Studies toward the identification of transcription factors in cassava storage root

Fatores de transcrição desempenham importantes funções em vários processos fisiológicos. Nos últimos anos, muitos fatores de transcrição têm sido isolados de plantas, emergindo como poderosas ferramentas na manipulação de características agronômicas. No presente trabalho, iniciamos estudos para isolar fatores de transcrição de mandioca (Manihot esculenta Crantz), importante cultura tropical e subtropical. Nossos resultados revelaram três tipos de proteínas diferencialmente expressas na raiz de reserva de mandioca (Manihot esculenta Crantz):e imunologicamente relacionadas com o fator de transcrição opaco-2 de milho. Experimentos de Southwestern mostraram duas proteínas capazes de interagir in vitro com uma seqüência de DNA do gene be2S1 de castanha-do-brasil.

A genomic assisted breeding program for cassava to improve nutritional quality and industrial traits of storage root

A mandioca é cultivada como "mandioca mansa" para consumo in natura e "mandioca para indústria" como fonte de amidos e farinhas. Raças locais foram utilizadas para descoberta de "mutações espontâneas" e desenvolvimento de abordagem evolutiva e de melhoramento para estudos de função gênica. Recursos de Genômica e Proteômica foram obtidos. Análises de expressão gênica por blot de RNA e microarranjos foram desenvolvidos para identificação de expressão diferencial. "Mandioca açucarada" foi identificada, sendo relacionada com falta de expressão do gene da BEI e de uma mutação "nonsence" na sequência do gene GBSSI causando a formação do amido serose. "Mandioca avermelhada" apresentou falta de expressão do gene CasLYB, e a "amarela" uma regulação de repressão do gene CasHYb. Análise Proteômica do complexo carotenóide-proteína, juntamente com a análise de expressão de gene da CAP4, revelaram uma dupla fita de cDNA associada ao elevado acúmulo de carotenóide. Sequenciamento do gene da GBSSI identificou 22 haplótipos e grande diversidade de nucleotídios. Populações segregantes de cruzamentos de fenótipos bioquímicos diferenciados com cultivares elites dos Cerrados foram obtidas.

Estimativa dos perfis de permeabilidade e de porosidade utilizando rede neural artificial

A permeabilidade e a porosidade são duas das mais importantes propriedades petrofísicas para a qualificação dos reservatórios de óleo e gás. A porosidade está relacionada à capacidade de armazenamento de fluidos e a permeabilidade, com a capacidade de produção destes fluidos. Suas medidas são, normalmente, realizadas em laboratório, através de testemunhos da rocha. Esses processos têm custos elevados e nem todos os poços são testemunhados. As estimativas da permeabilidade e da porosidade são de fundamental importância para os engenheiros de reservatório e geofísicos, uma vez que seus valores podem definir a completação ou não de um poço petrolífero. O perfil de porosidade e sua relação com o perfil de densidade, é bem conhecida na geofísica de poço. No entanto, existem poucas relações quantitativas e/ou qualitativas entre a porosidade e a permeabilidade, como por exemplo as relações de Kozeny. Sendo assim, este trabalho busca o estabelecimento do perfil de permeabilidade e do perfil de porosidade, a partir de informações do perfil de densidade. Para tanto, buscamos a relação entre a propriedade física da rocha (densidade) e as propriedades petrofísicas: permeabilidade e porosidade, utilizando como metodologia à técnica de redes neurais artificiais, como a rede neural artificial com função de base radial. A obtenção da permeabilidade e da porosidade a partir da rede neural artificial, que possui como entrada a informação da densidade possibilita um menor custo para a aquisição dessas importantes informações petrofísicas, permite ao intérprete de perfis de poço optar ou não pela exploração de uma unidade estudada, além de uma visão mais completa do reservatório. Os procedimentos para a estimativa da permeabilidade e da porosidade estão direcionados para uma única formação, mas os intérpretes de perfis poderão aplicar a diretriz apresentada no programa de rede neural artificial com função de base radial, utilizando a estimativa dessas propriedades petrofísicas para outras formações, inclusive de outros campos petrolíferos. Portanto, recomenda-se a utilização de um conjunto de dados completo, com quantidade de dados suficientes de um mesmo poço, a fim de viabilizar corretamente a melhor interpretação.

