Genetic variability analysis among clinical Candida spp. isolates using random amplified polymorphic DNA

The patterns of genetic variation of samples of Candida spp. isolated from patients infected with human immunodeficiency virus in Vitória, state of Espírito Santo, Brazil, were examined. Thirty-seven strains were isolated from different anatomical sites obtained from different infection episodes of 11 patients infected with the human immunodeficiency virus (HIV). These samples were subjected to randomly amplified polymorphic DNA (RAPD) analysis using 9 different primers. Reproducible and complex DNA banding patterns were obtained. The experiments indicated evidence of dynamic process of yeast colonization in HIV-infected patients, and also that certain primers are efficient in the identification of species of the Candida genus. Thus, we conclude that RAPD analysis may be useful in providing genotypic characters for Candida species typing in epidemiological investigations, and also for the rapid identification of pathogenic fungi.

Teleparallel equivalent of non-Abelian Kaluza-Klein theory

Based on the equivalence between a gauge theory for the translation group and general relativity, a teleparallel version of the non-Abelian Kaluza-Klein theory is constructed. In this theory, only the fiber-space turns out to be higher dimensional, spacetime being kept always four dimensional. The resulting model is a gauge theory that unifies, in the Kaluza-Klein sense, gravitational and gauge fields. In contrast with the ordinary Kaluza-Klein models, this theory defines a natural length scale for the compact submanifold of the fiber space, which is shown to be of the order of the Planck length.

Analog Model for Quantum Gravity Effects: Phonons in Random Fluids

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Matter-wave localization in a random potential

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Transpiration and stomatal resistance variations of perennial tropical crops under soil water availability conditions and water deficit

O experimento foi realizado no Departamento de Produção Vegetal da Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz, ESALQ/USP, Piracicaba, São Paulo, Brasil, utilizando-se as culturas de guaranazeiro (Paullinia cupana Kunth), cafeeiro (Coffea arabica L.), cajueiro (Anacardium occidentale L.), goiabeira (Psidium guajava L.) e seringueira (Hevea brasiliensis Muell. - Arg.). No período de seca (setembro/94) e de chuvas (novembro/94), realizaram-se determinações de resistência estomática (RE) (s cm-1) e transpiração (T) (µg cm-1 s-1) nas diferentes espécies. O delineamento experimental foi em blocos casualizados com cinco repetições. A partir das análises dos dados pode-se concluir: 1. diferenças significativas entre espécies, em termos das variáveis avaliadas no período de deficiência hídrica, com valores decrescentes de resistência estomática e crescente de transpiração na seguinte ordem: guaranazeiro > cafeeiro > cajueiro > goiabeira > seringueira; 2. Nas águas as diferenças entre espécies, para ambas as variáveis, foram menos evidentes, continuando a cultura da seringueira a apresentar menor resistência estomática e maior transpiração dentre as espécies; 3. As culturas de guaraná e café apresentaram maior resistência à perda de água, em relação às demais culturas.

Doses de boro e crescimento radicular e da parte aérea de cultivares de arroz de terras altas

O crescimento radicular é favorecido em condições adequadas de disponibilidade de boro no solo e, por isto, a aplicação da dose correta desse micronutriente é de grande importância, para que não ocorra prejuízo no desenvolvimento e na produtividade da cultura de arroz de terras altas, de acordo com a variedade e tipo de solo. O presente trabalho teve como objetivo avaliar a influência das doses de boro no crescimento radicular e da parte aérea, em três cultivares de arroz de terras altas. O experimento foi realizado em casa de vegetação, em vaso com capacidade de 10 L, que continha 8 dm³ de solo Latossolo Vermelho distrófico, sendo o delineamento experimental inteiramente casualizado, em esquema fatorial 3 x 3, com quatro repetições. Os tratamentos consistiram de três cultivares (Caiapó, Primavera e Maravilha) e três doses de boro (0, 3 e 6 mg dm-3), usando, como fonte, o bórax. A dose de 6 mg dm-3 foi prejudicial tanto à produção de matéria seca da parte aérea como de raiz para o arroz de terras altas. Além de apresentar maior capacidade de absorção de boro, o cultivar Maravilha apresentou-se mais tolerante à elevação da disponibilidade de B no solo, não ocorrendo alterações de comprimento, diâmetro e superfície radicular.

