Changes of beta-amyloid precursor protein splice patterns in brain cell aggregate cultures.

The splice pattern of beta-amyloid precursor protein (beta-APP) has been studied in a variety of neuronal and glial cells and in brain cell aggregate cultures by the polymerase chain reaction (PCR). The brain-typical pattern, in which beta-APP695 is the dominant form, has been found only in aggregate cultures but not in any of the other cell types including neuronal cell lines. Selective elimination of glial cells from aggregates resulted in increased quantities of beta-APP695, whereas removal of neurons led to a reduction of beta-APP695 and to an elevation of beta-APP751 and beta-APP770. This shift of splice pattern was not observed in cocultures of the neuronal cell line PC 12 with primary astrocytes combined in a variety of cellular ratios. Blood serum, which is an essential component of these cultures, tested on aggregates, did not reduce the amount of beta-APP695 or have any marked effects on splice patterns generally. From these results it is concluded that investigations on brain-typical splicing of beta-APP require primary neurons. Neuronal cell lines may be no suitable model systems. Splicing events favoring production of beta-APP695 may mark an important, very early step of amyloid formation in the brain.

Ecological assembly rules in plant communities--approaches, patterns and prospects.

Understanding how communities of living organisms assemble has been a central question in ecology since the early days of the discipline. Disentangling the different processes involved in community assembly is not only interesting in itself but also crucial for an understanding of how communities will behave under future environmental scenarios. The traditional concept of assembly rules reflects the notion that species do not co-occur randomly but are restricted in their co-occurrence by interspecific competition. This concept can be redefined in a more general framework where the co-occurrence of species is a product of chance, historical patterns of speciation and migration, dispersal, abiotic environmental factors, and biotic interactions, with none of these processes being mutually exclusive. Here we present a survey and meta-analyses of 59 papers that compare observed patterns in plant communities with null models simulating random patterns of species assembly. According to the type of data under study and the different methods that are applied to detect community assembly, we distinguish four main types of approach in the published literature: species co-occurrence, niche limitation, guild proportionality and limiting similarity. Results from our meta-analyses suggest that non-random co-occurrence of plant species is not a widespread phenomenon. However, whether this finding reflects the individualistic nature of plant communities or is caused by methodological shortcomings associated with the studies considered cannot be discerned from the available metadata. We advocate that more thorough surveys be conducted using a set of standardized methods to test for the existence of assembly rules in data sets spanning larger biological and geographical scales than have been considered until now. We underpin this general advice with guidelines that should be considered in future assembly rules research. This will enable us to draw more accurate and general conclusions about the non-random aspect of assembly in plant communities.

A new electrocardiographic criteria for discriminating between Brugada types 2 and 3 patterns and incomplete right bundle branch block

Le syndrome de Brugada, une affection rythmique du sujet jeune potentiellement fatale, se manifeste sur l'ECG par un bloc de branche droit (BBD) complet, avec sus-décalage majeur du segment ST et inversion des ondes Τ de V1 à V3 appelé pattern de type 1. Cette présentation peut être intermittente. Les manifestations incomplètes du syndrome de Brugada sont appelées patterns de types 2 ou 3, et sont caractérisées par un BBD incomplet et un sus-décalage ST plus ou moins prononcé dans les dérivations V-, et V2 de l'ECG. Cette description, cependant, est aussi celle du BBD incomplet fréquemment rencontré chez les sujets jeunes, de moins de 40 ans, et présent dans 3% de la population. Bo nombre de ces sujets sont donc référés pour une recherche de syndrome de Brugada. Le but de cette thèse est donc d'évaluer de nouveaux critères permettant de discriminer les BBD incomplets, banals, des sujets porteurs d'un syndrome de Brugada de types 2 ou 3. Trente-huit patients avec un pattern de Brugada de types 2 et 3, référés pour un test médicamenteux utilisant un antiarythmique révélant un pattern de type 1 chez les sujets porteurs, ont été inclus dans l'étude. Avant le test médicamenteux, deux angles ont été mesurés sur les dérivations Vi et/ou V2 : a, l'angle entre une ligne verticale et la descente de l'onde r', et β, l'angle entre la montée de l'onde S et la descente de l'onde r'. Les mesure à l'état basai des deux angles, seules ou combinées avec la durée du QRS, on été comparées entre les patients avec une épreuve pharmacologique positive et ceux dont l'épreuve s'est révélée négative (i.e. servant de groupe contrôle car porteur d'un véritable BBD incomplet). Des courbes ROC ont été établies afin de déterminer les valeurs d'angles les plus discriminantes. La moyenne des angles β était significativement plus petite chez les 14 patients avec un test pharmacologique négatif comparé aux 24 patients avec un test positif. La valeur optimale pour l'angle β était de 58°, ce qui donnait une valeur prédictive positive de 73% et une valeur prédictive négative de 97% pour une conversion en pattern de type 1 lors du test pharmacologique. L'angle α était un peu moins sensible et spécifique que β. Quand les angles étaient combinés à la durée du QRS, on observait une discrète amélioration de la discrimination entre les deux populations. Notre travail permet donc, chez des patients suspects d'un syndrome de Brugada, de discriminer entre un BBD incomplet et les patterns de Brugada types 2 et 3 en utilisant un critère simple basé sur l'ECG de surface potentiellement applicable au lit du patient

