Acidovorax citruli: genetic analyses and protocol for its detection in seeds

Bacterial fruit blotch of cucurbits (BFB), caused by the seed borne Gramnegative bacterium Acidovorax citrulli is a serious threat to cucurbit industry worldwide. Since late 1980`s after devastating outbreaks in watermelon fields in southern United States, BFB has spread worldwide and has been reported in other cucurbit crops such as melon, pumpkin, cucumber and squash. To date, there is evidence for the existence of at least two genetically and pathogenically distinct populations of A. citrulli. In Brazil, the first report of BFB was in 1991, in a watermelon field in São Paulo. Although widespread in the country, BFB has been a major problem to melon production. More precisely, BFB has caused significant yield losses to melon production in northeastern Brazil, which concentrates > 90% of the country`s melon production. Despite the management efforts and the recent advances in A. citrulli research, BFB is still a continuous threat to the cucurbit industry, including seed producers, growers and transplant nurseries. To better understand the population structure of A. citrulli strains in Brazil, and to provide a basis for the integrated management of BFB, we used pulsed-field gel electrophoresis (PFGE), multilocus sequence analysis (MLSA) of housekeeping and virulence-associated genes and pathogenicity tests on different cucurbit seedlings to characterize a Brazilian population of A. citrulli strains from different hosts and regions. Additionally, we conducted for the first time a comparative analysis of the A. citrulli group I and II population at genomic level and showed that these two groups differ on their genome sizes due to the presence of eight DNA segments, which are present in group II and absent in group I genomes. We also provide the first evidence to suggest that temperature might be a driver in the ecological adaptation of A. citrulli populations under nutrient-rich or -depleted conditions. Finally, in order to improve the routine detection of A. citrulli on melon seedlots, we designed a new primer set that is able to detect the different Brazilian haplotypes, thus minimizing the risk of false-negatives on PCR-based seed health testing.

Elaboração de embutido cozido tipo salsicha com carne mecanicamente separada de resíduos de filetagem de tilápias do Nilo

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Sistemas multiparticulados revestidos para liberação colônica de metronidazol

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Genetic characterisation of populations of the critically endangered Goliath grouper (Epinephelus itajara, Serranidae) from the Northern Brazilian coast through analyses of mtDNA

The Goliath grouper (Epinephelus itajara) is one of the most endangered species of fish of the subfamily Epinephelinae. Slow to develop and mature, and dependent on mangrove habitats for breeding, the species also suffers intense harvesting, which has reduced drastically in numbers in many areas. To contribute to the understanding of the characteristics of E. itajara populations, we conducted a molecular genetics study of the species, focusing on populations from the Northern Brazilian coast. The mtDNA control region (D-loop) of 116 individuals from five localities (Bragança, Ajuruteua, Parnaíba, Fortaleza and Natal) was analysed, and a sequence of 499 base pairs identified. Analyses of the sequences indicated that genetic variability was generally lower in E. itajara than in other endangered species of the genus. AMOVA found no significant grouping structure among the populations. Nested Clade Analysis revealed a significant association between genetic variability and geographic distribution among only three populations (Ajuruteua, Parnaíba and Natal). Genetic diversity was higher in populations from the Amazon region, which may be related to the better conservation of mangrove habitats in this area. Therefore, the present study could be used for the implementation of conservation and management measures in order to protect and consolidate these populations.

Qualidade do melão 'Orange flesh' minimamente processado e submetido a diferentes métodos de conservação

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Marcha de absorção sob regimes hídricos em Botucatu/SP e caracterização varietal de figos na Espanha

Pós-graduação em Agronomia (Horticultura) - FCA

Qualidade física e sensorial de biscoitos doces com fécula de mandioca

Neste trabalho, foi avaliada a substituição de 5,10 e 15% de farinha de trigo por fécula de mandioca na elaboração de biscoito doce. Ambas, farinha e fécula, foram submetidas à caracterização físico-química, reológica e análise térmica diferencial (DTA). Os biscoitos produzidos foram comparados por meio de análises sensoriais e microbiológicas. O resultado da análise térmica diferencial não mostrou qualquer alteração no comportamento de gelatinização do amido. O teste de aceitação sensorial mostrou que a crocância foi o único atributo que apresentou diferença significativa, indicando a viabilidade técnica de substituição da farinha de trigo por 15% de fécula de mandioca.

