Caracterização da distribuição de alelos de loci STR do cromossomo Y com elevada taxa de mutação em uma amostra populacional do Rio de Janeiro

Marcadores genéticos presentes no cromossomo Y, como os microssatélites (Y-STRs) e polimorfismos de único nucleotídeo (Y-SNPs) são utilizados na caracterização de linhagens masculinas, visto que são transmitidos às gerações seguintes sem alterações, a menos que ocorram mutações (Singh et al., 2011; Mitchell & Hammer, 1996; Butler, 2009). Por isso, esses marcadores são amplamente empregados em diversas situações, destacando-se o uso constante dos Y-STRs na genética forense por apresentarem alta capacidade de discriminar linhagens. Recentemente, foram descritos 13 marcadores com taxas de mutação substancialmente superiores àquelas verificadas para loci STR do cromossomo Y, denominados Rapidly Mutating (RM) Y-STRs (Ballantyne et al., 2010; Kayser et al., 2012). Devido às taxas de mutação elevadas, os RM-YSTRs apresentam maior eficiência na discriminação entre indivíduos proximamente relacionados, pertencentes à mesma linhagem patrilínea. O presente trabalho buscou aprofundar o conhecimento acerca das características populacionais e mutacionais dos loci RM-YSTRs em amostra do Rio de Janeiro, contribuindo com estudos desta natureza na população brasileira. Realizou-se a análise de 13 loci do cromossomo Y em 258 indivíduos do sexo masculino, compondo 129 pares de pais e filhos, nascidos no estado do Rio de Janeiro. O DNA das amostras foi extraído, conforme os protocolos vigentes na rotina do LDD-UERJ. As sequências genéticas de interesse foram amplificadas pela técnica de reação em cadeira da polimerase (PCR) através da realização de três PCR multiplex, cujos produtos de amplificação foram separados por eletroforese em sequenciador automático ABI-3500 (Applied Biosystems). Para os pares pai/filho que apresentaram haplótipos mutados, empregou-se a técnica de sequenciamento para confirmação das mutações. Os loci RM-YSTR geraram um poder de discriminação de 1,0 na amostra analisada, o que significa que todos os 129 indivíduos da amostra populacional apresentaram haplótipos diferentes para tais marcadores, com frequências de 0,0077 e diversidade haplotípica igual a 1. Além disso, foram obtidos valores elevados de diversidade gênica para os 13 marcadores. A análise de distância genética e os resultados de AMOVA baseados nos valores de Fst demonstraram que os RM-YSTR não indicam subdivisão populacional e traços ancestrais comuns. Tais valores estão associados às elevadas taxas de mutação encontradas, cuja média foi de 2,11 x 10-2. Foi possível observar que os loci RM-YSTR são muito discriminativos na amostra miscigenada analisada, além de terem maior capacidade de diferenciar indivíduos do que outros conjuntos de marcadores normalmente usados em estudos populacionais e análises forenses. Sendo assim, é possível concluir que os marcadores RM-YSTR são promissores para discriminar indivíduos da mesma linhagem patrilínea, visto que devido às suas elevadas taxas mutacionais e poder de discriminação, são capazes de diferenciar indivíduos de maneira mais eficiente do que os outros conjuntos de STR. Porém, é necessário maior número de estudos para melhor caracterização destes loci em diferentes populações.

Phylogeny of higher taxa of Hexapoda according to 12sRNA sequences

The phylogenetic relationship of Hexapoda has been debated for a long time, which will be resolved mainly depending on the settlement of monophyly, affinities and interrelationships among Protura, Collembola and Diplura. Mitochondrial 12sRNA gene about 35

Phylogenetic analysis of snow sheep (Ovis nivicola) and closely related taxa

Based on mitochondrial cytochrome b gene sequence analysis, the history of true sheep ( Ovis) began approximately 3.12 million years ago ( MYA). The evolution of Ovis resulted in three generally accepted genetic groups: Argaliforms, Moufloniforms, and Pac

Genetic status of selected fish taxa in relation to conservation of genetic and species diversity in the Victoria and Kyoga Lake basins