Patterns of split sex ratio in ants have multiple evolutionary causes based on different within-colony conflicts.

Split sex ratio-a pattern where colonies within a population specialize in either male or queen production-is a widespread phenomenon in ants and other social Hymenoptera. It has often been attributed to variation in colony kin structure, which affects the degree of queen-worker conflict over optimal sex allocation. However, recent findings suggest that split sex ratio is a more diverse phenomenon, which can evolve for multiple reasons. Here, we provide an overview of the main conditions favouring split sex ratio. We show that each split sex-ratio type arises due to a different combination of factors determining colony kin structure, queen or worker control over sex ratio and the type of conflict between colony members.

L'interdiction de discrimination en raison de la nationalité au sens de l'Accord sur la libre circulation des personnes

Introduction : 6 décembre 1992: le peuple suisse rejette l'Accord sur l'Espace économique européen (EEE). Le Conseil fédéral décide alors de privilégier la voie bilatérale pour réglementer ses relations avec l'Union européenne (UE). Près de sept ans plus tard, le 21 juin 1999, un premier paquet de sept accords bilatéraux sont signés à Luxembourg. L'Accord sur la libre circulation des personnes (ALCP ou Accord) en constitue certainement « la partie la plus importante ». L'ALCP a pour objectif de garantir la libre circulation des travailleurs salariés, des travailleurs indépendants ainsi que de certaines catégories de non-actifs, et de faciliter la prestation de services sur le territoire des parties contractantes. Or la réalisation de ces objectifs dépend directement de la mise en oeuvre de l'interdiction de discrimination en raison de la nationalité. Au coeur même du principe de libre circulation, l'interdiction de discrimination en raison de la nationalité constitue, sans aucun doute, la clé de voûte de l'Accords. Partant de ce constat, il conviendra d'étudier dans un premier temps le principe de libre circulation (Partie I), puis de nous pencher dans un second temps sur l'interdiction de discrimination en raison de la nationalité (Partie II). La première partie de notre étude (consacrée à la libre circulation des personnes en vertu de l'ALCP) débutera par un survol des dispositions essentielles à l'appréhension d'un droit fondamental à la libre circulation, ainsi que par une présentation succincte du régime communautaire de libre circulation. Après avoir rappelé les étapes du cheminement ayant conduit à l'adoption de l'ALCP, et après avoir défini les différentes sources régissant la libre circulation entre la Suisse et les Etats membres de l'UE, nous analyserons ensuite l'ALCP lui-même, en procédant à la détermination de son champ d'application ainsi qu'à l'examen des principes généraux qui le régissent. Cet examen nous amènera alors à déterminer le rôle que devrait jouer la jurisprudence de la Cour de justice des Communautés européennes (CJCE) dans le cadre de l'Accord. Fort de cette analyse, nous conclurons cette première partie par une présentation du régime de libre circulation tel qu'institué par l'ALCP, sans oublier bien sûr d'évoquer, finalement, la portée du concept d'entrave et de la notion de citoyenneté européenne dans le cadre de ce régime. La seconde partie de notre étude (consacrée à l'interdiction de discrimination en raison de la nationalité selon l'ALCP) identifiera, à titre liminaire, les différentes dispositions de l'Accord visant à prohiber les discriminations en raison de la nationalité. Ces dispositions mises en lumière, nous détaillerons alors les étapes de l'examen permettant de relever la présence d'une discrimination en raison de la nationalité, en nous