Aquatic macroinvertebrates survey and assessment of two artificial reservoirs into conservation units from the Southeast Region of Brazil

This study aims to inventory and assess the aquatic macroinvertebrates fauna in two artificial reservoirs into conservation units with differences regarding conservation level and to anthropogenic impacts. The samplings were carried out in Caetetus Ecological Station and Bauru City Zoological Park, where some physical and chemical variables also were measured. The results obtained indicated that the Caetetus Ecological Station is more effective in the conservation of the diversity of aquatic macroinvertebrates compared to Bauru City Zoological Park. These results can be attributed to the strong anthropogenic impact suffered by the reservoir in Bauru and demonstrate the importance of these areas in maintaining the diversity of aquatic macroinvertebrates community.

Diversity and genetic population structure of the Brazilian sharpnose shark Rhizoprionodon lalandii

Similar to many small, range-restricted elasmobranchs, the Brazilian sharpnose shark (Rhizoprionodon lalandii) is listed as 'data deficient' by the International Union for the Conservation of Nature (IUCN). Data on stock assessment and sustainability are scarce, and there is no information on population structure. This constitutes a management problem because this shark comprises approximately 50% of the catch of small coastal sharks in Brazil. In this study, populations of R. lalandii distributed from the Caribbean to southern Brazil were investigated using sequences from the mitochondrial DNA control region. Analysis of molecular variance revealed strong structuring between population samples from the Caribbean and those from the Brazilian coast (F{cyrillic}ST=0.254, P<0.0001). Significant differences in the rates of genetic diversity between these major areas were also detected. The observed levels of population structuring are likely to be driven by female phylopatry. Therefore, the identification of both mating and nursery areas with parallel ban/restriction of fishing in these areas may be critical for the long-term sustainability of these populations. © 2013 John Wiley & Sons, Ltd.

Responses of aquatic insect functional diversity to landscape changes in Atlantic forest

The Atlantic Forest domain, one of the 25 world's hotspots for biodiversity, has experienced dramatic changes in its landscape. While the loss of species diversity is well documented, functional diversity has not received the same amount of attention. In this study, we evaluated functional diversity of insects in streams utilizing three indices: functional diversity (FD), functional dispersion (FDis), and functional divergence (FDiv), seeking to understand the roles of three predictor sets in explaining functional patterns: (1) bioclimatic and landscape variables; (2) spatial variables; and (3) local environmental variables. We determined the amount of variation in different measures of functional diversity that was explained by each predictor set and their interplays using variation partitioning. Our study showed that variation in functional diversity is better explained by a set of variables linked to different scales dependent on spatial structures, indicating the importance of landscape and mainly environmental variables in the functional organization of aquatic insect communities, and that the relative importance of predictor sets depends on the indices considered. Variation in FD was better explained by the interplay among the three predictor sets and by local environmental variables, whereas variation in FDis was better explained by spatial variables and by the interplay between environmental and spatial variables. Variation in FDiv was not significantly explained by any predictors. Our study adds more evidence on the harmful effects caused by landscape changes on biodiversity in the Atlantic Forest, suggesting that these effects also influence the functional organization of stream insect communities. © 2013 The Author(s) Journal compilation © 2013 by The Association for Tropical Biology and Conservation.

No changes in seedling recruitment when terrestrial mammals are excluded in a partially defaunated Atlantic rainforest

One of the most intriguing questions in ecology is how to identify which and how many species will be able to inhabit human-modified landscapes. Large-bodied mammals structure plant communities by trampling, herbivory, seed dispersal and predation, and their local extinction may have pervasive consequences in plant communities due to the breakdown of key interactions. Although much attention has been given to understanding the effects of defaunation on plant communities, information on the potential impacts on plant functional groups (seed dispersal, seed size and seedling leaves defense) inhabiting continuous forests after defaunation is scarce. We conducted mammal surveys (line transects and camera trapping) to determine the defaunation status of a continuous Atlantic forest in Brazil. Then, we evaluated the effects of defaunation on seedling diversity, richness and abundance of functional groups using 15 plot-pairs (each pair with one open and one exclusion plot) monitored over 36. months. We found that the studied area is partially defaunated because it exhibits high abundance of primates, while terrestrial mammals, such as large rodents and ungulates, are rare. We found no significant changes in either seedling richness and diversity or in the seedling composition of plant functional groups in response to mammal exclosure. Seedling mortality and recruitment were similar between plot types. Our findings suggest that at semi-defaunated areas, where arboreal species are still present, terrestrial mammals have low impacts on the plant community reassembly. © 2013 Elsevier Ltd.

