The crystal structure of a lectin from Butea monosperma: Insight into its glycosylation and binding of ligands

Crystal structure of a lectin purified from Butea monosperma seeds was determined by Molecular Replacement method. Its primary structure was determined by Tandem Mass Spectroscopy and electron density maps from X-ray diffraction data. Its quaternary structure was tetrameric, formed of two monomers, alpha and beta, beta appearing as truncated alpha. The occurrence of two tetramers in the asymmetric unit of the crystal might be a consequence of asymmetric contacts due to difference in glycosylation and variable loops structures, to form an `octamer-structure'. The crystal structure showed binding pockets for gamma Abu, having a proposed role in plant defense, at the interface of canonical dimer-partners. Hemagglutination studies, enzyme kinetics, isothermal titration calorimetry and molecular dynamics showed that the lectin is specific to N-acetyl D-galactosamine, galactose and lactose in decreasing order, and alpha-amylase inhibitor. (C) 2014 Elsevier B.V. All rights reserved.

Quantum fluctuations and thermal dissipation in higher derivative gravity

In this paper, based on the AdS(2)/CFT1 prescription, we explore the low frequency behavior of quantum two point functions for a special class of strongly coupled CFTs in one dimension whose dual gravitational counterpart consists of extremal black hole solutions in higher derivative theories of gravity defined over an asymptotically AdS spacetime. The quantum critical points thus described are supposed to correspond to a very large value of the dynamic exponent (z -> infinity). In our analysis, we find that quantum fluctuations are enhanced due to the higher derivative corrections in the bulk which in turn increases the possibility of quantum phase transition near the critical point. On the field theory side, such higher derivative effects would stand for the corrections appearing due to the finite coupling in the gauge theory. Finally, we compute the coefficient of thermal diffusion at finite coupling corresponding to Gauss Bonnet corrected charged Lifshitz black holes in the bulk. We observe an important crossover corresponding to z = 5 fixed point. (C) 2015 The Author. Published by Elsevier B.V.

A comparison of the fine-scale structure of the diurnal cycle of tropical rain and lightning

In this study, the fine-scale structure of the diurnal variability of ground-based lightning is systematically compared with satellite-based rain. At the outset, it is shown that tropical variability of lightning exhibits a prominent diurnal mode, much like rain. A comparison of the geographical distribution of the timing of the diurnal maximum shows that there is very good agreement between the two observables over continental and coastal regions throughout the tropics. Following this global tropical comparison, we focus on two regions, Borneo and equatorial South America, both of which show the interplay between oceanward and landward propagations of the phase of the diurnal maximum. Over Borneo, both rain and lightning clearly show a climatological cycle of ``breathing in'' (afternoon to early morning) and ``breathing out'' (morning to early afternoon). Over the equatorial east coast of South America, landward propagation is noticed in rain and lightning from early afternoon to early morning. Along the Pacific coast of South America, both rain and lightning show oceanward propagation. Though qualitatively consistent, over both regions the propagation is seen to extend further in rainfall. Additionally, given that lightning highlights vigorous convection, the timing of its diurnal maximum often precedes that of rainfall in the convective life cycle. (C) 2015 Elsevier B.V. All rights reserved.

DETERMINISTIC ALGORITHMS FOR MATCHING AND PACKING PROBLEMS BASED ON REPRESENTATIVE SETS

In this work, we study the well-known r-DIMENSIONAL k-MATCHING ((r, k)-DM), and r-SET k-PACKING ((r, k)-SP) problems. Given a universe U := U-1 ... U-r and an r-uniform family F subset of U-1 x ... x U-r, the (r, k)-DM problem asks if F admits a collection of k mutually disjoint sets. Given a universe U and an r-uniform family F subset of 2(U), the (r, k)-SP problem asks if F admits a collection of k mutually disjoint sets. We employ techniques based on dynamic programming and representative families. This leads to a deterministic algorithm with running time O(2.851((r-1)k) .vertical bar F vertical bar. n log(2)n . logW) for the weighted version of (r, k)-DM, where W is the maximum weight in the input, and a deterministic algorithm with running time O(2.851((r-0.5501)k).vertical bar F vertical bar.n log(2) n . logW) for the weighted version of (r, k)-SP. Thus, we significantly improve the previous best known deterministic running times for (r, k)-DM and (r, k)-SP and the previous best known running times for their weighted versions. We rely on structural properties of (r, k)-DM and (r, k)-SP to develop algorithms that are faster than those that can be obtained by a standard use of representative sets. Incorporating the principles of iterative expansion, we obtain a better algorithm for (3, k)-DM, running in time O(2.004(3k).vertical bar F vertical bar . n log(2)n). We believe that this algorithm demonstrates an interesting application of representative families in conjunction with more traditional techniques. Furthermore, we present kernels of size O(e(r)r(k-1)(r) logW) for the weighted versions of (r, k)-DM and (r, k)-SP, improving the previous best known kernels of size O(r!r(k-1)(r) logW) for these problems.