Diet and niche breadth and overlap in fish communities within the area affected by an Amazonian reservoir (Amapá, Brazil)

Nós investigamos a amplitude e a sobreposição de nicho de espécies de peixes que ocorrem em quatro ambientes afetados pelo reservatório Coaracy Nunes, no Estado brasileiro do Amapá. Amostras sazonais de peixes foram coletadas usando uma configuração padrão com malhadeiras, tarrafas, linhas e armadilhas. Quinhentos e quarenta conteúdos estomacais, representando 47 espécies de peixes, foram analisados e quantificados. Amplitude e sobreposição de nichos foram estimadas usando os índices de Levin e Pianka, respectivamente, enquanto a competição interespecífica foi avaliada usando (RA3) modelo nulo. ANOVA e o teste de Kruskal¬Wallis foram usados para avaliar, respectivamente, as diferenças de amplitude e sobreposição de nichos entre áreas. Os dados indicaram que a maioria das espécies de peixes pertence às guildas de psicívoros, onívoros e detritívoros. Estas espécies provavelmente colonizaram os ambientes devido à disponibilidade de adequados recursos alimentares e às favoráveis condições físicas criadas pelo represamento do rio. De maneira geral, poucas espécies têm nichos amplos, mas muitas delas são altamente especializadas. Variação sazonal de recursos tem pouco efeito no comportamento alimentar da maioria das espécies nas áreas de estudo. Os modelos nulos indicaram que competição não foi um fator determinante na estrutura da comunidade.

Investigação do procedimento de higenização dos brinquedos em centros de convivência infantil

Pós-graduação em Enfermagem (mestrado profissional) - FMB

Dynamics of ovarian maturation during the reproductive cycle of Metynnis maculatus, a reservoir invasive fish species (Teleostei: Characiformes)

Neste estudo, avaliamos a dinâmica da maturação ovariana a desova durante o ciclo reprodutivo de Metynnis maculatus. Fêmeas adultas (n = 36) foram coletadas bimestralmente entre abril de 2010 e março de 2011. O índice gonadossomático (IGS) foi calculado e amostras de ovário e de sangue foram submetidas à avaliação morfométrica e das concentrações plasmáticas dos esteroides por ELISA, respectivamente. A espécie apresenta desenvolvimento ovariano assincrônico, com múltiplas desovas. Neste estudo revelamos que mesmo sendo de desova parcelada, os ovários do M. maculatus mostraram um padrão de desenvolvimento com predomínio de atividade vitelogênica entre abril a agosto e intensificação da desova em setembro. Em outubro houve uma diminuição nos valores médios de IGS, bem como registramos as maiores frequências de folículos pós-ovulatórios (FPOs). Observamos uma correlação positiva entre a frequência de FPOs e a concentração plasmática de 17 α-OHP. O M. maculatus tem potencial para ser usado como fonte para uso de hipófise para preparo de extrato bruto para indução hormonal, sendo o período teórico para coleta de hipófises de setembro a outubro, mas estudos específicos para esta finalidade ainda precisam ser desenvolvidos.

Solanum americanum: reservoir for Potato virus Y and Cucumber mosaic virus in sweet pepper crops

Weeds can act as important reservoirs for viruses. Solanum americanum (Black nightshade) is a common weed in Brazil and samples showing mosaic were collected from sweet pepper crops to verify the presence of viruses. One sample showed mixed infection between Cucumber mosaic virus (CMV) and Potato virus Y (PVY) and one sample showed simple infection by PVY. Both virus species were transmitted by plant extract and caused mosaic in tomato (Solanum lycopersicum cv. Santa Clara), sweet pepper (Capsicum annuum cv. Magda), Nicotiana benthamiana and N. tabaccum TNN, and local lesions on Chenopodium quinoa, C. murale and C. amaranticolor. The coat protein sequences for CMV and PVY found in S. americanum are phylogenetically more related to isolates from tomato. We conclude that S. americanum can act as a reservoir for different viruses during and between sweet pepper crop seasons.

Cyanobacteria detection in Guarapiranga Reservoir (São Paulo State, Brazil) using Landsat TM and ETM+ images

Algae bloom is one of the major consequences of the eutrophication of aquatic systems, including algae capable of producing toxic substances. Among these are several species of cyanobacteria, also known as blue-green algae, that have the capacity to adapt themselves to changes in the water column. Thus, the horizontal distribution of cyanobacteria harmful algae blooms (CHABs) is essential, not only to the environment, but also for public health. The use of remote sensing techniques for mapping CHABs has been explored by means of bio-optical modeling of phycocyanin (PC), a unique inland waters cyanobacteria pigment. However, due to the small number of sensors with a spectral band of the PC absorption feature, it is difficult to develop semi-analytical models. This study evaluated the use of an empirical model to identify CHABs using TM and ETM+ sensors aboard Landsat 5 and 7 satellites. Five images were acquired for applying the model. Besides the images, data was also collected in the Guarapiranga Reservoir, in São Paulo Metropolitan Region, regarding the cyanobacteria cell count (cells/mL), which was used as an indicator of CHABs biomass. When model values were analyzed excluding calibration factors for temperate lakes, they showed a medium correlation (R²=0.81, p=0.036), while when the factors were included the model showed a high correlation (R²=0.96, p=0.003) to the cyanobacteria cell count. The empirical model analyzed proved useful as an important tool for policy makers, since it provided information regarding the horizontal distribution of CHABs which could not be acquired from traditional monitoring techniques.