Evaluation of the microbial diversity of denitrifying bacteria in batch reactor

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Estudo químico de Jatropha curcas e de Jatropha gossypifolia nativas e cultivadas: avaliação de ciclopeptídeos em função de habitat e hábito : prospecção e atividade biológica

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Composição florística de comunidades epifíticas vasculares em unidades de conservação no Estado de São Paulo

Pós-graduação em Ciências Biológicas (Biologia Vegetal) - IBRC

Estudos taxonômicos e biológicos de Cunaxidae (Acari: Prostigmata) do Brasil

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Insecta e Arachnida associados ao solo: plantas herbáceas como área de refúgio visando ao controle biológico conservativo

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Molecular studies of Callithrix pygmaea (Primates, Platyrrhini) based on transferrin intronic and ND1 regions: implications for taxonomy and conservation

As classificações tradicionais envolvendo os macacos da infraordem Platyrrhini, principalmente baseadas em características morfológicas, têm sido contestadas por dados moleculares recentes. A subfamília Callitrichinae (Platyrrhine, Primates) engloba um diverso grupo de espécies, muitas das quais consideradas em perigo de extinção. A presente análise de duas regiões do DNA, um gene mitocondrial (ND1) e um gene nuclear (regiões intrônicas da transferrina), sugerem que Callithrix pygmaea apresenta variabilidade suficiente para justificar a existência de subespécies ou até mesmo de espécies distintas. As árvores filogenéticas baseadas na região do ND1 indicam que esta espécie está relacionada mais proximamente aos marmosets amazônicos do que aos da mata Atlântica. Estes resultados reabrem a discussão sobre diversidade e programas de conservação baseados apenas em classificações taxonômicas tradicionais.

Mitochondrial DNA mapping of social-biological interactions in Brazilian Amazonian African-descendant populations

ABSTRACT: The formation of the Brazilian Amazonian population has historically involved three main ethnic groups, Amerindian, African and European. This has resulted in genetic investigations having been carried out using classical polymorphisms and molecular markers. To better understand the genetic variability and the micro-evolutionary processes acting in human groups in the Brazilian Amazon region we used mitochondrial DNA to investigate 159 maternally unrelated individuals from five Amazonian African-descendant communities. The mitochondrial lineage distribution indicated a contribution of 50.2% from Africans (L0, L1, L2, and L3), 46.6% from Amerindians (haplogroups A, B, C and D) and a small European contribution of 1.3%. These results indicated high genetic diversity in the Amerindian and African lineage groups, suggesting that the Brazilian Amazonian African-descendant populations reflect a possible population amalgamation of Amerindian women from different Amazonian indigenous tribes and African women from different geographic regions of Africa who had been brought to Brazil as slaves. The present study partially mapped the historical biological and social interactions that had occurred during the formation and expansion of Amazonian African-descendant communities.

A ictiofauna de poças rochosas de maré: padrões de distribuição associados ao espaço e ambiente

