Estudo da distribuição de metais em água, sedimento e organismos aquáticos de rios e reservatórios pertencentes à rede de monitoramento da qualidade dos sedimentos do estado de São Paulo, Brasil

Dissertação (Mestrado)

Influência dos fatores abióticos sobre a variação espaço-temporal de paralonchurus brasiliensis (Steindachner, 1875) (pisces, sciaenidae) componente da fauna acompanhante da pesca de camarões no litoral Norte de São Paulo

Knowledge of the environmental factors influence on the spatial-temporal variation of fishes is important to fisheries management and conservation. Thus, the aim of this work was to analyze the influence of the abiotical factors on the spatial-temporal distribution of Paralonchurus brasiliensis (Pisces, Sciaenidae) caught by-catch with the shrimp fishing of Ubatuba and Caraguatatuba regions, north coast of São Paulo State. The fishes were captured every month from January to December 2002. Samples were collected by otter trawl at 5, 10, 15, 20, 25, 30 and 35m depths. The temperatures (surface and bottom), salinities (surface and bottom), sediment features and organic matters were verified for each depth. During all period of the study 12.642 specimens of P. brasiliensis were captured at Ubatuba and 17.166 at Caraguatatuba, which totalized the biomass of 267 for the first and 339kg for the other region. The females outnumbered males in fish population. The greatest values of biomass and number of individuals were registered at the summer and autumn seasons, while the lowest values were observed at the winter and spring seasons. The greatest abundances were found from 15 to 25m depth. In this study, it was verified that P. brasiliensis is a coastal waters associate species. The spatialtemporal distribution of P. brasiliensis is affected by intrusion of SACW and depth for the coastal region and by depth and sediment in sheltered areas such as Caraguatatuba

Desenvolvimento ponderal de bubalinos da raça Murrah criados em pastagem de Brachiaria brizantha no Centro-Oeste do Estado de São Paulo, Brasil

Foram analisados os dados de desempenho ponderal de bubalinos Murrah do Sistema de Produção de Leite da Universidade Estadual Paulista, Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia, campus de Botucatu. Os pesos foram corrigidos às diversas idades-padrão e o modelo incluiu os efeitos de sexo (S), mês (M) e ano (A) de nascimento, classe de idade da búfala ao parto (C) e as interações S x M, S x A, S x C e M x A. As médias ajustadas e respectivos erros-padrão estimados para as características estudadas foram: Peso ao Nascer (PN): 37,71 ± 8,25kg; Peso aos 120 dias (P120): 102,08 ± 16,27kg; Peso aos 240 dias (P240): 169,84 ± 22,83kg; Peso aos 365 dias (P365): 250,59 ± 25,12kg; Peso aos 550 dias (P550): 326,13 ± 39,27kg e Peso aos 730 dias (P730): 389,80 ± 31,26kg. O efeito de sexo (S) foi significativo somente para PN e P365, sendo que machos tenderam a nascer mais pesados que fêmeas. O mês de nascimento (M) exerceu efeito sobre o PN, P120 e P730 sendo que animais nascidos em maio foram os mais pesados ao nascer, enquanto os nascidos em janeiro e maio, foram os mais pesados aos 120 e 730 dias, respectivamente. O efeito de ano de foi significativo sobre o PN, P120, P240 e P730. Os filhos de búfalas das classes de idade 1 (3 anos ou menos) e da classe 6 (10,11 e 12 anos) foram os mais leves e mais pesados ao nascer, respectivamente. O fato de a classe de idade da búfala não exercer efeito sobre os P365, P550 e P730 sugere que, em rebanhos comerciais possa ser feita a substituição de búfalas não gestantes por novilhas prenhes, apesar de esta prática reduzir a média de idade do rebanho de cria. Bubalinos da raça Murrah oriundos de rebanhos leiteiros podem ser utilizados para a produção de carne.

