Proteomic and metabolomic responses of Pacific oyster Crassostrea gigas to elevated pCO2 exposure

The gradually increased atmospheric CO2 partial pressure (pCO2) has thrown the carbonate chemistry off balance and resulted in decreased seawater pH in marine ecosystem, termed ocean acidification (OA). Anthropogenic OA is postulated to affect the physiology of many marine calcifying organisms. However, the susceptibility and metabolic pathways of change in most calcifying animals are still far from being well understood. In this work, the effects of exposure to elevated pCO2 were characterized in gills and hepatopancreas of Crassostrea gigas using integrated proteomic and metabolomic approaches. Metabolic responses indicated that high CO2 exposure mainly caused disturbances in energy metabolism and osmotic regulation marked by differentially altered ATP, glucose, glycogen, amino acids and organic osmolytes in oysters, and the depletions of ATP in gills and the accumulations of ATP, glucose and glycogen in hepatopancreas accounted for the difference in energy distribution between these two tissues. Proteomic responses suggested that OA could not only affect energy and primary metabolisms, stress responses and calcium homeostasis in both tissues, but also influence the nucleotide metabolism in gills and cytoskeleton structure in hepatopancreas. This study demonstrated that the combination of proteomics and metabolomics could provide an insightful view into the effects of OA on oyster C. gigas. BIOLOGICAL SIGNIFICANCE: The gradually increased atmospheric CO2 partial pressure (pCO2) has thrown the carbonate chemistry off balance and resulted in decreased seawater pH in marine ecosystem, termed ocean acidification (OA). Anthropogenic OA is postulated to affect the physiology of many marine calcifying organisms. However, the susceptibility and metabolic pathways of change in most calcifying animals are still far from being understood. To our knowledge, few studies have focused on the responses induced by pCO2 at both protein and metabolite levels. The pacific oyster C. gigas, widely distributed throughout most of the world's oceans, is a model organism for marine environmental science. In the present study, an integrated metabolomic and proteomic approach was used to elucidate the effects of ocean acidification on Pacific oyster C. gigas, hopefully shedding light on the physiological responses of marine mollusk to the OA stress.

Population genetic and dispersal modeling data for Bathymodiolus mussels from the Mid-Atlantic Ridge

The zip folder comprises a text file and a gzipped tar archive. 1) The text file contains individual genotype data for 90 SNPs, 9 microsatellites and the mitochondrial ND4 gene that were determined in deep-sea hydrothermal vent mussels from the Mid-Atlantic Ridge (genus Bathymodiolus). Mussel specimens are grouped according to the population (pop)/location from which they have been sampled (first column). The remaining columns contain the respective allele/haplotype codes for the different genetic loci (names in the header line). The data file is in CONVERT format and can be directly transformed into different input files for population genetic statistics. 2) The tar archive contains NetCDF files with larval dispersal probabilities for simulated annual larval releases between 1998 and 2007. For each simulated vent location (Menez Gwen, Lucky Strike, Rainbow, Vent 1-10) two NetCDF files are given, one for an assumed pelagic larval duration of 1 year and the other one for an assumed pelagic larval duration of 6 months (6m).

Effects of elevated CO2 on early life history development of the yellowtail kingfish, Seriola lalandi, a large pelagic fish

An increasing number of studies have examined the effects of elevated carbon dioxide (CO2) and ocean acidification on marine fish, yet little is known about the effects on large pelagic fish. We tested the effects of elevated CO2 on the early life history development and behaviour of yellowtail kingfish, Seriola lalandi. Eggs and larvae were reared in current day control (450 µatm) and two elevated CO2 treatments for a total of 6 d, from 12 h post-fertilization until 3 d post-hatching (dph). Elevated CO2 treatments matched projections for the open ocean by the year 2100 under RCP 8.5 (880 µatm CO2) and a higher level (1700 µatm CO2) relevant to upwelling zones where pelagic fish often spawn. There was no effect of elevated CO2 on survival to hatching or 3 dph. Oil globule diameter decreased with an increasing CO2 level, indicating potential effects of elevated CO2 on energy utilization of newly hatched larvae, but other morphometric traits did not differ among treatments. Contrary to expectations, there were no effects of elevated CO2 on larval behaviour. Activity level, startle response, and phototaxis did not differ among treatments. Our results contrast with findings for reef fish, where a wide range of sensory and behavioural effects have been reported. We hypothesize that the absence of behavioural effects in 3 dph yellowtail kingfish is due to the early developmental state of newly hatched pelagic fish. Behavioural effects of high CO2 may not occur until larvae commence branchial acid-base regulation when the gills develop; however, further studies are required to test this hypothesis. Our results suggest that the early stages of kingfish development are tolerant to rising CO2 levels in the ocean.

Occurrence of the Oribatid Mite Trhypochthoniellus longisetus longisetus (Acari: Trhypochthoniidae) on Tilapia (Oreochromis niloticus).

