Essential oils as anti-nematode agents and their influence on in vitro nematode

Tese de doutoramento, Biologia (Biotecnologia), Universidade de Lisboa, Faculdade de Ciências, 2015

HES1 in immunity and cancer

Hairy and enhancer of split homolog-1 (HES1) is a part of an extensive family of basic helix-loop-helix (bHLH) proteins and plays a crucial role in the control and regulation of cell cycle, proliferation, cell differentiation, survival and apoptosis in neuronal, endocrine, T-lymphocyte progenitors as well as various cancers. HES1 is a transcription factor which is regulated by the NOTCH, Hedgehog and Wnt signalling pathways. Aberrant expression of these pathways is a common feature of cancerous cells. There appears to be a fine and complicated crosstalk at the molecular level between the various signalling pathways and HES1, which contributes to its effects on the immune response and cancers such as leukaemia. Several mechanisms have been proposed, including an enhanced invasiveness and metastasis by inducing epithelial mesenchymal transition (EMT), in addition to its strict requirement for tumour cell survival. In this review, we summarize the current biology and molecular mechanisms as well as its use as a clinical target in cancer therapeutics.

Genomic, Epigenomic and Transcriptomic Molecular Characterization of Splenic Marginal Zone Lymphoma Reveals Recurrent Abnormalities in miR-182

Splenic marginal zone lymphoma (SMZL) is a low grade B-cell non-Hodgkin's lymphoma. The molecular pathology of this entity remains poorly understood. To characterise this lymphoma at the molecular level, we performed an integrated analysis of 1) genome wide genetic copy number alterations 2) gene expression profiles and 3) epigenetic DNA methylation profiles.We have previously shown that SMZL is characterised by recurrent alterations of chromosomes 7q, 6q, 3q, 9q and 18; however, gene resolution oligonucleotide array comparative genomic hybridisation did not reveal evidence of cryptic amplification or deletion in these regions. The most frequently lost 7q32 region contains a cluster of miRNAs. qRT-PCR revealed that three of these (miR-182/96/183) show underexpression in SMZL, and miR-182 is somatically mutated in >20% of cases of SMZL, as well as in >20% of cases of follicular lymphoma, and between 5-15% of cases of chronic lymphocytic leukaemia, MALT-lymphoma and hairy cell leukaemia. We conclude that miR-182 is a strong candidate novel tumour suppressor miRNA in lymphoma.The overall gene expression signature of SMZL was found to be strongly distinct fromthose of other lymphomas. Functional analysis of gene expression data revealed SMZL to be characterised by abnormalities in B-cell receptor signalling (especially through the CD19/21-PI3K/AKT pathway) and apoptotic pathways. In addition, genes involved in the response to viral infection appeared upregulated. SMZL shows a unique epigenetic profile, but analysis of differentially methylated genes showed few with methylation related transcriptional deregulation, suggesting that DNA methylation abnormalities are not a critical component of the SMZL malignant phenotype.

Origin and regenerative potential of vertebrate mechanoreceptor-associated stem cells

Meissner corpuscles and Merkel cell neurite complexes are highly specialized mechanoreceptors present in the hairy and glabrous skin, as well as in different types of mucosa. Several reports suggest that after injury, such as after nerve crush, freeze injury, or dissection of the nerve, they are able to regenerate, particularly including reinnervation and repopulation of the mechanoreceptors by Schwann cells. However, little is known about mammalian cells responsible for these regenerative processes. Here we review cellular origin of this plasticity in the light of newly described adult neural crest-derived stem cell populations. We also discuss further potential multipotent stem cell populations with the ability to regenerate disrupted innervation and to functionally recover the mechanoreceptors. These capabilities are discussed as in context to cellularly reprogrammed Schwann cells and tissue resident adult mesenchymal stem cells.

