Genetic Diversity in the Modern Horse Illustrated from Genome-Wide SNP Data

Horses were domesticated from the Eurasian steppes 5,000-6,000 years ago. Since then, the use of horses for transportation, warfare, and agriculture, as well as selection for desired traits and fitness, has resulted in diverse populations distributed across the world, many of which have become or are in the process of becoming formally organized into closed, breeding populations (breeds). This report describes the use of a genome-wide set of autosomal SNPs and 814 horses from 36 breeds to provide the first detailed description of equine breed diversity. FST calculations, parsimony, and distance analysis demonstrated relationships among the breeds that largely reflect geographic origins and known breed histories. Low levels of population divergence were observed between breeds that are relatively early on in the process of breed development, and between those with high levels of within-breed diversity, whether due to large population size, ongoing outcrossing, or large within-breed phenotypic diversity. Populations with low within-breed diversity included those which have experienced population bottlenecks, have been under intense selective pressure, or are closed populations with long breed histories. These results provide new insights into the relationships among and the diversity within breeds of horses. In addition these results will facilitate future genome-wide association studies and investigations into genomic targets of selection. © 2013 Petersen et al.

Effect of thermal cycling and disinfection on microhardness of acrylic resin denture base

The purpose of this study was to investigate the effect of thermal cycling and disinfection on the microhardness of acrylic resins denture base. Four different brands of acrylic resins were evaluated: Onda Cryl, QC 20, Classico and Lucitone. Each brand of acrylic resin was divided into four groups (n = 7) according to the disinfection method (microwave, Efferdent, 4% chlorhexidine and 1% hypochlorite). Samples were disinfected during 60 days. Before and after disinfection, samples were thermal cycled between 5-55 °C with 30-s dwell times for 1000 cycles. The microhardness was measured using a microhardener, at baseline (B), after first thermal cycling (T1), after disinfection (D) and after second thermal cycling (T2). The microhardness values of all groups reduced over time. QC-20 acrylic resin exhibited the lowest microhardness values. At B and T1 periods, the acrylic resins exhibited statistically greater microhardness values when compared to D and T2 periods. It can be concluded that the microhardness values of the acrylic resins denture base were affected by the thermal cycling and disinfection procedures. However, all microhardness values obtained herein are within acceptable clinical limits for the acrylic resins. © 2013 Informa UK Ltd.

Photoelastic analysis of the influence of residual ridge inclination in conjugated class i mandibular prostheses with different attachment systems

Objectives: The aim of this study was to evaluate the stress distribution in mandibular free-end removable partial dentures (RPD) associated with FPD in the abutment teeth considering different inclinations of the residual ridge: (1) horizontal and (2) distal descending ridges and two designs of free-end RPD with different attachment systems were tested: (1) clasp and (2) system ERA. Methods. Axial loads (100 N) were applied on the teeth of the RPD. The images were recorded and the stress distribution was evaluated through photoelastic fringes. Results. In general, the distal descending ridge presented more photoelastic fringes in the region of the roots of the abutment teeth while the horizontal ridge exhibited higher compression in the base of the prosthesis. In the horizontal ridge, the denture with clasp presented more favourable stress distribution than the denture with the system ERA. In the distal descending ridge, the denture with the system ERA relieved the region of the abutment teeth and overloaded the residual ridge. Conclusion: The horizontal ridge presented more favourable performance; the dentures with clasp exhibited better performance for both ridges evaluated; the denture with the system ERA presented better results in the distal descending ridge. © 2013 Informa Healthcare.

Stimulation of MMP-1 and CCL2 by NAMPT in PDL cells

Periodontitis is an inflammatory disease caused by pathogenic microorganisms and characterized by the destruction of the periodontium. Obese individuals have an increased risk of periodontitis, and elevated circulating levels of adipokines, such as nicotinamide phosphoribosyltransferase (NAMPT), may be a pathomechanistic link between both diseases. The aim of this in vitro study was to examine the regulation of periodontal ligament (PDL) cells by NAMPT and its production under inflammatory and infectious conditions. NAMPT caused a significant upregulation of 9 genes and downregulation of 3 genes, as analyzed by microarray analysis. Eight of these genes could be confirmed by real-time PCR: NAMPT induced a significant upregulation of EGR1, MMP-1, SYT7, ITPKA, CCL2, NTM, IGF2BP3, and NRP1. NAMPT also increased significantly the MMP-1 and CCL2 protein synthesis. NAMPT was significantly induced by interleukin-1β and the periodontal microorganism P. gingivalis. NAMPT may contribute to periodontitis through upregulation of MMP-1 and CCL2 in PDL cells. Increased NAMPT levels, as found in obesity, may therefore represent a mechanism whereby obesity could confer an increased risk of periodontitis. Furthermore, microbial and inflammatory signals may enhance the NAMPT synthesis in PDL cells and thereby contribute to the increased gingival and serum levels of this adipokine, as found in periodontitis. © 2013 Marjan Nokhbehsaim et al.

