Nationales Fischereidatenerhebungsprogramm: Aktivitäten und Ausblick

Within the frame of the EU Data Collection Regulation (DCR), Germany is obliged since 2002 to collect basic fisheries data to support the Common Fisheries Policy. Various governmental institutions are involved in the collection of landings and effort data, biological and economic data of the German fisheries. About 200 trips on commercial fishery vessels were sampled from 2002 to 2006. Additional stock data are collected on research surveys. The landings of cod in the recreational fisheries in the North and Baltic Seas were recorded within a pilot study. In order to assess the economic situation of the fishing fleet and processing industry, economic data were collected. The collected data are being stored in a national database and being made available for scientific working groups. At present, the legal regulations within the DCR framework are being reviewed and adapted to the changing requirements of fisheries management.

Structure-function studies of serine hydrolases: synthesis of a gene for ∝-lytic protease and the purification and characterization of a mutant β-lactamase

The author has constructed a synthetic gene for ∝-lytic protease. Since the DNA sequence of the protein is not known, the gene was designed by using the reverse translation of ∝-lytic protease's amino acid sequence. Unique restriction sites are carefully sought in the degenerate DNA sequence to aid in future mutagenesis studies. The unique restriction sites are designed approximately 50 base pairs apart and their appropriate codons used in the DNA sequence. The codons used to construct the DNA sequence of ∝-lytic protease are preferred codons in E-coli or used in the production of β-lactamase. Codon usage is also distributed evenly to ensure that one particular codon is not heavily used. The gene is essentially constructed from the outside in. The gene is built in a stepwise fashion using plasmids as the vehicles for the ∝-lytic oligomers. The use of plasmids allows the replication and isolation of large quantities of the intermediates during gene synthesis. The ∝-lytic DNA is a double-stranded oligomer that has sufficient overhang and sticky ends to anneal correctly in the vector. After six steps of incorporating ∝-lytic DNA, the gene is completed and sequenced to ensure that the correct DNA sequence is present and that no mutations occurred in the structural gene.

β-lactamase is the other serine hydrolase studied in this thesis. The author used the class A RTEM-1 β- lactamase encoded on the plasmid pBR322 to investigate the roll of the conserved threonine residue at position 71. Cassette mutagenesis was previously used to generate all possible amino acid substitutions at position 71. The work presented here describes the purification and kinetic characterization of a T71H mutant previously constructed by S. Schultz. The mutated gene was transferred into plasmid pJN for expression and induced with IPTG. The enzyme is purified by column chromatography and FPLC to homogeneity. Kinetic studies reveal that the mutant has lower k_(cat) values on benzylpenicillin, cephalothin and 6-aminopenicillanic acid but no changes in k_m except for cephalothin which is approximately 4 times higher. The mutant did not change siginificantly in its pH profile compared to the wild-type enzyme. Also, the mutant is more sensitive to thermal denaturation as compared to the wild-type enzyme. However, experimental evidence indicates that the probable generation of a positive charge at position 71 thermally stabilized the mutant.

Galveston Bay Migrates to the Web; DSpace Comes to Texas

This presentation describes how the Galveston Bay Bibliography and Galveston Bay Information Center projects transitioned from a paper world to electronic format. The mission of the Galveston Bay Information Center (GBIC) is to serve as a repository for information and a resource for research on Galveston Bay, its watershed, and the coastal region for all members of the Galveston Bay Community. GBIC was created in response to critical losses of data and information that were identified in the early stages of Galveston Bay National Estuary Program and includes a physical collection as well as a bibliography. With the loss of funding imminent, the administrators of GBIC recognized the need to preserve the collection and its digital bibliography in perpetuity. Enter Texas Digital Library. The University’s participation in TDL enabled GBIC to make the Galveston Bay Bibliography more robust and visible to the entire world.

Benefício da natação em modelo experimental de doença gordurosa hepática não alcoólica e síndrome metabólica

O acúmulo crônico de gordura no fígado (doença hepática gordurosa não alcoólica ou esteatose hepática não alcoólica - NAFLD) está fortemente associada com a obesidade e a resistência à insulina. O estudo teve como objetivo investigar o efeito do exercício físico (natação) na redução da esteatose hepática e comorbidades associadas, incluindo a expressão hepática de síntese de ácidos graxos e receptor proliferador de peroxissoma atividade alfa. Camundongos machos C57BL/6 foram divididos em dois grandes grupos de acordo com a dieta durante 22 semanas: dieta padrão (10% de gordura, SC) ou dieta rica em gordura (60% de gordura, HF), caracterizando os grupos sedentários SC-Sed e HF-Sed. Nas últimas 10 semanas do experimento, metade dos grupos sedentários foram submetidos ao protocolo de natação com um aumento progressivo no tempo (6/dia até 60/dia, 5x/semana), caracterizando os grupos exercitados: SC-Ex e HF-Ex. No final do experimento, comparado ao grupo SC-Sed, o grupo HF-Sed teve a massa corporal significativamente superior, hiperglicemia, hiperinsulinemia com resistência à insulina, hipertrofia dos adipócitos (com infiltrado inflamatório), hipertrofia das ilhotas pancreáticas, dislipidemia, alteração das enzimas hepáticas e inflamatórias e NAFLD com mudanças na expressão de proteínas hepáticas lipogênicas e oxidativas. O programa de natação, mesmo concomitante com a dieta rica em gordura, reduziu o excesso de peso e todos os outros resultados, especialmente a NAFLD. Os resultados permitem concluir que a natação pode atenuar os efeitos deletérios de uma dieta rica em gorduras combinado com estilo de vida sedentário em camundongos. Estes dados reforçam a idéia que o exercício físico pode ser considerado uma estratégia terapêutica não farmacológica eficaz no tratamento da NAFLD, obesidade e resistência à insulina.