Effect of Ga content in Cu(Ga) on the growth of V3Ga following bronze technique

Diffusion controlled growth rate of V3Ga in the Cu(Ga)/V system changes dramatically because of a small change in Ga content in Cu(Ga). One atomic percent increase from 15 to 16 leads to more than double the product phase layer thickness and a decrease in activation energy from 255 to 142 kJ/mol. Kirkendall marker experiment indicates that V3Ga grows because of diffusion of Ga. Role of different factors influencing the diffusion rate of Ga and high growth rate of V3Ga are discussed. (C) 2015 Elsevier Ltd. All rights reserved.

Reply to Discussion on ``Bearing capacity of circular footings over rock mass by using axisymmetric quasi lower bound finite element limit analysis'' Comput. Geotech. 70 (2015) 138-149]

A discussion has been provided for the comments raised by the discusser (Clausen, 2015)1] on the article recently published by the authors (Chakraborty and Kumar, 2015). The effect of exponent alpha for values of GSI approximately smaller than 30 becomes more critical. On the other hand, for greater values of GSI, the results obtained by the authors earlier remain primarily independent of alpha and can be easily used. (C) 2015 Elsevier Ltd. All rights reserved.

Development of an automated ultrasonic spray pyrolysis system and the growth of Cu2ZnSnS4 thin films

An automated ultrasonic spray pyrolysis system is fabricated for the growth of thin films. The system is equipped with x-y movement and enables film deposition in different patterns and spray rates. Cu-2(Zn,Sn)S-4 (CZTS) films are deposited using this setup. The substrate temperature (T-s) is varied from 240 to 490 degrees C. Kesterite CZTS phase is observed in all the films together with binary phases. The films prepared at T-s <340 degrees C showed SnxSy phase and those at T-s >340 degrees C showed Cu2S phase. Sulfur incorporation is maximum (40%) at 440 degrees C and the films showed better morphology. The Cu and S concentrations are varied to remove binary phases. Depth wise elemental analysis confirmed the existence of single phase CZTS. p-Type CZTS films of resistivity in the range of 10(2)-10(3) Omega cm are obtained. (C) 2015 Elsevier B.V. All rights reserved.

Thermoelectric properties of indium doped Cu2CdSnSe4

Recently, research in copper-based quaternary chalcogenide materials has been found to be interesting for the study of thermoelectric properties because of their low thermal conductivity due to complex crystal structures. In the present work, stoichiometric quaternary chalcogenide compounds Cu2CdSn1-xInxSe4(x = 0, 0.025, 0.05, 0.1) were prepared by solid state synthesis. The powder X-ray diffraction patterns of all the samples showed a tetragonal crystal structure with the space group I (4) over bar 2m of the main phase. In addition to this phase, a small amount of impurity phase CdSe was present in all the samples, as confirmed by Rietveld analysis. The elemental composition of all the samples characterized by an Electron Probe Micro Analyzer showed a slight deviation from the nominal composition. The transport properties were measured in the temperature range of 350 K-723 K. The positive Seebeck coefficient of all the compounds indicate that the majority carriers are holes. The Seebeck coefficient and electrical resistivity did not follow the trend in the expected manner with In doping, which could be influenced by the presence of the impurity phases. The total thermal conductivity of all the samples was dominated by the lattice thermal conductivity, while the electronic contribution was very small due to the low carrier contribution. A lattice thermal conductivity decrease with an increase of temperature indicates the dominance of phonon-phonon scattering at higher temperatures. The maximum figure of merit zT = 0.30 at 723 K was obtained for the compound Cu2CdSn0.9In0.1Se4. (C) 2016 Elsevier Ltd. All rights reserved.