appuyant sur la jurisprudence de la Cour de justice et celle du Tribunal fédéral d'une part, et sur la doctrine développée en matière d'interdiction de discrimination d'autre part. Dans la foulée, nous pourrons ainsi présenter les différentes formes que peut revêtir une discrimination. Nous examinerons, en particulier, le régime prévu par la jurisprudence de la Cour de justice et celle du Tribunal fédéral en matière de discriminations à rebours présentant un élément transfrontalier. Suite de quoi nous serons en mesure - après examen des jurisprudences allemande et autrichienne relatives aux situations internes de discriminations à rebours - de procéder à une appréciation critique de la solution adoptée par le Tribunal fédéral en pareilles situations. A la suite de ces deux chapitres portant sur la notion et sur les formes de discriminations, il y aura lieu de définir le champ d'application matériel et personnel des différentes dispositions de l'Accord visant à interdire les discriminations en raison de la nationalité. Lors de la définition du champ d'application personnel en particulier, il conviendra, en premier lieu, d'identifier les personnes susceptibles d'invoquer ces différentes dispositions (les bénéficiaires). Cet examen débutera par l'identification des conditions générales communes à l'ensemble des dispositions étudiées. Il se poursuivra par l'analyse des conditions spécifiques de chaque norme, et se terminera par une présentation du régime particulier réservé aux membres de la famille et aux travailleurs détachés. En second lieu, il s'agira de déterminer les sujets de droit à l'encontre desquels ces dispositions sont opposables (les destinataires). Plus précisément, il s'agira d'examiner dans quelle mesure les particuliers, en sus des Etats, peuvent être destinataires des différentes obligations de l'ALCP en matière de libre circulation et d'interdiction de discrimination. Les champs d'application ayant été définis, il nous restera alors à examiner les différentes dispositions de l'Accord susceptibles de limiter la portée du principe de non-discrimination. Pour ce faire, nous analyserons en détail l'article 5 Annexe I-ALCP qui permet de limiter les droits consacrés par l'Accord pour des raisons d'ordre public, de sécurité publique ou de santé publique. Nous nous pencherons aussi sur les limitations liées à l'exercice de la puissance publique, consacrées par les articles 10, 16 et 22 al. 1 Annexe I-ALCP. Après un passage en revue des dernières dispositions de l'Accord prévoyant des limitations, nous examinerons ensuite dans quelle mesure certains principes non expressément prévus par l'Accord sont également susceptibles de justifier une différence de traitement en raison de la nationalité. Nous conclurons cette étude en analysant les implications juridiques d'une violation de l'interdiction de discrimination, ceci non seulement dans les relations liant l'Etat à un particulier, mais aussi dans celles liant deux particuliers entre eux. Dans le premier cas de figure nous verrons qu'il y a lieu de différencier l'analyse en fonction du type d'acte en question - les implications d'une violation n'étant pas les mêmes selon que l'on se trouve en présence d'une norme, d'une décision ou d'un contrat (de droit administratif ou de droit privé) présentant un caractère discriminatoire. Dans le second cas de figure, il s'agira cette fois-ci de distinguer les implications des conditions discriminatoires en fonction des différentes phases d'une relation contractuelle - aux stades de la conclusion d'un contrat, de son exécution et de sa résiliation.

Change in defense mechanisms and coping patterns during the course of 2-year-long psychotherapy and psychoanalysis for recurrent depression: a pilot study of a randomized controlled trial.