Cichlids are known for their explosive radiation especially in the African Great Lakes marked with a high level of lake endemism. These fishes have been characterized mainly along trophic and habitat differences, by variation in morphological structures such as teeth and jaws and by differences in body shape and coloration. Cichlids are important as a microcosm of macroevolution. The explosive radiation, young evolutionary scale, and the isolation of groups characterized with high levels of endemism and presence of living fossils makes the group important for evolutionary and genetic studies. Lake Victoria region cichlids which are isolated and relatively more recent in evolution were the last to be appreciated in their diversity. Recently Ole Seehausen has found scores of rock fishes in Lake Victoria which were up to then thought to be absent from the Lake and only known to occur in Lakes Malawi and Tanganyika. Greenwood put together the species groups of Lake Victoria, and later in the early 1980's revised the classification of haplochromine species to reflect the phyletic origin and interrelationship of the various groups in Lake Victoria region. Melan Stiassny has been interested in early evolution of cichlids while the likes of Paul Fuerst and Lees Kaufman and Axel Meyer have been interested and are working to explain the speciation mechanisms responsible for the explosive radiation and evolution of cichlids. Locally S.B Wandera and his student Getrude Narnulemo are spearheading the biodiversity and taxonomic studies of cichlids in Lake Victoria region

Floral Organogenesis and Development of two Taxa in Tribe Hyoscyameae (Solanaceae)-Przewalskia tanguitca and Hyoscyamus niger

Floral organogenesis and development of Przeivalskia langutica Maxim, endemic to China and Hyoscyamus niger L. , which belong to the tribe Hyoscyameae (Solanaceae), were studied using scanning electron microscope. They have three common characters of floral organ initiation and development: 1) initia-tion of the floral organs in the two species follows Hofmeister's rule; 2) the mode of corolla tube development belongs to the "late sympetaly" type; 3) primordia of the floral appendages initiated in a pentameroua pattern and acropetal order. But initiation of the calyx-lobe primordia showed different modes in these two species. The calyx-lobe primordia of H, niger have simultaneously whorled initiation, while those of P, tangulica have helical initiation, but the five calyx-lobe primordia form a ring after all five calyx-lobe primordia occur. The systematic significance of the present results in the genera Hyoscyamus and Przeivalskia is discussed in this paper.

Floral organogenesis and development of two taxa of the Solanaceae - Anisodus tanguticus and Atropa belladonna

Floral organogenesis and development of two Solanaceae species, Anisodus tanguticus and Atropa belladonna, were studied by using scanning electron microscopy (SEM) as part of a project on systematics and evolution in the tribe Hyoscyameae. These two species share the following common characters of floral organ initiation and development: (1) initiation of the floral organs in the two species follows Hofmeister's rule; (2) the mode of corolla tube development belongs to the "late sympetaly" type, namely, petals are initiated separately and later become joined by fusion of their basal meristem, then rise together and form a corolla tube; (3) primordia of the floral appendages are initiated in a pentamerous pattern and acropetal order: sepals are initiated first, followed by the petals and stamens, and finally the carpels. The whorl of five stamen primordia forms almost simultaneously and originates opposite the sepal primordia, but initiation of the sepal primordia shows different modes in the two species. The sepal primordia of Anisodus tanguticus have simultaneously whorled initiation, while those of Atropa belladonna have helical initiation. The systematic significance of the present results in the genera Anisodus and Atropa is discussed in this paper.

New taxa, names, and combinations in Saxifraga (Saxifragaceae) for the Flora of China

The following new species, new variety, new name, and four new combinations are published for the forthcoming account of Saxifraga L. in the Flora of China, Volume 8: S. epiphylla Gornall & H. Ohba, sp. nov., S. gemmigera Engler var. gemmuligera (Engler) J. T. Pan & Gornall, comb. nov., S. heterotricha Marquand & Airy-Shaw var. anadena (H. Smith) J. T. Pan & Gornall, comb. et stat, nov., S. hypericoides Franchet var. aurantiascens (Engler & Irmscher) J. T. Pan & Gornall, comb. nov., S. hypericoides var. rockii (Mattfeld) J. T. Pan & Gornall, comb. et stat. nov., S. sinomontana J. T. Pan & Gornall, nom. nov., and S. sinomontana var. amabilis H. Smith ex J. T. Pan, var. nov. In addition, the names S. mengtzeana Engler & Irmscher and S. mengtzeana var. cordatifolia Engler & Irmscher are lectotypified here.