760 resultados para type 2 fuzzy logic system


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Edwardsiella tarda is a gram-negative pathogen with a broad host range that includes humans, animals, and fish. Recent studies have shown that the LuxS/autoinducer type 2 (AI-2) quorum sensing system is involved in the virulence of E. tarda. In the present study, it was found that the E. tarda LuxS mutants bearing deletions of the catalytic site (C site) and the tyrosine kinase phosphorylation site, respectively, are functionally inactive and that these dysfunctional mutants can interfere with the activity of the wild-type LuxS. Two small peptides, 5411 and 5906, which share sequence identities with the C site of LuxS, were identified. 5411 and 5906 proved to be inhibitors of AI-2 activity and could vitiate the infectivity of the pathogenic E. tarda strain TX1. The inhibitory effect of 5411 and 5906 on AI-2 activity is exerted on LuxS, with which these peptides specifically interact. The expression of 5411 and 5906 in TX1 has multiple effects (altering biofilm production and the expression of certain virulence-associated genes), which are similar to those caused by interruption of luxS expression. Further study found that it is very likely that 5411 and 5906 can be released from the strains expressing them and, should TX1 be in the vicinity, captured by TX1. Based on this observation, a constitutive 5411 producer (Pseudomonas sp. strain FP3/pT5411) was constructed in the form of a fish commensal isolate that expresses 5411 from a plasmid source. The presence of FP3/pT5411 in fish attenuates the virulence of TX1. Finally, it was demonstrated that fish expressing 5411 directly from tissues exhibit enhanced resistance against TX1 infection.

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BACKGROUND: The Affordable Care Act encourages healthcare systems to integrate behavioral and medical healthcare, as well as to employ electronic health records (EHRs) for health information exchange and quality improvement. Pragmatic research paradigms that employ EHRs in research are needed to produce clinical evidence in real-world medical settings for informing learning healthcare systems. Adults with comorbid diabetes and substance use disorders (SUDs) tend to use costly inpatient treatments; however, there is a lack of empirical data on implementing behavioral healthcare to reduce health risk in adults with high-risk diabetes. Given the complexity of high-risk patients' medical problems and the cost of conducting randomized trials, a feasibility project is warranted to guide practical study designs. METHODS: We describe the study design, which explores the feasibility of implementing substance use Screening, Brief Intervention, and Referral to Treatment (SBIRT) among adults with high-risk type 2 diabetes mellitus (T2DM) within a home-based primary care setting. Our study includes the development of an integrated EHR datamart to identify eligible patients and collect diabetes healthcare data, and the use of a geographic health information system to understand the social context in patients' communities. Analysis will examine recruitment, proportion of patients receiving brief intervention and/or referrals, substance use, SUD treatment use, diabetes outcomes, and retention. DISCUSSION: By capitalizing on an existing T2DM project that uses home-based primary care, our study results will provide timely clinical information to inform the designs and implementation of future SBIRT studies among adults with multiple medical conditions.

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This paper introduces a recursive rule base adjustment to enhance the performance of fuzzy logic controllers. Here the fuzzy controller is constructed on the basis of a decision table (DT), relying on membership functions and fuzzy rules that incorporate heuristic knowledge and operator experience. If the controller performance is not satisfactory, it has previously been suggested that the rule base be altered by combined tuning of membership functions and controller scaling factors. The alternative approach proposed here entails alteration of the fuzzy rule base. The recursive rule base adjustment algorithm proposed in this paper has the benefit that it is computationally more efficient for the generation of a DT, and advantage for online realization. Simulation results are presented to support this thesis. (c) 2005 Elsevier B.V. All rights reserved.

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Shapememoryalloy (SMA) actuators, which have the ability to return to a predetermined shape when heated, have many potential applications in aeronautics, surgical tools, robotics and so on. Nonlinearity hysteresis effects existing in SMA actuators present a problem in the motion control of these smart actuators. This paper investigates the control problem of SMA actuators in both simulation and experiment. In the simulation, the numerical Preisachmodel with geometrical interpretation is used for hysteresis modeling of SMA actuators. This model is then incorporated in a closed loop PID control strategy. The optimal values of PID parameters are determined by using geneticalgorithm to minimize the mean squared error between desired output displacement and simulated output. However, the control performance is not good compared with the simulation results when these parameters are applied to the real SMA control since the system is disturbed by unknown factors and changes in the surrounding environment of the system. A further automated readjustment of the PID parameters using fuzzylogic is proposed for compensating the limitation. To demonstrate the effectiveness of the proposed controller, real time control experiment results are presented.