A mode-shape classification technique for robust speech rate estimation and syllable nuclei detection

Acoustic feature based speech (syllable) rate estimation and syllable nuclei detection are important problems in automatic speech recognition (ASR), computer assisted language learning (CALL) and fluency analysis. A typical solution for both the problems consists of two stages. The first stage involves computing a short-time feature contour such that most of the peaks of the contour correspond to the syllabic nuclei. In the second stage, the peaks corresponding to the syllable nuclei are detected. In this work, instead of the peak detection, we perform a mode-shape classification, which is formulated as a supervised binary classification problem - mode-shapes representing the syllabic nuclei as one class and remaining as the other. We use the temporal correlation and selected sub-band correlation (TCSSBC) feature contour and the mode-shapes in the TCSSBC feature contour are converted into a set of feature vectors using an interpolation technique. A support vector machine classifier is used for the classification. Experiments are performed separately using Switchboard, TIMIT and CTIMIT corpora in a five-fold cross validation setup. The average correlation coefficients for the syllable rate estimation turn out to be 0.6761, 0.6928 and 0.3604 for three corpora respectively, which outperform those obtained by the best of the existing peak detection techniques. Similarly, the average F-scores (syllable level) for the syllable nuclei detection are 0.8917, 0.8200 and 0.7637 for three corpora respectively. (C) 2016 Elsevier B.V. All rights reserved.

对流扩散方程的变步长摄动有限差分格式

摄动有限差分(PFD)方法是构造高精度差分格式的一种新方法。变步长摄动有限差分方法是等步长摄动有限差分方法的发展和推广。对需要局部加密网格的计算问题，变步长PFD格式不需要对自变量进行数学变换，且和等步长PFD格式一样，具有如下的共同特点：从变步长一阶迎风格式出发，通过把非微商项(对流系数和源项)作变步长摄动展开，展开幂级数系数通过消去摄动格式修正微分方程的截断误差项求出，由此获得高精度变步长PFD格式。该格式在一、二和三维情况下分别仅使用三、五和七个基点，且具有迎风性。文中利用变步长PFD格式对对流扩散反应模型方程，变系数方程及Burgers方程等进行了数值模拟，并与一阶迎风和二阶中心格式及其问题的精确解作了比较。数值试验表明，与一阶迎风和二阶中心格式相比，变步长PFD格式具有精度高，稳定性与收敛性好的特点。变步长PFD格式与等步长PFD格式相比，变步长PFD解在薄边界层型区域的分辨率得到了明显的提高。

Evaluación productiva y reproductiva del hato de la finca "San Benito" Telica, León, Nicaragua

El presente trabajo se realizó con el objetivo de estudiar el efecto de los diferentes factores ambientales y genético (RAZAV, NUMPA, AÑOP, EPOCA), sobre el comportamiento productivo y reproductivo de un hato bovino del municipio de Telica, departamento de León, en la finca "San Benito". Además se caracterizó la curva general de lactancia para la cual se utilizó el modelo Yx = axb e-ex. En donde "a" es el parámetro asociado con la producción inicial, "b" señala el ascenso al pico, "c" es la declinación de la producción post-pico y Yx es la producción diaria en el período "x". Se analizaron los registros productivos y reproductivos correspondiente al período de 1990 a 1992, las características estudiadas fueron: PLTOT, PL305, LARLA e IEP. En el análisis se utilizó el procedimiento de mínimos cuadrados mediante el análisis de varianza , se evaluó el efecto de raza, nOmero de parto, año de parto y época de parto. Este análisis mostró un efecto altamente significativo (p<0.01) del año de parto sobre las características PLTOT, PL305 y LARLA. La época de parto resultó altamente significativa (p<0.01), para las características PL305 y LARLA, y resultó significativa (p<0.05), para PLTOT. EL efecto de la raza de la vaca y el número de parto resultó no significativo para todas las variables estudiadas, así mismo, el estudio de las características: intervalo entre parto resultó no significativa Las medias de mínimos cuadrados reportados en este estudio fueron: 1287.30±464.77 kg, 1392.99±554.53 kg ,277.72 días y 468.06±32.62 días para PLTOT, PL305, LARLA e IEP respectivamente, resultando estos valores superiores a los reportados a nivel nacional. Las medias de mínimos cuadrados para los parámetros de la curva de lactancia fueron: 3.37±3.17, 0.36±0.24" 0.005±0.004 para “a”, "b" y "c" respectivamente.