Mites as parasites infesting fish have been described in a few case reports involving Histiostoma anguillarum, H. papillata, and Schwiebea estradai. We describe the unexpected occurrence of oribatid mites of the genus Trhypochthoniellus on farmed tilapia Oreochromis niloticus. The fish had mites on the skin, fins, and gills, as well as in the mouth. The morphological characteristics of the mites, observed by optical and scanning electron microscopy, were consistent with those described for T. longisetus longisetus. All stages of development were observed, suggesting that the mites were able to actively reproduce on fish

Mobile devices: dominant design as a goal

Since the beginning of the smartphones in the 80s, the mobile device market has grown and evolved towards devices connected everywhere, with hardware more and more close to computers and laptops than a classic mobile telephone. Nowadays, this market seems to be crowded and some companies seem not to know exactly which step is next. In this manner, a concept appears in the market as a solution or a difficulty to overcome: the dominant design. The thesis aims to establish an analysis and definition of what a dominant design is and how we should understand this concept: which are the costumers’ demands and needs? How can we relate this information with the dominant design? What is the strategy of the firm before designing a device? Do they use a concept similar to a dominant design?. The research base its analysis in a theoretical framework based in innovation and marketing literature, to then compare the model studied with data collected from surveys made to customers, interviews made to workers of the mobile device market, and different new projects on the market. The research finishes with a discussion about the theoretical and the empirical frameworks, and concludes replying the research questions, and defining a dominant design and its current situation in the market. RESUMEN. Desde la aparición de los Smartphones en los años 80, el mercado de los dispositivos móviles ha crecido y evolucionado hacia dispositivos cada vez más conectados, con hardware cada vez más cercano a los ordenadores de sobremesa y portátiles que al clásico teléfono móvil. A día de hoy, el mercado está saturado y algunas compañías parecen dubitativas ante el próximo paso a seguir. De esta manera, el concepto del diseño dominante aparece en el mercado como una solución a esta dificultad. El primer capítulo de este estudio se centra en establecer, a modo de introducción, los antecedentes al caso a estudiar, el objetivo de la tesis con sus limitaciones y delimitaciones, así como la metodología utilizada. También se plantean las preguntas principales (Research Questions) sobre el objetivo de la tesis, las cuales darán respuesta en la conclusión final al caso de estudio. Este proyecto tiene como objetivo establecer un análisis y definición sobre que es un diseño dominante y qué deberíamos entender como tal: ¿cuáles son las necesidades y las exigencias de los clientes? ¿Cómo se puede relacionar esta información con el diseño dominante en el sector tecnológico? ¿Cuáles son las estrategias de las empresas antes de diseñar un nuevo dispositivo? ¿Usan un concepto o modelos similares a un diseño dominante? Posteriormente, el segundo capítulo expone la bibliografía utilizada, y el enfoque analítico que se llevará a cabo con las 3 principales fuentes de datos. La investigación enfoca su análisis en un marco teórico, basado en publicaciones y bibliografía relacionadas con la innovación y el marketing, para luego comparar el modelo estudiado con un marco empírico: datos obtenidos de encuestas a consumidores, entrevistas a profesionales del sector de los dispositivos móviles, y diferentes prototipos y nuevos proyectos en este mercado. Entre esta literatura se encuentran manuales de marketing como “22 Immutable laws of Marketing” (de Al Ries & Jack Trout), publicaciones sobre el sector industrial de la tecnología y negocios: “Crossing the Chasm” de Geoffrey A. Moore y modelos de innovación entre otros como “Mastering the Dynamics of Innovation” de James M. Utterback. El tercer capítulo corresponde al estudio del marco teórico de la tesis, donde se analizará principalmente el modelo de innovación utilizado (el modelo cíclico de Utterback) y varios principios de marketing aplicados a este sector. Se plantean las bases de este modelo, la definición que el propio Utterback ofrece sobre el diseño dominante, y las 3 fases del proceso del mismo (Fluid Phase, Transitional Phase y Specific Phase), donde las empresas cambian de estrategia según las circunstancias evolutivas del dispositivo, su posición respecto el líder del mercado, o los procesos de estandarización y de costes. Por último se plantea la base para el desarrollo del diseño dominante en un ciclo evolutivo constante en el tiempo. Respecto a la parte más analítica de la tesis, el cuarto capítulo se desarrolla a partir de los datos obtenidos de las fuentes de información en el marco empírico de estudio. Se obtienen conclusiones sobre los datos realizados en ambas encuestas (en Español e Inglés) y sobre la relevancia de esta información; se estudian uno por uno hasta cuatro casos de nuevos dispositivos a corto-medio plazo en el mercado y se obtienen unas conclusiones globales sobre las entrevistas realizadas a los profesionales del sector y la relevancia de todas estas informaciones. En el quinto capítulo de la tesis se desarrolla la discusión en torno a los marcos teórico y empírico utilizados, para concluir respondiendo a las “Research Questions”, definiendo de esta manera el concepto de diseño dominante y comparando esta definición con la situación real del mercado. Se contrastan las bases del modelo de Utterback con los datos obtenidos en el capítulo cuarto, enfatizando la comparación entre las fases de este modelo con la realidad obtenida a través del estudio. Las encuestas realizadas a los consumidores se enmarcan en la segunda y tercera fase del ciclo, donde el desarrollo del diseño dominante ya está establecido y más desarrollado, mientras que las entrevistas unifican varios puntos clave a tener en cuenta en la primera y segunda fases, orientándose a las capas previas del proceso. Después se comparan uno a uno los 4 dispositivos analizados, a fin de establecer su jerarquía dentro del mercado, como posibles nuevos diseños dominantes o evoluciones especializadas de otros que ya aparecieron en el mercado con anterioridad. Así mismo, en esta parte final del estudio se comparan entre sí los resultados similares entre las tres fuentes de datos, y se analiza la veracidad de todas las fuentes consultadas. Finalmente, se han registrado en un sexto capítulo todas las referencias utilizadas en este proyecto, tanto publicaciones bibliográficas, entrevistas, citas de personajes relevantes del sector y enlaces en la red sobre noticias relevantes. En el apartado de apéndices se adjuntan tres anexos, donde se adjunta información utilizada en el caso de estudio, y la cual se ha obviado del texto principal con el objetivo de agilizar la lectura y la comprensión del mismo. Estos tres apéndices corresponden a las dos encuestas realizadas en ambos idiomas y la entrevista realizada a los profesionales del sector de los dispositivos móviles.