Epstein-Barr virus: clinical and epidemiological revisits and genetic basis of oncogenesis

Epstein-Barr virus (EBV) is classified as a member in the order herpesvirales, family herpesviridae, subfamily gammaherpesvirinae and the genus lymphocytovirus. The virus is an exclusively human pathogen and thus also termed as human herpesvirus 4 (HHV4). It was the first oncogenic virus recognized and has been incriminated in the causation of tumors of both lymphatic and epithelial nature. It was reported in some previous studies that 95% of the population worldwide are serologically positive to the virus. Clinically, EBV primary infection is almost silent, persisting as a life-long asymptomatic latent infection in B cells although it may be responsible for a transient clinical syndrome called infectious mononucleosis. Following reactivation of the virus from latency due to immunocompromised status, EBV was found to be associated with several tumors. EBV linked to oncogenesis as detected in lymphoid tumors such as Burkitt's lymphoma (BL), Hodgkin's disease (HD), post-transplant lymphoproliferative disorders (PTLD) and T-cell lymphomas (e.g. Peripheral T-cell lymphomas; PTCL and Anaplastic large cell lymphomas; ALCL). It is also linked to epithelial tumors such as nasopharyngeal carcinoma (NPC), gastric carcinomas and oral hairy leukoplakia (OHL). In vitro, EBV many studies have demonstrated its ability to transform B cells into lymphoblastoid cell lines (LCLs). Despite these malignancies showing different clinical and epidemiological patterns when studied, genetic studies have suggested that these EBV- associated transformations were characterized generally by low level of virus gene expression with only the latent virus proteins (LVPs) upregulated in both tumors and LCLs. In this review, we summarize some clinical and epidemiological features of EBV- associated tumors. We also discuss how EBV latent genes may lead to oncogenesis in the different clinical malignancies

Färg och missfärgning hos sågad björk : - Variation samt effekter av avverkningstidpunkt, lagring av timmer och torkning av sågad vara

Variation i björkvirkets färg beror på art, läge i träd, ursprung och lagringstid. Vårtbjörk har en mörkare färg än glasbjörk, men livligare struktur och glans. Timmer hugget under tillväxtsäsongen bör sågas färskt eller lagras högst en månad. Vid brädgårdstorkning är god luftcirkulation och skydd för väta och direkt solljus väsentligt. Strövirkets färskhet är av stor betydelse för att undvika fuktfärgning av virket.Variation in birch colours depend on species, position in tree, origin and the storage period. White birch is darker than hairy birch but with a lively structure and shine. During vegetation period timber storage exceeding one month should be avoided. Air circulation, protection from rain and direct sunlight are essential for yard drying. Freshness of stickers used for stacking is important to avoid water marks on wood surface.

Análises morfológicas e moleculares dos gêneros Galium L.e Relbunium (Endl.)Hook.f. (RUbieae-Rubiaceae)no estado do Rio Grande do Sul-Brasil

