Infinite push: a new support vector ranking algorithm that directly optimizes accuracy at the absolute top of the list

Ranking problems have become increasingly important in machine learning and data mining in recent years, with applications ranging from information retrieval and recommender systems to computational biology and drug discovery. In this paper, we describe a new ranking algorithm that directly maximizes the number of relevant objects retrieved at the absolute top of the list. The algorithm is a support vector style algorithm, but due to the different objective, it no longer leads to a quadratic programming problem. Instead, the dual optimization problem involves l1, ∞ constraints; we solve this dual problem using the recent l1, ∞ projection method of Quattoni et al (2009). Our algorithm can be viewed as an l∞-norm extreme of the lp-norm based algorithm of Rudin (2009) (albeit in a support vector setting rather than a boosting setting); thus we refer to the algorithm as the ‘Infinite Push’. Experiments on real-world data sets confirm the algorithm’s focus on accuracy at the absolute top of the list.

Phase-field elasticity model based on mechanical jump conditions

Computational models based on the phase-field method typically operate on a mesoscopic length scale and resolve structural changes of the material and furthermore provide valuable information about microstructure and mechanical property relations. An accurate calculation of the stresses and mechanical energy at the transition region is therefore indispensable. We derive a quantitative phase-field elasticity model based on force balance and Hadamard jump conditions at the interface. Comparing the simulated stress profiles calculated with Voigt/Taylor (Annalen der Physik 274(12):573, 1889), Reuss/Sachs (Z Angew Math Mech 9:49, 1929) and the proposed model with the theoretically predicted stress fields in a plate with a round inclusion under hydrostatic tension, we show the quantitative characteristics of the model. In order to validate the elastic contribution to the driving force for phase transition, we demonstrate the absence of excess energy, calculated by Durga et al. (Model Simul Mater Sci Eng 21(5):055018, 2013), in a one-dimensional equilibrium condition of serial and parallel material chains. To validate the driving force for systems with curved transition regions, we relate simulations to the Gibbs-Thompson equilibrium condition

Orientación estratégica, innovación y resultados en PYMES de nueva creación: el rol del marketing

[ES] A pesar del importante papel de las PYMES de nueva creación en el desarrollo económico, no tenemos constancia de trabajos que hayan abordado de manera simultánea el estudio de la relación entre tres orientaciones estratégicas clave como son la orientación emprendedora (OE), la orientación al mercado (OM) y la orientación al aprendizaje (OA) con la innovación y con el éxito de las PYMES de nueva creación. Los trabajos existentes en la actualidad son de carácter parcial, ya que se limitan a estudiar los efectos de sólo algunas de estas tres orientaciones estratégicas en los resultados de dichas empresas (Li y Atuahene-Gima, 2001; Renko et al., 2009).

Role of G protein coupled inwardly rectifier K+ channels (GIRK) on the neurobiology depression

353 págs.

Addressing and adapting to contemporary coastal management issues in the central Philippines

With arguably the world’s most decentralized coastal governance regime, the Philippines has implemented integrated coastal management (ICM) for over 30 years as one of the most successful frameworks for coastal resource management in the country. Anthropogenic drivers continue to threaten the food security and livelihood of coastal residents; contributing to the destruction of critical marine habitats, which are heavily relied upon for the goods and services they provide. ICM initiatives in the Philippines have utilized a variety of tools, particularly marine protected areas (MPAs), to promote poverty alleviation through food security and sustainable forms of development. From the time marine reserves were first shown to effectively address habitat degradation and decline in reef fishery production (Alcala et al., 2001) over 1,100 locally managed MPAs have been established in the Philippines; yet only 10-20% of these are effectively managed (White et al., 2006; PhilReefs, 2008). In order to increase management effectiveness, biophysical, legal, institutional and social linkages need to be strengthened and “scaled up” to accommodate a more holistic systems approach (Lowry et al., 2009). This summary paper incorporates the preliminary results of five independently conducted studies. Subject areas covered are the social and institutional elements of MPA networks, ecosystem-based management applicability, financial sustainability and the social vulnerability of coastal residents to climate change in the Central Philippines. Each section will provide insight into these focal areas and suggest how management strategies may be adapted to holistically address these contemporary issues. (PDF contains 4 pages)

Climate change adaptation through coastal and use management: The context of environmental justice

