌抑病机理的基础上，重点研究了拮抗菌规模化培养条件，生物菌剂制品的稳定性，以及拮抗菌对环境胁迫的生理反应。主要研究内容包括：（1）分析酵母菌拮抗菌、病原菌与果实之间的互作效应及其影响因子;（2）筛选酵母拮抗菌规模化培养的最佳营养配方及培养条件;（3）优化酵母拮抗菌干粉与液体剂型的制备方式;（4）研究酵母拮抗菌在不同剂型中生活力下降的可能机理;（5）探讨酵母拮抗菌次生代谢产物的抑菌效果。研究结果如下： 1、单独接种Monilinia fructicola或同时接种M. fructicola和Cryptococcus laurentii均能诱导甜樱桃果实SOD、CAT和POD等抗氧化酶活性升高并加速脂质过氧化，同时伴有PPO同工酶新酶带出现。病原菌M. fructicola和Penicillum expansum在接种初期均显著促进拮抗菌C. laurentii在桃果实伤口处的生长。C. laurentii在接种24h内显著抑制桃果实LOX活性、O2•-产生与H2O2积累。单独接种病原菌能显著诱导桃果实LOX活性升高，促进O2•-产生，但抑制H2O2积累。病菌侵染后果实中 O2•-增加，以及H2O2的降低可能是桃果实对病原菌侵染的一种生理应答方式。 2、抗坏血酸钠能显著提高C. laurentii对甜樱桃果实褐腐病的防治效果，较低浓度的拮抗菌（ 1×107 cells mL-1）与200mM抗坏血酸配合使用可以达到较高浓度拮抗菌（1×108 cells mL-1）单独使用对M. fructicola的防治效果。抗坏血酸钠的协同抑病机理可能是在抑制病原菌生长的同时，也抑制了果实的抗氧化酶活性，从而加速了脂质过氧化过程。 3、酵母菌产业化培养条件的筛选结果表明，不同拮抗菌对培养基中营养物质的需求不一样，培养所需的温度有差异。在120L发酵罐的中试实验表明两种拮抗菌采用筛选出的最佳培养条件均得到浓度大于1× 109 CFU mL-1的菌悬液。 4、保护剂种类是影响Rhodotorula glutinis 和 C. laurentii两种酵母拮抗菌冷冻干燥效果的最主要因素，但保护剂效果的发挥依赖于其浓度与酵母菌生长阶段。无菌水和PBS（100mM, pH5.8）可以作为拮抗菌C. laurentii液体剂型的有效保护剂，而柠檬酸钠（100mM, pH5.8）则诱导拮抗菌C. laurentii的生活力快速丧失。 5、酵母菌拮抗菌冻干制品的研究表明，在胁迫环境下酵母菌生活力快速丧失与大量产生活性氧有关，这暗示活性氧的产生可能是导致酵母菌细胞死亡的主要因素。柠檬酸钠（100mM, pH5.8）对C. laurntii死亡的诱导效应受柠檬酸根浓度和介质酸度的双重影响。活性氧在柠檬酸钠诱导酵母菌生活力快速丧失中大量产生并发挥重要作用。 6、酵母拮抗菌能够产生某些对果实采后病原真菌具有抑制效果的挥发性和不挥发性物质。同一种酵母菌产生的物质对不同病原菌有不同的拮抗效果，而不同酵母菌对同一种病原菌的拮抗效果也不完全相同。但是，不同类型的培养基对拮抗菌产生的抑菌物质有明显的影响。

