Apical sorting of a voltage- and Ca2+-activated K+ channel α-subunit in Madin-Darby canine kidney cells is independent of N-glycosylation

The voltage- and Ca2+-activated K+ (KV,Ca) channel is expressed in a variety of polarized epithelial cells seemingly displaying a tissue-dependent apical-to-basolateral regionalization, as revealed by electrophysiology. Using domain-specific biotinylation and immunofluorescence we show that the human channel KV,Ca α-subunit (human Slowpoke channel, hSlo) is predominantly found in the apical plasma membrane domain of permanently transfected Madin-Darby canine kidney cells. Both the wild-type and a mutant hSlo protein lacking its only potential N-glycosylation site were efficiently transported to the cell surface and concentrated in the apical domain even when they were overexpressed to levels 200- to 300-fold higher than the density of intrinsic Slo channels. Furthermore, tunicamycin treatment did not prevent apical segregation of hSlo, indicating that endogenous glycosylated proteins (e.g., KV,Ca β-subunits) were not required. hSlo seems to display properties for lipid-raft targeting, as judged by its buoyant distribution in sucrose gradients after extraction with either detergent or sodium carbonate. The evidence indicates that the hSlo protein possesses intrinsic information for transport to the apical cell surface through a mechanism that may involve association with lipid rafts and that is independent of glycosylation of the channel itself or an associated protein. Thus, this particular polytopic model protein shows that glycosylation-independent apical pathways exist for endogenous membrane proteins in Madin-Darby canine kidney cells.

Molecular genetics of pattern formation in the inner ear: Do compartment boundaries play a role?

The membranous labyrinth of the inner ear establishes a precise geometrical topology so that it may subserve the functions of hearing and balance. How this geometry arises from a simple ectodermal placode is under active investigation. The placode invaginates to form the otic cup, which deepens before pinching off to form the otic vesicle. By the vesicle stage many genes expressed in the developing ear have assumed broad, asymmetrical expression domains. We have been exploring the possibility that these domains may reflect developmental compartments that are instrumental in specifying the location and identity of different parts of the ear. The boundaries between compartments are proposed to be the site of inductive interactions required for this specification. Our work has shown that sensory organs and the endolymphatic duct each arise near the boundaries of broader gene expression domains, lending support to this idea. A further prediction of the model, that the compartment boundaries will also represent lineage-restriction compartments, is supported in part by fate mapping the otic cup. Our data suggest that two lineage-restriction boundaries intersect at the dorsal pole of the otocyst, a convergence that may be critical for the specification of endolymphatic duct outgrowth. We speculate that the patterning information necessary to establish these two orthogonal boundaries may emanate, in part, from the hindbrain. The compartment boundary model of ear development now needs to be tested through a variety of experimental perturbations, such as the removal of boundaries, the generation of ectopic boundaries, and/or changes in compartment identity.

Cell fate determination in the vertebrate retina.

In the vertebrate central nervous system, the retina has been a useful model for studies of cell fate determination. Recent results from studies conducted in vitro and in vivo suggest a model of retinal development in which both the progenitor cells and the environment change over time. The model is based upon the notion that the mitotic cells within the retina change in their response properties, or "competence", during development. These changes presage the ordered appearance of distinct cell types during development and appear to be necessary for the production of the distinct cell types. As the response properties of the cells change, so too do the environmental signals that the cells encounter. Together, intrinsic properties and extrinsic cues direct the choice of cell fate.

Phage display selection of ligand residues important for Src homology 3 domain binding specificity.