Desde o início da história taxonômica de Relbunium, muitos foram os trabalhos que enfatizaram sua autonomia e posição taxonômica. Atualmente, alguns estudos sugerem que as espécies pertencentes a Relbunium devam ser incluídas em uma seção do gênero Galium. Porém, recentes estudos moleculares na tribo Rubieae, destacam Galium como um grupo parafilético, e Relbunium como um gênero independente e monofilético. O problema taxonômico referente a Galium e Relbunium é de difícil solução, devido à ausência de estudos que integrem caracteres morfológicos, ecológicos e moleculares. No presente trabalho objetivou-se adicionar informações para o conhecimento básico das espécies de Relbunium e Galium para o sul do Brasil, a partir de caracteres morfológicos e moleculares, buscando responder a seguinte questão: “Relbunium pode ser considerado um gênero ou apenas uma seção dentro de Galium?”. Para atingir os objetivos, foi analisada a morfologia das espécies, com ênfase nas folhas, flores e frutos para duas espécies de Galium e treze de Relbunium: G. latoramosum, G. uruguayense, R. equisetoides, R. gracillimum, R. hirtum, R. humile, R. humilioides, R. hypocarpium, R. longipedunculatum, R. mazocarpum, R. megapotamicum, R. nigro-ramosum, R. ostenianum, R. richardianum e R. valantioides. Chaves de identificação foram geradas a partir dos resultados das análises morfológicas. As folhas foram analisadas quanto à forma, ápice, padrão de venação, tricomas, estômatos, distribuição de idioblastos secretores e vascularização do hidatódio. Esses caracteres não evidenciaram a separação entre os gêneros, auxiliando apenas na individualização das espécies. A morfologia das flores e frutos auxiliou na diferenciação dos gêneros e espécies estudadas. As flores são comumente bispóricas, a exceção de G. latoramosum. Brácteas involucrais, ausentes em Galium, estão presentes nas espécies de Relbunium, de duas a quatro; nesse gênero há presença de antopódio, ausente em Galium. A corola possui tricomas glandulares unicelulares na face adaxial, e na face abaxial os tricomas, quando presentes, são simples e idioblastos secretores estão presentes apenas em R. gracillimum. O androceu tem quatro estames alternipétalos e exsertos, com anteras dorsifixas e tetrasporangiadas, de deiscência longitudinal. O ovário é ínfero, bicarpelar, bilocular, com um rudimento seminal anátropo e unitegumentado por lóculo. O desenvolvimento dos frutos, a estrutura do pericarpo e da testa foram descritos. Os frutos são do tipo baga, em R. gracillimum e R. hypocarpium, ou esquizocarpo, nas demais espécies. A consistência do pericarpo pode variar de carnosa, nos frutos do tipo baga, a levemente seca, nos frutos esquizocarpos. Entre as espécies, observou-se uma variação com relação ao exocarpo, que pode ser liso, piloso ou com idioblastos secretores. A testa é constituída por apenas uma camada de células, que em R. hypocarpium mostra-se descontínua. Além das descrições morfológicas, foram realizados estudos moleculares das espécies, através do seqüenciamento de fragmentos do DNA nuclear (ITS) e plastidial (trnL-F). A partir dos resultados obtidos formam elaborados cladogramas com base nos dados morfológicos e moleculares. O cladograma construído a partir dos dados morfológicos (vegetativos e reprodutivos) evidenciou a distinção dos dois gêneros, ou seja, sustenta Relbunium como táxon independente. Nesse cladograma observa-se que a VI presença ou ausência de brácteas foi determinante, e proporcionou a separação dos gêneros. A uniformidade dos caracteres morfológicos vegetativos entre as espécies auxiliou apenas na distinção das espécies de Relbunium. Com relação aos dados moleculares, os fragmentos de DNA utilizados mostraram-se pouco informativos. A análise do fragmento ITS, em especial, contribuiu para confirmação da relação entre algumas espécies (R. hirtum e R. ostenianum, e R. humile e R. mazocarpum). A análise combinada dos dados morfológicos e moleculares não caracterizou Relbunium como um clado monofilético, sendo sua manutenção não sustentada, isso, principalmente, devido à falta de diferenças moleculares entre as espécies. Conclui-se que para o grupo em questão as análises morfológicas, das folhas, flores e frutos, foram suficientes para destacar Relbunium como um gênero autônomo e monofilético na tribo Rubieae.

Interferência de caruru-de-mancha, maria-pretinha, picão-preto e tiririca em tomateiro industrial

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Controle químico de biótipos de buva (Conyza canadensis e Conyza bonariensis) resistentes ao glyphosate

Studies were conducted at Estacao Experimental de Citricultura de Bebedouro, SP to evaluate the response of glyphosate-resistant horseweed and hairy fleabane biotypes to herbicides glyphosate, bromacil + diuron, diuron e paraquat isolated and in mixture and effect of a sequential application of glyphosate. The experimental design was of complete randomized blocks with four replication and seven treatments. The herbicides were applied with costal sprayer, constant pressure with three nozzles TT110015, the equivalent spray volume was 150 L ha(-1). The control was visually evaluated, trough percentile note scale. The best results were obtained to general control of weed with diuron isolated and glyphosate in mixture with bromacil + diuron while to glyphosate-resistant horseweed and hairy fleabane there was no difference between the treatments. After sequential application to Conyza sp control, the best treatment was obtained associated with diuron and bromacil+diuron.

Desenvolvimento e composição mineral do picão-preto sob diferentes níveis de pH

Visando estudar a tolerância do picão-preto (Bidens pilosa) a diferentes níveis de pH do substrato, conduziu-se um ensaio em condições de câmara de crescimento e utilizando-se a técnica de hidroponia, no qual três plântulas foram transplantadas para recipientes contendo solução nutritiva de Hoagland & Arnon, com pH ajustado para 3,5, 4,0, 5,0, 6,0, 7,0 e 8,0. O delineamento experimental utilizado foi o inteiramente casualizado com três repetições. Ao final do período experimental, 42 dias após o transplante, observou-se que as plantas que se desenvolveram nos pHs 3,5 e 8,0 apresentaram-se menores, com menor comprimento e volume do sistema radicular, menor número de folhas vivas e, consequentemente, menor peso de matéria seca das folhas, caule e raízes. Os teores de N e S nas raízes diminuiram com o aumento do pH do substrato, enquanto os de Ca e Mg aumentaram e os de K e P diminuiram no pH 5,0 a 6,0. No caule, apenas o teor de Mg foi afetado pelo pH, mostrando resposta positiva. Na folha obteve-se os maiores teores de P, S, Ca e Mg quando a planta se desenvolveu em pH 6,0. Não se constatou diferença significativa entre os efeitos dos pHs 5,0, 6,0 e 7,0 nos parâmetros avaliados, sendo que foi no pH 6,0 que se estimou, através de análise de regressão, melhor desenvolvimento do picão-preto. Concluiu-se que o picãopreto apresenta melhor desenvolvimento em pHs próximo ao neutro, com certa tolerância a pHs extremos (3,5 e 8,0).