Microbiological and physicochemical characterization of surimi obtained from waste of piramutaba fillet

O objetivo deste trabalho foi realizar a caracterização físico-química e microbiológica do surimi obtido de resíduos da filetagem de piramutaba. Os resultados da caracterização físico-química dos resíduos e surimi foram: umidade (76,37 e 79,11%), lipídios totais (5,35 e 0,74%), proteínas (14,92 e 10,79%), cinzas (3,03 e 2,35%), pH (6,9 e 7,4), valor calórico (109,15 e 77,86 kcal.g^-1) e atividade de água (ambos 0,98), respectivamente. Os resultados dos valores de bases voláteis totais foi de 7,29 mgN/100^-1 g (resíduos) e carboidratos de 7,01% (surimi). Os valores de lipídios totais e proteínas foram reduzidos durante o preparo do surimi, provavelmente, devido a sucessivas lavagens durante o processamento. Os resíduos e o surimi foram analisados microbiologicamente estando em conformidade com os parâmetros exigidos. Os resultados mostraram que houve uma perda da cor vermelha (parâmetro a*) e amarela (parâmetro b*). Por outro lado, o parâmetro L* (luminosidade) aumentou após o processamento do surimi. Conclui-se que os resíduos de piramutaba podem ser empregados como matéria-prima de qualidade na elaboração de surimi e como fonte de nutrientes para a alimentação humana, constituindo-se também como uma alternativa para destino dos resíduos, antes lançados no ambiente.

Physicochemical properties of three sugary cassava landraces

Neste trabalho, foram avaliadas propriedades físicas e físico-químicas das raízes de três acessos de mandiocaba (Manihot esculenta Crantz): São Francisco Bag 3, Manicueira 62 e Castanhal Iracema. Os três acessos apresentaram elevada produtividade estimada (≥3,93kg planta^-1) e as suas raízes apresentaram altos teores de açúcares (≥3,92g 100g^-1 de raiz), apresentando-se como uma alternativa para a produção de xarope, particularmente o acesso São Francisco Bag 3 (4,76g 100g^-1). O acesso Manicueira 62 foi o que apresentou o maior conteúdo de amido (4,40g 100^-1). As três raízes estudadas apresentaram altos níveis de cianeto total (>195mg kg^-1), o que indica que elas também necessitam ser processadas antes de serem consumidas.

Processamento e caracterização de snack extrudado a partir de farinhas de quirera de arroz e de bandinha de feijão

Este trabalho teve por objetivo desenvolver nova formulação de snack por extrusão termoplástica a partir de mistura de farinhas de quirera de arroz e de bandinha de feijão, bem como avaliar o potencial nutricional, tecnológico e sensorial do novo produto. A farinha de bandinha de feijão carioca foi incorporada à farinha de quirera de arroz na proporção de 30%. O snack foi produzido em extrusora monorrosca, escala piloto. Os parâmetros de extrusão foram fixos, utilizando-se três zonas de extrusão com temperaturas de 40, 60 e 85 °C; velocidade do parafuso de 177 rpm; taxa de alimentação de 292 g.min-1, e matriz circular de 3,85 mm de diâmetro. A amostra de snack foi submetida a caracterizações fisicoquímica, tecnológica e sensorial. Observou-se efeito significativo da farinha de bandinha de feijão no aumento dos teores proteico e de fibras no snack obtido, quando comparada à farinha de quirera de arroz. Em relação às características tecnológicas do produto, obteve-se 0,17 g.cm-3 para densidade aparente, 7,75 para o índice de expansão e 435, g.f para a dureza instrumental. A formulação estudada foi aceita sensorialmente, com índice de aceitação para impressão global de 76%. Conclui-se que é possível produzir snacks por extrusão a partir da incorporação de 30% de farinha de bandinha de feijão à farinha de quirera de arroz, resultando em produto aceito sensorialmente e com adequado valor nutricional.