Surface mucous as a source of genomic DNA from Atlantic billfishes (Istiophoridae) and swordfish (Xiphiidae)

Procedures for sampling genomic DNA from live billfishes involve manual restraint and tissue excision that can be difficult to carry out and may produce stresses that affect fish survival. We examined the collection of surface mucous as a less invasive alternative method for sourcing genomic DNA by comparing it to autologous muscle tissue samples from Atlantic blue marlin (Makaira nigricans), white marlin (Tetrapturus albidus), sailfish (Istiophorus platypterus), and swordfish (Xiphias gladius). Purified DNA from mucous was comparable to muscle and was suitable for conventional polymerase chain reaction, random amplified polymorphic DNA analysis, and mitochondrial and nuclear locus sequencing. The nondestructive and less invasive characteristics of surface mucous collection may promote increased survival of released specimens and may be advantageous for other marine fish genetic studies, particularly those involving large live specimens destined for release.

Dietas ricas em gordura, frutose e sacarose: alterações no fígado

Hábitos inadequados no estilo de vida, pelo consumo exacerbado de dietas ricas em gorduras e açúcares (frutose e sacarose), correlacionam-se positivamente com o desenvolvimento da obesidade, da resistência à insulina (RI) e da esteatose hepática não alcoólica (NAFLD). O estudo teve como objetivo avaliar a magnitude dos efeitos da administração crônica de dietas ricas em gordura e/ou frutose, e ainda, comparar os efeitos dos açúcares isoladamente (frutose e sacarose) sob as alterações bioquímicas, o perfil inflamatório, as respostas morfofuncionais e as expressões proteicas e gênicas de fatores de transcrição envolvidos na lipogênese, na beta-oxidação, na gliconeogênese e no estresse oxidativo no fígado. Camundongos machos C57BL/6 foram divididos em dois experimentos: 1) Dieta controle/standard chow (SC), dieta high fat (HF 42%), dieta high frutose (HFr 34%) e dieta high fat + high frutose (HFHFr - 42% fat + 34% frutose) por 16 semanas; 2) Dieta controle/standard chow (SC), dieta high frutose (HFru 50%) e dieta high sacarose (HSu 50%) por 15 semanas. Ao final dos experimentos foram observados: 1) Não houve diferença na massa corporal entre os animais HFr e SC, só foi observado ganho de peso nos grupos HF e HFHFr. Houve ainda aumento do colesterol total, dos triglicerídeos plasmáticos e hepáticos e RI nos grupos HF, HFr e HFHFr. No fígado, foi observado NAFLD com aumento na expressão de SREBP-1c e PPAR-γ, e redução de PPAR-α. A gliconeogênese mediada pelo GLUT-2 e PEPCK também foi aumentada nos grupos HF, HFr e HFHFr em relação ao grupo SC. Áreas de necroinflamação também foram observadas nos animais HFr e HFHFr; 2) Não houve diferença na massa corporal entre os grupos SC, HFru e HSu. Porém, houve aumento do colesterol total, dos triglicerídeos plasmáticos e hepáticos, da RI, das adipocinas (IL-6, resistina, MCP-1 e leptina), e redução da adiponectina. No fígado, abundante NAFLD com predominância da expressão proteica e gênica de SREBP-1c, PPAR-γ e redução de PPAR-α; e desequilíbrio antioxidante com redução da SOD, da Catalase e da GRx nos grupos HFru e HSu quando comparados ao SC. Não houve diferença na GPx entre os três grupos. Ainda foi observado aumento na expressão proteica de G6Pase, PEPCK e GLUT-2, envolvidos na gliconeogênese hepática nos grupos HFru e HSu. Áreas de necroinflamação, característico da transição NAFLD-NASH, também foram observados. Os resultados permitem concluir que, independente do aumento da massa corporal, a administração crônica de dietas ricas em frutose e sacarose tem efeitos similares aos observados com o consumo de dieta hiperlipídica. Parece que a RI e a NAFLD sejam os precursores destas alterações.

Preliminary investigations on the population dynamics of Otolithes ruber (Sciaenidae) on Sofala Bank, Mozambique

Catch length-frequency data of Otolithes ruber (Schneider, 1801) obtained from the "Projecto de Pesca Experimental da RDA" on Sofala Bank, Mozambique, in 1987 were used to estimate growth parameters, mortalities and exploitation rates. The yield-and biomass-per-recruit analyses based thereon suggest that the stock is overfished.