Despite an increasing literary focus on climate change adaptation, the facilitation of this adaptation is occurring on a limited basis (Adger et al. 2007) .This limited basis is not necessarily due to inability; rather, a lack of comprehensive cost estimates of all options specifically hinders adaptation in vulnerable communities (Adger et al. 2007). Specifically the estimated cost of the climate change impact of sea-level rise is continually increasing due to both increasing rates and the resulting multiplicative impact of coastal erosion (Karl et al., 2009, Zhang et al., 2004) Based on the 2007 Intergovernmental Panel on Climate Change report, minority groups and small island nations have been identified within these vulnerable communities. Therefore the development of adaptation policies requires the engagement of these communities. State examples of sea-level rise adaptation through land use planning mechanisms such as land acquisition programs (New Jersey) and the establishment of rolling easements (Texas) are evidence that although obscured, adaptation opportunities are being acted upon (Easterling et al., 2004, Adger et al.2007). (PDF contains 4 pages)

Estudo do comportamento de modelo de circuito de memória imediata

A modelagem matemática e computacional é uma ferramenta que tem sido bastante utilizada no campo da Biologia e das Ciências Biomédicas. Nos dias de hoje, uma quantidade significativa de dados experimentais nessa área pode ser encontrada na literatura, tornando possível o desenvolvimento de modelos que combinem a experimentação e hipóteses teóricas. O objetivo do presente projeto é implementar um modelo matemático de transmissão sináptica conectando neurônios em um circuito de descargas repetitivas ou reverberativo, a fim de investigar o seu comportamento diante de variações paramétricas. Através de simulações computacionais, utilizando um programa desenvolvido em linguagem C++, pretende-se utilizá-lo para simular um circuito de memória imediata. Afora o considerável avanço da Neurofisiologia e Neurociência computacional no sentido do entendimento das características fisiológicas e comportamentais das habilidades do Sistema Nervoso Central, muitos mecanismos neuronais ainda permanecem completamente obscuros. Ainda não se conhece definitivamente o mecanismo pelo qual o cérebro adquire, armazena e evoca as informações. Porém, o postulado de Hebb referente às redes reverberantes, onde a idéia de que redes de reverberação facilitariam a associação de dados coincidentes entre informações sensoriais, temporalmente divergentes, tem sido aceito para explicar a formação de memória imediata (Johnson et al., 2009). Assim, com base no postulado de Hebb, os resultados observados no modelo neuromatemático-computacional adotado possuem características de um circuito de memória imediata.

A expressão do objeto direto anafórico na aquisição bilíngue simultânea de português brasileiro e inglês: uma investigação sobre o parâmetro do objeto nulo

A presente investigação se volta para a expressão de objeto direto anafórico (ODA) na produção de dados espontâneos de aquisição bilíngue simultânea (BFLA Bilingual First Language Acquisition) de Português Brasileiro (PB) e de inglês. A literatura em BFLA tem assumido que as duas línguas são adquiridas de maneira independente (DE HOUWER, 1990, 2005; PARADIS; GENESEE, 1996), porém indica que pode haver momentos de interação entre os dois sistemas linguísticos, resultando em transferência entre propriedades paramétricas das línguas (HULK; MÜLLER, 2000; MÜLLER; HULK, 2001; PÉREZ-LEROUX, et al 2009 ; STRIK; PÉREZ-LEROUX, 2011; SORACE, 2011). Essa investigação é conduzida com base na teoria de Princípios & Parâmetros (CHOMSKY, 1981) do Gerativismo, reformulada com o Programa Minimalista (CHOMSKY, 1995). PB e inglês se diferenciam em relação à marcação paramétrica para ODA: o PB admite objeto nulo anafórico (ON) e o inglês não. A hipótese de trabalho adotada é de que haverá transferência do PB para o inglês. Dois tipos de categorias nulas são observados: objetos nulos dêitico (Odeit) e anafórico (ON). Assume-se que a manifestação do primeiro tipo indica um estágio default universal, que constituiria uma estratégia facilitadora (RIZZI, 2005). A possibilidade de uso de ONs agramaticais no inglês é concebida como resultado da presença de dados ambíguos, que reforçariam essa possibilidade equivocadamente no inglês, em consonância com o defendido em Hulk & Müller (2000) e Müller & Hulk (2001). Assume-se, ademais, que as restrições semânticas que regem a distribuição das formas possíveis para ODA no PB (CYRINO, 2006; LOPES, 2009) só poderiam ser detectadas em uma faixa etária mais alta. São analisados dados espontâneos de três bilíngues simultâneos (N, L e A) em interação com seus pais. N foi acompanhado dos 2;1,18 aos 3;8,24 anos de idade, enquanto L foi acompanhada dos 2;5,30 aos 3;1,1 anos e A foi acompanhado dos 3;2,6 aos 3;8,26 anos. As manifestações de ODA foram identificadas e classificadas em DP, pronome, ON e ODeit. Comparando os bilíngues, constatou-se que cada criança parece estar em um momento de aquisição: N apresenta instâncias de ODeit em contextos imperativos e pronomes aparecem apenas no inglês aos 2;5,2 anos. L tem preferência por DPs nas duas línguas e usa pronomes apenas na língua inglesa. Aos 2;6,22 anos, surgem instâncias de ON com mais frequência no PB, mas também no inglês. A criança A apresenta todos os tipos de preenchimento de ODA e ONs aparecem nas duas línguas. Os dados indicam que ONs agramaticais estão presentes no inglês, sugerindo que há transferência do PB para o inglês

