Human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) genotyping in Rio de Janeiro, Brazil: assessing subtype and drug-resistance associated mutations in HIV-1 infected individuals failing highly active antiretroviral therapy

In order to assess the human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) drug resistance mutation profiles and evaluate the distribution of the genetic subtypes in the state of Rio de Janeiro, Brazil, blood samples from 547 HIV-1 infected patients failing antiretroviral (ARV) therapy, were collected during the years 2002 and 2003 to perform the viral resistance genotyping at the Renageno Laboratory from Rio de Janeiro (Oswaldo Cruz Foundation). Viral resistance genotyping was performed using ViroSeqTM Genotyping System (Celera Diagnostic-Abbott, US). The HIV-1 subtyping based on polymerase (pol) gene sequences (protease and reverse transcriptase-RT regions) was as follows: subtype B (91.2%), subtype F (4.9%), and B/F viral recombinant forms (3.3%). The subtype C was identified in two patients (0.4%) and the recombinant CRF_02/AG virus was found infecting one patient (0.2%). The HIV-1 genotyping profile associated to the reverse transcriptase inhibitors has shown a high frequency of the M184V mutation followed by the timidine-associated mutations. The K103N mutation was the most prevalent to the non-nucleoside RT inhibitor and the resistance associated to protease inhibitor showed the minor mutations L63P, L10F/R, and A71V as the more prevalent. A large proportion of subtype B was observed in HIV-1 treated patients from Rio de Janeiro. In addition, we have identified the circulation of drug-resistant HIV-1 subtype C and are presenting the first report of the occurrence of an African recombinant CRF_02/AG virus in Rio de Janeiro, Brazil. A clear association between HIV-1 subtypes and protease resistance mutations was observed in this study. The maintenance of resistance genotyping programs for HIV-1 failing patients is important to the management of ARV therapies and to attempt and monitor the HIV-1 subtype prevalence in Brazil.

Construcció d'un Sistema d'Informació Geogrà fica per a la gestió de rutes en camins no cartografiats

La resolució de la problemàtica exposada al llarg d'aquest treball s'aborda en dues fases. Una primera constitueix un estudi teòric dels diversos conceptes implicats: SIG, cartografia, geodèsia i GPS, amb especial atenció al tipus de receptors GPS disponibles al mercat. La segona part és eminentment pràctica i està formada per l'exposició de la solució adoptada per a respondre a les necessitats de l'empresa

Plaisir et souffrance au travail : une lecture psychodynamique au sein d'un office régional de placement suisse

En Suisse, comme dans la plupart des pays industrialisés, le stress au travail et l'épuisement qui en découle sont devenus, au cours des dernières décennies, une réalité qui ne cesse de s'accentuer. Différentes disciplines scientifiques ont tenté de rendre compte, depuis le milieu du siècle dernier, des difficultés rencontrées par les individus dans le cadre de leur travail, avec une prédominance marquée pour des analyses de type causaliste. Dans le cadre de cette étude doctorale, nous nous sommes penché sur le cas d'un office régional de placement, mais avec une perspective sensiblement différente. La grille de lecture psychodynamique utilisée permet en effet de donner accès au sens des situations de travail et d'ouvrir sur une compréhension originale des mécanismes à l'origine des problèmes de santé mentale au travail. Cette approche permet ainsi de comprendre les rapports complexes que les individus entretiennent avec leur travail tel que structuré et organisé, et d'analyser leur expérience en termes de plaisir, de souffrance, de défenses face à la souffrance et de répercussions sur la santé. Dans ce but, nous avons utilisé une méthodologie basée sur des entrevues collectives, afin de stimuler l'expression libre des travailleurs. L'enquête s'est déroulée en deux temps : une première série d'entretiens de groupe a permis la récolte des données empiriques, puis une seconde série, appelée entretiens de restitution, a donné la possibilité aux participants de réagir sur l'interprétation de leur parole faite par le chercheur, et de valider l'analyse. Nos résultats mettent alors en évidence que le travail, tel qu'organisé au sein de cette institution de service public, apparaît considérablement pathogène, mais heureusement compensé par le pouvoir structurant de la relation d'aide aux assurés. Ils montrent également que l'expérience subjective de travail des participants a pour principales sources de souffrance la perception désagréable d'un manque de reconnaissance, d'autonomie et de pouvoir sur leurs actes. - In Switzerland and in other industrialized countries, work-related stress and resulting burn-out has become an ever increasing problem in recent decades. Many researchers Jrom many different fields have made efforts to understand the difficulties employees encounter at work since the middle of the last century. Most of this research is based on a cause and effect analysis approach. For this doctoral research project, we have analyzed cases handled by an unemployment office in Switzerland. We have taken a novel approach by using a number of psychodynamic criteria which permitted us to interpret situations at work and to open up a new way of understanding the mechanisms at work which lead to mental health problems. This approach allows us to understand account the complex relationship people have towards structured and organized work as well as to take into account and to analyze their experience in terms of pleasure, suffering, defense mechanisms against suffering and the consequences on their mental health. In order to achieve this goal we performed collective interviews in order to encourage workers to express themselves freely. The interviews were divided into two series. The first series of group interviews allowed us to collect empirical statistics and the second series gave the workers an opportunity to react to the researchers ' analysis of their answers and to validate the researchers ' interpretation of their answers. Our results show that work has considerable negative effects on mental health. Fortunately, these negative effects are counterbalanced by the psychological support system offered by the unemployment office. Our project also shows that the subjective negative experiences of workers are caused by their perceptions of being under-appreciated, lack of autonomy and having no power over their acts.