Parâmetros cinéticos e têmporo-espacial de ovinos hígidos da raça Santa Inês

Pós-graduação em Medicina Veterinária - FMVZ

A quantização da eletrodinâmica de Podolsky em equilíbrio termodinâmico no formalismo de Matsubara-Fradkin

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Aplicação de redes neuronais artificiais ao tratamento e interpretação de perfis geofísicos de poço aberto

A análise dos perfis petrofísicos de poço aberto possui um papel de fundamental importância para os estudos geológicos e geofísicos, no que se refere a obtenção de um maior conhecimento da subsuperfície, bem como para a identificação e exploração de depósitos minerais e petrolíferos. Alguns tópicos importantes da interpretação geológica dos perfis como a determinação de interfaces, a identificação mineralógica e a correlação poço-a-poço são extremamente tediosos e dispendem na sua execução uma grande carga horária. A automação destes procedimentos é em princípio bastante complicada, mas necessária, pois permitirá um melhor aproveitamento do tempo de trabalho do geólogo de produção e do intérprete de perfis. As redes neuronais artificiais apresentam uma boa performance para a solução destes tipos de problema, inclusive nos casos nos quais os algoritmos sequenciais apresentam dificuldades. Mostrar-se-á nesta tese que as redes neuronais artificiais podem ser utilizadas eficientemente para a automação desses procedimentos da interpretação geológica dos perfis. Apresentamos detalhadamente as novas arquiteturas e as aplicações sobre dados sintéticos e perfis reais.

Construção de banco de dados petrofísicos para determinação automática de litologias

Neste trabalho desenvolveu-se uma solução para o clássico problema da determinação automática de litologias. Construiu-se um banco de dados utilizando-se a técnica de análise discriminante aplicada sobre trechos testemunhados de poços perfilados de um campo situado em lâmina d'água profunda localizado na bacia de Campos. A técnica de análise de agrupamento, utilizada por um grande número de pesquisadores, foi testada para o mesmo conjunto de dados porém não forneceu resultados satisfatórios em comparação com os obtidos com a análise discriminante. Os dados de perfis, após sofrerem correções ambientais, são colocados em profundidade com os dados de testemunhagem e determina-se uma função discriminante que classifica as respostas dos perfis de acordo com as litofácies descritas nos testemunhos. Dessa forma obtém-se um banco de dados, a partir do qual se faz a discriminação de litologias em poços, testemunhados ou não, da mesma área. O banco de dados assim construído permite sua atualização através da incorporação de trechos testemunhados de novos poços. Mostra-se a necessidade de agrupar as litologias em quatro litofácies principais para este campo de maneira a padronizar os resultados, diminuir as indeterminações e melhorar a apresentação final. Como produto final obtém-se uma curva discriminada de eletrofácies que reproduz, com algum grau de certeza, as litofácies que reproduzem as litologias esperadas em subsuperfície. Como exemplo de aplicação deste método, utilizou-se as curvas discriminadas para correlacionar três poços, utilizando para isto um algoritmo de correlação automática.

Deconvolução de perfis de poço

A maioria dos perfis de poço utilizados nas avaliações petrofísicas de reservatórios possuem uma resolução vertical na ordem de um metro. Isto cria um problema quando as espessuras típicas das camadas são inferiores a um metro, uma vez que não há correção das leituras. Os perfis de alta resolução vertical como da ferramenta de propagação eletromagnética (EPT, Schlumberger), o dipmeter (SHDT, Schlumberger) ou das ferramentas de varredura acústica ou elétrica possuem uma resolução vertical da ordem de centimetros, mas apresentam uma limitada aplicação para as avaliações petrofísicas. Nós apresentamos um método para a deconvolução de um perfil de baixa resolução vertical que utiliza informações de um perfil de alta resolução vertical para identificar uma nítida interface entre camadas que apresentam valores da propriedade petrofísica contrastante, mas localmente constante em ambos os lados. A partir desse intervalo de controle, nós determinamos a função resposta vertical da ferramenta sob as condições atuais do poço com base no teorema da convolução. Utilizamos várias interfaces de modo a obter valores mais representativos da resposta da ferramenta. O perfil de baixa resolução é então deconvoluido utilizando a transformada discreta de Fourier (FFT) sobre todo o intervalo de interesse. É importante destacar que a invasão do filtrado da lama e a presença do bolo de lama não produzem efeitos danosos sobre o método, que foi aplicado a perfis sintéticos e a dados de campo, onde a aplicação de filtros com um correto ajuste de profundidade, bem como a própria escolha do intervalo de controle, antes da deconvolução, são de extrema importância para o sucesso do método.

