Genetics of cadmium hyperaccumulation variance in Thlaspi caerulescens natural populations from Switzerland

SUMMARY Heavy metal presence in the environment is a serious concern since some of them can be toxic to plants, animals and humans once accumulated along the food chain. Cadmium (Cd) is one of the most toxic heavy metal. It is naturally present in soils at various levels and its concentration can be increased by human activities. Several plants however have naturally developed strategies allowing them to grow on heavy metal enriched soils. One of them consists in the accumulation and sequestration of heavy metals in the above-ground biomass. Some plants present in addition an extreme strategy by which they accumulate a limited number of heavy metals in their shoots in amounts 100 times superior to those expected for a non-accumulating plant in the same conditions. Understanding the genetic basis of the hyperaccumulation trait - particularly for Cd - remains an important challenge which may lead to biotechnological applications in the soil phytoremediation. In this thesis, Thlaspi caerulescens J. & C. Presl (Brassicaceae) was used as a model plant to study the Cd hyperaccumulation trait, owing to its physiological and genetic characteristics. Twenty-four wild populations were sampled in different regions of Switzerland. They were characterized for environmental and soil parameters as well as intrinsic characteristics of plants (i.e. metal concentrations in shoots). They were as well genetically characterized by AFLPs, plastid DNA polymorphism and genes markers (CAPS and microsatellites) mainly developed in this thesis. Some of the investigated genes were putatively linked to the Cd hyperaccumulation trait. Since the study of the Cd hyperaccumulation in the field is important as it allows the identification of patterns of selection, the present work offered a methodology to define the Cd hyperaccumulation capacity of populations from different habitats permitting thus their comparison in the field. We showed that Cd, Zn, Fe and Cu accumulations were linked and that populations with higher Cd hyperaccumulation capacity had higher shoot and reproductive fitness. Using our genetic data, statistical methods (Beaumont & Nichols's procedure, partial Mantel tests) were applied to identify genomic signatures of natural selection related to the Cd hyperaccumulation capacity. A significant genetic difference between populations related to their Cd hyperaccumulation capacity was revealed based on somè specific markers (AFLP and candidate genes). Polymorphism at the gene encoding IRTl (Iron-transporter also participating to the transport of Zn) was suggested as explaining part of the variation in Cd hyperaccumulation capacity of populations supporting previous physiological investigations. RÉSUMÉ La présence de métaux lourds dans l'environnement est un phénomène préoccupant. En effet, certains métaux lourds - comme le cadmium (Cd) -sont toxiques pour les plantes, les animaux et enfin, accumulés le long de la chaîne alimentaire, pour les hommes. Le Cd est naturellement présent dans le sol et sa concentration peut être accrue par différentes activités humaines. Certaines plantes ont cependant développé des stratégies leur permettant de pousser sur des sols contaminés en métaux lourds. Parmi elles, certaines accumulent et séquestrent les métaux lourds dans leurs parties aériennes. D`autres présentent une stratégie encore plus extrême. Elles accumulent un nombre limité de métaux lourds en quantités 100 fois supérieures à celles attendues pour des espèces non-accumulatrices sous de mêmes conditions. La compréhension des bases génétiques de l'hyperaccumulation -particulièrement celle du Cd - représente un défi important avec des applications concrètes en biotechnologies, tout particulièrement dans le but appliqué de la phytoremediation des sols contaminés. Dans cette thèse, Thlaspi caerulescens J. & C. Presl (Brassicaceae) a été utilisé comme modèle pour l'étude de l'hyperaccumulation du Cd de par ses caractéristiques physiologiques et génétiques. Vingt-quatre populations naturelles ont été échantillonnées en Suisse et pour chacune d'elles les paramètres environnementaux, pédologique et les caractéristiques intrinsèques aux plantes (concentrations en métaux lourds) ont été déterminés. Les populations ont été caractérisées génétiquement par des AFLP, des marqueurs chloroplastiques et des marqueurs de gènes spécifiques, particulièrement ceux potentiellement liés à l'hyperaccumulation du Cd (CAPS et microsatellites). La plupart ont été développés au cours de cette thèse. L'étude de l'hyperaccumulation du Cd en conditions naturelles est importante car elle permet d'identifier la marque, éventuelle de sélection naturelle. Ce travail offre ainsi une méthodologie pour définir et comparer la capacité des populations à hyperaccumuler le Cd dans différents habitats. Nous avons montré que les accumulations du Cd, Zn, Fe et Cu sont liées et que les populations ayant une grande capacité d'hyperaccumuler le Cd ont également une meilleure fitness végétative et reproductive. Des méthodes statistiques (l'approche de Beaumont & Nichols, tests de Martel partiels) ont été utilisées sur les données génétiques pour identifier la signature génomique de la sélection naturelle liée à la capacité d'hyperaccumuler le Cd. Une différenciation génétique des populations liée à leur capacité d'hyperaccumuler le Cd a été mise en évidence sur certains marqueurs spécifiques. En accord avec les études physiologiques connues, le polymorphisme au gène codant IRT1 (un transporteur de Fe impliqué dans le transport du Zn) pourrait expliquer une partie de la variance de la capacité des populations à hyperaccumuler le Cd.