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BACKGROUND: The need for structured education programmes for type 2 diabetes is a high priority for many governments around the world. One such national education programme in the United Kingdom is the DESMOND Programme, which has been shown to be robust and effective for patients in general. However, these programmes are not generally targeted to people with intellectual disabilities (ID), and robust evidence on their effects for this population is lacking. We have adapted the DESMOND Programme for people with ID and type 2 diabetes to produce an amended programme known as DESMOND-ID. This protocol is for a pilot trial to determine whether a large-scale randomised trial is feasible, to test if DESMOND-ID is more effective than usual care in adults with ID for self-management of their type 2 diabetes, in particular as a means to reduce glycated haemoglobin (Hb1Ac), improve psychological wellbeing and quality of life and promote a healthier lifestyle. This protocol describes the rationale, methods, proposed analysis plan and organisational and administrative details.

METHODS/DESIGN: This trial is a two arm, individually randomised, pilot trial for adults with ID and type 2 diabetes, and their family and/or paid carers. It compares the DESMOND-ID programme with usual care. Approximately 36 adults with mild to moderate ID will be recruited from three countries in the United Kingdom. Family and/or paid carers may also participate in the study. Participants will be randomly assigned to one of two conditions using a secure computerised system with robust allocation concealment. A range of data will be collected from the adults with ID (biomedical, psychosocial and self-management strategies) and from their carers. Focus groups with all the participants will assess the acceptability of the intervention and the trial.

DISCUSSION: The lack of appropriate structured education programmes and educational materials for this population leads to secondary health conditions and may lead to premature deaths. There are significant benefits to be gained globally, if structured education programmes are adapted and shown to be successful for people with ID and other cognitive impairments.

TRIAL REGISTRATION: Registered with International Standard Randomised Controlled Trial (identifier: ISRCTN93185560 ) on 10 November 2014.

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Optimization methods have been used in many areas of knowledge, such as Engineering, Statistics, Chemistry, among others, to solve optimization problems. In many cases it is not possible to use derivative methods, due to the characteristics of the problem to be solved and/or its constraints, for example if the involved functions are non-smooth and/or their derivatives are not know. To solve this type of problems a Java based API has been implemented, which includes only derivative-free optimization methods, and that can be used to solve both constrained and unconstrained problems. For solving constrained problems, the classic Penalty and Barrier functions were included in the API. In this paper a new approach to Penalty and Barrier functions, based on Fuzzy Logic, is proposed. Two penalty functions, that impose a progressive penalization to solutions that violate the constraints, are discussed. The implemented functions impose a low penalization when the violation of the constraints is low and a heavy penalty when the violation is high. Numerical results, obtained using twenty-eight test problems, comparing the proposed Fuzzy Logic based functions to six of the classic Penalty and Barrier functions are presented. Considering the achieved results, it can be concluded that the proposed penalty functions besides being very robust also have a very good performance.

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To compare in the Swiss population the results of several scores estimating the risk of developing type 2 diabetes. This was a single-center, cross-sectional study conducted between 2003 and 2006 in Lausanne, Switzerland. Overall, 3,251 women and 2,937 men, aged 35-75 years, were assessed, of which 5,760 (93%) were free from diabetes and included in the current study. The risk of developing type 2 diabetes was assessed using seven different risk scores, including clinical data with or without biological data. Participants were considered to be eligible for primary prevention according to the thresholds provided for each score. The results were then extrapolated to the Swiss population of the same sex and age. The risk of developing type 2 diabetes increased with age in all scores. The prevalence of participants at high risk ranged between 1.6 and 24.9% in men and between 1.1 and 15.7% in women. Extrapolated to the Swiss population of similar age, the overall number of participants at risk, and thus susceptible to intervention, ranged between 46,708 and 636,841. In addition, scores that included the same clinical variables led to a significantly different prevalence of participants at risk (4.2% [95% CI 3.4-5.0] vs. 12.8% [11.5-14.1] in men and 2.9% [2.4-3.6] vs. 6.0% [5.2-6.9] in women). CONCLUSIONS; The prevalence of participants at risk for developing type 2 diabetes varies considerably according to the scoring system used. To adequately prevent type 2 diabetes, risk-scoring systems must be validated for each population considered.

