La tagatose-1,6-bisphosphate aldolase et la fructose-1,6-bisphosphate aldolase de classe I : mécanisme et stéréospécificité

La tagatose-1,6-biphosphate aldolase de Streptococcus pyogenes est une aldolase qui fait preuve d'un remarquable manque de spécificité vis à vis de ses substrats. En effet, elle catalyse le clivage réversible du tagatose-1,6-bisphosphate (TBP), mais également du fructose-1,6-bisphosphate (FBP), du sorbose-1,6-bisphosphate et du psicose-1,6-bisphosphate, quatre stéréoisomères, en dihydroxyacétone phosphate (DHAP) et en glycéraldéhyde-3-phosphate (G3P). Aldolase de classe I, qui donc catalyse sa réaction en formant un intermédiaire covalent obligatoire, ou base de Schiff, avec son susbtrat, la TBP aldolase de S. pyogenes partage 14 % d’identité avec l’enzyme modèle de cette famille, la FBP aldolase de muscle de mammifère. Bien que le mécanime catalytique de la FBP aldolase des mammifères ait été examiné en détails et qu’il soit approprié d’en tirer des renseignements quant à celui de la TBP aldolase, le manque singulier de stéréospécificité de cette dernière tant dans le sens du clivage que celui de la condensation n’est toujours pas éclairci. Afin de mettre à jour les caractéristiques du mécanisme enzymatique, une étude structurale de la TBP aldolase de S. pyogenes, un pathogène humain extrêmement versatile, a été entreprise. Elle a permis la résolution des structures de l’enzyme native et mutée, en complexe avec des subtrats et des inhibiteurs compétitifs, à des résolutions comprises entre 1.8 Å et 2.5 Å. Le trempage des cristaux de TBP aldolase native et mutante dans une solution saturante de FBP ou TBP a en outre permis de piéger un authentique intermédiaire covalent lié à la Lys205, la lysine catalytique. La determination des profils pH de la TBP aldolase native et mutée, entreprise afin d'évaluer l’influence du pH sur la réaction de clivage du FBP et TBP et ìdentifier le(s) résidu(s) impliqué(s), en conjonction avec les données structurales apportées par la cristallographie, ont permis d’identifier sans équivoque Glu163 comme résidu responsable du clivage. En effet, le mode de liaison sensiblement différent des ligands utilisés selon la stéréochimie en leur C3 et C4 permet à Glu163, équivalent à Glu187 dans la FBP aldolase de classe I, d’abstraire le proton sur l’hydroxyle du C4 et ainsi d’amorcer le clivage du lien C3-C4. L’étude du mécanimse inverse, celui de la condensation, grâce par exemple à la structure de l’enzyme native en complexe avec ses substrats à trois carbones le DHAP et le G3P, a en outre permis d’identifier un isomérisme du substrat G3P comme possible cause de la synthèse des isomères en C4 par cette enzyme. Ce résultat, ainsi que la decouverte d’un possible isomérisme cis-trans autour du lien C2-C3 de la base de Schiff formée avec le DHAP, identifié précedemment, permet de cerner presque complètement les particularités du mécanisme de cette enzyme et d’expliquer comment elle est capable de synthétiser les quatres stéréoisomères 3(S/R), 4(S/R). De plus, la résolution de ces structures a permis de mettre en évidence trois régions très mobiles de la protéine, ce qui pourrait être relié au rôle postulé de son isozyme chez S. pyogenes dans la régulation de l’expression génétique et de la virulence de la bactérie. Enfin, la résolution de la structure du mutant Lys229→Met de la FBP aldolase de muscle en complexe avec la forme cyclique du FBP, de même que des études cristallographiques sur le mutant équivalent Lys205→Met de la TBP aldolase de S. pyogenes et des expériences de calorimétrie ont permis d’identifier deux résidus particuliers, Ala31 et Asp33 chez la FBP aldolase, comme possible cause de la discrimination de cette enzyme contre les substrats 3(R) et 4(S), et ce par encombrement stérique des substrats cycliques. La cristallographie par rayons X et la cinétique enzymatique ont ainsi permis d'avancer dans l'élucidation du mécanisme et des propriétés structurales de cette enzyme aux caractéristiques particulières.