Geoprocessing applied to the assessment of environmental noise: a case study in the city of Sorocaba, São Paulo, Brazil

Noise mapping has been used as an instrument for assessment of environmental noise, helping to support decision making on urban planning. In Brazil, urban noise is not yet recognized as a major environmental problem by the government. Besides, cities that have databases to drive acoustic simulations, making use of advanced noise mapping systems, are rare. This study sought an alternative method of noise mapping through the use of geoprocessing, which is feasible for the Brazilian reality and for other developing countries. The area chosen for the study was the central zone of the city of Sorocaba, located in So Paulo State, Brazil. The proposed method was effective in the spatial evaluation of equivalent sound pressure level. The results showed an urban area with high noise levels that exceed the legal standard, posing a threat to the welfare of the population.

Checklist dos mamíferos do Estado de São Paulo, Brasil

A fauna de mamíferos do estado de São Paulo consta de 231 táxons, sendo este número uma estimativa da real diversidade presente na região, dado a falta de amostragem em grandes extensões do estado, e também de revisões taxonômicas para determinados grupos. Ainda assim, nosso conhecimento aumentou em 20% desde a última estimativa em 1998, principalmente em relação aos quirópteros e roedores. Estes dados são provenientes de inventários faunísticos, e também do estudo de espécimes depositados em coleções científicas oriundos de revisões taxonômicas. Também temos um maior volume de dados a respeito da distribuição dos mamíferos em relação às diferentes paisagens presentes no estado, o que nos permite dividir a mastofauna em três componentes distintos: o mais importante desses é o das espécies generalistas, que ocorrem em todas as principais paisagens do estado; o segundo grupo concentra espécies das formações abertas, e o terceiro grupo inclui as espécies essencialmente florestais. Além disso, o número de estudos que tem se preocupado com o efeito da fragmentação de hábitats sobre as comunidades de mamíferos, bem como a respeito da permeabilidade das espécies em áreas alteradas, também aumentaram. Dados a respeito da ocorrência, abundância e vulnerabilidade das espécies foram essenciais para traçar estratégias em relação à escolha de áreas e à indicação de ações prioritárias para a conservação dos mamíferos no estado, assim como classificar as espécies nas diferentes categorias de ameaças propostas, culminando na Lista das Espécies Ameaçadas do Estado de São Paulo. Entretanto, ainda existem inúmeras lacunas de conhecimento, que vão desde o número limitado de amostras zoológicas, até a falta de informações acerca da ecologia e história natural de várias espécies. É imprescindível que aumentemos as amostras de mamíferos em coleções zoológicas, principalmente em áreas de Floresta Ombrófila Densa, nos fragmentos de Cerrado, bem como em áreas do centro e oeste do Estado, que permanecem ainda pouco estudadas, com o objetivo de produzir um maior número de revisões taxonômicas em diversos grupos de mamíferos, e de estudos com abordagens filogeográficas e de genética de populações, para diagnosticarmos de forma efetiva a riqueza de mamíferos no estado, bem como os mecanismos evolutivos responsáveis por esta diversificação. Aliados a esses estudos serão necessárias abordagens ecológicas para gerarmos conhecimento, que em conjunto, nos permitirá avaliarmos o estado de conservação dos mamíferos de São Paulo e tomarmos decisões sobre as melhores estratégias para manejarmos e preservarmos estas espécies.

Avaliação da potencial migração de Helicoverpa armigera (Lepidoptera: Noctuidae) por massas de ar para áreas produtoras de cultivos hospedeiros do Estado de São Paulo.