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ABSTRACT Recombinant adenoviruses are currently under intense investigation as potential gene delivery and gene expression vectors with applications in human and veterinary medicine. As part of our efforts to develop a bovine adenovirus type 2 (BAV2) based vector system, the nucleotide sequence of BAV2 was determined. Sixty-six open reading frames (ORFs) were found with the potential to encode polypeptides that were at least 50 amino acid (aa) residue long. Thirty-one of the BAV2 polypeptide sequences were found to share homology to already identified adenovirus proteins. The arrangement of the genes revealed that the BAV2 genomic organization closely resembles that of well-characterized human adenoviruses. In the course of this study, continuous propagation of BAV2 over many generations in cell culture resulted in the isolation of a BAV2 spontaneous mutant in which the E3 region was deleted. Restriction enzyme, sequencing and PCR analyses produced concordant results that precisely located the deletion and revealed that its size was exactly 1299 bp. The E3-deleted virus was plaque-purified and further propagated in cell culture. It appeared that the replication of such a virus lacking a portion of the E3 region was not affected, at least in cell culture. Attempts to rescue a recombinant BAV2 virus with the bacterial kanamycin resistance gene in the E3 region yielded a candidate as verified with extensive Southern blotting and PCR analyses. Attempts to purify the recombinant virus were not successful, suggesting that such recombinant BAV2 was helper-dependent. Ten clones containing full-length BAV2 genomes in a pWE15 cosmid vector were constructed. The infectivity of these constructs was tested by using different transfection methods. The BAV2 genomic clones did appear to be infectious only after extended incubation period. This may be due to limitations of various transfection methods tested, or biological differences between virus- and E. co//-derived BAV2 DNA.

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Thèse réalisée en cotutelle avec l'Université Pierre et Marie Curie, Paris VI, France