Em estudos com comunidades biológicas, a busca por padrões de ocorrência e distribuição das espécies vêm ganhando espaço em pesquisas realizadas nas últimas décadas. O conhecimento da estrutura das comunidades e suas relações, associados às interações desses organismos com o meio ambiente, fornecem subsídios necessários para a manutenção dessas comunidades, bem como informações relevantes em planos de conservação e manejo. Sendo assim, o objetivo desta pesquisa foi avaliar o efeito do ambiente e do espaço na estruturação da assembleia de peixes de poças rochosas de maré, descrevendo o padrão de ocupação das espécies nesse ambiente, testando a hipótese de que o espaço possui maior efeito na estruturação da ictiofauna. Foram amostradas 80 poças rochosas ao longo da Zona Costeira Amazônica, sendo 40 no período de maior precipitação e 40 no período de estiagem de 2011. Estas poças estão localizadas em cinco praias do litoral paraense e foram mensuradas quanto ao volume, a distância da margem e as variáveis físico-químicas da água, como pH, temperatura e salinidade. Foram coligidos 1.311 peixes, sendo 633 indivíduos na chuva e 648 na estiagem. Os indivíduos estão distribuídos em nove ordens, 14 famílias e 21 espécies, sendo a Ordem Perciformes a ordem mais abundante, com B. soporator e L. jocu sendo as espécies mais representativas. Os resultados obtidos na rotina BioEnv evidenciaram que as variáveis abióticas pH, temperatura e volume são responsáveis pela estruturação da comunidade. O cálculo da diversidade β evidenciou uma ampla variação de dados, abrangendo desde a substituição total das espécies até comunidades idênticas entre si, quanto à ocorrência e abundância. A DCA evidenciou que o período pluviométrico não é determinante na distribuição das espécies, uma vez que não há diferença na composição entre os dois períodos. O efeito do espaço e do ambiente sobre a comunidade foi pequeno, uma vez que a maior parte da variação não foi explicada utilizando-se todas as variáveis ambientais, como em uma segunda análise, em que só foram utilizadas as variáveis definidas pela rotina BioEnv. Seguindo o mesmo padrão, a pRDA apenas para as variáveis mais correlacionadas evidenciou que: 6% respondem ao ambiente, 4% ao espaço, 2% ao ambiente e espaço e 88% são outros fatores. Os resultados obtidos nessas análises comprovam que os fatores abióticos mensurados, bem como a distância entre as amostras, não são determinantes na composição e distribuição da ictiofauna em poças rochosas, refutando assim a hipótese de que o espaço possui efeito na estruturação da ictiofauna, uma vez que as condições ambientais sofrem constantes perturbações ocasionadas pelo movimento de marés. Sendo assim, as espécies que ocupam esse ambiente se mostram adaptadas, e por isso, não teriam sua distribuição afetada pela variação dos parâmetros ambientais nessa escala de estudo, respondendo somente ao efeito do espaço.

Uso de hábitats por mamíferos terrestres de médio e grande porte na Serra do Cachimbo, PA

Mamíferos neotropicais de médio e grande porte são ainda pouco estudados. Na Amazônia as lacunas no conhecimento científico sobre este grupo ocorrem principalmente pela dificuldade da realização de estudos mais completos durante curtos períodos de tempo e recursos financeiros limitados. Para minimizar estes problemas, métodos indiretos de estudá-los têm sido utilizados como alternativa aos métodos tradicionais e por isso foram aplicados neste trabalho. Com o intuito de se detectar como a comunidade local de mamíferos de médio e grande porte faz uso do hábitat, através da comparação da freqüência de uso de diferentes fitofisionomias obtida por meio da contabilização de pegadas, pretende-se contribuir para a conservação e identificação de áreas de alto valor biológico para as espécies estudadas. A riqueza de espécies e a freqüência relativa de uso de hábitats foram analisadas de forma comparativa entre a Campina, a Savana Arbórea Aberta (Campo Cerrado), a Savana Arbórea Densa (Cerradão) e a Floresta Ombnifila através de três visitas à área de estudo. Foram obtidos registros de 33 espécies, distribuídas em 8 ordens, 18 famílias e 29 gêneros. As formações fitofisionômicas na área de estudo não diferiram em termos da presença de espécies, com exceção da fauna de primatas, que é particular de formações florestais. Entretanto, com relação ao uso de hábitats, foram demonstradas tendências distintas na freqüência de uso de cada formação fitofisionômica pelas diferentes espécies. A maioria das espécies registradas pelo método de detecção de pegadas parece sofrer os efeitos da variação sazonal do regime de chuvas. Além disso parecem depender mais das formações fitofisionômicas florestais. Isto fica claro quando é demonstrada uma maior diversidade e uso dos hábitats florestados pelas espécies estudadas. Entretanto, são versáteis na ocupação dos diferentes tipos de hábitat, com exceção de espécies arborícolas. Sendo assim, a Serra do Cachimbo apresenta uma fauna rica e diversificada talvez devido ao fato desta região apresentar uma mesclagem de elementos fitofisionômicos distintos, o que favoreceria tanto espécies com preferências por hábitats florestais quanto savanóides.