Composição florística, estrutura e heterogeneidade ambiental da comunidade arbórea de uma várzea em Porto Ferreira, SP, Brasil

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Physicochemical characteristics of experimental net melon hybrids developed in Brazil

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Reutilization of chemical waste in methodologies for analyses of neutral detergent fiber and acid detergent fiber

The disposal of chemical waste and the precision of analyses of the neutral (NDF) and acid (ADF) detergent fiber contents were evaluated utilizing conventional (Van Soest) and alternative methods of analyses. The recovery of acetone promoted both economic and environmental gains, with a recovery rate of 84.12%. The precision of the analyses was not observed in most of the determinations with reutilization of chemical waste in all the analytical methods tested, in spite of promoting decrease in cost, time invested in the preparation of solutions and the disposal of chemical waste.

Effect of fructooligosaccharides on the physicochemical properties of sour cassava starch and baking quality of gluten-free cheese bread

The present research was undertaken to explore the influence of fructooligosaccharides (FOS) on the functional and thermal properties of sour cassava starch and the quality characteristics of gluten-free (GF) cheese bread. Fructooligosaccharides were used to replace sour cassava starch at substitution level of 9% (SF1), 17% (SF2), and 29% (SF3). The functional and thermal properties of the starch-FOS mixtures were determined by the water absorption index (WAI), water solubility index (WSI), pasting profile analysis, thermal transition temperatures and enthalpy of gelatinization. Moreover, the GF cheese breads with starch-FOS mixtures were analyzed for height, diameter, weight, specific volume and dough moisture content. The sample with the highest FOS content (SF3) presented the lowest WAI (1.44), peak (62.4 rapid visco units (RVU), breakdown (53.4 RVU), final (13.8 RVU), and setback (4.9 RVU) viscosities, dough moisture content (31.7%), and enthalpy of gelatinization (9.5 J/g) and the highest WSI (29.4%) and pasting temperature (69.1 degrees C). The height, diameter and specific volume of GF cheese bread samples made from sour cassava starch were 3.14 cm, 6.35 cm, and 1.49 cm(3)/g, respectively. The SF1 mixture samples resulted in a 3.01 cm height, 6.34 cm diameter, and 1.55 cm(3)/g specific volume. According to Brazilian food labeling regulations, the latter product cannot be categorized as a good source of fiber because the minimum level of fiber per portion was not reached.

Cluster and meta-analyses of genetic parameters for feed intake traits in growing beef cattle

A data set based on 50 studies including feed intake and utilization traits was used to perform a meta-analysis to obtain pooled estimates using the variance between studies of genetic parameters for average daily gain (ADG); residual feed intake (RFI); metabolic body weight (MBW); feed conversion ratio (FCR); and daily dry matter intake (DMI) in beef cattle. The total data set included 128 heritability and 122 genetic correlation estimates published in the literature from 1961 to 2012. The meta-analysis was performed using a random effects model where the restricted maximum likelihood estimator was used to evaluate variances among clusters. Also, a meta-analysis using the method of cluster analysis was used to group the heritability estimates. Two clusters were obtained for each trait by different variables. It was observed, for all traits, that the heterogeneity of variance was significant between clusters and studies for genetic correlation estimates. The pooled estimates, adding the variance between clusters, for direct heritability estimates for ADG, DMI, RFI, MBW and FCR were 0.32 +/- 0.04, 0.39 +/- 0.03, 0.31 +/- 0.02, 0.31 +/- 0.03 and 0.26 +/- 0.03, respectively. Pooled genetic correlation estimates ranged from -0.15 to 0.67 among ADG, DMI, RFI, MBW and FCR. These pooled estimates of genetic parameters could be used to solve genetic prediction equations in populations where data is insufficient for variance component estimation. Cluster analysis is recommended as a statistical procedure to combine results from different studies to account for heterogeneity.