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Le récepteur de la vasopressine de type 2 (V2R) joue un rôle crucial dans l’homéostasie hydrique. Exprimé principalement au niveau du rein, son activation par l’hormone antidiurétique arginine-vasopressine (AVP) favorise la réabsorption d’eau, participant ainsi à diminuer la diurèse. Plus de 200 mutations dans le gène du V2R ont été associées au diabète néphrogénique insipide congénital (DINc), une maladie causée par une perte de fonction du récepteur. À l’opposé, trois mutations découvertes récemment induisent un gain de fonction du V2R, et sont la cause du syndrome néphrogénique de l’anti-diurèse inappropriée (NSIAD). Les travaux de cette thèse visent à mieux comprendre les bases moléculaires responsables de la perte ou du gain de fonction des récepteurs mutants associés à ces deux maladies. Dans plus de 50% des cas, les mutations faux-sens affectent négativement l’adoption d’une conformation native par le V2R, provoquant la reconnaissance et la rétention intracellulaire des mutants par le système de contrôle de qualité du réticulum endoplasmique. Nos résultats ont démontré que l’interaction entre les récepteurs mutants et le chaperon moléculaire calnexine est dépendante de N-glycosylation et que sa durée varie en fonction de la mutation. De plus, l’importance de cette modification co-traductionnelle et des interactions lectines-sucres dans le processus de maturation d’un mutant donné s’est avérée une caractéristique intrinsèque, puisque l’absence de N-glycosylation n’a pas affecté le mutant Y128S (phénotype léger) tandis que la maturation du mutant W164S (phénotype sévère) a été totalement abolie. Nos résultats suggèrent aussi que l’action des chaperons pharmacologiques (CP), molécules favorisant la maturation des mutants du V2R, peut survenir à différentes étapes au cours du processus de maturation, selon le mutant réchappé. Ces différences entre muta nts suggèrent des processus biosynthétiques ‘personnalisés’ dictés par la nature de la mutation impliquée et pourraient expliquer la différence de sévérité des manifestations cliniques chez les patients porteurs de ces mutations. Bien qu’une récupération de fonction ait été obtenue pour les mutants Y128S et W164S par un traitement au CP, il n’en est pas de même pour toutes les mutations occasionnant un défaut conformationnel. C’est ce que nous avons démontré pour le mutant V88M, affligé de deux défauts, soit une faible efficacité de maturation combinée à une basse affinité pour l’AVP. Dans ce cas, et malgré une augmentation du nombre de récepteurs mutants la surface cellulaire, la diminution de l’affinité apparente du récepteur mutant pour l’AVP a été exacerbée par la présence résiduelle de CP à son site de liaison, rendant impossible l’activation du récepteur aux concentrations physiologiques d’AVP. Les mutants R137C et R137L ont une activité constitutive élevée et mènent au NSIAD tandis que la substitution de cette même arginine par une histidine (R137H) mène au DINc. Ces trois mutants se sont avéré partager plusieurs caractéristiques, dont une efficacité de maturation réduite et une désensibilisation spontanée élevée. La seule différence iden tifiée entre ces mutants est leur niveau d’activité constitutive. Le CP utilisé dans nos études possède aussi la propriété d’agoniste inverse, mais n’a pourtant pas diminué l’activité constitutive des mutants R137C/L, suggérant une conformation active ‘figée’. Seul l’effet chaperon a été observé, entraînant la hausse de récepteurs à la surface cellulaire, qui se traduit par une augmentation de la production de second messager. Nous avons par contre suggéré l’utilisation d’AVP puisqu’il favorise l’endocytose des récepteurs R137/L sans promouvoir leur activation, diminuant ainsi le nombre de récepteurs actifs à la surface cellulaire. Nous avons identifié la première mutation occasionnant un gain de fonction du V2R qui n’implique pas l’arginine 137. Le mutant F229V a une activité constitutive élevée et, contrairement aux R137C et R137L, il n’est pas sujet à une désensibilisation spontanée accrue. L’observation que des agonistes inverses sont aptes à inhiber l’activité constitutive de ce nouveau mutant est une découverte importante puisque l’insuccès obtenu avec les mutations précédentes suggérait que ces molécules n’étaient pas utiles pour le traitement du NSIAD. Considérés globalement, ces travaux illustrent le caractère particulier des formes mutantes du V2R et l’importance de bien cerner les conséquences fonctionnelles des mutations afin d’apporter aux patients atteints de DINc ou NSIAD une thérapie personnalisée, et de développer de nouveaux agents thérapeutiques adaptés aux besoins.

