Produção in vitro de metano e análise da diversidade genética das Archaea metanogênicas do rúmen de bovinos

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Filogeografia de três espécies de Passeiriformes (Suboscines) na região do Baixo Tocantins - Ilha do Marajó - Pará

A região do Baixo Tocantins - ilha do Marajó é excelente local para se realizar um estudo de integração de dados geológicos e biológicos visando-se a compreensão dos processos de diversificação de espécies. Foram estimados parâmetros de genética populacional e realizadas análises filo genéticas das populações amostradas utilizando-se o gene ND2, relacionando-os com o cenário geológico proposto para a evolução da região. Foram utilizadas inferência bayesiana e máxima verossimilhança para reconstrução de filogenias intraespecíficas, redes de haplótipos e o teste de desvio de neutralidade R2, AMOVA, F _ST e Nm para as análises populacionais, para três espécies de aves Passeriformes: Xiphorhynchus spixii e Glyphorynchs spirurus (Dendrocolaptidae) e Willisornis poecilinotus (Thamnophilidae). As populações de X spixii não apresentaram estruturação geográfica, exibindo altos níveis de fluxo gênico entre elas. A árvore filogenética de G. spirurus apresentou um grupo de haplótipos únicos da ilha do Marajó (1M) e um grupo irmão contendo haplótipos pertencentes às áreas de endemismo Xingu (XI), Belém (BE) e 1M. Essa topologia indica um aparente contato secundário recente na 1M entre uma população isolada e endêmica da própria ilha com populações do continente (XI). A árvore obtida para W poecilinotus apresentou uma topologia semelhante àquela de G. spirurus, indicando que a formação da 1M provavelmente atuou de maneira similar em diferentes espécies, com similares capacidades de dispersão, gerando padrões filogeográficos concordantes. Comparando--se as três espécies, concluímos que X spixii possui maior capacidade de dispersão respondendo de maneira distinta ao mesmo efeito vicariante. Estimativas do relógio molecular para o nó que separa o grupo de haplótipos endêmicos da ilha do Marajó mostram que tanto as populações de G. spirurus, quanto às de W. poecilinotus são muito mais antigas que os eventos que levaram à separação total da 1M em relação ao continente (aproximadamente 10.000 anos AP), com uma idade estimada aproximadamente 747.000 anos AP para G. spirurus e 798.000 anos AP para W. poecilinotus, indicando que outros processos vicariantes anteriores à separação total da Ilha do Marajó poderiam ter separado essas populações endêmicas da ilha.

Variação morfológica, vocal e genética na espécie politípica Lepidocolaptes albolineatus (Aves – Dendrocolaptidae)

Lepidocolaptes albolineatus (Aves: Dendrocolaptidae) é uma espécie biológica politípica, constituída pelos seguintes táxons: L. a. albolineatus, que ocorre na Área de Endemismo (AE) Guiana, L. a. duidae (AE Imeri), L .a. fuscicapillus (AE Rondônia), L. a. madeirae (AE Rondônia) e L. a .layardi (AEs Tapajós, Xingu e Belém). Os objetivos deste trabalho foram: (1) revisar a validade e a diagnosabilidade dos táxons atualmente agrupados em L. albolineatus com base em caracteres morfológicos, vocais e moleculares e (2) reavaliar os limites interespecíficos entre estes táxons. Foram mensurados 150 espécimes depositados em 8 museus do Brasil e EUA. Para a análise molecular, foram seqüenciados um total de 940 pb do gene mitocondrial ND2 para 35 indivíduos de todos os táxons de L. albolineatus. As análises filogenéticas foram realizadas nos programa PAUP 4.0 b 10 e MrBayes 3.1 utilizando-se os métodos de parcimônia (MP), máxima verossimilhança (MV) e inferência Bayesiana. A combinação de dados morfológicos e moleculares revelou a existência de 5 clados fortemente apoiados estatisticamente: clado 1 (agrupando indivíduos da AE Rondônia), clado 2 (agrupando espécimes das AE Belém, Xingu e Tapajós), clado 3 (incluindo espécimes da AE Inambari), clado 4 (incluindo indivíduos da AE Imeri) e clado 5 (agrupando indivíduos da AE Guiana). Todos os clados corresponderam a táxons já nomeados, exceto o clado 3 para o qual nenhum nome válido se encontra disponível, já que o nome fuscicapillus na verdade se aplica ao clado 1 e, portanto, deve ser considerado sinônimo sênior de madeirae. A principal separação genética e morfológica em L. albolineatus acontece entre o táxon nominal e os demais, embora cada um dos 5 clados possa ser considerado uma espécie distinta (com base no Conceito Filético Geral de Espécie) através de uma combinação única de caracteres morfológicos, vocais e moleculares diagnósticos.