Relevé des consultations et des transferts de patients par enquête directe auprès des médecins: méthode d'une enquête, acceptabilité et limites d'interprétation. [Summary of consultations and transfer of patients by a direct survey of physicians: survey methods, acceptability and limits of interpretation].

A survey of medical ambulatory practice was carried out in February-March 1981 in the two Swiss cantons of Vaud and Fribourg (total population: 700,000), in which 205 physicians participated. The methodology used was inspired from the U.S. National Ambulatory Medical Care Survey, the data collection instrument of which was adapted to our conditions; in addition, data were gathered on all referrals prescribed by 154 physicians during two weeks. (The instruments used are presented.) The potential and limits of this type of survey are discussed, as well as the representativity of the participating physicians and of the recorded visits, which are a systematic sample of over 43,000 visits.

Evaluation of the natural killer cytotoxicity and the levels of cytokines in rats with type I diabetes mellitus

Type I diabetes mellitus (insulin-dependent DM = IDDM) is a chronic disease characterized by specific destruction of pancreatic beta cells, resulting in an absolute lack of insulin. Immune mechanisms, genetic susceptibility, and environmental factors are all implicated in the pathogenesis of Type 1 diabetes. This study was aimed at determining the efficiency of cytokines, natural killer (NK) cells in the pathophysiology of IDDM. Therefore, we evaluated the plasma levels of cytokines by specific enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) and the cytotoxicity activity of NK cells by anti-candididal index in rats with type I diabetes. We found that the cytotoxicity activity of NK cells in IDDM groups significantly decreased compared to the control groups. The levels of interferon-g (IFN-g) in IDDM groups were slightly higher than in healthy controls. These results indicate that the changes of T H1 type cytokines such as IFN-g and NK cell activity can play a role in the etiology of IDDM. The data may provide new strategies for the treatment of IDDM.

Estudi d'eines CASE que suporten OCLper a la generació automà tica de codi Java

Es tracta d'una recerca d'eines CASEque actualment suporten OCL en la generació automàtica de codi Java per estudiar-les ianalitzar-les a través d'un model de proves consistent en un diagrama de classes del modelestàtic de l'UML i una mostra variada d'instruccions OCL, amb l'objectiu de detectar lesseves mancances, analitzant el codi obtingut i determinar si controla o no cada tipus derestricció, i si s'han implementat bé en el codi.