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La neuropathie humaine sensitive et autonome de type 2 (NHSA 2) est une pathologie héréditaire rare caractérisée par une apparition précoce des symptômes et une absence d’affectation motrice. Cette pathologie entraîne la perte de perception de la douleur, de la chaleur et du froid ainsi que de la pression (toucher) dans les membres supérieurs et inférieurs et est due à des mutations autosomales récessives confinées à l’exon HSN2 de la protéine kinase à sérine/thréonine WNK1 (with-no-lysine protein kinase 1). Cet exon spécifique permettrait de conférer une spécificité au système nerveux à l’isoforme protéique WNK1/HSN2. La kinase WNK1 est étudiée en détails, en particulier au niveau du rein, mais son rôle au sein du système nerveux demeure inconnu. Considérant le début précoce de la neuropathie et le manque d’innervation sensorielle révélé par des biopsies chez les patients NHSA2, notre hypothèse de recherche est que les mutations tronquantes menant à la NHSA de type 2 causent une perte de fonction de l’isoforme WNK1/HSN2 spécifique au système nerveux entraînant un défaut dans le développement du système nerveux sensoriel périphérique. Chez l’embryon du poisson zèbre, WNK1/HSN2 est exprimé au niveau des neuromastes de la ligne latérale postérieure, un système mécanosensoriel périphérique. Nous avons obtenu des embryons knockdown pour WNK1/HSN2 par usage d’oligonucléotides morpholino antisens (AMO). Nos trois approches AMO ont révélé des embryons présentant des défauts d’établissement au niveau de la ligne latérale postérieure. Afin de déterminer la voie pathogène impliquant l’isoforme WNK1/HSN2, nous nous sommes intéressés à l’interaction rapportée entre la kinase WNK1 et le co-transporteur neuronal KCC2. Ce dernier est une cible de phosphorylation de WNK1 et son rôle dans la promotion de la neurogenèse est bien connu. Nous avons détecté l’expression de KCC2 au niveau de neuromastes de la ligne latérale postérieure et observé une expression accrue de KCC2 chez les embryons knockdown pour WNK1/HSN2 à l’aide de RT-PCR semi-quantitative. De plus, une sur-expression d’ARN humain de KCC2 chez des embryons a produit des défauts dans la ligne latérale postérieure, phénocopiant le knockdown de WNK1/HSN2. Ces résultats furent validés par un double knockdown, produisant des embryons n’exprimant ni KCC2, ni WNK1/HSN2, dont le phénotype fut atténué. Ces résultats nous mènent à suggérer une voie de signalisation où WNK1/HSN2 est en amont de KCC2, régulant son activation, et possiblement son expression. Nous proposons donc que la perte de fonction de l’isoforme spécifique cause un débalancement dans les niveaux de KCC2 activée, menant à une prolifération et une différenciation réduites des progéniteurs neuronaux du système nerveux périphérique. Les défauts associés à la NHSA de type 2 seraient donc de nature développementale et non neurodégénérative.

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Ce mémoire présente mes travaux ayant menés au développement d’une première génération de radioligands marqués au fluor-18 (t1/2 = 110 min) et au carbone-11 (t1/2 = 20.4 min) destinés à l’imagerie cérébrale in vivo du récepteur tyrosine kinase neurotrophique de type 2 (TrkB) en tomographie par émission de positons (TEP). Ces travaux reposent sur l’identification récente de ligands de TrkB non peptidiques à hautes affinités dérivés du 7,8-dihydroxyflavone. La synthèse d’une série de dérivés du 7,8-dihydroxyflavone non-radioactifs de même que des précuseurs à l’incorporation du fluro-18 et du carbone-11 a d’abord été effectuée. Partant des précurseurs adéquats synthétisés, la radiosynthèse de deux radioligands, l’un marqué au fluor-18 et l’autre au carbone-11, a été développée. Ces radiosynthèses reposent respectivement sur une 18F-radiofluorination nucléophile aromatique nouvelle et hautement efficace et sur une 11C-méthylation N-sélective. Les radiotraceurs de TrkB ainsi obtenus ont ensuite été évalués in vitro en autoradiographie et in vivo en tant que traceurs TEP dans des rats. L’évaluation des propriétés physico-chimique de même que de la stabilité in vitro des radiotraceurs sont présentées. Partant d’une série d’analogues cristallisés de ces flavones synthétiques, une étude de relation structure-activité a été menée. La combinaison de cette étude, de pair avec l’évaluation in vivo de la première génération de radiotraceurs de TrkB a aussi permis d’investiguer les pharmacophores nécessaires à l’affinité de ces ligands de même que d’identifier des fragments structurels associés au métabolisme des radiotraceurs. La radiosynthèse d’un troisième radioligand de TrkB et son évaluation TEP in vivo de même que la mise en lumière des modifications structurelles utiles au développement d’une seconde génération de radioligands de TrkB avec des propriétés optimisées pour fin d’imagerie TEP sont aussi détaillés.