The Src homology 3 (SH3) domain is a 50-aa modular unit present in many cellular proteins involved in intracellular signal transduction. It functions to direct protein-protein interactions through the recognition of proline-rich motifs on associated proteins. SH3 domains are important regulatory elements that have been demonstrated to specify distinct regulatory pathways important for cell growth, migration, differentiation, and responses to the external milieu. By the use of synthetic peptides, ligands have been shown to consist of a minimum core sequence and to bind to SH3 domains in one of two pseudosymmetrical orientations, class I and class II. The class I sites have the consensus sequence ZP(L/P)PP psi P whereas the class II consensus is PP psi PPZ (where psi is a hydrophobic residue and Z is a SH3 domain-specific residue). We previously showed by M13 phage display that the Src, Fyn, Lyn, and phosphatidylinositol 3-kinase (PI3K) SH3 domains preferred the same class I-type core binding sequence, RPLPP psi P. These results failed to explain the specificity for cellular proteins displayed by SH3 domains in cells. In the current study, class I and class II core ligand sequences were displayed on the surface of bacteriophage M13 with five random residues placed either N- or C-terminal of core ligand residues. These libraries were screened for binding to the Src, Fyn, Lyn, Yes, and PI3K SH3 domains. By this approach, additional ligand residue preferences were identified that can increase the affinity of SH3 peptide ligands at least 20-fold compared with core peptides. The amino acids selected in the flanking sequences were similar for Src, Fyn, and Yes SH3 domains; however, Lyn and PI3K SH3 domains showed distinct binding specificities. These results indicate that residues that flank the core binding sequences shared by many SH3 domains are important determinants of SH3 binding affinity and selectivity.

A protein-binding domain, EH, identified in the receptor tyrosine kinase substrate Eps15 and conserved in evolution.

In this report we structurally and functionally define a binding domain that is involved in protein association and that we have designated EH (for Eps15 homology domain). This domain was identified in the tyrosine kinase substrate Eps15 on the basis of regional conservation with several heterogeneous proteins of yeast and nematode. The EH domain spans about 70 amino acids and shows approximately 60% overall amino acid conservation. We demonstrated the ability of the EH domain to specifically bind cytosolic proteins in normal and malignant cells of mesenchymal, epithelial, and hematopoietic origin. These observations prompted our search for additional EH-containing proteins in mammalian cells. Using an EH domain-specific probe derived from the eps15 cDNA, we cloned and characterized a cDNA encoding an EH-containing protein with overall similarity to Eps15; we designated this protein Eps15r (for Eps15-related). Structural comparison of Eps15 and Eps15r defines a family of signal transducers possessing extensive networking abilities including EH-mediated binding and association with Src homology 3-containing proteins.

Un modelo para comprender la dinámica de los territorios rurales. El caso de la Argentina

Los territorios rurales de América Latina, y de la Argentina en particular, han sufrido cambios profundos en las últimas décadas producto de transformaciones en materia productiva, demográfica y social. Los cambios son complejos y han dado lugar a una multiplicidad de miradas y de enfoques sobre la nueva realidad. Frente a esta creciente complejidad, se plantea la construcción de un modelo interpretativo de la realidad rural de la Argentina que bien puede contribuir también para abordar las realidades de otros mundos rurales latinoamericanos. El modelo conceptual que se ofrece se construyó a partir del análisis empírico de numerosos casos de territorios rurales de la Argentina. Dicho modelo permite comprender los complejos procesos de organización y la dinámica rural, además de constituirse en una herramienta de prognosis para la definición de políticas públicas acordes que alienten nuevas dinámicas de desarrollo rural en la Argentina

Análise de práticas de compras sustentáveis aplicada à indústria química brasileira.

No contexto organizacional, o departamento de suprimentos exerce papel fundamental na melhoria dos desempenhos sociais e ambientais de uma cadeia. Dentre as atividades desempenhadas pela função de suprimentos está a seleção de fornecedores na qual são definidos os critérios utilizados para a escolha de um fornecedor. Sendo assim, pode-se afirmar que a função de suprimentos é capaz de estender a sua cadeia requerimentos econômicos, sociais e ambientais. Como objeto desse trabalho foi selecionada a indústria química, uma vez que trata-se de uma indústria base para diversas outras atividades econômicas e com grande importância na economia brasileira. Além disso, é um segmento marcado por acidentes ambientais bem como programas de apoio ambiental e social mundialmente reconhecidos como o Responsible Care. Diante desse contexto, esse trabalho buscou propor um modelo conceitual de seleção de fornecedores que incorpore critérios sociais e ambientais para a indústria química. A partir da revisão de literatura, elaborou-se a proposta de um modelo conceitual capaz de abranger organizações compradoras em diferentes níveis de maturidade para incorporação de critérios sociais e ambientais em seu processo de seleção de fornecedores. A primeira etapa proposta no modelo consiste na utilização de ferramentas simples como listagens, nessa primeira etapa o objetivo é proteger a organização compradora de um comportamento não adequado por parte do fornecedor à legislação pertinente. A segunda etapa do modelo consiste no desenvolvimento de uma base gerencial, estabelecimento de critérios sociais e ambientais e utilização de certificações para seleção de fornecedores. Através do método survey, por correio eletrônico, entre abril a setembro do ano de 2015, objetivou-se compreender as atitudes dos responsáveis por formular e implementar as estratégias de compras em direção às compras sustentáveis. A pesquisa demonstrou que há descompasso entre estratégia e execução no sentido de incorporar as perspectivas sociais e ambientais em um processo de seleção de fornecedores. O estudo indicou que as organizações ainda se encontram em estágios iniciais de seleção do fornecedor e compras em se tratando da inclusão de uma perspectiva socioambiental. As ações apresentam-se mais em termos de políticas e documentações, do que em nível operacional.

