Determinação de genes potencialmente responsivos à radiação ionizante através de aprendizado de máquina

A predição da resposta do tumor a radioterapia e a questão mais importante durante o tratamento de pacientes com câncer. Como consequência, a predição de genes que sejam responsivos a radiação ionizante e uma possibilidade para a melhoria dos resultados clínicos e a otimização das doses as quais os pacientes são submetidos ao longo do tratamento. Juntamente com esses dados, é possível obter respostas sobre os mecanismos de resistência a radiação dos tumores e até mesmo a identificação de biomarcadores responsáveis pela resistência a radiação ionizante que podem ser potenciais para o desenvolvimento de novas drogas visando a proteção de tecidos saudáveis. A determinação experimental dos genes que sejam responsivos à radiação ionizante é algo caro e que demanda muito tempo e trabalho; porém, se utilizarmos uma forma computacional de direcionar os estudos experimentais diretamente aos genes que têm mais potencial para serem responsivos à radiação ionizante, as pesquisas podem ser mais direcionadas e específicas. Para determinar essa característica, construímos, analisamos e determinamos os dados da topologia da rede integrada de interações moleculares entre genes humanos, contendo interações físicas entre proteínas, interações metabólicas e interações de regulação transcricional. Os dados topológicos foram utilizados como atributos de treinamento para o aprendizado de máquina, no qual os genes conhecidamente responsivos à radiação ionizante foram apresentados a um algoritmo de árvore de decisão que gerou modelos de predição com índices de sensibilidade e precisão de 5% e 72%, respectivamente. Os índices de acerto obtidos para os conjuntos de teste foram satisfatórios, retornando 91% dos genes conhecidos como responsiveis à radiação ionizante utilizados para o treinamento da árvore de decisão. Nós aplicamos o modelo de predição na rede integrada e atribuímos probabilidades ...

Biofilme estafilocócico: prevenção, detecção da produção e determinação do perfil de resistência a antimicrobianos

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Uso de microarray para determinação da expressão gênica diferencial em oócitos Bos Taurus Indicus e Bos Taurus Taurus submetidos ao estresse térmico

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Determinação eletroanalítica e cromatográfica do corante solvente azul 14 em amostras de combustíveis

Métodos comparativos foram desenvolvidos para detectar e quantificar o corante solvente azul 14 (SA-14) em amostras de combustíveis. O método eletroanalítico foi baseado na técnica de voltametria de onda quadrada (VOQ) com detecção em +0,60 V vs. Ag/AgCl sobre o eletrodo de carbono vítreo, usando tampão Britton-Robinson e N, N-dimetilformamida (1:1, v/v) como eletrólito suporte. Para metodologia, envolvendo a cromatografia líquida de alta performance (CLAE) foi empregada uma fase móvel composta de acetonitrila e cloreto de lítio (85:15, v/v) e a detecção eletroquímica foi realizada em um potencial de oxidação em +0,65 V vs. Ag/AgCl. Sob as melhores condições de trabalho curvas de calibração foram obtidas, para ambos os métodos, as quais foram lineares na faixa de concentração de 5,0×10 -7 a 6,0×10 -6 mol L-1 (VOQ) e 8,0×10 -8 a 3,0×10 -6 mol L-1 (CLAE). Os métodos foram aplicados para quantificar o corante em amostras de álcool e querosene após um simples processo de extração em fase sólida com resultados de recuperação satisfatórios.

Atividade antioxidante e determinação de fenóis totais, carotenoides, betacarotenos, licopeno e zinco em variedades branca, amarela e rosada de Manihot Esculenta Crantz

There are cassava varieties that present compounds as carotenoids, beta-carotene, lycopene and minerals important for human and animal health. The present study evaluated the antioxidant activity of the white, yellow and pinkish varieties of Manihot esculenta, by mean of the DPPH test and by the ferrous ion-chelating activity. Furthermore, the total phenols, carotenoids, beta-carotene, lycopene and zinc contents were also determined. Utilizing the DPPH test it was possible to find that extracts of boiled samples presented higher antioxidant activity (89.53% - pinkish) in comparison to the fresh samples (1.97% - white). For the ferrous ion-chelating test, the highest activity was found for the boiled pinkish variety extract (63.43%) and the lowest was for fresh yellow extract (17.34%) the white sample did not present activity. The highest concentration of total phenols and zinc content was obtained for the boiled pinkish variety extract 136.12 mg EAG/g of extract and 0,811ppm, respectively, in the concentration of 1000 µg/mL. The pinkish variety presented also higher quantity of pigments, including carotenoid (29.40 µg/g), beta-carotene (9.14 µg/100g) and lycopene (68.92%). According to the results obtained in this study it was possible to conclude that the yellow and pinkish varieties of M. esculenta present quantity of phenolic compounds and minerals sufficient to attribute the antioxidant activity and may thus contribute to reduce oxidative damage and be used as nutraceuticals or directly ingested in the diet to maintain good health.