Temporal and Spatial Variability of Limnological Characteristics in Areas under the Influence of Tilapia Cages in the Chavantes Reservoir, Paranapanema River, Brazil

The influence of tilapia cages on limnological characteristics of the Chavantes Reservoir, Paranapanema River, Brazil, was investigated in March and June 2007. Principal components analysis was used to compare the transparency; dissolved oxygen; temperature; total organic nitrogen, phosphorus, and dissolved solids; chlorophyll aand electrical conductivity of fish farm 1 (239.3m.t.), 2 (461.5m.t.) and areas without cages, in the lacustrine and river-reservoir transition regions. The variables differentiated the regions and areas with and without cages. In March, in the lacustrine region, there was a thermal and chemical stratification, and in the transition region, there was a temperature and oxygen reduction gradient between the surface and bottom that was also observed in June in fish farm 1. The higher transparency confirmed the increased light penetration in the lacustrine region. In the transition region, there were higher turbidity, total dissolved solid, and conductivity values that are likely related to allochthonous material flow and transport. In fish farms, lower oxygen and pH values indicate intense decomposition and respiration. The generally higher total dissolved solid and nutrient values, turbidity, and conductivity and the lower transparency in one or both fish farms indicate their contribution to eutrophication, demonstrating the need for careful monitoring.

Storage of 'Espada' mango fruits in modified atmosphere and cooling: effects on conservation

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Emergy assessment of tilapia cage farming in a hydroelectric reservoir

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Influence of the combination of probiotic cultures during fermentation and storage of fermented milk

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Storage moduli, loss moduli and damping factor of GaAs and Ga1-xMnxAs thin films using DMA 2980

The spin injector part of spintronic FET and diodes suffers from fatigue due to rising heat on the depletion layer. In this study the stiffness of Ga1-xMnxAs spin injector in terms of storage modulus with respect to a varying temperature, 45 degrees C <= T <= 70 degrees C was determined. It was observed that the storage modulus for MDLs (Manganese Doping Levels) of 0%, 1% and 10% decreased with increase in temperature while that with MDLs of 20% and 50% increase with increase in temperature. MDLs of 20% and 50% appear not to allow for damping but MDLs <= 20% allow damping at temperature range of 45 degrees C <= T <= 70 degrees C. The magnitude of storage moduli of GaAs is smaller than that for ferromagnetic Ga1-xMnxAs systems. The loss moduli for GaAs were found to reduce with increase in temperature. Its magnitude of reducing gradient is smaller than Ga1-xMnxAs systems. The two temperature extremes show a general reduction in loss moduli for different MDLs at the study temperature range. From damping factor analysis, damping factors for ferromagnetic Ga1-xMnxAs was found to increase with decrease in MDLs contrary to GaAs which recorded the largest damping factor at 45 degrees C <= T <= 70 degrees C Hence, MDL of 20% shows little damping followed by 50% while MDL of 0% has the most damping in an increasing trend with temperature. (C) 2013 Elsevier Ltd. All rights reserved.

Chemical Composition, Rumen Fermentation Kinetics, Digestibility and Energy Value of Cassava Leaves Hay at Different Storage Times

Cassava leaves have been widely used as a protein source for ruminants in the tropics. However, these leaves contain high level of hydro-cyanic acid (HCN) and condensed tannins (CT). There are evidences that making hay can eliminate more than 90% of HCN and that long-term storage can reduce CT levels. A complete randomized design with four replicates was conducted to determine the effect of different storage times (0-control, 60, 90 and 120 days) on chemical composition, in vitro rumen fermentation kinetics, digestibility and energy value of cassava leaves hay. Treatments were compared by analyzing variables using the GLM procedure (SAS 9.1, SAS Institute, Inc., Cary, NC). Crude protein (CP) and ether extract (EE) of the cassava hay were not affected (P > 0.05) by storage time (17.7% and 3.0%, respectively). Neutral detergent fiber, acid detergent fiber, total carbohydrate and non-fiber carbohydrate were not affected either (P>0.05) by storage time (47.5, 32.6, 72.3 and 25.8% respectively). However, other parameters were influenced. CT was lower (P<0.05) in hay after 120 days of storage compared with control (1.75% versus 3.75%, respectively). Lignin and insoluble nitrogen in neutral detergent, analyzed without sodium sulfite, were higher (P<0.01) after 120 days of storage, compared with the control (11.22 versus 13.57 and 1.65 versus 3.81% respectively). This suggests that the CT has bound to the fiber or CP and became inactive. Consequently, the in vitro digestibility of organic matter (50.36%), total digestible nutrients (44.79%) and energy (1.61 Mcal/KgMS), obtained from gas production data at 72 h of incubation, has increased (P<0.05) with storage times (56.83%, 51.53% and 1.86 Mcal/KgMS, respectively). The chemical composition and fermentative characteristics of cassava hay suffered variations during the storage period. The best values were obtained after 90 days of storage. This is probably due to the reduction in condensed tannins.