鄂尔多斯高原生物多样性研究

本文根据不同尺度的时空耦合，结合生物地球化学特征，气候梯度分析，人类土地利用方式等多种方法'探讨了鄂尔多斯高原生物多样性的格局和原因。生物多样性的维持、生物多样性的生态系统功能表现，以及鄂尔多斯高原对全球变化的响应模式等问题。在时间大尺度上，探讨了第四纪更新世冰期一间冰期循环模式，全新世稳定气候期的气候突变以及人类干扰历史对生物多样性的影响，在时间小尺度上，探讨j．群落演替过程以及生物多样性的变化规律;在空间大尺度上，探讨了鄂尔多斯高原与青藏高原在气候变化上的长程相关关系，并初步分析了全球变化如何通过青藏高原对鄂尔多斯高原产生重要影响的机制;在中等空间尺度上，选择了一条横贯鄂尔多斯高原的生态样带，探讨水分梯度和人类土地利用方式对生物地球化学特征、生物多样性在生态过渡的特点与生物多样性的关系的影响以及控制样带生物多样性的气候因子，生态系统功能特征与生物多样性的关系：在空间小尺度上，探讨了残留植被类型生物多样性的特征，从而为台理评价人类干扰对生物多样性的影响打下基础。通过上述各方面的研究得出如下主要结果： 1．研制BPAS(Biodiversity Pattem Analvsis System)软件，该软件是本研究项目数据管理、分析，模拟及显示的基础，并且用BPAS软件模拟了鄂尔多斯高原年降雨量，年温度、海拔高度，可能蒸散率，辐射干燥度，第一性生产力等生态背景变量分布形式。 2．发现在鄂尔多斯高原距今5000aBP左右的时间存在一次强烈的荒漠化过程，这一过程对鄂尔多斯高原的生物多样性和人类物质文明都产生巨大的影响。该过程可能是一次全球性的短期急剧降温造成的，应属于全新世气候适宜期的气候突变事件。 3．发现了两处残留植被，分别指示森林或森林草原和典型草原的地带性状况，根据春季干燥度模拟了油松林的潜在分布区，并用残存林区的地理位置进行验证，结果证明模拟效果良好。此外，发现鄂尔多斯高原春季干燥度的分布形式与辐射干燥度的分布形式相当吻合。 4．荒漠化是鄂尔多斯高原生物多样性丧失的最重要的原因。气候变化是鄂尔多斯高原荒漠化的最重要的自然驱动力，冰期一间冰期的循环振荡是导致鄂尔多斯高原生物多样性激烈变化的原因． 5．根据古孢粉分析，古地球化学特征研究、残留植被、油松林潜在分布区模拟以及有关的历史文献资料分析，初步推断匈奴时期以来在气候格局上并没有发生很大的变迁，这段时间的生物多样性丧失主要应归昝于人类干扰造成的荒漠化后果． 6．提出了判断生态过渡带的客观、合理的数量化方法，并在鄂尔多斯高原的实际应用中效果良好用土壤的可供给水量指标代替大气降雨量对Holdridge系统进行修正，从而使Holdridge系统更加具有生物生态学意义，并且可以用来解释小尺度的植被类型格局和评估人类干扰作用的效果． 7．影响生物多样性的因子作用大小排序：人类干扰>土壤结合太阳能）辐射干燥度>可能蒸散率>净第一性生产力>生物温度>年均降雨。 8．根据样带水分梯度，分析了75种植物的生态幅度，生态位重叠情况;并对主要的植物类群进行了沿水分梯度的分化研究。 9．模拟了未来全球变化在年均温度升高2℃，降雨提高10%，降雨提高20%和40%三种变化模式下,自然系统、过度放牧条件下的系统和人为荒漠化下的三种不同生态系统的响应模式。

Inter-regional correlation in tree-growth variations in the western United States, 1513-1964, at ENSO, sunspot, and longer frequency bands

Cross-spectral analysis of regional tree-ring data suggests the spatial pattern of correlation between moisture variations in the Sierra Nevada of central California and in other parts of the western United States is frequency dependent. Short wavelengths (2.8 to 10.7 years), perhaps associated with El Niño/Southern Oscillation, are strongly coherent both to the north (Oregon) and to the south (Southern California). Longer wavelengths (45 to 75 years) are strongly coherent only to the north. Frequency bands corresponding to annual sunspot series were associated with relatively weak patterns of spatial correlation.

