Memoria del TFC Scientific Ubuntu LiveDVD.

El usuario objetivo para el que queremos construír un LiveDVD, es elinvestigador/estudiante que necesita de unas herramientas concretas para la resoluciónde problemas de carácter matemático y estadístico, que, unido a generadores de gráficos,son comunes a la mayoría de áreas científicas y de investigación. Otras áreas de interésson construír aplicaciones en un entorno de desarrollo avanzado (IDE) e incluso un gestorde referencias bibliográficas. Añadiremos también un editor de texto basado en LaTeXmuy útil para la generación de documentos de manera profesional y una herramienta deplanificación de proyectos.

Reliability of stable carbon and oxygen isotope compositions of pedogenic needle fibre calcite as environmental indicators: examples from Western Europe.

Stable carbon and oxygen isotope analyses were conducted on pedogenic needle fibre calcite (NFC) from seven sites in areas with roughly similar temperate climates in Western Europe, including the Swiss Jura Mountains, eastern and southern France, northern Wales, and north-eastern Spain. The δ(13)C values (-12.5 to-6.8 0/00 Vienna Pee Dee Belemnite (VPDB)) record the predominant C(3) vegetation cover at the sites. A good correlation was found between mean monthly climatic parameters (air temperature, number of frost days, humidity, and precipitation) and δ(18)O values (-7.8 to-3.40/00 VPDB) of all the NFC. Similar seasonal variations of δ(18)O values for monthly NFC samples from the Swiss sites and those of mean monthly δ(18)O values of local precipitation and meteorological data point out precipitation and preferential growth/or recrystallisation of the pedogenic needle calcite during dry seasons. These covariations indicate the potential of stable isotope compositions of preserved NFC in fossil soil horizons as a promising tool for palaeoenvironmental reconstructions.

Publication trends of shared decision making in 15 high impact medical journals: a full-text review with bibliometric analysis.

BACKGROUND: Shared Decision Making (SDM) is increasingly advocated as a model for medical decision making. However, there is still low use of SDM in clinical practice. High impact factor journals might represent an efficient way for its dissemination. We aimed to identify and characterize publication trends of SDM in 15 high impact medical journals. METHODS: We selected the 15 general and internal medicine journals with the highest impact factor publishing original articles, letters and editorials. We retrieved publications from 1996 to 2011 through the full-text search function on each journal website and abstracted bibliometric data. We included publications of any type containing the phrase "shared decision making" or five other variants in their abstract or full text. These were referred to as SDM publications. A polynomial Poisson regression model with logarithmic link function was used to assess the evolution across the period of the number of SDM publications according to publication characteristics. RESULTS: We identified 1285 SDM publications out of 229,179 publications in 15 journals from 1996 to 2011. The absolute number of SDM publications by journal ranged from 2 to 273 over 16 years. SDM publications increased both in absolute and relative numbers per year, from 46 (0.32% relative to all publications from the 15 journals) in 1996 to 165 (1.17%) in 2011. This growth was exponential (P < 0.01). We found fewer research publications (465, 36.2% of all SDM publications) than non-research publications, which included non-systematic reviews, letters, and editorials. The increase of research publications across time was linear. Full-text search retrieved ten times more SDM publications than a similar PubMed search (1285 vs. 119 respectively). CONCLUSION: This review in full-text showed that SDM publications increased exponentially in major medical journals from 1996 to 2011. This growth might reflect an increased dissemination of the SDM concept to the medical community.

Toxoplasma gondii: 1908-2008, homage to Nicolle, Manceaux and Splendore

The discovery of Toxoplasma gondii independently by Nicolle and Manceaux (1908) and Splendore (1908) was to open a "Pandora's Box" that has led research on this parasite into a number of scientific disciplines. In the 100 years since its discovery, the mystery surrounding T. gondii and its inter-relationship with humans has continued to provide a stimulating source of material in many areas of research, resulting in the publication of almost 20,000 papers and a number of books. This flood of diverse information shows no sign of abating, with an average of 10 papers per week appearing in PubMed. Herein, it is impossible to do more than provide a very superficial comment on what has become a massive body of scientific information. T. gondii has many unique features and seems to be the "exception to almost every rule" thus acting as a focus for research in disciplines from epidemiology to immunology to human behaviour to cell biology to human disease. In this review a number of the historical advances will be mentioned and combined with a description of the basic biology of the parasite.

Aspectos éticos de las comunicaciones cientificas

Artículo especial. Este texto está basado en el trabajo final del Master de Bioética y Humanización de la Asistencia realizado en la Escuela de Bioética de San Juan de Dios (Sevilla), Facultad de Teología de Granada, Universidad de Comillas durante los cursos 2006-07 y 2007-08.

Validador de políticas de acceso abierto

MELIBEA és un directori i validador de polítiques en favor de l'accés obert a la producció científico-acadèmica. Com a directori, descriu les polítiques institucionals existents relacionades amb l'accés obert (AO) a la producció científica i acadèmica. Com a validador, les sotmet a una anàlisi qualitatiu i quantitatiu basat en el compliment d'un conjunt d'indicadors que reflecteixen les bases en què es fonamenta una política institucional. El validador indica una puntuació i un percentatge de compliment per a cada una de les polítiques analitzades. Això es realitza a partir dels valors assignats a certs indicadors i la seva ponderació en funció de la seva importància relativa. La suma dels valors ponderats de cadascun dels indicadors s'ajusta a una escala percentual i condueix al que hem anomenat "Percentatge validat d'accés obert", el càlcul del qual s'exposa en l'apartat de Metodologia. Els tipus d'institucions que s'analitzen són universitats, centres de recerca, agències finançadores i organitzacions governamentals.