Distribuição espacial e determinação da depreciação quantitativa e qualitativa causada por Tetranychus ogmophallos (Acari: Tetranychidae) ao amendoinzeiro

Pós-graduação em Agronomia (Entomologia Agrícola) - FCAV

Determinação do tempo de vida de restaurações totalmente cerâmicas (y-tzp/porcelana) com incidência da carga em diferentes regiões de contato

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Determinação de chumbo em tubos de raios catódicos e em solo contaminado por espectrometria de absorção atômica

Pós-graduação em Ciência dos Materiais - FEIS

Determinação de áreas prioritárias para conservação na zona de amortecimento de UC de proteção integral: o caso da Estação Ecológica de Ribeirão Preto, SP

Observa-se como estratégia mundial para a conservação da biodiversidade a criação de unidades de conservação. No Brasil, especificamente no Estado de São Paulo, devido a intensa degradação da Mata Atlântica, verifica-se a criação de unidades de proteção integral, a fim de se preservar de modo restrito os recursos naturais que ainda lhe restam. Na cidade de Ribeirão Preto, uma região com alto desempenho agrícola e intensa expansão urbana, constata-se a presença de uma Estação Ecológica (EERP), fragmento florestal de 154,16 ha, altamente isolado e fragmentado. Assim, a EERP e sua zona de amortecimento (ZA) vêm sendo fortemente pressionada pela expansão urbana e agrícola da região, comprometendo a sua integridade ecossistêmica. Dentre os impactos negativos gerados destacam-se: alta especulação imobiliária e o intenso cultivo de monoculturas, que contribuem para a degradação do solo nas regiões do entorno. A fim de se reduzir tais impactos, o presente trabalho buscou apresentar um prognóstico de planejamento ambiental para a ZA da EERP, a qual se encontra altamente impactada, segundo os critérios definidos por Ranieri (2004). Desse modo, criou-se cenários ideais para a preservação dos recursos naturais do local

Ensaios laboratoriais para a determinação da resistência de conexão entre geogrelhas de PVA e blocos segmentais

During the retaining wall project in soil reinforced with geogrids and face milling system for segmental blocks is essential to determine the maximum connection resistance between the block and the geogrid. Thus, the aim of this study was to analyze the connection resistance based on ASTM D- 6638-01 between the segmental block model MW of Muros Terrae® company with the geogrids model Fortrac® M 35 / 20x20, Fortrac® M 55 / 30x20, Fortrac® M 80 / 30x20 and Fortrac® M 110 / 30x20 of HUESKER Synthetic GmbH using gravel 1 as a filling material. As a result, the resistance curves were obtained for the four models of geogrids and was described how it fracture. An additional investigation was the average gain connection resistance percentage when it is applied to geogrid a second layer instead of a single layer. The average percentage gains in the connection resistance to the geogrids model Fortrac® M 35 / 20x20, Fortrac® M 55 / 30x20, Fortrac® M 80 / 30x20 and Fortrac® M 110 / 30x20 were, respectively, 63.20 %, 63, 47%, 62.23 % and 51.34 %. Finally, we made a comparative analysis of the results of this study with those obtained by Guimarães (2006), Urashima et. al (2008) and Almeida and Toma (2011) to evaluate which combinations offered higher connection resistance

Otimização de um método analítico para determinação de ácidos graxos em plasma sanguíneo de rato

This work has as main theme optimize the method of determination of fatty acids such as methyl octanoate, methyl palmitate, methyl stearate, methyl oleate, methyl linoleate and methyl linolenate in blood plasma samples from mice. The method proved to be very suitable for the analysis, in which we obtained the following linear coefficients: 0.9992, 0.9989, 0.9996, 0.9995, 0.9999 for methyl linoleate acid, methyl oleate, methyl palmitate, methyl stearate and methyl octanoate, respectively. Esterification of the samples gave good reading of chromatograms of samples without interfering peaks. The results obtained were as expected from the diet of mices

Validação de metodologia analítica para determinação de residual de detergente alcalino

O presente trabalho foi realizado nas dependências da FURP (Fundação para o Remédio Popular) de Américo Brasiliense - SP, com o objetivo de validar o método de determinação para residual de detergente alcalino nos equipamentos de revestimento de comprimidos. O trabalho foi desenvolvido no laboratório do Controle de Qualidade da FURP. A validação de limpeza é um tema pouco visto durante o curso de graduação em Farmácia - Bioquímica, porém bastante importante dentro da Indústria Farmacêutica. O processo de limpeza dos equipamentos utilizados na indústria farmacêutica deve ser validado para garantir a qualidade dos produtos. Determinar o residual de um produto de limpeza em um equipamento assegura que o agente de limpeza usado no processo, no caso o detergente alcalino, esteja em uma quantidade dentro do limite aceitável após a limpeza do equipamento. Primeiramente, validou-se o método analítico utilizado para determinar a quantidade de resíduo através da condutividade. Foram analisados os parâmetros linearidade, precisão e especificidade, que se encontraram dentro do limite permitido. Também foi realizado o estudo de recuperação (recovery) do resíduo de detergente do equipamento para confirmar a eficácia da técnica de amostragem juntamente com o método analítico quantitativo escolhido. Após a validação da metodologia analítica quantitativa e o estudo de recuperação foi possível definir um procedimento adequado para a análise do residual de detergente alcalino nos equipamentos submetidos ao processo de limpeza. Juntamente com o setor de Garantia da Qualidade, também foi realizado o estudo de validação da limpeza dos equipamentos da linha de sólidos da FURP (unidade Américo Brasiliense), neste estudo foi avaliado se o procedimento de limpeza estava sendo eficiente e também foi possível fazer a determinação de residual de detergente alcalino presente no equipamento após amostragem com swab, ...

Determinação de fatores de correção da intensidade de limiar anaeróbio em diferentes séries de treinamento intermitente na natação

Pós-graduação em Ciências da Motricidade - IBRC

Determinação molecular da viabilidade do Mycobacterium leprae: uma comparação com outras abordagens metodológicas

Pós-graduação em Doenças Tropicais - FMB