A influência do metabolismo redox na transmissão da doença de Chagas

As formas epimastigotas de Trypanosoma cruzi proliferam e se diferenciam no interior de diferentes compartimentos do trato digestivo dos triatomíneos. Esses ambientes antagônicos, no que diz respeito à concentração de nutrientes, pH e status redox, constituem um desafio para o protozoário por conterem moléculas e fatores capazes de deflagrar diferentes sinalizações e respostas no parasito. Por isso, testamos a influência de produtos abundantes do metabolismo do vetor e de status redox distintos, frente aos processos de proliferação e diferenciação in vivo e in vitro. Como exemplo temos o heme e a hemozoína, subprodutos da digestão da hemoglobina, e o urato, rico na urina dos insetos. O heme é uma importante molécula em todos os seres vivos. Nosso grupo mostrou seu papel na proliferação in vitro de T. cruzi e que esse sinal é governado pela enzima redox-sensível CaMKII (Lara et al., 2007; Souza et al., 2009). Esse efeito parece depender de uma sinalização redox, onde o heme e não seus análigos induz a formação de EROs, modulando a atividade da CaMKII (Nogueira et al, 2011). Apesar de gerar espécies reativas de oxigênio (EROs) em formas epimastigotas, o heme não alterou a ultraestrutura desses parasitos mostrando uma adaptação a ambientes oxidantes. Al��m disso, a adição de FCCP inibiu a formação de EROs mitocondrial, diminuindo a proliferação dos parasitos. Em contrapartida, a AA aumentou drasticamente a produção de EROs mitocondrial levando à morte dos epimastigotas. Estes resultados confirmam a hipótese de regulação redox do crescimento de epimastigotas. A formação de β- hematina (hemozoína) constitui uma elegante estratégia para minimizar o efeito tóxico do heme nos insetos hematófagos. Contudo, a β-hematina não influenciou a proliferação ou a metaciclogênese in vitro. Já o urato, e outros antioxidantes clássicos como o GSH e o NAC prejudicaram a proliferação in vitro de epimastigotas. Estes efeitos foram parcialmente revertidos quando os antioxidantes foram incubados juntamente com o heme. Durante a metaciclogênese in vitro, o NAC e o urato induziram um aumento significativo das formas tripomastigotas e levaram a diminuição da porcentagem de formas epimastigotas. Em contrapartida, o heme e a β-hematina apresentaram o efeito oposto, diminuindo a porcentagem de formas tripomastigotas e aumentando a de epimastigotas. No intuito de confirmar a influencia do status redox na biologia do parasito in vivo, nós quantificamos a carga parasitária nas porções anterior e posterior e no reto do triatomíneo alimentado na presença ou na ausência de NAC e urato por qPCR. O tratamento com os antioxidantes aumentou a carga parasitária em todas as partes do intestino analisadas. Posteriormente, para diferenciar as formas evolutivas responsáveis pelo incremento da carga parasitária, foram realizadas contagens diferenciais nas mesmas porções do intestino do inseto vetor. Cinco dias após a infecção foi observado aumento significativo de formas tripomastigotas e diminuição de formas epimastigotas in vivo. Em conjunto, estes dados sugerem que, assim como a concentração de nutrientes e o pH, o status redox também pode influenciar a biologia do T. cruzi no interior do inseto vetor. Neste cenário, moléculas oxidantes agiriam a favor da proliferação, e em contraste, antioxidantes parecem favorecer a metaciclogênese.