Acúmulo de matéria seca e macronutrientes por plantas de Merremia aegyptia

Um experimento em casa de vegetação foi conduzido entre janeiro e junho de 2008, na FCAV/UNESP, Brasil, objetivando estudar a produção de massa seca, a marcha de absorção e o acúmulo de macronutrientes por Merremia aegyptia, uma importante planta daninha em culturas anuais e perenes no Brasil. As plantas foram cultivadas em vasos de 7 L com substrato de areia, que foram irrigados diariamente com solução nutritiva de Hoagland & Arnon. Os tratamentos corresponderam às épocas de avaliação, em intervalos de 14 dias, iniciando-se 21 dias após a emergência (DAE). em cada avaliação, as plantas de quatro vasos foram analisadas quanto à produção de massa seca e ao conteúdo de macronutrientes. M. aegyptia apresentou pequeno acúmulo de massa seca e de macronutrientes no início da fase experimental, os quais foram intensificados após 49 DAE. As folhas foram as principais estruturas acumuladoras de massa seca na primeira metade do ciclo de M. aegyptia, enquanto os caules o foram na segunda metade. N e K foram os macronutrientes mais acumulados em plantas de M. aegyptia. O período de máximo acúmulo teórico de massa seca e macronutrientes por M. aegyptia ocorreu entre 146 e 160 DAE.

Determination of Merremia cissoides leaf area using the linear measures of the leaflets

O conhecimento da área foliar de plantas daninhas pode auxiliar o estudo das relações de interferência entre elas e as culturas agrícolas. O objetivo desta pesquisa foi determinar uma equação matemática que estime a área foliar de Merremia cissoides, a partir da relação entre as dimensões lineares dos limbos foliares. Folhas da espécie foram coletadas de diferentes locais na Universidade Estadual Paulista, Jaboticabal, Estado de São Paulo, Brasil, medindo-se o comprimento (C), a largura máxima (L) e a área foliar de três tipos de folíolos. Foram estimadas equações lineares Y = a x (X) para cada tipo de folíolo. Houve sobreposição dos intervalos de confiança das equações dos folíolos primário e secundário, por isso considerou-se uma única equação da média desses folíolos, além da equação do folíolo principal, para caracterização da área foliar de M. cissoides. Assim, a área foliar dessa espécie pode ser estimada pelo somatório das áreas dos limbos foliares dos folíolos principal e primário + secundário, por meio da equação AFnest = 0,501 x (X) + 2,181 x (Z), em que X indica C x L do folíolo principal e Z indica C x L médios dos folíolos primário + secundário, respectivamente.