Comportamiento productivo de cerdos alimentados con desperdicios de cocina y residuos de galleta en la dieta, bajo distintos porcentajes de inclusión

El presente estudio se realizó en la granja porcina de la Universidad Nacional Agraria (U.N.A), ubicada en el Km. 13 a los 86°. 09' 36" longitud oeste y los 12° 08'15" latitud norte de la comunidad de Sabana Grande, Municipio de Managua con un elevación de 56 m sobre el nivel del mar (INETER, 1987). La fase de campo fue realizada de Julio a Octubre de 1999, con el objetivo de evaluar el comportamiento productivo de cerdos en crecimiento, desarrollo y engorde alimentados con tres raciones diferentes: (T1) Desperdicio de Galleta 100%, (T2) Desperdicio de Galleta 75% + Desperdicio de cocina 25%, (T3) Desperdicio de cocina 100%. Se utilizaron 18 cerdos comerciales de ambos sexos, con peso promedio de inicio de 54.86 kg, que fueron distribuidos en tres tratamientos con seis repeticiones con los datos levantados de pesaje de los diferentes tratamientos, se efectúo el análisis estadístico correspondiente al diseño experimental completamente al Azar (DCA) y su correspondiente análisis para las variables en estudio, G.M D. y C.A. Los cerdos que presentaron una ganancia de peso más alta, fueron los que se alimentaron con la ración l00 % de desperdicio de cocina teniendo una ganancia media diaria de 0.758 kg. los cerdos alimentados 75 % DDG, + 25 % DDC, alcanzaron una ganancia de peso promedio de 0.578 kg. mientras que el tratamiento 100% DDG alcanzo una ganancia media de peso promedio de 0.17 kg. El análisis de la ganancia media diaria se demostró con una alfa de 5 %. El análisis estadístico mostró que las diferencias en conversión alimenticia fueron significativas entre tratamientos con un Alfa al 5 %. Al comparar las utilidades generadas entre el T t y T2, estos resultaron financieramente aceptables, de forma similar se comportaron el T1 y T3., no obstante, desde el punto de vista nutricional, estos no cumplieron los requerimientos de la categoría, por lo que el T2, se presentó finalmente como el más aceptable nutricionalmente.

Análisis de la relación entre optimismo, calidad de vida y estabilidad emocional en personas con cáncer

Resumen: Este estudio se propuso analizar la relación del optimismo con ansiedad, depresión y calidad de vida global en una muestra de 45 pacientes oncológicos, 34% hombres y 66% mujeres con un promedio de 50,5 años y un rango de 21 a 74 años. Según la localización de la neoplasia se conformó una muestra mixta. Para este trabajo se realizó un muestreo no probabilístico con control de las variables: estadio de la enfermedad, fase y tipo de tratamiento médico/clínico, equipo médico actuante y enfermedades concomitantes. Cumplió con las normas éticas establecidas (FePRA, 2013; Helsinki, 2008). Para evaluar optimismo se administró la versión española del LOT-R (Otero, Luengo, Romero y Castro, 1998), para Calidad de Vida el cuestionario FACT-G en su 4ta versión (Cella, Tulsky, Gray, 1993) y para ansiedad y depresión la versión española de la escala HAD (Caro & Ibáñez, 1992). Se encontraron correlaciones significativas entre optimismo con cada una de las variables en estudio y se reportaron diferencias significativas entre los pesimistas y los optimistas en Ansiedad (F= 6.35, p = .015); Depresión (F= 5.30, p = .026) y Calidad de Vida (F= 8.99, p = .004).

Efecto de tres distancias de siembra sobre el rendimiento de tres variedades de tabaco habano (Nicotiana tabacum L.), en el municipio de Condega, Esteli

El presente estudio se desarrolló en la finca Cerro Azul, Comunidad de San Pedro, municipio de Condega, Estelí, situado a 620 msnm, 14° 72' 24'' Latitud Norte y 86° 56' 30'' Longitud Oeste, con el objetivo de evaluar el efecto de tres distancia de siembra de siembra (30.48, 35.56 y 40.64 cm) sobre el rendimiento de tres variedades de tabaco (Habano Criollo 751, Habano 2,000 y Habano 98). El ensayo se estableció en febrero del año 2,004. Se utilizó un diseño en Bloques Completos al Azar (BCA) con arreglos en Parcelas Divididas con cuatro réplicas, ubicando en las parcelas grandes las distancias de siembra. A los resultados obtenidos se les realizó un análisis de varianza (ANDEVA) y separación de medias a través de la prueba de rangos múltiples de Tukey con un 95 % de confianza (8=0.05). Los resultados del estudio determinaron que las densidades estudiadas no presentaron efecto significativo en las variables evaluadas. Por otro lado, las variedades de Habano evaluadas demostraron alta significación estadística en la altura de planta y cortes realizados. Para el caso de la distancia entre plantas, los mayores promedios se observaron a los 60 DDT en la densidad de 30,629 plantas ha-1 con 127.78 cm y el menor valor la densidad de 26 814 plantas ha-1 con 120.98 cm. La variedad Habano 2 000 mostró la mayor altura con 128.92 cm, y 121.28 cm la variedad Habano Criollo con 121.28 cm. La mayor longitud de hoja se obtuvo en la densidad de 30 629 plantas ha-1 con un valor promedio de 49.41 cm, y la menor longitud de obtuvo en 35,725 plantas ha-1. Habano Criollo y Habano 2000 presentaron longitud de 49.55 y 49.10 cm. El peso final al beneficiado presentó diferencias estadísticas a los 94 y 102 ddt, siendo la densidad de 35,725 plantas ha-1 la de mayores valores (582.78 y 692.06kg ha-1) y la de menor promedio la densidad 26,814 (483.92 y 628.57 kg ha-1). La variedad Habano 98 evaluada a los 102 ddt mostró 684.78 kg ha-1 y 624.41 kg ha-1 para Habano Criollo. El cultivar Habano 98 con la menor distancia de siembra presentó la mejor relación Beneficio/Costo, obteniendo una ganancia de 2.03 dólar por cada dólar invertido.

