"The Black Imprint of Sandals in White Mosaic Floors": H.D.'s Mythomystical Poetics

My dissertation examines the traces of inverse (mytho)mysticism, more synchronous with mythical alchemy than transcendent mystery, in H.D.’s mature work (1946-1961). Whereas H.D.’s earliest works respond to a fin de siècle occultism and a collective psyche troubled by the eschatological distress that, as Susan Acheson writes, “was widespread amongst modernist writers grappling with …world events and with the implications of Nietzsche’s inaugural annunciation of modernity in terms of the death of God” (187), her later oeuvre is dedicated to the same work of soul undertaken by the “secret cult of Night” in Vale Ave. Here, her thematic scope faces two ways: backward to ancient Greek mystery cults and their palingenesic rites and forward to depth psychologists searching for the Soul of the World. Vale Ave plays a pronounced role in my study as symbolic guide; in its seventy-four sequences the layering of time in the “trilogy” of past, present, and future that H.D. had explored during the years of the Second World War in order to get behind the fallen walls of cause and effect collapses into two distinct phases of human origin—“meeting” (evolution) and “parting” (involution)—and the poem invites Lilith and Lucifer to be its archetypal guides. My method for the study is imaginal, entering such disciplines as history, philosophy, and theology and bringing psychological understanding to them. John Walsh’s introduction to Vale Ave notes H.D.’s theme “that the human psyche exists in a dimension outside of time and space as well as within them. In Vale Ave, H.D. presents the extremity of this dual-dimensionality: metempsychosis” (vii). However, the concept that H.D. investigates is more than a literary processus of characters who adopt different masks and appear at various junctures in a chronological unwinding of history. I explore H.D.'s works as part of a Modernist tradition of writing “books of the dead” designed not to guide the soul after death, but to draw the gaze upon “a nearer thing,” as H.D. writes in Erige Cor Tuum Ad Me In Caelum, the wisdom intrinsic in the spirit of life itself.

Species boundaries and phylogenetic relationships within the green algal genus Codium (Bryopsidales) based on plastid DNA sequences

Despite the potential model role of the green algal genus Codium for studies of marine speciation and evolution, there have been difficulties with species delimitation and a molecular phylogenetic framework was lacking. In the present study, 74 evolutionarily significant units (ESUs) are delimited using 227 rbcL exon 1 sequences obtained from specimens collected throughout the genus' range. Several morpho-species were shown to be poorly defined, with some clearly in need of lumping and others containing pseudo-cryptic diversity. A phylogenetic hypothesis of 72 Codium ESUs is inferred from rbcL exon 1 and rps3-rp/16 sequence data using a conventional nucleotide substitution model (GTR + Gamma + I), a codon position model and a covariotide (covarion) model, and the fit of a multitude of substitution models and alignment partitioning strategies to the sequence data is reported. Molecular clock tree rooting was carried out because out-group rooting was probably affected by phylogenetic bias. Several aspects of the evolution of morphological features of Codium are discussed and the inferred phylogenetic hypothesis is used as a framework to study the biogeography of the genus, both at a global scale and within the Indian Ocean. (c) 2007 Elsevier Inc. All rights reserved.

Nonrigid Structure-From-Motion From 2-D Images Using Markov Chain Monte Carlo

In this paper we present a new method for simultaneously determining three dimensional (3-D) shape and motion of a non-rigid object from uncalibrated two dimensional (2- D) images without assuming the distribution characteristics. A non-rigid motion can be treated as a combination of a rigid rotation and a non-rigid deformation. To seek accurate recovery of deformable structures, we estimate the probability distribution function of the corresponding features through random sampling, incorporating an established probabilistic model. The fitting between the observation and the projection of the estimated 3-D structure will be evaluated using a Markov chain Monte Carlo based expectation maximisation algorithm. Applications of the proposed method to both synthetic and real image sequences are demonstrated with promising results.