Resumo Helicoverpa armigera (Hübner, 1808) (Lepidoptera: Noctuidae) é um inseto exótico, altamente polífago, que foi detectado no Brasil em 2013 causando sérios danos em cultivos de soja, milho e algodão, localizados em áreas estaduais específicas das regiões Nordeste e Centro-Oeste com a presença do bioma Cerrado. Após o período de um ano o inseto foi identificado em várias regiões do País. A literatura indica que o inseto adulto apresenta características físicas que favorecem sua grande capacidade de voo, tanto em distância (100-1000 km) quanto a elevadas altitudes (maiores que 1,5 km acima do nível do solo), aumentando o seu potencial para dispersão de longo alcance, principalmente por voos migratórios das áreas já atacadas. Por essa razão, as massas de ar brasileiras podem atuar como potenciais facilitadoras à atividade migratória do inseto a longas distâncias para as áreas de maior concentração de seus cultivos hospedeiros preferenciais, resultante da atração natural do inseto aos fatores químicos delas decorrentes. Desse modo, devem ser consideradas em avaliações de áreas mais propícias à presença de H. armigera para orientar monitoramentos e estratégias de manejo locais. Este trabalho avaliou a potencial migração de H. armigera por massas de ar para áreas produtoras de cultivos hospedeiros do estado de São Paulo, considerando seus municípios produtores de algodão, soja, milho, tomate, feijão, café e laranja; as principais massas de ar brasileiras; a presença de grandes áreas com cultivos de eucalipto e pinus (outras potenciais barreiras físicas ao inseto); e a localização do bioma Cerrado paulista. Informações das áreas produtoras e das áreas plantadas por município de 2008, 2012 e 2014, disponibilizadas pelo IBGE, foram utilizadas em planos de informação georreferenciados, elaborados em ArcGis 10.3, para identificar a localização de suas respectivas grandes áreas em cada ano. O cruzamento georreferenciado também resultou mapas das áreas plantadas em 2014 com todos os cultivos citados, indicando as de maior potencial de infestação/reinfestações de H. armigera no estado de São Paulo, para orientar monitoramentos e estratégias de Manejo Integrado de Pragas - MIP locais. Abstract Helicoverpa armigera (Hübner, 1808) (Lepidoptera: Noctuidae) is an exotic insect highly polyphagous, which was detected in Brazil in 2013 causing serious damage to soybean, corn and cotton crops located in specific state areas in the northeast and center-west regions with the presence of Cerrado Biome (similar to the Savannah). After a oneyear period, the insect was detected in several regions of the country. Foreign literature indicates that the adult phase of the insect shows certain physical characteristics which favor its great flight capacity, even related to reach long distances (100-1000 Km) as many as to reach high altitudes (overtaken 1.5 Km above the ground level), increasing its potential of farthest dispersion, mainly by migratory flights from the areas already attacked. Therefore, the Brazilian air masses may act as potentially enhance the insect's farthest migratory activity to areas of greater concentration of its preferential host crops due to the insect's natural attraction to their chemical factors. Thus, migration potential of H. armigera by air masses toward preferential host crop areas must be considered in evaluations of most favorable areas to the presence of the insect to guide monitoring and local management strategies. The present work evaluated the H. armigera migration potential by air masses toward producing areas of host crops in São Paulo state, Brazil, considering its municipalities producing cotton, soybean, corn, tomato, bean, coffee, orange, eucalyptus and pine trees, as well as the main Brazilian air masses and the presence of Cerrado Biome in the state. Information of producing and of planting areas with the annual crops by municipalities in 2008, 2012 and 2014, provided by IBGE, were used in cross-maps made using ArcGis 10.3, in order to identify the location of their respective greater areas in each year. Cross-maps also provided results indicating the planting areas in 2014 with all crops already mentioned, as well as the potential areas to infestation/reinfestations of H. armigera in São Paulo State, in order to guide monitoring and local strategies of IPM.

Reproductive cycle of the swimming crab Portunus spinimanus Latreille (Crustacea, Decapoda, Brachyura) from Ubatuba, São Paulo, Brazil

This study analyses some reproductive aspects of Portunus spinimanus Latreille, 1819, a crab usually commercialized in Ubatuba region. Monthly otter-trawl collections were taken for two years along the northern coast of São Paulo State, Brazil. The reproductive period was studied based on the frequency of ovigerous females in the population along the year; the frequency of physiologically mature swimming crabs and the type of spawn. The condition of development of ovigerous females ovary was associated with the stage of eggs development. This species presents continuous reproduction in Ubatuba region and total spawn, but with successive broods, which suggests a multiple spawn during the reproduction period.