Une nouvelle méthode pour estimer la torsion géométrique en scoliose idiopathique de l’adolescent

La scoliose idiopathique de l’adolescent (SIA) est une déformation tridimensionnelle (3D) de la colonne vertébrale. Pour la plupart des patients atteints de SIA, aucun traitement chirurgical n’est nécessaire. Lorsque la déformation devient sévère, un traitement chirurgical visant à réduire la déformation est recommandé. Pour déterminer la sévérité de la SIA, l’imagerie la plus utilisée est une radiographie postéroantérieure (PA) ou antéro-postérieure (AP) du rachis. Plusieurs indices sont disponibles à partir de cette modalité d’imagerie afin de quantifier la déformation de la SIA, dont l’angle de Cobb. La conduite thérapeutique est généralement basée sur cet indice. Cependant, les indices disponibles à cette modalité d’imagerie sont de nature bidimensionnelle (2D). Celles-ci ne décrivent donc pas entièrement la déformation dans la SIA dû à sa nature tridimensionnelle (3D). Conséquemment, les classifications basées sur les indices 2D souffrent des mêmes limitations. Dans le but décrire la SIA en 3D, la torsion géométrique a été étudiée et proposée par Poncet et al. Celle-ci mesure la tendance d’une courbe tridimensionnelle à changer de direction. Cependant, la méthode proposée est susceptible aux erreurs de reconstructions 3D et elle est calculée localement au niveau vertébral. L’objectif de cette étude est d’évaluer une nouvelle méthode d’estimation de la torsion géométrique par l’approximation de longueurs d’arcs locaux et par paramétrisation de courbes dans la SIA. Une première étude visera à étudier la sensibilité de la nouvelle méthode présentée face aux erreurs de reconstructions 3D du rachis. Par la suite, deux études cliniques vont présenter la iv torsion géométrique comme indice global et viseront à démontrer l’existence de sous-groupes non-identifiés dans les classifications actuelles et que ceux-ci ont une pertinence clinique. La première étude a évalué la robustesse de la nouvelle méthode d’estimation de la torsion géométrique chez un groupe de patient atteint de la SIA. Elle a démontré que la nouvelle technique est robuste face aux erreurs de reconstructions 3D du rachis. La deuxième étude a évalué la torsion géométrique utilisant cette nouvelle méthode dans une cohorte de patient avec des déformations de type Lenke 1. Elle a démontré qu’il existe deux sous-groupes, une avec des valeurs de torsion élevées et l’autre avec des valeurs basses. Ces deux sous-groupes possèdent des différences statistiquement significatives, notamment au niveau du rachis lombaire avec le groupe de torsion élevée ayant des valeurs d’orientation des plans de déformation maximales (PMC) en thoraco-lombaire (TLL) plus élevées. La dernière étude a évalué les résultats chirurgicaux de patients ayant une déformation Lenke 1 sous-classifiées selon les valeurs de torsion préalablement. Cette étude a pu démontrer des différences au niveau du PMC au niveau thoraco-lombaire avec des valeurs plus élevées en postopératoire chez les patients ayant une haute torsion. Ces études présentent une nouvelle méthode d’estimation de la torsion géométrique et présentent cet indice quantitativement. Elles ont démontré l’existence de sous-groupes 3D basés sur cet indice ayant une pertinence clinique dans la SIA, qui n’étaient pas identifiés auparavant. Ce projet contribue dans la tendance actuelle vers le développement d’indices 3D et de classifications 3D pour la scoliose idiopathique de l’adolescent.

Chemical composition of zeolites in sandstones at DSDP Sites 445 and 446

Andesitic volcaniclastic sandstones of Middle Eocene age recovered from DSDP Sites 445 and 446, a back-arc basin, contain clinoptilolite, heulandite and analcite as a pore-filling cement. Clinoptilolite and heulandite at Sites 445 and 446 contain different chemical composition from other deep-sea clinoptilolites and heulandites. The dominant cation of both clinoptilolite and heulandite is Na+ ion activity in pore water was greater at the time of their formation. Volcanic glass has acted as a precursor for both clinoptilolite and heulandite at Sites 445 and 446. Biogenic silica is also suggested as a precursor. High Na+ ion activity in pore water also helped to transform clinoptilolite and heulandite to analcite downhole. The necessary Na+ ions for this clinoptilolite, heulandite and analcite at Sites 445 and 446 might have been provided by hydrothermal circulation of seawater through more permeable sandstones deposited during early stages of back-arc basin rifting.