Implication des hôpitaux en évaluation des technologies de la santé : quel rôle pour les hôpitaux? : éléments théoriques et enquête auprès d'établissements suisses et québécois

Le présent mémoire traite de l'implication des hôpitaux universitaires en évaluation des technologies de la santé. Le champ d'étude est vaste : - L'évaluation des technologies de la santé est une discipline dont l'étendue fait appel aux sciences exactes (physique, statistiques, ingénierie, méthodologie de la recherche analytique, etc.) ainsi qu'aux sciences sociales (économie, éthique, etc.) - L'hôpital universitaire est une organisation des plus complexes qui soit. Le "produit final" - l'amélioration de la santé du patient - est totalement non standardisé, il n'existe pas de modèle d'hôpital universitaire type et unique (inclusion ou non d'un centre de recherche, d'une faculté de médecine, d'un comité de gestion politique, etc.) et les corps de métiers qui le composent sont des plus variés et représentés en grand nombre Ainsi, l'étendue du champ relève des domaines interdépendants tels que la technologie (elle-même incluse dans le domaine de l'innovation aujourd'hui en développement), le management (ou administration des soins, du système de santé dans lequel s'inscrit l'hôpital universitaire), le financement de l'institution (mais aussi la rémunération des professionnels) et enfin la stratégie de l'hôpital. Le présent travail ne fait qu'effleurer ce large spectre d'investigation. La thématique de l'évaluation des technologies de la santé n'est guère connue en Suisse, ou plutôt elle n'est que peu développée et reconnue comme une science interdisciplinaire destinée à porter un jugement de valeur afin d'aider la prise de décision, sens profond qui la définit dans d'autres pays tel le Canada et plus particulièrement le Québec. Enfin, il convient de souligner que le présent travail n'a pas comme objectif de comparer les systèmes de santé québécois et suisse ou de réaliser toute autre critique de l'un ou de l'autre. Le but du stage ([à l'Université de Montréal], cf. Préambule) était d'observer des structures reconnues au niveau international et nullement de juger de l'ensemble du système de santé. Si l'on peut s'inspirer des réussites ailleurs, il convient de s'en tenir à l'inspiration de celles-ci pour ensuite, éventuellement, les contextualiser dans d'autres lieux. Ainsi, à chaque fois qu'il sera fait mention du Québec par la suite, ce sera dans l'intention de démontrer l'originalité de la démarche et d'élargir le débat dans le contexte qui nous intéresse. [Auteur p. 7]

Anà lisi, diseny i implementació d'un aplicació de gestió d'espais fent servir l'arquitectura J2EE

L'objectiu principal d'aquest treball és exposar tots els passos seguits per a desenvolupar un projecte (anàlisi, disseny, implementació i proves) que utilitza una tecnologia determinada: l'arquitectura J2EE, una arquitectura escalable que permet un desenvolupament simplificat dels projectes d'aplicacions. El projecte escollit és una aplicació de gestió d'espais, la finalitat del qual és gestionar els espais que pertanyen a una entitat multiespacial, com ara una universitat o un hospital.

Seroepidemiological study of herpes simplex virus type 2 in patients with the acquired immunodeficiency syndrome in the city of Niterói, Rio de Janeiro, Brazil

This study was designed to determine the seroprevalence of herpes simplex virus type 2 (HSV-2) and to evaluate its association with age, sex as well as other demographic and behavioural factors in 150 human immunodeficiency virus (HIV) positive adults patients attending the general medical outpatient ward for routine care of Niterói, state of Rio de Janeiro, Brazil. Serum samples were screened for HSV-2 antibodies using an indirect ELISA. Eighty-three patients were men (mean age: 38.8) and 67 were women (mean age: 35.4). The estimated prevalence of HSV-2 was 52% (95% CI: 44-60%) and it was higher among men (53%) than among women (50.7%). Overall, the age of first sexual intercourse and past history of genital herpes were associated with HSV-2 seropositivity. Analysis by gender disclosed significant association of number of lifetime sex partners only among men. Although HSV-2 antibodies were frequent in the study group, genital herpes was reported by 21.8% of the HSV-2 positive subjects, indicating low awareness of the HSV-2 infection. These results may have public health importance for Brazil as the high rate of HSV-2 infection may act as a cofactor of HIV transmission.

Disseny i implementació d'un Videoclub online amb J2EE i una llibreria de tags de suport per la capa de presentació

Disseny i implementació parcial d'un Videoclub online en J2EE. Es fa ús dels patrons de disseny i frameworks més adients les diferents capes de l'arquitectura justificant la seva elecció. Així mateix, es desenvolupa una llibreria de tags pròpia, que dóna suport en el desenvolupament de les vistes d'un model de negoci d'aquest tipus.

Improving binding affinity and stability of peptide ligands by substituting glycines with D-amino acids.