Very little research has been conducted so far to study the potential mechanisms of change in long-term active psychological treatments of recurrent depression. The present pilot randomized controlled trial aimed to determine the feasibility of studying the change process occurring in patients during the course of 2-year-long dynamic psychotherapy, psychoanalysis, and cognitive therapy, as compared with clinical management. In total, eight outpatients presenting with recurrent depression, two patients per treatment arm, were included. All patients were randomly assigned to one of the four treatment conditions. Defense mechanisms and coping patterns were assessed using validated observer-rated methodology based on transcribed, semistructured follow-along independent dynamic interviews. The results indicated that, whereas some patients in the active treatments changed on the symptomatic levels, some others remained unchanged during the course of their 2-year-long treatment. However, with regard to potential mechanisms of change in these patients, changes in defense mechanisms and coping patterns were revealed to be important processes over time in successful therapies and, to a lesser extent, in less successful treatments. No change was found either on outcome or on the process measure for the control condition, that is, clinical management. These results are discussed along with previous data comparing change in defense mechanisms and coping during the course of treatments.

Extent and patterns of MGMT promoter methylation in glioblastoma- and respective glioblastoma-derived spheres.

Purpose: Quantitative methylation-specific tests suggest that not all cells in a glioblastoma with detectable promoter methylation of the O6-methylguanine DNA methyltransferase (MGMT) gene carry a methylated MGMT allele. This observation may indicate cell subpopulations with distinct MGMT status, raising the question of the clinically relevant cutoff of MGMT methylation therapy. Epigenetic silencing of the MGMT gene by promoter methylation blunts repair of O6-methyl guanine and has been shown to be a predictive factor for benefit from alkylating agent therapy in glioblastoma. Experimental Design: Ten paired samples of glioblastoma and respective glioblastoma-derived spheres (GS), cultured under stem cell conditions, were analyzed for the degree and pattern of MGMT promoter methylation by methylation-specific clone sequencing, MGMT gene dosage, chromatin status, and respective effects on MGMT expression and MGMT activity. Results: In glioblastoma, MGMT-methylated alleles ranged from 10% to 90%. In contrast, methylated alleles were highly enriched (100% of clones) in respective GS, even when 2 MGMT alleles were present, with 1 exception (<50%). The CpG methylation patterns were characteristic for each glioblastoma exhibiting 25% to 90% methylated CpGs of 28 sites interrogated. Furthermore, MGMT promoter methylation was associated with a nonpermissive chromatin status in accordance with very low MGMT transcript levels and undetectable MGMT activity. Conclusions: In MGMT-methylated glioblastoma, MGMT promoter methylation is highly enriched in GS that supposedly comprise glioma-initiating cells. Thus, even a low percentage of MGMT methylation measured in a glioblastoma sample may be relevant and predict benefit from an alkylating agent therapy. Clin Cancer Res; 17(2); 255-66. (C)2010 AACR.

New generation vaccine induces effective melanoma-specific CD8+ T cells in the circulation but not in the tumor site.

Although increasing evidence suggests that CTL are important to fight the development of some cancers, the frequency of detectable tumor-specific T cells is low in cancer patients, and these cells have generally poor functional capacities, compared with virus-specific CD8(+) T cells. The generation with a vaccine of potent CTL responses against tumor Ags therefore remains a major challenge. In the present study, ex vivo analyses of Melan-A-specific CD8(+) T cells following vaccination with Melan-A peptide and CpG oligodeoxynucleotides revealed the successful induction in the circulation of effective melanoma-specific T cells, i.e., with phenotypic and functional characteristics similar to those of CTL specific for immunodominant viral Ags. Nonetheless, the eventual impact on tumor development in vaccinated melanoma donors remained limited. The comprehensive study of vaccinated patient metastasis shows that vaccine-driven tumor-infiltrating lymphocytes, although activated, still differed in functional capacities compared with blood counterparts. This coincided with a significant increase of FoxP3(+) regulatory T cell activity within the tumor. The consistent induction of effective tumor-specific CD8(+) T cells in the circulation with a vaccine represents a major achievement; however, clinical benefit may not be achieved unless the tumor environment can be altered to enable CD8(+) T cell efficacy.

EEG Patterns and Imaging Correlations in Encephalopathy: Encephalopathy Part II.