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La présente thèse, organisée en trois volets, poursuivait trois objectifs : i) Estimer les coûts médicaux directs du traitement du DT2 dans 4 pays d’Afrique subsaharienne et dans le cas du Mali, rapprocher ces coûts médicaux directs estimés aux dépenses effectives des patients diabétiques ; ii) Examiner le coût-efficacité des interventions de prévention basées sur la modification du mode de vie chez les sujets à haut risque du DT2; iii) Cerner la perception et les attitudes des acteurs de la santé sur les outils de plaidoyer développés dans le cadre du projet DFN et leur potentiel d’impact sur les décideurs. Dans le premier volet, il s’est agi d’estimer les coûts du DT2 et de ses complications au moyen d’un calculateur et de le mettre à l’épreuve au Bénin, au Burkina- Faso, en Guinée et au Mali. Les composantes de soins pour le DT2 et ses complications avaient été définies au préalable par une équipe de spécialistes, sur la base de leur expérience clinique et des lignes directrices existantes. Les prix ont été relevés dans deux structures hospitalières du secteur public et deux du privé. Les coûts ont été estimés sur une base annuelle pour le DT2 avec ou sans complications chroniques puis par épisode pour les complications aiguës. Dans le cas du Mali, ces coûts ont été rapprochés des dépenses de patients diabétiques d’après une précédente enquête transversale dans ce pays. Cette enquête portait sur 500 sujets diabétiques sélectionnés au hasard dans les registres. Les dépenses pour les soins des trois derniers mois avaient été relevées. Les déterminants des dépenses ont été explorés. Il ressort des différences de coûts dans le même secteur puis entre le secteur privé et le secteur public. Le coût minimum du traitement du DT2 sans complications dans le secteur public représentait entre 21% et 34% de PIB par habitant, puis entre 26% - 47% en présence de la rétinopathie et au-delà de 70% pour la néphropathie, la complication chronique la plus coûteuse. Les dépenses des sujets diabétiques enquêtés au Mali, étaient en deçà des coûts minima estimatifs des différentes complications excepté la rétinopathie et le DT2 sans complication. Les facteurs comme l’insulinothérapie, le nombre de complications et la résidence dans la capitale étaient significativement associés aux dépenses plus élevées des patients. Dans le second volet, la revue systématique a consisté à recenser les études d’évaluation économique des interventions de prévention du DT2 dans des groupes à haut risque par l’alimentation et/ou l’activité physique. Les interventions de contrôle de l’obésité comme facteur de risque majeur de DT2 ont également été considérées. Les études ont été sélectionnées dans les bases de données scientifiques en utilisant les mots clés et des critères prédéfinis. Les études originales publiées entre janvier 2009 et décembre 2014 et conduites en français, anglais ou espagnol étaient potentiellement éligibles. La liste de contrôle de « British Medical Journal » a servi à évaluer la qualité des études. Des 21 études retenues, 15 rapportaient que les interventions étaient coût-efficaces suivant les limites d’acceptabilité considérées. Six études étaient non concluantes, dont quatre destinées à la prévention du DT2 et deux, au contrôle de l’obésité. Dans le troisième volet, les perceptions d’utilisateurs potentiels de ce calculateur et d’un autre outil de plaidoyer, à savoir, l’argumentaire narratif expliquant la nécessité de se pencher sur la lutte contre le DT2 en Afrique, ont été évaluées dans une étude qualitative exploratoire. Les données ont été collectées au cours d’entretiens individuels avec 16 acteurs de la santé de quatre pays d’Afrique subsaharienne et un groupe de discussion avec 10 étudiants de master de nutrition à l’issue d’un atelier de formation sur le plaidoyer faisant appel à ces outils, au Bénin. Les entretiens ont été enregistrés, transcrits et codés à l’aide du logiciel QDA Miner. Les participants ont souligné la pertinence des outils pour le plaidoyer et la convivialité du calculateur de coûts. Il demeure cependant que le contexte politique marqué par la compétition des priorités, l’absence de cohésion entre les décideurs et un défaut de données notamment sur le coût-efficacité des interventions sont des freins à la priorisation du DT2 dans les politiques de santé en Afrique subsaharienne que les répondants ont relevés. L’étude confirme que le traitement du DT2 est financièrement inabordable pour un grand nombre de patients. Elle souligne que les dépenses des patients sont en deçà des coûts estimés pour un traitement approprié avec quelques exceptions. La prévention du DT2 basée le mode de vie est coût-efficace mais devrait être étudiée en Afrique. On peut espérer que la pertinence des outils de ce travail telle que relevée par les acteurs de santé se traduise par leur utilisation. Ceci pour susciter des interventions de prévention afin d’infléchir l’évolution du DT2 et son impact économique en Afrique subsaharienne.