PCR amplification of short tandem repeat sequences allows serial studies of chimaerism/engraftment following BMT in rodents

Animal models of bone marrow transplantation (BMT) allow evaluation of new experimental treatment strategies. One potential strategy involves the treatment of donor marrow with ultra-violet B light to allow transplantation across histocompatibility boundaries without an increase in graft rejection or graft-versus-host disease. A major requirement for a new experimental protocol, particularly if it involves manipulation of the donor marrow, is that the manipulated marrow gives rise to long-term multilineage engraftment. DNA based methodologies are now routinely used by many centres to evaluate engraftment and degree of chimaerism post-BMT in humans. We report the adaptation of this methodology to the serial study of engraftment in rodents. Conditions have been defined which allow analysis of serial tail vein samples using PCR of short tandem repeat sequences (STR-PCR). These markers have been used to evaluate the contribution of ultraviolet B treated marrow to engraftment following BMT in rodents without compromising the health of the animals under study. Chimaerism data from sequential tail vein samples and bone marrow from selected sacrificed animals showed excellent correlation, thus confirming the validity of this approach in analysing haemopoietic tissue. Thus the use of this assay may facilitate experimental studies in animal BMT.

Caractérisation et étude d'un élément régulateur du gène codant pour le récepteur à la vasopressine de type 2

Thèse réalisée en cotutelle avec l'Université Pierre et Marie Curie, Paris VI, France

Parcours d'entrée en vie féconde des femmes au Burkina Faso : une analyse séquentielle

Alors que dans les sociétés de l’Afrique de l’Ouest, le mariage représente traditionnellement le point de départ de la séquence des événements démographiques associés à la formation de la famille, aujourd’hui cette séquence s’est complexifiée. Suite à l’effritement des modes traditionnels du passage à l’âge adulte, les jeunes citadins reportent leur mariage, le contexte de l’initiation sexuelle est plus fréquemment prénuptial et le nombre de naissances hors mariage semble augmenter. Peu d’études se sont penchées sur l’analyse de la séquence de ces événements sous l’angle du parcours individuel. L’objectif central de ce mémoire est d’explorer, de décrire et d’expliquer les changements survenus dans les parcours d’entrée en vie féconde des femmes durant leur jeunesse en utilisant comme unité d’analyse l’entièreté des parcours. Utilisant les données EDS du Burkina Faso, nous synthétisons en parcours, sous forme des séquences d’épisodes, les calendriers du premier rapport sexuel, de la première union et de la première naissance. Avec l’analyse séquentielle, nous identifions quatre catégories de parcours : nuptial, sexualité prénuptiale, maternité prénuptiale et célibataires. La méthode permet également une catégorisation plus fine des parcours et une visualisation de modèles de transitions. Nous analysons ensuite l’association entre les caractéristiques individuelles et les parcours suivis grâce à des modèles multinomiaux. Nos résultats confirment l’augmentation des parcours non nuptiaux auprès des jeunes. De plus, ils montrent qu’un niveau de scolarité plus élevé augmente la probabilité de suivre un parcours non-traditionnel, notamment chez les femmes urbaines, le milieu de socialisation à l’enfance ayant aussi un effet sur le choix du parcours.

Modélisation de l'interprétation des pianistes & applications d'auto-encodeurs sur des modèles temporels

Ce mémoire traite d'abord du problème de la modélisation de l'interprétation des pianistes à l'aide de l'apprentissage machine. Il s'occupe ensuite de présenter de nouveaux modèles temporels qui utilisent des auto-encodeurs pour améliorer l'apprentissage de séquences. Dans un premier temps, nous présentons le travail préalablement fait dans le domaine de la modélisation de l'expressivité musicale, notamment les modèles statistiques du professeur Widmer. Nous parlons ensuite de notre ensemble de données, unique au monde, qu'il a été nécessaire de créer pour accomplir notre tâche. Cet ensemble est composé de 13 pianistes différents enregistrés sur le fameux piano Bösendorfer 290SE. Enfin, nous expliquons en détail les résultats de l'apprentissage de réseaux de neurones et de réseaux de neurones récurrents. Ceux-ci sont appliqués sur les données mentionnées pour apprendre les variations expressives propres à un style de musique. Dans un deuxième temps, ce mémoire aborde la découverte de modèles statistiques expérimentaux qui impliquent l'utilisation d'auto-encodeurs sur des réseaux de neurones récurrents. Pour pouvoir tester la limite de leur capacité d'apprentissage, nous utilisons deux ensembles de données artificielles développées à l'Université de Toronto.