神农架地区米心水青冈林和锐齿槲栎林的格局与过程

本文对神农架地区广泛分布的米心水青冈林和锐齿槲栎林的种群和群落学特征、干扰历史、更新策略、生物量、生产量及元素循环特征进行了研究。得到如下结论： 1 米心水青冈林是神农架地区山地垂直分布的地带性植被类型，主要群落学特征为：（1）建群种明显，该区域主要有2种类型，即米心水青冈林和米心水青冈、锐齿槲栎林;（2）群落结构简单，但物种组成丰富，在6600m~2样地中出现高等植物（不含苔藓植物）77科150属271种，组成种类以蔷薇科、百合科、忍冬科、虎耳草科、樟科、杜鹃花科和壳斗科为主;（3）群落乔木层（占重要值的12％）和灌木层（占盖度的15％）中含有一定比例的常绿树种;（4）群落生活型以高位芽植物（70.89%）占绝对优势，其次为地面芽植物（15.50%）和地下芽植物(12.92%)。 2 米心水青冈是多主干的树种，萌枝现象普遍，但萌枝数量不同地点差异较大。通过萌枝产生的枝群体平均密度为257 ± 99.3n•hm~(-2)。枝群体的年龄结构表现为“幼龄个体数目较多型”和“中国年龄阶段数目较多型”，并且有较多的枝群体表现出一致的年龄结构。从整个群落米心水青冈的年龄结构来看，表现出发展型种群的特点。枝群体的分布格局为随机分布。9丛米心水青冈完整的年轮分析结果表明，它们萌枝的时间不是边疆的，而与森林的受干扰有关。根据83个圆盘和生长锥芯资料，米心水青冈在萌枝后成长为乔木层或林冠层的过程中，径向生长表现为5种模式。这是丛株内竞争的结果。萌枝在米心水青冈林的维持和发展过程中，具有重要的生态学作用。 3 锐齿槲栎林是神农架地区山地垂地分布的地带性植被类型，主要群落学特征为：（1）建群种明显，该区域主要有2种类型，即锐齿槲栎林和锐齿槲栎、米心水青冈林;（2）群落乔木层和灌木层中含有一定比例的常绿树种，和暖温带的落叶栎林有较大差异;（3）群落物种组成丰富，不仅具有典型的温带科属，还有典型亚热带分布的科属，组成种类主要以蔷薇科、百合科、忍冬科、虎耳草科、山茱萸科、杜鹃花科、壳斗科和樟科;（4）生活型以高位芽植物（66.32%）占绝对优势，其次为地面芽（23.51%）和地下芽（9.47%）植物。 4 通过样地调查、树干解析及直径分析法，对米心水青冈林和锐齿槲栎林受压和释压历史及更新策略进行了研究。米心水青冈直径生长表现为5种模式。而锐齿槲栎只表现为2种模式。85.9 ± 6.9%的米心水青冈有过受压过程，平均受压2.1 ± 0.8次，平均受压时间为47 ± 24.1a，最长受压时间73a，平均释压次数为1.6 ± 0.7次，平均释压时间为23 ± 21.5a，而60.83%的锐齿槲栎都均有1次受压。平均受压时间为19 ± 14a，受压后没有表现出释压过程。结合高生长和径向生长，认为米心水青冈是耐阴树种，它的更新策略是在林下形成苗性萌枝，在有林窗形成时释压生长进入乔木层;而锐齿槲栎是不耐阴树种，它的更新策略是通过产生大量种子，当有大的林窗时，幼苗在林窗内生长逐步进入乔木层。 5 神农架地区102-130a成熟米心水青冈林的生物量在251.31-358.63T•hm~(-2)之间，平均为288.70 ± 48.30T•~(-2)，20-60a锐齿槲栎林群落生物量在134.85-301.20T•hm~(-2)，平均为231.60 ± 78.10T•hm~(-2)。虽然米心水青冈林和锐齿槲栎林灌木层草本层及藤本植物组成很丰富，但二种类型森林生物量的95％以上集中在乔木层。乔木层生物量主要集中在少数优势种中。在米心水青冈林生物量从大到小的序列中，前5种植物分别占乔木层总生物量58.67%-96.37%不等，同样锐齿槲栎林前5种植物占群落生物量的68.13%-95.26%。常绿植物占乔木层生物量的比例变化较大，米心水青冈林中占2.85-18.70%，锐齿槲栎林中一般常绿植物占0.8-9.98%，只有1个锐齿槲栎林样地常绿植物（主要是粉白杜鹃）占乔木层生物量的44.04%。米心水青冈林生物量根冠比为0.27 ± 0.05，锐齿槲栎林为0.21 ± 0.06。神农架地区米心水青冈林的生物量，在成熟的欧洲水青冈林及日本的水青冈林生物量范围之内，而锐齿槲栎林生物量远远大于我国温带落叶栎林的生物量。 