Proposta de modelo para o desenvolvimento de projetos minerais sustentáveis no Brasil.

A mineração brasileira, assim como todo o setor da industria de transformação, tem perdido competitividade ao longo do tempo, além disso o Brasil necessita tornar suas operações mais sustentáveis e agregar valor a sua produção industrial. A mineração é um setor onde esta questão se torna mais crítica, pois além de poder gerar forte impacto ambiental, a produção é fortemente baseada em commodities, com baixo valor agregado. Um dos caminhos para superar os obstáculos ao crescimento sustentável da mineração no Brasil é o desenvolvimento de projetos minerais inovadores. As condições estabelecidas pelo governo brasileiro para incentivo à inovação são muito abrangentes, práticas e atrativas; os recursos para financiamento são abundantes e os mecanismos para operacionalização extremamente profissionais. No entanto, na maioria das empresas brasileiras estão presentes a aversão ao risco, a falta das práticas de planejamento e de gestão de projetos e a visão de curto prazo focada na atuação corretiva, fatores que não favorecem o ambiente inovador nas empresas. Ou seja, o grande desafio para a mudança da mineração brasileira, tornando-a mais sustentável e competitiva, está na forma de pensar dos seus lideres; pois as condições existentes para desenvolvimento tecnológico estão disponíveis, mas as empresas necessitam aprender a utilizá-las. Este é um trabalho de pesquisa aplicada, que apresenta uma proposta de metodologia para desenvolvimento de projetos minerais sustentáveis, que foi utilizada por algumas empresas e obteve resultados muito positivos; com isto, é possível estabelecer um caminho que favoreça a mudança da cultura predominante, facilitando o desenvolvimento de inovações na mineração e contribuindo para o seu ganho de competitividade e sustentabilidade. A aplicação da metodologia proposta foi aplicada em um caso hipotético de mineração de ferro e os resultados foram muito positivos, demonstrando que o projeto inovador e sustentável seria muito mais competitivo que um tradicional, principalmente, em momentos de mercado em baixa.

Processo de desenvolvimento de produtos em PMEs industriais do setor de imóveis hospitalares.

Nas Pequenas e Médias Empresas (PMEs) industriais em que o seu produto é essencialmente metal mecânico e o desenvolvimento de produtos é estratégico, surgem questões sobre quais são as metodologias mais adequadas para as diferentes fases de projeto de produto e como implantá-las em um modelo de Processo de Desenvolvimento de Produto (PDP) adequado às necessidades dessas empresas, de modo a aumentar a probabilidade de sucesso do produto. O presente trabalho propõe um modelo de referência do PDP aplicado a PMEs industriais do setor metal mecânico que desenvolvem móveis hospitalares. O modelo é baseado em propostas de PDP da grande área mecânica, especificidades do produto, a saber, móveis hospitalares e dispositivos médicos e em fatores da realidade das PMEs. O trabalho divide-se nas seguintes fases principais: revisão bibliográfica sobre propostas de modelos de gestão do PDP da grande área mecânica e do setor específico de móveis e dispositivos médicos, revisão de normas e regulamentações que tenham influência no PDP, realização de estudos de casos múltiplos de PMEs industriais metal mecânicas que desenvolvem móveis hospitalares, no Brasil e na Colômbia e, por último, síntese de uma proposta final do modelo de referência de PDP, específico para as PMEs industriais do setor metal mecânico que desenvolvem móveis hospitalares, aplicado à realidade do Brasil e da Colômbia.