Influência dos fatores abióticos sobre a variação espaço-temporal de paralonchurus brasiliensis (Steindachner, 1875) (pisces, sciaenidae) componente da fauna acompanhante da pesca de camarões no litoral Norte de São Paulo

Knowledge of the environmental factors influence on the spatial-temporal variation of fishes is important to fisheries management and conservation. Thus, the aim of this work was to analyze the influence of the abiotical factors on the spatial-temporal distribution of Paralonchurus brasiliensis (Pisces, Sciaenidae) caught by-catch with the shrimp fishing of Ubatuba and Caraguatatuba regions, north coast of São Paulo State. The fishes were captured every month from January to December 2002. Samples were collected by otter trawl at 5, 10, 15, 20, 25, 30 and 35m depths. The temperatures (surface and bottom), salinities (surface and bottom), sediment features and organic matters were verified for each depth. During all period of the study 12.642 specimens of P. brasiliensis were captured at Ubatuba and 17.166 at Caraguatatuba, which totalized the biomass of 267 for the first and 339kg for the other region. The females outnumbered males in fish population. The greatest values of biomass and number of individuals were registered at the summer and autumn seasons, while the lowest values were observed at the winter and spring seasons. The greatest abundances were found from 15 to 25m depth. In this study, it was verified that P. brasiliensis is a coastal waters associate species. The spatialtemporal distribution of P. brasiliensis is affected by intrusion of SACW and depth for the coastal region and by depth and sediment in sheltered areas such as Caraguatatuba

Toxoplasma gondii antibodies in wild rodents and marsupials from the Atlantic Forest, state of São Paulo, Brazil

Toxoplasma gondii é um protozoário parasita que infecta animais de sangue quente, incluindo seres humanos. Pequenos roedores e marsupiais têm papel importante na epidemiologia do T. gondii, pois são fontes de infecção para os felídeos domésticos e selvagens. Amostras de soro de 151 roedores e 48 marsupiais, capturados na Mata Atlântica, Estado de São Paulo, Sudeste do Brasil, foram analisadas para a pesquisa de anticorpos anti-T. gondii. Os anticorpos foram detectados pelo Teste de Aglutinação Modificada (MAT ≥ 25), com 8,6% (13/151) dos roedores e 10,4% (5/48) dos marsupiais soropositivos, com títulos variando de 25 a 6.400 e de 25 a 3.200, respectivamente, para os roedores e os marsupiais. Três das oito espécies de roedores (Akodon spp., Oligoryzomys nigripes e Rattus norvegicus) e uma das quatro espécies de marsupiais (Didelphis aurita) apresentaram animais positivos. A presença de anticorpos anti-T. gondii foi descrita pela primeira vez no roedor Oligoryzomys nigripes.

Haplotype characterization of the COI mitochondrial gene in Chrysoperla externa (Neuroptera: Chrysopidae) from different environments in Jaboticabal, state of São Paulo, southeastern Brazil

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Brucellosis due to Brucella suis in a swine herd associated with a human clinical case in the State of São Paulo, Brazil

Brucella suis has been recognized as the major etiological agent of human brucellosis in areas free from Brucella melitensis infection. However, with changes in swine management, the occurrence of swine brucellosis has decreased as has the human incidence of B. suis infection. A swine brucellosis outbreak within a herd from Jaboticabal (So Paulo, Brazil) was detected in July 2006. The herd comprised approximately 300 sows and 1,500 finishing animals. Many sows within this herd experienced abortions, while others exhibited vaginal discharge; three sows suffered posterior paralysis. Among 271 sows, 254 (93.7%) tested positive for brucellosis by complement fixation, and among 62 randomly bled finishing animals, 17 (27.4%) also tested positive. The B. suis biovar 1 was cultured from 14 aborted fetuses and six sows. Brucella was identified using routine methods. Fourteen farm workers were tested using agglutination tests, with three workers showing evidence of Brucella antibody titers. A 39-year-old woman, who worked with maternal pigs and had direct contact with aborted fetuses, presented an agglutinating titer of 480 IU/mL and displayed clinical signs of infection. Our findings suggest that despite a reduction of swine brucellosis throughout Brazil, B. suis infection still occurs, thereby posing a zoonotic risk.