6 神农架地区102-130a米心水青冈林生产量范围在1857-2786g•m~(-2)•a~(-1)，平均为2330 ± 397 g•m~(-2)•a~(-1)。20-60a锐齿槲栎林的生产量范围在1319-2521 g•m~(-2)•a~(-1)，平均为1930 ± 498 g•m~(-2)•a~(-1)。米心水青冈林和锐齿槲栎林乔木层生产量占群落总生产量的95％以上，乔木层各器官生产量大小顺序为叶> 树干> 枝和根，其中叶生产量占乔木层的一半以上，达53.87 ± 2.72%（米心水青冈林）和57.31 ± 6.23%（锐齿槲栎林）。在乔木层生产量从大到小的序列中，前5种植物平均占乔木层总生产量的81.03 ± 13.94%（米心水青冈林，范围在62.75%-92.66%）和84.23 ± 9.68%（锐齿槲栎林，范围在68.54-95.11%）。米心水青冈林和锐齿槲栎林群落地下部分生产量占总生产量的比例分别为11.29 ± 1.02%和9.22 ± 2.72。和我国其它地区地带性植被类型相比。米心水青冈林和锐齿槲栎生产量是较高的，和亚热带绿阔叶林生产量接近，但在器官分配上两者差异较大。 7 米心水青冈林和锐齿槲栎林土壤均呈酸性。其中锐齿槲栎林地土壤酸性更强。土壤元素特征表现为Al>C>K>Mg>Ca>N>S、P的特点，富铝化作用明显。8种元素在群落优势植物不同部位含量差异较大，N、P、K、Ca、Mg基本上是以叶片含量最高，树干或根中最低。仅从叶片来看，元素特征表现为C>Ca、N>K>Mg>S>P、Al。优势植物的C/N和C/P显著高于暖温带落叶阔叶林优势植物。8种元素在米心水青冈林和锐齿槲栎林中积累量分别为147.09 ± 25.60和116.00 ± 37.63 Mg hm~(-2)a~(-1)，其中97％以上积累在群落乔木层。两种森林类型各元素的积累量都表现为C>Ca, N> K> Mg> P> S> Al的特点。米心水青风林和锐齿槲栎林8种元素的年存留量分别为6263 ± 90.8和5946 ±246 kg hm~(-2)a~(-1),其中N、P、K、Ca、Mg 5种主要营养元素的存留量分别为179.7 ± 18.2和169.4 ± 23.5kg hm~(-2) a~(-1)。两种森林类型各元素的存留量都表现为C> N> Ca> K> Mg> S> P> Al。

Anomalies in North American climate: the South Asian-tropical west Pacific connection

How do tropical heating fluctuations create North American climate anomalies? We propose some answers using the results from a simplified global atmospheric model. We find that the South Asian-tropical west Pacific area is especially effective at stimulating North American responses. The relatively strong tropical/extratropical interaction between these two areas is the result of two major processes acting on the Rossby wave signal induced by the tropical heating fluctuations. These factors are: 1) Wave guiding by the Asian-north Pacific subtropical jet; and 2) Wave amplification within unstable regions of the jet flank. These factors allow relatively small, remote, and short-term tropical fluctuations to have relatively large impacts on North American climate.