Biomasa y nutrientes de arboles de sombra temporal y permanente en sistemas agroforestales con Coffea arabiga L de cinco años en el Pacifico de Nicaragua

Chavarria, E; Hernández, J. 2,006. Biomasa y nutrientes de árboles de sombra temporal y permanente en sistemas agroforestales con Coffea arabiga L de 5 años en el pacífico de Nicaragua. La presente investigación se realizó en sistemas agroforestales con café (Coffea arábiga L.) en el Municipio de Masatepe, Nicaragua, determinando el aporte de biomasa y los contenidos de N, P, K, Ca y Mg. de la sombra temporal y permanente. Se evaluaron dos factores de estudio en un diseño de bloques completamente al azar con arreglo de parcelas subdivididas: A) Tipo de sombra: temporal estableciéndose de forma homogénea y mixtas, especies de leguminosas más no leguminosas para sombra de café como Cajanus cajan y Ricinus communis y en sombra permanente, especies de árboles leguminosas y/o maderables (Inga laurina, Simarouba glauca, Samanea saman, Tabebuia rosea) y una parcela de café a pleno sol, distribuidas en parcelas grandes; B) Los niveles de insumos: Convencional Intensivo (CI) y Convencional Extensivo (CE), Orgánico Intensivo (OI) y Orgánico Extensivo (OE); relativos a aportes de nutrientes, manejo de enfermedades, malezas e insectos dañinos. La biomasa de sombra temporal se cuantificó en 2,002 por podas y 2,003 por eliminación de la misma. También se cuantificó la biomasa en la sombra permanente por podas en 2,004 y de raleo 2,005. La biomasa total por especie y tratamientos en sombra temporal y permanente, se obtuvieron a partir de los componentes hojas, tallos menores a 2 cm, tallos mayores de 2 cm de diámetro y tronco. Se tomó una muestra de biomasa fresca por tratamiento, se secó al horno a temperaturas de 65 ºC, para obtener el contenido de materia seca. A este mismo material, se procedió a la determinación de las concentraciones de los elementos minerales anteriormente mencionados. Los resultados obtenidos mostraron que la especie de sombra temporal no leguminosa Higuera (Ricinus communis) presentó el mayor aporte de materia seca con 4,356 kg ha-1 en dos años (2,002 + 2,003), representando también los mayores contenidos de N, P, K, Ca y Mg con 82, 28, 165, 68 y 57 kg ha-1 respectivamente. Respecto a las especies de sombra permanente, sometidas al manejo de poda el nivel de sombra Il+Sg produce los mayores aportes de MS con 5,695.66 kg ha-1 a-1 de los cuales el 39 % se recicla en el sistema, este mismo tipo de sombra aporta al sistema los mayores contenidos de N, P, K, Ca y Mg con 64, 55, 55, 66 y 36 % respectivamente. En el manejo de raleo el tipo de sombra que produjo mayor cantidad de MS es Sg+Tr con 9,096.89 kg ha-1 a-1 aportando al sistema el 45 %, este mismo tipo de sombra aporta al sistema las mayores cantidades de N, P, K, Ca y Mg con 67, 54, 70, 80 y 44 % respectivamente. Los porcentaje restante de materia seca y nutrientes tanto en poda y raleo correspondiente a tallos mayores de 2 cm de diámetro, es extraído del sistema como leña y postes respectivamente.