Microanálise e geoquímica em testemunhos de corais como elementos de interpretação dos impactos das forçantes naturais e antrópicas sobre a costa do Brasil

Corais pétreos são formadores de recifes. Por secretarem carbonato de cálcio pela base de seus pólipos, esses corais zooxantelados formam um exoesqueleto, composto geralmente por cristais de aragonita. Os padrões de crescimento coralinos variam desde a escala sazonal a centenária e podem ser caracterizados pela medida da taxa de crescimento, a variabilidade dos isótopos estáveis de oxigênio e carbono e pelas razões elementares Sr/Ca, Mg/Ca, U/Ca, Cd/Ca, Ra/Ca (entre outras) em seu esqueleto. Em um contexto global, os recifes cumprem importante papel como sumidouros de carbono atmosférico. Diante das evidências de um oceano mais quente na era moderna, a temperatura da superfície do mar (TSM) tem sido considerada um importante fator de controle da calcificação e crescimento coralino. Geralmente, a calcificação tende a aumentar com a elevação da TSM dentro de uma estreita faixa aceitável para o funcionamento pleno do metabolismo coralino. Neste trabalho, desenvolveu-se uma re-análise das taxas de crescimento de testemunhos de corais amostrados na costa brasileira (Salvador-Ba - Baía de Todos os Santos, Parque Nacional Marinho dos Abrolhos-Ba e Armação dos Búzios-RJ) empregando-se uma combinação de bandas de crescimento (alta e baixa densidades) auxiliado pelo método de luminescência e datação por radioisótopos de U e Th. As diferenças nas cronologias para os dois métodos variou de 1 ano para o caso de Abrolhos até 7,4 anos para Búzios (em seções específicas do testemunho). Foram analisadas variações de calcificação no esqueleto coralino e interpretadas à luz das razões Sr/Ca e U/Ca (ambos próxies da TSM), séries climáticas de AMO e PDO, e pH pelágico oceânico. Identificamos uma diminuição na taxa de calcificação do exoesqueleto no tempo estudado na amostra de Salvador de 0,4 g/cm2, e um aumento em Abrolhos de 0,4 g/cm2 e Búzios 0,3 g/cm2, exceto nos anos de 1950 ao final de 1980 e de 1910 ao final de 1930, respectivamente. Uma microtomografia de raio-X foi empregada para determinar micro-estruturas coralinas, sendo os parâmetros mais relevantes a microporosidade e a anisotropia. Para Abrolhos e Búzios, foi identificado um aumento na porosidade total do exoesqueleto, principalmente no começo de 1940 até o fim da década de 1980 e entre 1890 a 1930 respectivamente. Notou-se forte associação entre a redução do padrão de calcificação com o aumento da porosidade. Os testemunhos da espécie Siderastrea stellata coletados em Abrolhos e Búzios mostraram alta associação das razoes Sr/Ca e U/Ca com a taxa de calcificação, caracterizando uma resposta similar a de outros autores para a Grande Barreira na Austrália (DE'ATH et al., 2009) e para a região central do Mar Vermelho (CANTIN et al., 2010). Em relação as razões Ba/Ca, Salvador e Abrolhos evidenciaram variáveis que contribuíram para este aumento como a forçante de produção de petróleo e aumento populacional (economia), e TSM (oceano). Para Búzios, a TSM (oceano), produção de petróleo, aumento populacional e NDVI (economia). Após os anos de 1990, o impacto dos fatores econômicos, al��m das variáveis oceânicas respondem mais significativamente o aumento da razão Ba/Ca em todos os sítios quase que concomitantemente na costa brasileira.

Saline-saturated DMSO-EDTA as a storage medium for microbial DNA analysis from coral mucus swab samples