Predicting biological parameters of estuarine benthic communities using models based on environmental data

Este trabalho objetivou predizer parâmetros da estrutura de associações macrobentônicas (composição específica, abundância, riqueza, diversidade e equitatividade) em estuários do Sul do Brasil, utilizando modelos baseados em dados ambientais (características dos sedimentos, salinidade, temperaturas do ar e da água, e profundidade). As amostragens foram realizadas sazonalmente em cinco estuários entre o inverno de 1996 e o verão de 1998. Em cada estuário as amostras foram coletadas em áreas não poluídas, com características semelhantes quanto a presença ou ausência de vegetação, profundidade e distância da desenbocadura. Para a obtenção dos modelos de predição, foram utilizados dois métodos: o primeiro baseado em Análise Discriminante Múltipla (ADM) e o segundo em Regressão Linear Múltipla (RLM). Os modelos baseados em ADM apresentaram resultados melhores do que os baseados em regressão linear. Os melhores resultados usando RLM foram obtidos para diversidade e riqueza. É possível então, concluir que modelos como aqui derivados podem representar ferramentas muito úteis em estudos de monitoramento ambiental em estuários.

Determinação qualitativa de enterobactérias presentes em tartarugas da Amazônia (podocnemis expansa) de vida livre e cativeiro

A tartaruga da amazônia (Podocnemis expansa) corresponde a um recurso faunístico muito importante para as populações ribeirinhas da região amazônica, além de ser uma das principais espécies indicadas para produção em cativeiro. O consumo dessa espécie como alimento na região, gerou uma demanda de estudos quanto à questão sanitária e seu impacto na saúde pública. O principal objetivo deste trabalho foi avaliar a microbiota intestinal de tartarugas da amazônia de vida livre e cativeiro, verificando a ocorrência de bactérias da Família Enterobacteriaceae no trato intestinal desses animais. Para isso, foram utilizadas 116 tartarugas adultas, de ambos os sexos, sendo que, 51 foram capturadas na Ilha de São Miguel, município de Santarém (PA), 50 animais pertenciam a um cativeiro comercial e 15 eram provenientes de um criadouro conservacionista, localizados na região metropolitana de Belém, Pará. De cada animal, foi colhida amostra de material biológico cloacal, utilizando-se swabs estéreis para em seguida serem acondicionados em tubos com meios de transporte e enviados ao laboratório para análises bacteriológicas. Todas as amostras foram imersas em caldos Selenito e BHI durante 24 horas e posteriormente semeadas em Agar Shigella-Salmonella e Agar Mac Conkey na temperatura de 37ºC por 24 horas. As UFCs (Unidades formadoras de colônia) foram semeadas em Agar Muller Hilton por mais 24 horas em estufa a 37ºC e identificadas pelo sistema Vitek® totalmente automatizado. Do total de 116 amostras foram obtidos 245 crescimentos bacterianos nos quais 83 (33,87%) eram provenientes dos animais de vida livre, com a identificação de 20 espécies bacterianas. Nos animais mantidos em cativeiro, foram obtidos 162 (65,72%) isolamentos, identificando-se 10 espécies de bactérias. Oito espécies foram encontradas em ambos os ambientes e 14 espécies em apenas um deles. A espécie Klebsiella pneumoniae foi a mais frequente, com 52 isolamentos, totalizando 21,22% dos crescimentos bacterianos, seguida de Enterobacter cloacae (35/14,29%), Serratia marcescens (29/11,84%) e Salmonella species (24/9,80%). Nos quelônios de vida livre, os microrganismos mais isolados constituiram-se dos genêros Enterobacter, Klebsiella, Citrobacter e Aeromonas. Klebsiella pneumoniae, Serratia marcescens, Enterobacter cloacae e Salmonella spp. apresentaram frequências elevadas naqueles animais cativos. Este resultado evidencia uma maior diversidade de microrganismos entre os animais de vida livre e uma contaminação elevada por amostra nos animais de cativeiro. As espécies Salmonella sp., E. coli e Acinetobacter ssp., tiveram sua frequência aumentada provavelmente devido a influência do cativeiro, sendo portanto, sugeridas como indicativas da qualidade sanitária de populações da tartaruga da Amazônia.