Kaposi's sarcoma-associated herpesvirus latency-associated nuclear antigen 1 mimics Epstein-Barr virus EBNA1 immune evasion through central repeat domain effects on protein processing

Kaposi's sarcoma-associated herpesvirus (KSHV/human herpesvirus 8 [HHV8]) and Epstein-Barr virus (EBV/HHV4) are distantly related gammaherpesviruses causing tumors in humans. KSHV latency-associated nuclear antigen 1 (LANA1) is functionally similar to the EBV nuclear antigen-1 (EBNA1) protein expressed during viral latency, although they have no amino acid similarities. EBNA1 escapes cytotoxic lymphocyte (CTL) antigen processing by inhibiting its own proteosomal degradation and retarding its own synthesis to reduce defective ribosomal product processing. We show here that the LANA1 QED-rich central repeat (CR) region, particularly the CR2CR3 subdomain, also retards LANA1 synthesis and markedly enhances LANA1 stability in vitro and in vivo. LANA1 isoforms have half-lives greater than 24 h, and fusion of the LANA1 CR2CR3 domain to a destabilized heterologous protein markedly decreases protein turnover. Unlike EBNA1, the LANA1 CR2CR3 subdomain retards translation regardless of whether it is fused to the 5′ or 3′ end of a heterologous gene construct. Manipulation of sequence order, orientation, and composition of the CR2 and CR3 subdomains suggests that specific peptide sequences rather than RNA structures are responsible for synthesis retardation. Although mechanistic differences exist between LANA1 and EBNA1, the primary structures of both proteins have evolved to minimize provoking CTL immune responses. Simple strategies to eliminate these viral inhibitory regions may markedly improve vaccine effectiveness by maximizing CTL responses. Copyright © 2007, American Society for Microbiology. All Rights Reserved.

Human interferon B1 ser17: Coding DNA synthesis, expression, purification and characterization of bioactive recombinant protein

A protocol to produce large amounts of bioactive homogeneous human interferon β1 expressed in Escherichia coli was developed. Human interferon β1 ser17 gene was constructed, cloned and subcloned, and the recombinant protein expressed in E. coli cells. Solubilization of recombinant human interferon β1 ser17 (rhIFN-β1 ser17) was accomplished by employing a brief shift to high alkaline pH in the presence of non-ionic detergent. The recombinant protein was purifi ed by three chromatographic steps. N-terminal amino acid sequencing and mass spectrometry analysis provided experimental evidence for the identity of the recombinant protein. Reverse phase liquid chromatography demonstrated that the content of deamidates and sulphoxides was similar to a commercial standard. Size exclusion chromatography demonstrated the absence of high molecular mass aggregates and dimers. The protocol represents an effi cient and high-yield method to obtain bioactive homogeneous monomeric rhIFN-β1 ser17 protein. It may thus represent an important step towards scaling up for rhIFN-β1 ser17 large-scale production. © 2010 Villela AD, et al.

Fusão da ressonância nuclear magnética e cintilografia mamária no carcinoma de mama localmente avançado. Análise da correlação entre os exames em pacientes submetidos à quimioterapia neoadjuvante

Pós-graduação em Pesquisa e Desenvolvimento (Biotecnologia Médica) - FMB

Clonagem, expressão e purificação de domínios da proteína AtRLI2 (RNase L Inhibitor), um supressor endógeno de silenciamento por RNA de Arabidopis thaliana, visando estudos estruturais

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Modelo cinético estocástico para a transcrição considerando colisões entre as moléculas de RNA polimerase

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Estudos estruturais do precursor dos peptídeos potenciadores de Bradicinina e da proteína nudel: nuclear distribution element-like

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Maturação nuclear de ovócitos de cadelas em estro e anestro submetidos à maturação in vitro

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

A contribuition to the study of channel coding in wireless communication systems

Pós-graduação em Engenharia Elétrica - FEIS

Relacionamento filogenético de espécies pertencentes às famílias Coreidae e Pentatomidae (Heteroptera) a partir dos genes mitocondriais COI, 16S e nuclear 18S