Micronutrientes na soja: produtividade e análise econômica

A disponibilidade de produtos comerciais contendo micronutrientes tem aumentado nos últimos anos, embora existam resultados experimentais mostrando grande variabilidade, o que torna este tema contraditório. A diminuição do custo relativo no uso de micronutrientes e a expectativa de ganhos em escala, nos últimos anos, tem motivado produtores a utilizar micronutrientes como cobalto, boro e molibdênio, pela sua influência na fixação simbiótica de nitrogênio na soja. O objetivo do trabalho foi de determinar a viabilidade técnica e econômica da aplicação de alguns micronutrientes, com destaque para Mo e Co, na produtividade de grãos da soja. O experimento foi conduzido nos anos agrícolas 2001/02 e 2002/03, na Fazenda Paineira, da SLC Agrícola Ltda, em Coronel Bicaco, RS, em Latossolo Vermelho Distroférrico típico há oito anos sob plantio direto. O delineamento experimental foi de blocos ao acaso com três repetições, com parcelas de 10 x 50 m. A implantação da soja foi em 18/11 de 2001 e em 24/11 de 2002, com população de 225 e 190 mil plantas ha-1, para os dois anos agrícolas, respectivamente. O espaçamento entre linhas foi de 0,40 m e a cultivar foi a RS-10 para os dois anos. Os tratamentos em 2001/02 foram: (1) CoMo; (2)CoMo+Mo; (3) CoMo +Mo+Mo; (4) CoMo+Mo+P30; (5) CoMo +B; (6) B; (7) Mo; (8) Mo+Mo; e (9) Testemunha. em 2003/04, os tratamentos foram: (1) CoMo+2x Mo; (2)CoMo+2x Mo+B; (3) CoMo+2x Mo+Phitosol PK; (4) CoMo+2x Fortifol CaB; (5) CoMo+2x Mo + LBE-PT1; (6) CoMo+2x Mo+P30; (7) CoMo+2x Mo+Stimulate; e (8) Testemunha. O uso de micronutrientes, especialmente Mo e Co, mostrou-se contraditório na avaliação da produtividade física de grãos através de comparação de médias. Entretanto, na maioria dos casos, o retorno econômico da aplicação dos micronutrientes foi positivo, mas evidenciou sua dependência de altas produtividades e preços favoráveis no momento da comercialização.

Estimation of (co)variance components and genetic parameters for weights of red-winged tinamou using random regression models

Com este trabalho objetivou-se determinar parâmetros genéticos para peso corporal de perdizes em cativeiro. Foram utilizados modelos de regressão aleatória na análise dos dados considerando os efeitos genéticos aditivos diretos (AD) e de ambiente permanente de animal (AP) como aleatórios. As variâncias residuais foram modeladas utilizando-se funções de variância de ordem 5. A curva média da população foi ajustada por polinômios ortogonais de Legendre de ordem 6. Os efeitos genéticos aditivos diretos e de ambiente permanente de animal foram modelados utilizando-se polinômios de Legendre de segunda a nona ordem. Os melhores resultados foram obtidos pelos modelos de ordem 6 de ajuste para os efeitos genéticos aditivos diretos e de ordem 3 para os de ambiente permanente pelo Critério de Informação de Akaike e ordem 3 para ambos os efeitos pelos Critério de Informação Bayesiano de Schwartz e Teste de Razão de Verossimilhança. As herdabilidades estimadas variaram de 0,02 a 0,57. O primeiro autovalor respondeu por 94 e 90% da variação decorrente de efeitos aditivos diretos e de ambiente permanente, respectivamente. A seleção de perdizes para peso corporal é mais efetiva a partir de 112 dias de idade.

Surface effects on vortex dynamics in thin type-II superconducting stripes with random pinning

We analyze the dynamics of a driven vortex lattice moving in a thin Superconducting stripe. The two dimensional stripe is assumed to be finite in the longitudinal direction, where we take into account the Surface effects, and infinite in the transversal direction. The numerical simulations are performed using the Langevin dynamics, including the vortex-vortex interaction, interaction of vortices with the surface current, vortex images, transport current and randomly distributed pinning centers. We show results for the differential resistivity and the vortex trajectories as a function of the external force. (C) 2004 Elsevier B.V. All rights reserved.