L'utilisation de la musique comme support de nouveaux apprentissages dans le vieillissement normal et la maladie d'Alzheimer

L’objectif de ce travail de thèse est d’évaluer le potentiel de la musique comme support mnémotechnique pour l’acquisition de nouvelles informations chez des personnes âgées saines et atteintes de la maladie d’Alzheimer (MA). Les bénéfices de la musique sur la cognition ont souvent été mis en évidence, y compris chez des populations âgées ou atteintes de démence. Parallèlement, chez des sujets jeunes, l’idée que la musique peut servir de support pour la mémoire a été largement débattue. Pourtant, très peu d’études ont posé cette question auprès de populations âgées ou dans la démence, malgré le besoin persistant de stratégies d’intervention dans ce domaine. Dans le présent travail, deux études sont menées dans une cohorte de 8 participants atteints d’un stade léger de la maladie d’Alzheimer, et 7 participants âgés sains appariés en âge et niveau de scolarité. La première étude porte sur la mémoire verbale, et compare l’apprentissage et la rétention de paroles (textes inconnus) présentées de manière récitée ou chantée. Lorsque les paroles sont chantées, différents degrés de familiarité de la mélodie sont contrastés. Aussi, l’action motrice étant intimement liée à l’écoute musicale, nous contrastons deux procédures d’apprentissage impliquant (ou non) la production synchronisée des paroles à mémoriser pendant l’encodage : le participant est invité à chanter à l’unisson avec un modèle (ou à écouter simplement sans chanter). Les résultats de cette étude sont présentés et discutés dans les deux premiers articles de la partie expérimentale. Ils suggèrent globalement que la musique n’aide pas l’apprentissage en rappel immédiat ; un effet délétère est même observé lorsque la mélodie utilisée est non familière. Par contre, la musique favorise la rétention à long terme des paroles, principalement pour les participants MA. Elle ne semble cependant pas interagir avec la procédure d’apprentissage impliquant le chant à l’unisson. La seconde étude porte sur l’apprentissage de séquences de gestes. Suivant la même logique que dans la première étude, nous explorons l’influence d’un accompagnement musical (versus apprentissage en silence) et d’une procédure d’apprentissage avec production synchronisée (versus observation) des gestes durant l’encodage. Les résultats (article 3) ne montrent pas non plus d’interaction entre l’accompagnement et la procédure d’apprentissage, mais différents effets de chaque composante sur les deux groupes de participants. Effectuer les gestes en synchronie avec un modèle lors de l’encodage est bénéfique pour les sujets Contrôles, mais plutôt délétère pour les participants MA. Par contre, l’accompagnement musical favorise davantage l’apprentissage chez les sujet MA que chez les Contrôles. En discussion générale, nous discutons les implications de ces résultats pour la neuropsychologie fondamentale et clinique, et proposons notamment différentes recommandations visant à maximiser ces effets et à les rendre pertinents pour l’usage thérapeutique en stimulation cognitive.