Improving the binding affinity and/or stability of peptide ligands often requires testing of large numbers of variants to identify beneficial mutations. Herein we propose a type of mutation that promises a high success rate. In a bicyclic peptide inhibitor of the cancer-related protease urokinase-type plasminogen activator (uPA), we observed a glycine residue that has a positive ϕ dihedral angle when bound to the target. We hypothesized that replacing it with a D-amino acid, which favors positive ϕ angles, could enhance the binding affinity and/or proteolytic resistance. Mutation of this specific glycine to D-serine in the bicyclic peptide indeed improved inhibitory activity (1.75-fold) and stability (fourfold). X-ray-structure analysis of the inhibitors in complex with uPA showed that the peptide backbone conformation was conserved. Analysis of known cyclic peptide ligands showed that glycine is one of the most frequent amino acids, and that glycines with positive ϕ angles are found in many protein-bound peptides. These results suggest that the glycine-to-D-amino acid mutagenesis strategy could be broadly applied.

Disseny d'un sistema de gestió per a una cambra de congelació robotitzada de masses congelades.

Alguns dels grans fabricants del sector de les masses congelades fan servir robots per a l'emmagatzematge, servei i gestió dels productes de les cambres de congelació. Aquests robots només emmagatzemen i serveixen palets de caixes d'un mateix tipus de producte; així, doncs, només són útils quan el client és un gran consumidor, com un distribuïdor o una delegació, però no un petit comerç, com un restaurant o una fleca, els quals també són clients potencials del fabricant. Per tant, el problema es planteja en el moment de servir els clients que tenen problemes d'emmagatzematge, els quals es veuen obligats a fer comandes de diversos productes, que, a més, en total no fan ni de bon tros un palet sencer. A partir d'aquí la idea és dissenyar un sistema, emprant la tècnica de l'orientació a objectes (O-O), que gestioni un conjunt de robots que, a més d'emmagatzemar i gestionar una cambra de congelació, siguin capaços de servir les comandes fent una selecció de caixes de productes concrets, és a dir, les que sol·licita el client que ha fet la comanda per caixes i no per palets. Per qüestions d'organització i d'estocs, aquests robots han de ser independents dels altres, és a dir, han de treballar en una cambra independent de la dels robots que treballen per palets (actualment aquesta feina la fan treballadors dins una cambra independent de la dels robots).

Presence of alternative lengthening of telomeres mechanism in patients with glioblastoma identifies a less aggressive tumor type with longer survival.

Patients with glioblastoma (GBM) have variable clinical courses, but the factors that underlie this heterogeneity are not understood. To determine whether the presence of the telomerase-independent alternative lengthening of telomeres (ALTs) mechanism is a significant prognostic factor for survival, we performed a retrospective analysis of 573 GBM patients. The presence of ALT was identified in paraffin sections using a combination of immunofluorescence for promyelocytic leukemia body and telomere fluorescence in situ hybridization. Alternative lengthening of telomere was present in 15% of the GBM patients. Patients with ALT had longer survival that was independent of age, surgery, and other treatments. Mutations in isocitrate dehydrogenase (IDH1mut) 1 frequently accompanied ALT, and in the presence of both molecular events, there was significantly longer overall survival. These data suggest that most ALT+ tumors may be less aggressive proneural GBMs, and the better prognosis may relate to the set of genetic changes associated with this tumor subtype. Despite improved overall survival of patients treated with the addition of chemotherapy to radiotherapy and surgery, ALT and chemotherapy independently provided a survival advantage, but these factors were not found to be additive. These results suggest a critical need for developing new therapies to target these specific GBM subtypes.

First detection of a human astrovirus type 8 in a child with diarrhea in Belém, Brazil: comparison with other strains worldwide and identification of possible three lineages

This study describes the genetic relationships of the first human astrovirus type-8 (HAstV-8) detected in Belém-Brazil, during a public hospital-based study. This strain was compared with other HAstV-8 strains identified elsewhere which have sequences available at GeneBank. The regions ORF1a (primers Mon348/Mon340) and ORF2 (primers Mon269/Mon270) were analyzed by nucleotide sequencing and a high similarity rate was observed among the Belém strain and other HAstV-8 strains. In ORF1a, homology values of 93-100% were detected, and in ORF2 96-99%. Considering the sequence variation (7%) observed in ORF2 region, it was suggested that HAstV-8 strains could be divided in three different lineages.