Effects of swimming training at the intensity equivalent to aerobic/anaerobic metabolic transition in alloxan diabetic rats

The present study was designed to determine the exercise intensity equivalent to the metabolic aerobic/anaerobic transition of alloxan diabetic rats, through lactate minimum test (LMT), and to evaluate the effects of swimming exercise at this intensity (LM) on the glucose and protein metabolism of these animals. Adult male Wistar rats received alloxan (SD, alloxan-injected rats that remained sedentary) intravenously (30 mg kg(-1) body weight) for diabetes induction. As controls (SC, vehicle-injected rats that remained sedentary), vehicle-injected rats were utilized. Two weeks later, the animals were submitted to oral glucose tolerance test (oGTT) and LMT. After the tests, some of the animals were submitted to swimming exercise training [TC (vehicle-injected rats that performed a 6-week exercise program) and TD (alloxan-injected rats that performed a 6-week exercise program)] for I h day(-1), 5 days week(-1), with an overload equivalent to LM determined by LMT, for 6 weeks. At the end of the experiment, the animals were submitted to a second LMT and oGTT, and blood and skeletal muscle assessments (protein synthesis and degradation in the isolated soleus muscle) were made. The overload equivalent to LM at the beginning of the experiment was lower in the SID group than in the SC group. After training, the overload equivalent to LM was higher in the TC and TD groups than in the SC and SD groups. The blood glucose of TD rats during oGTT was lower than that of SD rats. Protein degradation was higher in the SD group than in other groups. We conclude that LMT was sensitive to metabolic and physiologic alterations caused by uncontrolled diabetes. Training at LM intensity improved aerobic condition and the glucose and protein metabolism of alloxan diabetic rats. (C) 2007 Elsevier B.V. All rights reserved.

Distribution profile and availability of Cr, Ni, Cu, Cd and Pb in different sediments from anhumas surface water collection reservoir, Araraquara-São Paulo State, Brazil

In this work the influence of the anhtropogenic activities in the uptake of metals at a reservoir for public water supply in Araraquara City, São Paulo State, Brazil was studied. For this, the distribution of Cr, Ni, Cu, Cd and Pb in sediments collected from Anhumas reservoir, at seven sampling points and at three depths for each point was investigated. The pseudo-total and available metals contained in the different sediment samples were assessed using an ICP-AES technique. Among the five metals studied, cadmium possesses the largest relative potential availability, with percentages of 20 to 98% for the three different sediment types. In addition, the following decreasing availability order was characterized: Cd > Cu > Pb > Ni > Cr.

Buffalos milk yield analysis using random regression models

Data comprising 1,719 milk yield records from 357 females (predominantly Murrah breed), daughters of 110 sires, with births from 1974 to 2004, obtained from the Programa de Melhoramento Genetic de Bubalinos (PROMEBUL) and from records of EMBRAPA Amazonia Oriental - EAO herd, located in Belem, Para, Brazil, were used to compare random regression models for estimating variance components and predicting breeding values of the sires. The data were analyzed by different models using the Legendre's polynomial functions from second to fourth orders. The random regression models included the effects of herd-year, month of parity date of the control; regression coefficients for age of females (in order to describe the fixed part of the lactation curve) and random regression coefficients related to the direct genetic and permanent environment effects. The comparisons among the models were based on the Akaike Infromation Criterion. The random effects regression model using third order Legendre's polynomials with four classes of the environmental effect were the one that best described the additive genetic variation in milk yield. The heritability estimates varied from 0.08 to 0.40. The genetic correlation between milk yields in younger ages was close to the unit, but in older ages it was low.

The use of nonparametric contrasts in one-way layouts and random block designs

Nonparametric simple-contrast estimates for one-way layouts based on Hodges-Lehmann estimators for two samples and confidence intervals for all contrasts involving only two treatments are found in the literature.Tests for such contrasts are performed from the distribution of the maximum of the rank sum between two treatments. For random block designs, simple contrast estimates based on Hodges-Lehmann estimators for one sample are presented. However, discussions concerning the significance levels of more complex contrast tests in nonparametric statistics are not well outlined.This work aims at presenting a methodology to obtain p-values for any contrast types based on the construction of the permutations required by each design model using a C-language program for each design type. For small samples, all possible treatment configurations are performed in order to obtain the desired p-value. For large samples, a fixed number of random configurations are used. The program prompts the input of contrast coefficients, but does not assume the existence or orthogonality among them.In orthogonal contrasts, the decomposition of the value of the suitable statistic for each case is performed and it is observed that the same procedure used in the parametric analysis of variance can be applied in the nonparametric case, that is, each of the orthogonal contrasts has a chi(2) distribution with one degree of freedom. Also, the similarities between the p-values obtained for nonparametric contrasts and those obtained through approximations suggested in the literature are discussed.