No anticorrelation between cyclotron line energy and X-ray flux in 4U 0115+634

We report on an outburst of the high mass X-ray binary 4U 0115+634 with a pulse period of 3.6 s in 2008 March/April as observed with RXTE and INTEGRAL. During the outburst the neutron star’s luminosity varied by a factor of 10 in the 3–50 keV band. In agreement with earlier work we find evidence of five cyclotron resonance scattering features at ~10.7, 21.8, 35.5, 46.7, and 59.7 keV. Previous work had found an anticorrelation between the fundamental cyclotron line energy and the X-ray flux. We show that this apparent anticorrelation is probably due to the unphysical interplay of parameters of the cyclotron line with the continuum models used previously, e.g., the negative and positive exponent power law (NPEX). For this model, we show that cyclotron line modeling erroneously leads to describing part of the exponential cutoff and the continuum variability, and not the cyclotron lines. When the X-ray continuum is modeled with a simple exponentially cutoff power law modified by a Gaussian emission feature around 10 keV, the correlation between the line energy and the flux vanishes, and the line parameters remain virtually constant over the outburst. We therefore conclude that the previously reported anticorrelation is an artifact of the assumptions adopted in the modeling of the continuum.

Modulation allostérique du récepteur FP dans le cancer colorectal

Les prostaglandines modulent d’importants rôles physiologiques. Elles sont aussi impliquées dans le développement d’une variété de conditions pathologiques telles l’inflammation, la douleur et le cancer. La prostaglandine PGF2α et son récepteur (récepteur FP) se trouvent impliqué dans la modulation de nombreuses pathologies tels lors de l’accouchement préterme et le cancer colorectal. Récemment, nous avons fait partie d’un groupe de recherche ayant développé des modulateurs allostériques du récepteur FP. Dans une première étude, l’action du PGF2α sur le déclenchement des contractions myométriales a été évaluée, car peu d’information est connue sur la signalisation de cette prostaglandine lors de l’accouchement. Ainsi, nous avons utilisé un peptidomimétique de la deuxième boucle extracellulaire, dénommée PDC113.824. Nos résultats ont démontré que le PDC113.824 permettait de retarder la mise bas chez des souris gestantes, mais agissait de manière différente sur les multiples voies de signalisation de la PGF2α. Ainsi, le PDC113.824 inhibait la voie RhoA-ROCK, dépendante de l’activation de la protéine Gα12 par le. Les protéines RhoA-ROCK sont des acteurs clés dans le remodelage du cytosquelette d’actine et des contractions myométriales lors de l’accouchement. De plus, le PDC113.824 en présence de PGF2α agit comme un modulateur positif sur la voie dépendante de l’activation de la protéine Gαq. Le PDC113.824 serait donc un modulateur allostérique non compétitif possédant des actions à la fois de modulateurs positifs et négatifs sur la signalisation du récepteur FP Dans une seconde étude, des analogues du PDC113.824 ont été conçus et analysés dans un second modèle pathologique, le cancer colorectal. Ce cancer possède de hauts niveaux de récepteur FP. Nous avons donc étudié le rôle du récepteur FP dans le développement et la progression du cancer colorectal et l’effet de modulateurs allostériques. Il est généralement accepté que dans le cancer colorectal, la prostaglandine PGE2 permet la croissance et l’invasion tumorale, ainsi que l’angiogenèse. Toutefois, peu d’informations sont connues sur le rôle du PGF2α dans le cancer colorectal. C’est dans ce contexte que nous avons décidé d’examiner la contribution de ce récepteur dans la progression du cancer colorectal et cherché à déterminer si la modulation des fonctions du récepteur FP a un impact sur la croissance de tumeurs colorectales. Nos recherches ont révélé que l’activation du récepteur FP permet la migration et la prolifération de plusieurs lignées cellulaires humaines et murines d’adénocarcinomes colorectaux. Dans ce contexte, nos expériences ont démontré que la migration des cellules cancéreuses était dépendante de l’activation de la voie Rho. Nos résultats démontrent qu’en effet, l’activation de RhoA, une petite GTPase clé de la voie Gα12, est inhibée de façon sélective par nos composés. De plus, nos molécules allostériques sont également efficaces pour inhiber la voie de signalisation de la ß-caténine, une protéine impliquée dans la genèse du cancer colorectal. In vivo, le traitement de souris avec un des ces modulateurs a permis une inhibition effective de la croissance tumorale. Dans l’ensemble, nos résultats suggèrent donc que les modulateurs allostériques des récepteurs FP pourraient constituer une nouvelle classe de médicaments utilisés pour le traitement du cancer colorectal.