Controle químico de plantas dos gêneros Ipomoeae Merremia em cana-soca

To evaluate the efficiency of herbicide application in post emergence, alone and in mixture, for Ipomoea grandifolia, I. hederifolia, I. purpurea, I. quamoclit, Merremia aegyptia and M. cissoides control in sugarcane, an experiment was conducted on a commercial production area in Jaboticabal, SP, Brazil, from November 2007 to July 2008. Six herbicide treatments [trifloxysulfuron plus ametryn (37 plus 1463.07 g ha(-1)), diuron plus hexazinone (1.170 + 330 g ha(-1)), metribuzin (1.920 g ha(-1)), (trifloxysulfuron plus ametryn, 27.75 + 1097.3 g ha(-1)) plus (diuron plus hexazinone, 702 + 198 g ha(-1)), metribuzin (960 g ha(-1)) plus (trifloxysulfuron plus ametryn, 27.75 + 1097.3 g ha(-1)) and metribuzin (960 g ha(-1)) plus (diuron plus hexazinone, 702 + 198 g ha(-1))] and two treatments without application were evaluated. The visual injuries caused by the herbicide did not affect stalk number and stalk diameter in sugarcane. However, the plants treated with diuron plus hexazinone presented lower stalk height. The herbicides diuron plus hexazinone, alone and in mixture with trifloxysulfuron plus ametryn, were efficient in the control of all morningglory and woodrose species. Application of trifloxysulfuron plus ametryn alone controlled satisfactorily only I. hederifolia. Metribuzin was efficient in the control of I. grandifolia, I. quamoclit, M. aegyptia and M. cissoides. Besides these species, the association of this herbicide with diuron plus hexazinone resulted in excellent I. hederifolia control. The mixture of metribuzin with trifloxysulfuron plus ametryn was efficient in controlling I. hederifolia, M. aegyptia and M. cissoides. The new emergence of the morningglory and woodrose species evaluated after herbicide application or manual weed elimination would not harm the mechanized harvest of sugarcane stalks in the next harvest.

Variáveis qualitativas da pulverização em feijão, Bidens pilosa E Brachiaria plantaginea

Conduziu-se este trabalho, com o objetivo de avaliar a qualidade da deposição da calda de pulverização em plantas de feijão (Phaseolus vulgaris L.), Bidens pilosa L. e de Brachiaria plantaginea (Link) Hitchc. presentes na linha e entrelinha da cultura. Foi utilizado como traçador o corante Azul Brilhante FDC-1 (500 ppm). Utilizaram-se cinco pontas de pulverização: jato plano (XR 110015 VS e XR 11002 VS), jato plano duplo (TJ60 11002 VS) e jato cônico (TX-6 VS e TX-8 VS) e dois volumes de aplicação 150 e 200 L ha-1. O delineamento utilizado foi de blocos ao acaso, com 4 repetições. Foram amostradas 25 plantas em cada parcela/repetição, de plantas de feijão e plantas daninhas presentes na linha e na entrelinha da cultura. Após a aplicação, as plantas foram coletadas e lavadas em água destilada para quantificação do traçador em espectrofotômetro. Os dados ajustaram-se à curva de regressão pelo modelo de Gompertz. Os resultados evidenciaram que: para as plantas de feijão as pontas XR 110015 e TJ60 proporcionaram as deposições mais uniformes, nos volumes de 150 e 200 L ha-1, respectivamente; a ponta TX-6 no volume de 150 L ha-1 apresentou melhor uniformidade de distribuição para ambas as espécies de plantas daninhas presentes na linha da cultura; para as plantas daninhas presentes na entrelinha, no volume de 150 L ha-1, destacaram-se as pontas XR 110015 e TJ60 11002 para B. pilosa e B. plantaginea, respectivamente, no volume de 200 L ha-1 destacou-se a ponta TX-8 para ambas as espécies.

Phosphorus and potassium balance in soil under crop rotation and fertilization

The use of crop rotation and manure application can provide sustainability for an agricultural production system by improving soil quality and increasing nutrient use efficiency. This study aimed to evaluate the effect of mineral, organic and mineral+organic fertilization on grain yield and on soil phosphorus and potassium balance, in two crop systems under no-till, with and without rotation of cover crops. The experiment was carried out from 2006 to 2008 on a clayey Rhodic Hapludox in Marechal Candido Rondon, Parana State, Brazil. The cropping sequence in the rotation system involving cover crops was black oat + hairy vetch + forage turnip/corn/pigeon pea/wheat/mucuna + brachiaria + sunn hemp, and in the succession system was wheat/corn/wheat/soybean. Organic and mineral+organic fertilizations consisted of the application of solely manure and manure combined with mineral fertilizer, respectively. Soil P and K balances were calculated after the second year of the experiment, up to a depth of 0.40 m. First year corn yields were higher in the crop succession system accompanied by mineral fertilization. In the second year, wheat and soybean yield did not vary between crop systems and nutrient sources, demonstrating the residual effect of crop rotation and manure use. Crop rotation with cover crops resulted in an increase in soil K levels by promoting the recycling of this nutrient in the soil. In both crop systems, the application of mineral and organic fertilizers - either in isolation or in combination - resulted in a negative soil P and K balance in the short term. This represents a threat to the sustainability of the agricultural production system in the long term, due to the depletion of soil nutrient reserves.