Um estudo da estabilidade mecânica de poços a partir de perfis geofísicos em formações pouco consolidadas

A análise da estabilidade mecânica de um poço pode ser feita a partir do cálculo de parâmetros elásticos da formação utilizando a densidade do meio e as velocidades de propagação das ondas compressional e cisalhante na formação rochosa, os quais podem ser obtidos de perfis geofísicos do poço. Em formações sedimentares pouco consolidadas as ferramentas de perfilagem sônica convencionais (monopolares) não conseguem registrar com acuidade a velocidade da onda cisalhante pois a primeira chegada dessa onda é camuflada pela chegada de outras ondas que podem ser mais rápidas que a onda cisalhante num poço perfurado neste tipo de formação. Medidas das velocidades sônicas são feitas em laboratório em amostras da formação, sob condições semelhantes às condições in situ, servindo como ajuste das velocidades registradas no poço pela ferramenta de perfilagem sônica. Para a análise de estabilidade da formação, perfis auxiliares são necessários como o perfil de porosidade, saturação de fluidos e perfis de composição mineralógica da formação rochosa. Exige-se ainda dados de testes de avaliação da formação e de condições do reservatório, mas que são comuns em poços de petróleo, como o teste de formação e os testes de pressurização do poço, tais como o teste de micro-fraturamento hidráulico ou o teste de absorção. A avaliação das tensões principais efetivas que atuam distante do poço, e que não são afetadas pela sua presença, é feita através da associação de um modelo de deformação elástica apropriado e o resultado do teste de pressurização disponível para o poço em estudo. Utilizando resultados clássicos da teoria da elasticidade geral pode-se calcular o campo de tensões modificado na vizinhança da parede do poço devido ao efeito da própria presença do poço ali perfurado e da diferença de pressão existente entre o interior do poço e a formação rochosa. A determinação das propriedades mecânicas da formação a partir das velocidades sônicas e a avaliação do campo de tensões assumindo um modelo elástico de deformação, supõem o meio rochoso no qual as ondas se propagam como elástico, homogêneo e isotrópico. Esta suposição representa a principal aproximação assumida pela metodologia descrita neste trabalho. De posse das propriedades mecânicas da formação e do campo de tensões que age na vizinhança do poço resta definir o critério segundo o qual a rocha sofre instabilidade mecânica quando submetida aquele campo de tensões. Isto permite determinar se, nas condições avaliadas do poço e da formação, haverá quebra da parede do poço por excesso de tensão e, se houver, qual a sua extensão. Assim o problema é como analisar o comportamento mecânico de um poço em uma formação pouco consolidada a partir de perfis geofísicos os quais podem ter problemas no registro das propriedades físicas do meio em formações deste tipo. A metodologia proposta é aplicada a dois intervalos de profundidade pertencentes a dois poços onde arenitos e folhelhos se intercalam e nos quais todos os dados necessários estão disponíveis. Os resultados obtidos mostram que, exceto quando outros mecanismos de quebra da parede do poço agem na formação, a metodologia proposta consegue com sucesso detectar zonas de ocorrência de instabilidade mecânica do poço provocadas por um campo de tensões que excede a resistência mecânica da formação.

A glossary for biometeorology

Here we present, for the first time, a glossary of biometeorological terms. The glossary aims to address the need for a reliable source of biometeorological definitions, thereby facilitating communication and mutual understanding in this rapidly expanding field. A total of 171 terms are defined, with reference to 234 citations. It is anticipated that the glossary will be revisited in coming years, updating terms and adding new terms, as appropriate. The glossary is intended to provide a useful resource to the biometeorology community, and to this end, readers are encouraged to contact the lead author to suggest additional terms for inclusion in later versions of the glossary as a result of new and emerging developments in the field.

Implant-retained finger prosthesis with modified retention system

Background: Amputations affect both the physical and the psychological aspects of an individual, causing significant impact on self-esteem. The main causes of finger amputations are work-related accidents with dangerous machinery, road traffic accidents, and animal bites, as well as systemic diseases such as diabetes. This report aims to describe a simple technique for fabrication of implant-retained finger prosthesis with a modified base of the retention system.Case Description and Methods: The O-Ring retention system was used with a modified hexagon-shaped base and a metallic capsule adapted to the acrylic resin to attach the prosthesis to the implant.Findings and Outcomes: The prosthesis was made with silicone, and after osseointegration, it was installed without complications, leading to a patient satisfied with the end result and encouraged to return to social life.

High Levels of Diversity Uncovered in a Widespread Nominal Taxon: Continental Phylogeography of the Neotropical Tree Frog Dendropsophus minutus

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Avaliação cinemática em cães: revisão

Kinematics is the geometry of motion, including displacement, speed and acceleration, without considering the forces acting over a body. The use of kinematics is still very limited when we are evaluating dogs because of the high cost of the equipment, but the information obtained is objective and precise, what is essential for a trustful evaluation. Taking all this into consideration, this evaluation will describe some researches that used the method, specifying the final objective for each of them. By this analysis, we can conclude that kinematic studies, according to the characteristics of dog races, are necessary to explain how body structure and conformance may affect the function. Besides that, according to normative patterns of a population it is possible to study some diseases and treatment evolution

Antinociceptive, anti-inflammatory and gastroprotective effects of a hydroalcoholic extract from the leaves of Eugenia punicifolia (Kunth) DC. in rodents

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)