Isolation of Pseudomonas aeruginosa strains from dental office environments and units in Barretos, state of São Paulo, Brazil, and analysis of their susceptibility to antimicrobial drugs

Uma ampla variedade de patógenos oportunistas tem sido detectadas nos tubos de alimentação de água dos equipos odontológicos, particularmente no biofilme formado na superfície do tubo. Entre os patógenos oportunistas encontrados nos tubos de água, Pseudomonas aeruginosa é reconhecida como uma das principais causadoras de infecções nosocomiais. Foram coletadas 160 amostras de água e 200 amostras de fomites em quarenta clinicas odontológicas na cidade de Barretos, São Paulo, Brasil, durante o período de Janeiro a Julho de 2005. Setenta e seis cepas de P. aeruginosa, isoladas a partir dos fomites (5 cepas) e das amostras de água (71 cepas), foram analisadas quanto à susceptibilidade à seis drogas antimicrobianas freqüentemente utilizadas para o tratamento de infecções provocadas por P. aeruginosa. As principais suscetibilidades observadas foram para a ciprofloxacina, seguida pelo meropenem. A necessidade de um mecanismo efetivo para reduzir a contaminação bacteriana dentro dos tubos de alimentação de água dos equipos odontológicos foi enfatizada, e o risco da exposição ocupacional e infecção cruzada na prática odontológica, em especial quando causada por patógenos oportunistas como a P. aeruginosa foi realçado.

Thermochronology of the South American platform in the state of São Paulo, Brazil, through apatite fission tracks

The fission-track method (FTM) in apatite was applied to 45 samples collected in the Serra da Mantiqueira (Mantiqueira mountain range), the Serra do Mar (Mar mountain range), regions next to these mountain ranges and the coastal region between Ubatuba and Santos in the State of São Paulo, Brazil, to study the thermochronology of the South American Platform in southeast Brazil and its influence on Santos and Campos basins. The data presented in this work complement the previously presented data on the same region (Tello Saenz et al., 2003. J. S. Am. Earth Sci. 15, 765-774) with 31 new samples analyzed. The weighted mean of the corrected ages from high Mantiqueira (around 1000 m), (121 +/- 6) Ma, coincides with the South Atlantic opening. The fact that its thermal history starts at a relatively low temperature (similar to 80 degrees C) suggests that the age of similar to 120 Ma would be the formation age of Serra da Mantiqueira due to a rapid pulse, in which tracks had no time to be retained at the closure temperature, that is similar to 120 degrees C. The Serra do Mar presents a more complicated thermal history, with several reactivations indicated by the changes in the slope of its cooling curve. The thermal histories obtained in the regions next to these mountain ranges are compatible with the results mentioned above. The Santos Basin has unconformities that agree with changes in the slope thermal histories of the studied region. (c) 2005 Elsevier Ltd. All rights reserved.

Monitoring of the dissemination of Salmonella in the chicken Frankfurt-sausage production line of a sausage factory in the state of São Paulo, Brazil

Poultry meat and its derivatives are among the foodstuffs considered by environmental health authorities to present the highest risks to the public. A total of 185 samples were collected in five monthly batches, from different processing stages in a sausage plant that uses mechanically-deboned chicken meat (MDCM) and tested for the presence of Salmonella. Enrichment was carried out in both Kauffman tetrathionate broth and Rappaport-Vassiliadis broth and isolation on Salmonella-Shigella agar and brilliant-green agar. Live Salmonella bacteria were isolated from six samples of the raw meat and from the emulsion, in batches three, four and five, but not from any sample in batches one or two. The six isolated strains were all classified as Salmonella Albany, which has not previously been reported in MDCM. of the two enrichment broths, Rappaport-Vassiliadis gave the better results. The Pattern of contamination suggests a probable common source, given that a new supplier was used in the third, fourth, and fifth months. It was also shown that the industrial cooking was effective in preventing Salmonella surviving in the final product.

Isolation and isoenzyme characterization of Leishmania (Viannia) braziliensis from a case of human cutaneous leishmaniasis in northeast centre of the state of São Paulo

The diagnosis of human cutaneous leishmaniasis in small towns is sometimes made without the species identification of the Leishmania, even in areas without previous epidemiological surveys. Here we report the isolation of a Leishmania strain from a patient of Rincão, state of São Paulo, that was identified by isoenzyme characterization as L. (Viannia) braziliensis. Sand fly collections were made in the area where the patient live in order to investigate the likely vector species.