Begomovírus de plantas de pimentão e tomate no Estado de São Paulo: ocorrência, variabilidade, identificação de biótipos de bemisia tabaci e de resistência em capsicum spp

Pós-graduação em Agronomia (Proteção de Plantas) - FCA

Detecção molecular de Streptococus agalactiae em amostras de leite bovino obtidas de tanques de expansão

Pós-graduação em Medicina Veterinária - FMVZ

Estudos metabolômicos entre interações da rizosfera de Senna spectabilis e rizobacterias associadas

Pós-graduação em Química - IQ

Plant growth promoting bacteria in Brachiaria brizantha

Brachiaria brizantha is considered one of the preferred fodders among farmers for having high forage yield and large production of root mass. The association of beneficial bacteria with these grasses can be very valuable in the recovery of the pasture areas with nutritional deficiency. With the aim of studying this possibility, we carried out the sampling of soil and roots of B. brizantha in three areas (Nova Odessa-SP, So Carlos-SP and Campo Verde-MT, Brazil). Seventy-two bacterial strains were isolated and used in tests to evaluate their biotechnological potential. Almost all isolates presented at least one positive feature. Sixty-eight isolates produced analogues of indole-3-acetic acid, ten showed nitrogenase activity when subjected to the method of increasing the concentration of total nitrogen (total N) in the culture medium and sixty-five isolates showed nitrogenase activity when subjected to acetylene reduction technique. The partial sequencing of 16S rRNA of these isolates allowed the identification of seven main groups, with the prevalence of those affiliated to the genus Stenotrophomonas (69 %). At the end, this work elected the strains C4 (Pseudomonadaceae) and C7 (Rhodospirillaceae) as promising organisms for the development of inoculants due to their higher nitrogenase activity.

Inferring population connectivity across the range of distribution of the stiletto shrimp Artemesia longinaris Spence Bate, 1888 (Decapoda, Penaeidae) from DNA barcoding: implications for fishery management

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Associação entre mesoplasma sp e formigas da tribo Attini (Hymenoptera, formicidae)

As formigas da tribo Attini apresentam reconhecida simbiose com microrganismos: fungos mutualistas basidiomicetos nas famílias Lepiotaceae e Pterulaceae cultivados pelas formigas, bactérias actinomicetas ou no gênero Burkholderia produtoras de antibióticos contra fungos entomopatogênicos, fungos ascomicetos do gênero Escovopsis micófagos para o mutualista, e comensais como fungos, leveduras e bactérias que degradam celulose. Um novo mutualista é descrito no presente trabalho: uma espécie de bactéria no gênero Mesoplasma, detectada via PCR para 16S no DNA genômico de Attini derivadas (gêneros Acromyrmex, Atta, Serycomyrmex e Cyphomyrmex), intermediárias (Trachymyrmex) e basais (Apterostigma, Mycetarotes, Mycocepurus e Mycetagroicos). Uma única linhagem de Mesoplasma com baixíssima diversidade 16S esteve presente nas Attini, mas não em formigas de tribos filogeneticamente próximas a Attini, como Dolichoderini (Tapinoma sp), Camponotini (Camponotus sp), Cephalotini (Cephalotes sp), Crematogastrini (Crematogaster sp), Pheidolini (Pheidole sp) e Ponerini (Pachycondyla sp), indicando uma simbiose Mesoplasma-Attini recente e específica.

Performance and composition of bacterial communiies in anaerobic fluidized bed reactors for hydrogen production: Effects of organic loading rate and alkalinity

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Determinação molecular da viabilidade do Mycobacterium leprae: uma comparação com outras abordagens metodológicas

Pós-graduação em Doenças Tropicais - FMB

Caracterização do groundnut ringspot virus (grsv) e seu vetor (Frankliniella schultzei) em melancia

Pós-graduação em Agronomia (Proteção de Plantas) - FCA

Perfil de suscetibilidade, genes de resistência aos aminoglicosídeos e similaridade genética em amostras de Acinetobacter baumannii isoladas em um Hospital Terciário

Pós-graduação em Microbiologia - IBILCE

Amblyomma yucumense n. sp (Acari: Ixodidae), a parasite of wild mammals in Southern Brazil

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Bacterial diversity from environmental sample applied to bio-hydrogen production

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)