939 resultados para clones
Resumo:
Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)
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Com o objetivo de avaliar a eficiência da seleção precoce em Eucalyptus spp. foram usados dados de dois testes clonais avaliados quanto ao crescimento em altura (ALT), diâmetro à altura do peito (DAP) e volume individual de madeira (VOL) aos 25, 50 e 72 meses de idade. O delineamento experimental nos dois testes clonais foi o de blocos casualizados, com trinta tratamentos (clones), seis repetições, sendo um deles com seis e o outro com dez plantas em linha por parcela, no espaçamento de 3,0 m x 3,0 m. Foi feita a análise de variância para cada caracter e idade. Foram obtidas as estimativas de coeficiente de determinação genotípico e de correlações genotípicas entre os caracteres nas idades juvenis e na idade de rotação. Para verificar a viabilidade da aplicação da seleção precoce, foi simulada a seleção de 30% dos clones nas idades juvenis e na idade de rotação para cada um dos caracteres e idades avaliadas, obtendo-se as estimativas de ganhos genéticos com a seleção direta e indireta. Houve diferenças significativas entre os clones avaliados nos dois experimentos para todos os caracteres e idades. Com base nos resultados obtidos, é possível efetuar a seleção precoce aos 2 anos de idade sobre o caracter DAP em testes clonais de eucalipto.
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The survey presented here describes the bacterial diversity and community structures of a pristine forest soil and an anthropogenic, terra preta from the Western Amazon forest using molecular methods to identify the predominant phylogenetic groups. Bacterial community similarities and species diversity in the two soils were compared using oligonucleotide fingerprint grouping of 16S rRNA gene sequences for 1500 clones (OFRG) and by DNA sequencing. The results showed that both soils had similar bacterial community compositions over a range of phylogenetic distances, among which Acidobacteria were predominant, but that terra preta supported approximately 25% greater species richness. The survey provides the first detailed analysis of the composition and structure of bacterial communities from terra preta anthrosols using noncultured-based molecular methods. (c) 2006 Elsevier Ltd. All rights reserved.
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In the present work, we report the use of bacterial colonies to optimize macroarray technique. The devised system is significantly cheaper than other methods available to detect large-scale differential gene expression. Recombinant Escherichia coli clones containing plasmid-encoded copies of 4,608 individual expressed sequence tag (ESTs) were robotically spotted onto nylon membranes that were incubated for 6 and 12 h to allow the bacteria to grow and, consequently, amplify the cloned ESTs. The membranes were then hybridized with a beta-lactamase gene specific probe from the recombinant plasmid and, subsequently, phosphorimaged to quantify the microbial cells. Variance analysis demonstrated that the spot hybridization signal intensity was similar for 3,954 ESTs (85.8%) after 6 h of bacterial growth. Membranes spotted with bacteria colonies grown for 12 h had 4,017 ESTs (87.2%) with comparable signal intensity but the signal to noise ratio was fivefold higher. Taken together, the results of this study indicate that it is possible to investigate large-scale gene expression using macroarrays based on bacterial colonies grown for 6 h onto membranes.