Pós-graduação em Genética - IBILCE

Desenvolvimento de um magnetometro a precessão nuclear

O objetivo desta tese foi desenvolver um magnetômetro à precessão nuclear para prospecção geofísica e estações-base magnéticas. O magnetômetro à precessão nuclear mede a intensidade total do campo magnético. Seu funcionamento é baseado na ressonância magnética nuclear. A medida de campo é feita pela de terminação da freqüência de precessão de núcleos de hidrogênio – prótons - de líquidos não viscosos no campo magnético terrestre. O magnetômetro é constituído de duas partes: o sensor e o instrumento de medida. O sensor é uma bobina solenoidal, cujo núcleo é preenchido com o líquido. Três líquidos diferentes foram testados; água, propanol e um querosene sintético. Optou-se pelo uso do querosene porque oferece maior amplitude no sinal de precessão, dando, conseqüentemente, maior relação sinal/ ruído. O sistema de medida contém os circuitos de sintonia e amplificação do sinal e, os circuitos lógicos para a programação da operação e contagem da freqüência de precessão. Cada ciclo de medida tem duração de 3 segundos, sendo 2,3s para a polarização e 0,7s para a recepção do sinal. São possíveis dois modos de operação: manual, reciclando automaticamente e por controle remoto. O sinal de precessão é amplificado seletivamente em uma das 14 faixas de sintonia, que cobrem medidas entre 22000 e 95000 gammas. A freqüência de precessão é multiplicada por um fator de 64 e contada durante um tempo igual a 0,36699s, determinado com base na razão giromagnética do próton. O número de pulsos contados é numericamente igual ao valor do campo magnético em gammas. A resposta pode ser lida em mostradores digitais ou na saída BCD paralela quando operando por controle remoto. A precisão da medida é de 1 gamma. O instrumento foi testado no campo para avaliar a relação sinal/ruído, gradiente suportável e consumo de potência. Nos testes de aplicação do protótipo, foram obtidos dados de variação diurna e realizaram-se levantamentos magnético de reconhecimento e detalhe em um sítio arqueológico na Ilha de Marajó, Pará. As respostas dos testes foram comparados com dois magnetômetros comerciais - o GP-70, McPhar e o G-816, Geometrics e, ainda, com dados do Observatório Magnético de Tatuoca-Pa. Em todos os casos, a comparação dos dados mostrou bom desempenho do magnetômetro em teste.

Sequence characterization of coding regions of the myostatin gene (GDF8) from Brazilian Murrah buffaloes (Bubalus bubalis) and comparison with the Bos taurus sequence

Within about 30 years the Brazilian buffalo (Bubalus bubalis) herd will reach approximately 50 million head as a result of the great adaptive capacity of these animals to tropical climates, together with the good productive and reproductive potential which make these animals an important animal protein source for poor and developing countries. The myostatin gene (GDF8) is important in the physiology of stock animals because its product produces a direct effect on muscle development and consequently also on meat production. The myostatin sequence is known in several mammalian species and shows a high degree of amino acid sequence conservation, although the presence of non-silent and silent changes in the coding sequences and several alterations in the introns and untranslated regions have been identified. The objective of our work was to characterize the myostatin coding regions of B. bubalis (Murrah breed) and to compare them with the Bos taurus regions looking for variations in nucleotide and protein sequences. In this way, we were able to identify 12 variations at DNA level and five alterations on the presumed myostatin protein sequence as compared to non double-muscled bovine sequences.

Contribuição para a clonagem em eqüinos por meio de tranferência nuclear

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Análise das relações filogenéticas entre espécies da subfamília Bryconinae (Ostariophysi: Characiformes: Characidae) utiliando sequeências de DNA mitocrondrial e nuclear

Pós-graduação em Ciências Biológicas (Zoologia) - IBB

(S)-Goniothalamin induces DNA damage, apoptosis, and decrease in BIRC5 messenger RNA levels in NCI-H460 cells

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Building the sugarcane genome for biotechnology and identifying evolutionary trends

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)