The mucus surface layer of corals plays a number of integral roles in their overall health and fitness. This mucopolysaccharide coating serves as vehicle to capture food, a protective barrier against physical invasions and trauma, and serves as a medium to host a community of microorganisms distinct from the surrounding seawater. In healthy corals the associated microbial communities are known to provide antibiotics that contribute to the coral���s innate immunity and function metabolic activities such as biogeochemical cycling. Culture-dependent (Ducklow and Mitchell, 1979; Ritchie, 2006) and culture-independent methods (Rohwer, et al., 2001; Rohwer et al., 2002; Sekar et al., 2006; Hansson et al., 2009; Kellogg et al., 2009) have shown that coral mucus-associated microbial communities can change with changes in the environment and health condition of the coral. These changes may suggest that changes in the microbial associates not only reflect health status but also may assist corals in acclimating to changing environmental conditions. With the increasing availability of molecular biology tools, culture-independent methods are being used more frequently for evaluating the health of the animal host. Although culture-independent methods are able to provide more in-depth insights into the constituents of the coral surface mucus layer’s microbial community, their reliability and reproducibility rely on the initial sample collection maintaining sample integrity. In general, a sample of mucus is collected from a coral colony, either by sterile syringe or swab method (Woodley, et al., 2008), and immediately placed in a cryovial. In the case of a syringe sample, the mucus is decanted into the cryovial and the sealed tube is immediately flash-frozen in a liquid nitrogen vapor shipper (a.k.a., dry shipper). Swabs with mucus are placed in a cryovial, and the end of the swab is broken off before sealing and placing the vial in the dry shipper. The samples are then sent to a laboratory for analysis. After the initial collection and preservation of the sample, the duration of the sample voyage to a recipient laboratory is often another critical part of the sampling process, as unanticipated delays may exceed the length of time a dry shipper can remain cold, or mishandling of the shipper can cause it to exhaust prematurely. In remote areas, service by international shipping companies may be non-existent, which requires the use of an alternative preservation medium. Other methods for preserving environmental samples for microbial DNA analysis include drying on various matrices (DNA cards, swabs), or placing samples in liquid preservatives (e.g., chloroform/phenol/isoamyl alcohol, TRIzol reagent, ethanol). These methodologies eliminate the need for cold storage, however, they add expense and permitting requirements for hazardous liquid components, and the retrieval of intact microbial DNA often can be inconsistent (Dawson, et al., 1998; Rissanen et al., 2010). A method to preserve coral mucus samples without cold storage or use of hazardous solvents, while maintaining microbial DNA integrity, would be an invaluable tool for coral biologists, especially those in remote areas. Saline-saturated dimethylsulfoxide-ethylenediaminetetraacetic acid (20% DMSO-0.25M EDTA, pH 8.0), or SSDE, is a solution that has been reported to be a means of storing tissue of marine invertebrates at ambient temperatures without significant loss of nucleic acid integrity (Dawson et al., 1998, Concepcion et al., 2007). While this methodology would be a facile and inexpensive way to transport coral tissue samples, it is unclear whether the coral microbiota DNA would be adversely affected by this storage medium either by degradation of the DNA, or a bias in the DNA recovered during the extraction process created by variations in extraction efficiencies among the various community members. Tests to determine the efficacy of SSDE as an ambient temperature storage medium for coral mucus samples are presented here.

The Impact of Contract Type on Service Provider Information Requirements

This paper is concerned with the role of information in the servitization of manufacturing which has led to “the innovation of an organisation’s capabilities and processes as equipment manufacturers seek to offer services around their products” (Neely 2009, Baines et al 2009). This evolution has resulted in an information requirement (IR) shift as companies move from discrete provision of equipment and spare parts to long-term service contracts guaranteeing prescribed performance levels. Organisations providing such services depend on a very high level of availability and quality of information throughout the service life-cycle (Menor et al 2002). This work focuses on whether, for a proposed contract based around complex equipment, the Information System is capable of providing information at an acceptable quality and requires the IRs to be examined in a formal manner. We apply a service information framework (Cuthbert et al 2008, McFarlane & Cuthbert 2012) to methodically assess IRs for different contract types to understand the information gap between them. Results from case examples indicate that this gap includes information required for the different contract types and a set of contract-specific IRs. Furthermore, the control, ownership and use of information differs across contract types as the boundary of operation and responsibility changes.

Anomalous optical and electronic properties of dense sodium

Based on the density functional theory, we systematically study the optical and electronic properties of the insulating dense sodium phase (Na-hp4) reported recently (Ma et al., 2009). The structure is found optically anisotropic. Through Bader analysis, we conclude that ionicity exists in the structure and becomes stronger with increasing pressure.

Investigation of excited states in 22Mg via resonant elastic scattering of 21Na+p and its astrophysical implications

The excited states in 22Mg have been investigated by the resonant elastic scattering of 21Na + p.A 4.0 MeV/nucleon 21Na beam was separated by the Center for Nuclear Study (CNS) radioactive ion beam separator (CRIB) and then used to bombard a thick (CH2)n target. The energy spectra of recoiled protons were measured at scattering angles of θc.m. ≈ 172◦, 146◦, and 134◦, respectively. A wide energy-range of excitation function in 22Mg (up to Ex ∼ 8.9 MeV) was obtained simultaneously with a thick-target method, and a state at 7.06 MeV was newly observed. The resonant parameters were deduced from an R-matrix analysis of the center-of-mass (c.m.) differential cross-section data with a SAMMY-M6-BETA code. The astrophysical resonant reaction rate for the 18Ne(α,p)21Na reactionwas recalculated based on the present parameters.Generally speaking,the present rates are much smaller than the previous ones.