SUMMARY:: The EEG patterns seen with encephalopathies can be correlated to cerebral imaging findings including head computerized tomography and MRI. Background slowing without slow-wave intrusion is seen with acute and chronic cortical impairments that spare subcortical white matter. Subcortical/white matter structural abnormalities or hydrocephalus may produce projected slow-wave activity, while clinical entities involving both cortical and subcortical regions (diffuse cerebral abnormalities) engender both background slowing and slow-wave activity. Triphasic waves are seen with hepatic and renal insufficiency or medication toxicities (e.g., lithium, baclofen) in the absence of a significant cerebral imaging abnormality, Conversely, subcortical/white matter abnormalities may facilitate the appearance of triphasic waves without significant hepatic, renal, or toxic comorbidities. More specific syndromes, such as Jakob-Creutzfeldt disease, autoimmune limbic encephalitis, autoimmune corticosteroid-responsive encephalopathy with thyroid autoimmunity, sepsis-associated encephalopathy, and acute disseminated encephalomyelitis, have imaging/EEG changes that are variable but which may include slowing and epileptiform activity. This overview highlighting EEG-imaging correlations may help the treating physician in the diagnosis, and hence the appropriate treatment, of patients with encephalopathy.

Circadian and circaseptan patterns of natality and perinatal mortality of infants with different birth weights

OBJECTIVE. Data on human natality, stillbirth and perinatal mortality from Switzerland (1979-1987), available in four birthweight categories, are reexamined to assess any about-weekly (circaseptan) and changes in about-daily (circadian) patterns in central Europe over a century and a halfDESIGN. Retrospective analyses on archived data.SETTING. Federal Office of Statistics for Switzerland.RESULTS. In addition to prominent circadians, weekly patterns are also documented.CONCLUSION. Exogenous variations, prominent in early extrauterine life, such as changes of scheduling in obstetrics, may contribute to circadian and cireaseptan natality patterns. Information on these patterns serves in the optimization of neonatal care. Partly endogenous, partly physical environmental aspects, at least of about-weekly patterns, remain to be elucidated in series consisting exclusively of spontaneous parturitions.

Cenomanian (early Late Cretaceous) ammonoid faunas of Western Europe - Part II: Diversity patterns and the end-Cenomanian anoxic event

Diversity patterns of ammonoids are analyzed and compared with the timing of anoxic deposits around the Cenomanian/Turonian (C/T) boundary in the Vocontian, Anglo-Paris, and Monster basins of Western Europe. Differing from most previous studies, which concentrate on a narrow time span bracketing the C/T boundary, the present analysis covers the latest Albian to Early Turonian interval for which a high resolution, ammonoid-based biochronology, including 34 Unitary Associations zones, is now available. During the latest Albian-Middle Cenomanian interval, species richness of ammonoids reveals a dynamical equilibrium oscillating around an average of 20 species, whereas the Late Cenomanian-Early Turonian interval displays an equilibrium centered on an average value of 6 species. The abrupt transition between these two successive equilibria lasted no longer than two Unitary Associations. The onset of the decline of species richness thus largely predates the spread of oxygen-poor water masses onto the shelves, while minimal values of species richness coincide with the Cenomanian-Turonian boundary only. The decline of species richness during the entire Late Cenomanian seems to result from lower origination percentages rather than from higher extinction percentages. This result is also supported by the absence of statistically significant changes in the extinction probabilities of the poly-cohorts. Separate analyses of species richness for acanthoceratids and heteromorphs, the two essential components of the Cenomanian ammonoid community, reveal that heteromorphs declined sooner than acanthoceratids. Moreover, acanthoceratids showed a later decline at the genus level than at the species level. Such a decoupling is accompanied by a significant increase in morphological disparity of acanthoceratids, which is expressed by the appearance of new genera. Last, during the Late Cenomanian, paedomorphic processes, juvenile innovations and reductions of adult size dominated the evolutionary radiation of acanthoceratids. Hence, the decrease in ammonoid species richness and their major evolutionary changes significantly predates the spread of anoxic deposits. Other environmental constraints such as global flooding of platforms, warmer and more equable climate, as well as productivity changes better correlate with the timing of diversity changes and evolutionary patterns of ammonoids and therefore, provide more likely causative mechanisms than anoxia alone.