Logique d'action et quête de sens : le risque en protection de l'enfance

La présente recherche a comme sujet la gestion des risques au cœur de la prise de décision en protection de l’enfance. Elle a comme objectif une meilleure compréhension de la pratique à partir de la construction des logiques d’action déployées par les professionnels ainsi que la réflexion sur le sens qu’ils accordent à leurs actions. Le projet est porté par une posture constructiviste : les professionnels « construisent » la situation problématique de l’enfant à protéger tout comme ils construisent la solution envisagée. C’est à partir de la combinaison entre la réflexivité (Schön; Racine; Giddens) et la délibération éthique (Bossé, Morin et Dallaire) que des groupes de discussion impliquant des professionnels de professions et de statuts différents ont été réalisés au Centre jeunesse de l’Estrie. Ces groupes s’inscrivent dans une méthodologie qualitative laissant place aux discours des acteurs et sont accompagnés d’entretiens individuels comme stratégie complémentaire de cueillette de données. Les données ont été explorées à partir d’une analyse de contenu sous trois axes (Van der Maren) : une analyse horizontale (dégager les éléments pertinents à partir d’un cadre de délibération éthique), une analyse verticale (dégager les interactions et les inter-influences dans les groupes de discussion) et une analyse transversale (dégager des noyaux de sens et des logiques d’action à travers les discours). Les résultats permettent d’établir des séquences dans la prise de décision des professionnels à partir desquelles se construisent les logiques d’action. Trois logiques sont dégagées de l’analyse de contenu ⎯ collaborative, délibérative, légaliste ⎯ qui sont appuyées sur plusieurs dimensions regroupées à l’intérieur de trois axes d’intérêt : le rapport au mandat de protection, le rapport à la situation et le rapport au risque. Au-delà des logiques elles-mêmes, les résultats portent également à réfléchir des éléments de processus qui influencent la prise de décision. Ces éléments amènent à explorer et à questionner la posture professionnelle et la conviction, le dialogue et la présence d’espace de traduction ainsi que l’apport de la délibération collective. Au final, la recherche permet de réaffirmer la complexité de la pratique de protection de l’enfance mais elle conduit également à plaider en faveur d’une conscientisation de la pratique. Dégager des logiques d’action procure des clés de réflexivité pour les professionnels les menant à conscientiser leur prise de décision et ainsi accéder

Modeling High-Dimensional Audio Sequences with Recurrent Neural Networks

Cette thèse étudie des modèles de séquences de haute dimension basés sur des réseaux de neurones récurrents (RNN) et leur application à la musique et à la parole. Bien qu'en principe les RNN puissent représenter les dépendances à long terme et la dynamique temporelle complexe propres aux séquences d'intérêt comme la vidéo, l'audio et la langue naturelle, ceux-ci n'ont pas été utilisés à leur plein potentiel depuis leur introduction par Rumelhart et al. (1986a) en raison de la difficulté de les entraîner efficacement par descente de gradient. Récemment, l'application fructueuse de l'optimisation Hessian-free et d'autres techniques d'entraînement avancées ont entraîné la recrudescence de leur utilisation dans plusieurs systèmes de l'état de l'art. Le travail de cette thèse prend part à ce développement. L'idée centrale consiste à exploiter la flexibilité des RNN pour apprendre une description probabiliste de séquences de symboles, c'est-à-dire une information de haut niveau associée aux signaux observés, qui en retour pourra servir d'à priori pour améliorer la précision de la recherche d'information. Par exemple, en modélisant l'évolution de groupes de notes dans la musique polyphonique, d'accords dans une progression harmonique, de phonèmes dans un énoncé oral ou encore de sources individuelles dans un mélange audio, nous pouvons améliorer significativement les méthodes de transcription polyphonique, de reconnaissance d'accords, de reconnaissance de la parole et de séparation de sources audio respectivement. L'application pratique de nos modèles à ces tâches est détaillée dans les quatre derniers articles présentés dans cette thèse. Dans le premier article, nous remplaçons la couche de sortie d'un RNN par des machines de Boltzmann restreintes conditionnelles pour décrire des distributions de sortie multimodales beaucoup plus riches. Dans le deuxième article, nous évaluons et proposons des méthodes avancées pour entraîner les RNN. Dans les quatre derniers articles, nous examinons différentes façons de combiner nos modèles symboliques à des réseaux profonds et à la factorisation matricielle non-négative, notamment par des produits d'experts, des architectures entrée/sortie et des cadres génératifs généralisant les modèles de Markov cachés. Nous proposons et analysons également des méthodes d'inférence efficaces pour ces modèles, telles la recherche vorace chronologique, la recherche en faisceau à haute dimension, la recherche en faisceau élagué et la descente de gradient. Finalement, nous abordons les questions de l'étiquette biaisée, du maître imposant, du lissage temporel, de la régularisation et du pré-entraînement.