Indicadors bibliomètrics de l'activitat científica de Catalunya (Scopus, 2003-2008) : síntesi

L'enfocament principal d'aquest informe elaborat per Scimago, una de les principals fonts d'informació estadística, se centra en el sistema de producció científica de Catalunya i la seva relació amb l'Estat espanyol i amb el món. L'estudi conté un conjunt d'indicadors de macroanàlisi basada en comparacions amb altres comunitats autònomes; una anàlisi sobre el rendiment segons categories temàtiques i de manera comparada amb l'Estat espanyol i el món, i aportacions per a una microanàlisi. Les anàlisis comprenen la producció científica de tota mena d'institucions agrupades en els sectors universitari, sanitari, d'ens públics de recerca i ens privats. Les conclusions de l'estudi revelen que l'impacte científic de la recerca catalana és semblant al del Canadà, Singapur o Finlàndia. L'informe situa Catalunya com la primera comunitat espanyola pel que fa a l'impacte científic internacional. Matemàtiques, química, immunologia, ciències mediambientals, física, informàtica, ciències dels materials, medicina i agricultura són les àrees de recerca a Catalunya amb un impacte superior a la mitjana mundial. Les enginyeries registren un dèficit de producció científica si es compara amb l'activitat mundial.

Indicadores bibliométricos de la actividad científica de Cataluña (Scopus, 2003-2008) : síntesis

L'enfocament principal d'aquest informe elaborat per Scimago, una de les principals fonts d'informació estadística, se centra en el sistema de producció científica de Catalunya i la seva relació amb l'Estat espanyol i amb el món. L'estudi conté un conjunt d'indicadors de macroanàlisi basada en comparacions amb altres comunitats autònomes; una anàlisi sobre el rendiment segons categories temàtiques i de manera comparada amb l'Estat espanyol i el món, i aportacions per a una microanàlisi. Les anàlisis comprenen la producció científica de tota mena d'institucions agrupades en els sectors universitari, sanitari, d'ens públics de recerca i ens privats. Les conclusions de l'estudi revelen que l'impacte científic de la recerca catalana és semblant al del Canadà, Singapur o Finlàndia. L'informe situa Catalunya com la primera comunitat espanyola pel que fa a l'impacte científic internacional. Matemàtiques, química, immunologia, ciències mediambientals, física, informàtica, ciències dels materials, medicina i agricultura són les àrees de recerca a Catalunya amb un impacte superior a la mitjana mundial. Les enginyeries registren un dèficit de producció científica si es compara amb l'activitat mundial.

Pigments and plasters discovered in the House of Diana (Cosa, Grosseto, Italy): An integrated study between art history, archaeology and scientific analyses

The pigments and the plasters of the Roman frescoes discovered at the House of Diana (Cosa, Grosseto, Italy) were analysed using non-destructive and destructive mineralogical and chemical techniques. The characterization of both pigments and plasters was performed through optical microscopy, scanning electron microscopy and electron microprobe analysis. The pigments were identified by Raman spectroscopy and submitted to stable isotope analysis. The results were integrated with the archaeological data in order to determine and reconstruct the provenance, trade patterns and the employment of the raw materials used for the elaboration of the frescoes.

Bulky DNA adducts, 4-aminobiphenyl-haemoglobin adducts and diet in the European Prospective Investigation into Cancer and Nutrition (EPIC) prospective study

In contrast to some extensively examined food mutagens, for example, aflatoxins, N-nitrosamines and heterocyclic amines, some other food contaminants, in particular polycyclic aromatic hydrocarbons (PAH) and other aromatic compounds, have received less attention. Therefore, exploring the relationships between dietary habits and the levels of biomarkers related to exposure to aromatic compounds is highly relevant. We have investigated in the European Prospective Investigation into Cancer and Nutrition (EPIC) cohort the association between dietary items (food groups and nutrients) and aromatic DNA adducts and 4-aminobiphenyl-Hb adducts. Both types of adducts are biomarkers of carcinogen exposure and possibly of cancer risk, and were measured, respectively, in leucocytes and erythrocytes of 1086 (DNA adducts) and 190 (Hb adducts) non-smokers. An inverse, statistically significant, association has been found between DNA adduct levels and dietary fibre intake (P = 0·02), vitamin E (P = 0·04) and alcohol (P = 0·03) but not with other nutrients or food groups. Also, an inverse association between fibre and fruit intake, and BMI and 4-aminobiphenyl-Hb adducts (P = 0·03, 0·04, and 0·03 respectively) was observed. After multivariate regression analysis these inverse correlations remained statistically significant, except for the correlation adducts v. fruit intake. The present study suggests that fibre intake in the usual range can modify the level of DNA or Hb aromatic adducts, but such role seems to be quantitatively modest. Fibres could reduce the formation of DNA adducts in different manners, by diluting potential food mutagens and carcinogens in the gastrointestinal tract, by speeding their transit through the colon and by binding carcinogenic substances.