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Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)
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Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)
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Avaliaram-se a composição química da madeira e da casca de sete espécies (E. saligna E. grandis, E. urophylla, E. camaldulensis, E. citriodora, E. paniculata e E. pellita) e três clones de eucalipto (híbridos de E. grandis x E. urophylla), antes e durante o cultivo das linhagens LE-95/01 e LE-96/18 de shiitake (Lentinula edodes), em toras. Cada linhagem de shiitake foi inoculada em nove toras de cada tipo de eucalipto com 1 m de comprimento e 9 a 14 cm de diâmetro. Assim, o delineamento experimental foi inteiramente casualizado, com 20 tratamentos e nove repetições, sendo cada repetição correspondente a uma tora. As toras foram mantidas em estufa climatizada, com temperatura de 25 ºC ± 5 e umidade relativa do ar entre 60-80%, durante 12 meses. Para a determinação da composição química da madeira, analisaram-se cunhas de discos e cascas de eucalipto recém-cortadas (sem inoculação das linhagens de L. edodes) e cunhas de discos e cascas retirados de toras já inoculadas com as linhagens de L. edodes após oito meses de incubação. Os resultados mostraram diferenças nos teores de holocelulose, lignina e extrativos totais na madeira e casca após o corte e depois de oito meses de incubação nas espécies e clones de eucalipto; o maior índice de decomposição da holocelulose na madeira, ao longo do tempo, ocorreu no E. saligna (5,5%), indicando, assim, ser o mais favorável para o desenvolvimento micelial do L. edodes. Já na casca aconteceu no clone 24 (22,2%). O E. camaldulensis apresentou o maior índice de decomposição da lignina na madeira (6,8%), ao longo do tempo. Já na casca, entre os eucaliptos testados, o E. grandis sofreu a maior decomposição de lignina (21,9%); o L. edodes degradou muito mais a holocelulose e lignina da casca que da madeira, tornando evidente a importância da casca; a casca da maioria dos tipos de eucaliptos apresentou menor teor de holocelulose, maior teor de extrativos totais e teores de lignina semelhantes ou superiores quando comparados com a madeira. O fator tipo de eucalipto (espécies e clones) teve maior efeito que o fator linhagem de L. edodes na degradação da holocelulose e lignina.
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Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)
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Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)
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Escherichia coli has been one of the most widely used hosts in recombinant protein production, in both laboratory and industrial scale since the advent of recombinant DNA technology. Despite the substantial progress of studies on the molecular biology and immunology of infections, there is currently no medication-based prophylaxis capable of preventing leishmaniasis. As such, there is a great need to identify specific antigens for the development of vaccines and diagnostic kits against visceral leishmaniasis. Thus, the primary goal of the present study is to assess the influence of cultivation conditions on the production of Leishmania chagasi antigens, carried out in a rotating incubator and bioreactor. To that end, several assays were conducted to evaluate the kinetic behavior of antigens (648, 503) of Leishmania. i. chagasi in two different compositions of media (2xTY, TB), with and without an inducer. In order to improve expression, assays were performed in a benchtop bioreactor using the best conditions obtained in a rotating incubator, in addition to assessing the influence of stirring speed. Results show that high complexity of the cultivation medium favored kinetic growth of clones (648, 503). However, in assays submitted to induction by IPTG, this elevated complexity did not promote the expression of recombinant proteins. Expression of antigens 648 and 503 exhibited behavior associated with growth and, in terms of location, proteins 648 and 503 are intracellularly stored. Lactose may be the most adequate inducer in protein expression, when considering factors, cost, toxicity and stability. Elevated stirring may increase cell growth in clone 53, although it may not result in high concentrations for the protein of interest. On the other hand, positive results were obtained for all recombinant clones (648, 503) tested, confirmed by the electrophoretic profile
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Thermal stability, thermal decomposition process, residual mass, temperature of glass transition (T-g) and temperature dependence of storage modulus (E'), were determined for latex membranes prepared from six clones of Hevea brasiliensis: IAC 331, IAC 332, IAC 333 and IAC 334 grown at experimental plantations of Instituto Agronomico de Campinas (IAC) in Votuporanga, São Paulo State, Brazil. Latex membranes from GT1 and RRIM 600 Asian matrix clones were used as references. The thermal behavior of latex membranes from genetically improved rubber trees was characterized using thermogravimetry/derivative thermogravimetry (TG/DTG), differential scanning calorimetry (DSC) and dynamic mechanical analysis (DMA). The thermal behavior of latex from clones studied in the present work showed similar features of the clones previously reported (IAC 40, IAC 300, IAC 301, IAC 328, IAC 329 and IAC 330), with mass loss in four consecutive steps, except IAC 333, which showed an additional mass loss step. (c) 2006 Elsevier B.V. All rights reserved.