Structure and chemistry of TECHNO encrustations

Using as a starting point the results giving 'traditional' growth rates as determined by the decrease of radioelements (part I) and the hypothesis of rapid formation, the different mineralogical, structure and chemical characteristics of the sample have been studied to try to understand the possible mode of formation of this encrustation. A rapid formation would account for (1) the very peculiar structure of the sample composed of oriented botryoids and the bundle-like structure of the outermost oxide layer; (2) the fact that this sample represents a substitution of a preexisting hyaloclastite; (3) the different chemical gradients, mainly iron, thorium and uranium; (4) the fact that this sample which cannot have been maintained at the sediment-water interface by bioturbation is not covered by a great thickness of sediments. On the other hand, an unsolved problem remains: Why different radionuclides used for dating give growth rates of the same order of magnitude and different 'exposition ages'.

Tree line shifts and disturbance events for sites studied in the Torneträsk area of sub-Arctic Sweden for the period 1800-2009

Aim: Models project that climate warming will cause the tree line to move to higher elevations in alpine areas and more northerly latitudes in Arctic environments. We aimed to document changes or stability of the tree line in a sub-Arctic model area at different temporal and spatial scales, and particularly to clarify the ambiguity that currently exists about tree line dynamics and their causes. Location: The study was conducted in the Tornetrask area in northern Sweden where climate warmed by 2.5 °C between 1913 and 2006. Mountain birch (Betula pubescens ssp. czerepanovii) sets the alpine tree line. Methods: We used repeat photography, dendrochronological analysis, field observations along elevational transects and historical documents to study tree line dynamics. Results: Since 1912, only four out of eight tree line sites had advanced: on average the tree line had shifted 24 m upslope (+0.2 m/year assuming linear shifts). Maximum tree line advance was +145 m (+1.5 m/year in elevation and +2.7 m/year in actual distance), whereas maximum retreat was 120 m downslope. Counter-intuitively, tree line advance was most pronounced during the cooler late 1960s and 1970s. Tree establishment and tree line advance were significantly correlated with periods of low reindeer (Rangifer tarandus) population numbers. A decreased anthropozoogenic impact since the early 20th century was found to be the main factor shaping the current tree line ecotone and its dynamics. In addition, episodic disturbances by moth outbreaks and geomorphological processes resulted in descent and long-term stability of the tree line position, respectively. Main conclusions: In contrast to what is generally stated in the literature, this study shows that in a period of climate warming, disturbance may not only determine when tree line advance will occur but if tree line advance will occur at all. In the case of non-climatic climax tree lines, such as those in our study area, both climate-driven model projections of future tree line positions and the use of the tree line position for bioclimatic monitoring should be used with caution.

Surgery, its principles and practice,

"The first six volumes of this work recorded the progress of Surgery down to 1913. Then came the Great War ... Hence, immediately after the Armistice ... I began to assemble a full staff of experts, whose work appears in Volumes VII and VIII."--Preface, v.7, 1921.

A study of the effect of high yield criteria for emergency room skull radiography /

Mode of access: Internet.

Survey of non-destructive tire inspection techniques. Preliminary memorandum.

National Highway Traffic Safety Administration, Washington, D.C.

Experiment in assessing color separation techniques for identifying small density variations in tires. Interim report.

National Highway Traffic Safety Administration, Research Institute, Washington, D.C.

Static brake inspection investigation. Volume 3 - appendices. Final report.

National Highway Traffic Safety Administration, Washington, D.C.

La Radiologia medica : rivista mensile.

Editor: 1914- F. Perussia.

Handbuch der Radiologie, unter Mitwirkung von A. Bestelmeyer,

Mode of access: Internet.

Hawkins electrical guide. Questions, answers & illustrations; a progressive course of study for engineers, electricians, students and those desiring to acquire a working knowledge of electricity and its applications; a practical treatise,

"Credit is largely due to Frank D. Graham ... for the authorship of the Guides, and for the original sketches illustrating electrical principles and construction."--Pref. to no. 1.

Tables of interplanar spacings computed for the characteristic radiations of copper, molybdenum, iron, chromium and cobalt

"ASTIA document no. AD142344."

Effects of irradiation on reproduction in female beagles

UCD 102.