Un modelo para comprender la dinámica de los territorios rurales. El caso de la Argentina

Los territorios rurales de América Latina, y de la Argentina en particular, han sufrido cambios profundos en las últimas décadas producto de transformaciones en materia productiva, demográfica y social. Los cambios son complejos y han dado lugar a una multiplicidad de miradas y de enfoques sobre la nueva realidad. Frente a esta creciente complejidad, se plantea la construcción de un modelo interpretativo de la realidad rural de la Argentina que bien puede contribuir también para abordar las realidades de otros mundos rurales latinoamericanos. El modelo conceptual que se ofrece se construyó a partir del análisis empírico de numerosos casos de territorios rurales de la Argentina. Dicho modelo permite comprender los complejos procesos de organización y la dinámica rural, además de constituirse en una herramienta de prognosis para la definición de políticas públicas acordes que alienten nuevas dinámicas de desarrollo rural en la Argentina

Un modelo para comprender la dinámica de los territorios rurales. El caso de la Argentina

Los territorios rurales de América Latina, y de la Argentina en particular, han sufrido cambios profundos en las últimas décadas producto de transformaciones en materia productiva, demográfica y social. Los cambios son complejos y han dado lugar a una multiplicidad de miradas y de enfoques sobre la nueva realidad. Frente a esta creciente complejidad, se plantea la construcción de un modelo interpretativo de la realidad rural de la Argentina que bien puede contribuir también para abordar las realidades de otros mundos rurales latinoamericanos. El modelo conceptual que se ofrece se construyó a partir del análisis empírico de numerosos casos de territorios rurales de la Argentina. Dicho modelo permite comprender los complejos procesos de organización y la dinámica rural, además de constituirse en una herramienta de prognosis para la definición de políticas públicas acordes que alienten nuevas dinámicas de desarrollo rural en la Argentina

Hodgkin's lymphoma cell lines express a fusion protein encoded by intergenically spliced mRNA for the multilectin receptor DEC-205 (CD205) and a novel C-type lectin receptor DCL-1

Classic Hodgkin's lymphoma (HL) tissue contains a small population of morphologically distinct malignant cells called Hodgkin and Reed-Sternberg (HRS) cells, associated with the development of HL. Using 3'-rapid amplification of cDNA ends ( RACE) we identified an alternative mRNA for the DEC-205 multilectin receptor in the HRS cell line L428. Sequence analysis revealed that the mRNA encodes a fusion protein between DEC-205 and a novel C-type lectin DCL-1. Although the 7.5-kb DEC-205 and 4.2-kb DCL-1 mRNA were expressed independently in myeloid and B lymphoid cell lines, the DEC-205/DCL-1 fusion mRNA (9.5 kb) predominated in the HRS cell lines ( L428, KM-H2, and HDLM-2). The DEC-205 and DCL-1 genes comprising 35 and 6 exons, respectively, are juxtaposed on chromosome band 2q24 and separated by only 5.4 kb. We determined the DCL-1 transcription initiation site within the intervening sequence by 5'-RACE, confirming that DCL-1 is an independent gene. Two DEC-205/DCL-1 fusion mRNA variants may result from cotranscription of DEC-205 and DCL-1, followed by splicing DEC-205 exon 35 or 34-35 along with DCL-1 exon 1. The resulting reading frames encode the DEC-205 ectodomain plus the DCL-1 ectodomain, the transmembrane, and the cytoplasmic domain. Using DCL-1 cytoplasmic domain-specific polyclonal and DEC-205 monoclonal antibodies for immunoprecipitation/Western blot analysis, we showed that the fusion mRNA is translated into a DEC-205/DCL-1 fusion protein, expressed in the HRS cell lines. These results imply an unusual transcriptional control mechanism in HRS cells, which cotranscribe an mRNA containing DEC-205 and DCL-1 prior to generating the intergenically spliced mRNA to produce a DEC-205/DCL-1 fusion protein.