[Inondations de voies ferrées en région parisienne, début janvier 1920] : [photographie de presse] / [Agence Rol]

Référence bibliographique : Rol, 57487

Multifocalité du carcinome épidermoïde sur les voies digestive supérieure et respiratoire distale : technicité du diagnostic endoscopique [Multiple squamous cell carcinoma of the upper digestive and lower respiratory tracts : methodology of endoscopic screening]

L'étude porte sur 951 porteurs d'un cancer primaire bucco-pharyngo-laryngé, et révèle un taux de multifocalité du carcinome épidermoïde sur les voies digestive supérieure (bouche-pharynx-oesophage) et aérienne distale (larynx-trachée-bronches) s'élevant à 14,5 %. Les secondes localisations peuvent être simultanées (6,4 %) ou successives (8,1 %) à la découverte du premier cancer: dès la deuxième année du follow-up leur incidence dépasse celle des récidives. Elles se localisent tant au niveau ORL (8,5 %) qu'oesophagien (3 %) ou bronchique (3 %). Le cancer du voile présente un taux de multifocalité particulièrement élevé (51 %). Les auteurs décrivent un type d'endoscopie de dépistage (bucco-pharyngo-oesophago-laryngo-trachéobronchoscopie) dont la fiabilité repose sur une technicité spécifique d'une part, et sur la connaissance des caractéristiques propres aux secondes localisations d'autre part. Ce dépistage systématique permet de détecter les tumeurs secondaires à un stade le plus souvent précoce et encore asymptomatique.

Lectures classiques, spécialement destinées aux écoles primaires et supérieures... par Émile de La Cour, et précédées d'un enseignement raisonné sur la lecture à haute voix, par Ed. Mennechet,...

Comprend : Enseignement raisonné sur la lecture à haute voix

Chimioradiothérapie postopératoire des cancers des voies aérodigestives : vers un nouveau standard [Post-operative radiochemotherapy of the head and neck: Towards new standards?]

Head and neck squamous cell carcinomas are frequently diagnosed at an advanced stage. Their treatment remains controversial, and has to be multidisciplinary. External beam radiotherapy is a recognized treatment option after radical curative surgery in order to improve local control. Different adjuvant treatment options have been studied in order to improve the outcome of these patients. We review in this paper the different prognostic factors indicating an adjuvant treatment and the interest of treatment intensification in bad prognostic patients.

Lésions iatrogènes des voies biliaires lors de la cholécystectomie laparoscopique

Objective: Laparoscopic cholecystectomy (LC) has become the gold standard in the treatment of symptomatic cholelithiasis. The aim of this study was to determine the frequency of occurrence and risk factors of iatrogenic bile duct injuries (IBDI) in the LC and study their treatment modalities. Methods: Between January 2000 and December 2011, a series of 13 patients (6 men, 7 women, mean age 66.7 years, mean BMI 27.9 kg/m2) underwent IBDI in our institution for 2'840 LC performed. These patients were identified retrospectively using a wide range of classification codes in our medical center for archiving. Their medical records were examined individually to identify a IBDI. Results: The frequency of IBDI was 0.46% (n=13). The most common indication for surgery was acute cholecystitis (69.2%). The main cause was the confusion of the common bile duct with the cystic duct in 38.5% of cases. Strasberg classification applied to our sample identified the following injuries: A (n=4), D (n=4), E1 (n=3) and E5 (n=2). They were diagnosed intraoperatively in 46.2% of cases and postoperatively in 53.8% of cases. The rate of type D lesions was significantly higher in the group with intraoperative recognition (p= 0.009), while the rate of type A lesions was significantly higher in the group with postoprative recognition (p = 0.026). Intraoperatively, 83.3% of the lesions were treated by primary suture with a biliary drainage and a hepatico-jejunal anastomosis was performed immediately in one case (16.7%). Postoperatively, 85.7% of the lesions were treated by non-surgical techniques in first- line and 4 of them have undergone biliary surgery later. The total number of therapeutic procedures for each IBDI after LC was significantly higher when the diagnosis was made postoperatively (3.4 vs. 1.5, p= 0.040). Conclusion: This study has identified a patient at risk of IBDI, this one is relatively old, overweight and has an inflammatory environment. Misidentification of biliary anatomy remains the main cause. There is a clear relationship between the timing of recognition and the type of injury involved. The primary suture with adequate drainage seems to be the method of choice for intraoperative discovery, while in case of postoperative recognition, the treatment must be adapted after a multidisciplinary consensus by combining interventional radiology, endoscopy and surgery.

"Marxisme et philosophie du langage" (1929) de V. Volochinov et sa réception chez R. Chor : deux voies du développement de la science du langage «marxiste» dans les années 1920 en Russie

Malgré le succès de  « Marxisme et philosophie du langage » (par la suite MPL) de V. Volochinov, ce texte n'a suscité que trois comptes rendus. Le quatrième est ébauché par A. Romm. Resté à l'état de notes, ce compte rendu est bien étudié par les chercheurs contemporains. En revanche, le compte rendu écrit par R. Chor n'a jamais été analysé de façon détaillée. Notre article a pour but de combler cette lacune et porte sur le contenu de l'analyse critique de MPL faite par Chor. Son examen révèle que le compte rendu écrit par cette dernière et MPL de Volochinov représentent la formulation de principes de base diamétralement opposés de la science du langage «marxiste». Cela se manifeste dans la réception des idées de F. de Saussure. Si Chor considère la conception de ce dernier comme fondement de la linguistique «théorique» portant sur la langue en tant que système de signes (ou de «signifiances» dans les termes de Chor), Volochinov rejette la théorie de Saussure. Il la considère comme «abstraite», d'où le nom «objectivisme abstrait» qu'il donne au saussurisme. En élaborant la philosophie du langage «marxiste», il s'appuie sur la néo-philologie idéaliste (les idées de Vossler et de son Ecole) définie dans MPL comme «subjectivisme individualiste». Volochinov propose d'étudier la «langue» comme fait réel, accessible à l'observation immédiate et non pas comme objet d'étude «théorique». Ce fait constitue une cible de la critique adressée par Chor à Volochinov