Spawning and habitat management in salmonid populations at the southern edge of their natural ranges = Reproducción y gestión del hábitat en poblaciones de salmónidos en el extremo meridional de sus distribuciones naturales

Las poblaciones de salmónidos en la Península Ibérica (trucha común, Salmo trutta; y salmón atlántico, Salmo salar) se encuentran cerca del límite meridional de sus distribuciones naturales, y por tanto tienen una gran importancia para la conservación de estas especies. En la presente Tesis se han investigado algunos aspectos de la reproducción y de la gestión del hábitat, con el objeto de mejorar el conocimiento acerca de estas poblaciones meridionales de salmónidos. Se ha estudiado la reproducción de la trucha común en el río Castril (Andalucía, sur de España), donde se ha observado que la freza ocurre desde diciembre hasta abril con el máximo de actividad en febrero. Este hecho representa uno de los periodos reproductivos más tardíos y con mayor duración de toda la distribución natural de la especie. Además, actualmente se sabe que el resto de poblaciones andaluzas tienen periodos de reproducción similares (retrasados y extendidos). Análisis en la escala de la distribución natural de la trucha común, han mostrado que la latitud explica parcialmente tanto la fecha media de reproducción (R2 = 62.8%) como la duración del periodo de freza (R2 = 24.4%) mediante relaciones negativas: a menor latitud, la freza ocurre más tarde y durante más tiempo. Es verosímil que un periodo de freza largo suponga una ventaja para la supervivencia de las poblaciones de trucha en hábitats impredecibles, y por tanto se ha propuesto la siguiente hipótesis, que deberá ser comprobada en el futuro: la duración de la freza es mayor en hábitats impredecibles que en aquellos más predecibles. La elevada tasa de solapamiento de frezaderos observada en el río Castril no se explica únicamente por una excesiva densidad de reproductores. Las hembras de trucha eligieron lugares específicos para construir sus frezaderos en vez de dispersarse aleatoriamente dentro del hábitat adecuado para la freza que tenían disponible. Estas observaciones sugieren que las hembras tienen algún tipo de preferencia por solapar sus frezaderos. Además, en ríos calizos como el Castril, las gravas pueden ser muy cohesivas y difíciles de excavar, por lo que el solapamiento de frezaderos puede suponer una ventaja para la hembra, porque la excavación en sustratos que han sido previamente removidos por frezas anteriores requerirá menos gasto de energía que en sustratos con gravas cohesivas que no han sido alteradas. Por tanto, se ha propuesto la siguiente hipótesis, que deberá ser comprobada en el futuro: las hembras tienen una mayor preferencia por solapar sus frezaderos en ríos con sustratos cohesivos que en ríos con sustratos de gravas sueltas. En el marco de la gestión del hábitat, se han empleado dos enfoques diferentes para la evaluación del hábitat físico, con el objeto de cuantificar los cambios potenciales en la disponibilidad de hábitat, antes de la implementación real de determinadas medidas sobre el hábitat. En primer lugar, se ha evaluado el hábitat físico del salmón atlántico en el río Pas (Cantabria, norte de España), en la escala del microhábitat, empleando la metodología IFIM junto con un modelo hidráulico bidimensional (River2D). Se han simulado una serie de acciones de mejora del hábitat y se han cuantificado los cambios en el hábitat bajo estas acciones. Los resultados mostraron un aumento muy pequeño en la disponibilidad de hábitat, por lo que no sería efectivo implementar estas acciones en este tramo fluvial. En segundo lugar, se ha evaluado el hábitat físico de la trucha común en el río Tajuña (Guadalajara, centro de España), en la escala del mesohábitat, empleando la metodología MesoHABSIM. Actualmente, el río Tajuña está alterado por los usos agrícolas de sus riberas, y por tanto se ha diseñado una restauración para mitigar estos impactos y para llevar al río a un estado más natural. Se ha cuantificado la disponibilidad de hábitat tras la restauración planteada, y los resultados han permitido identificar los tramos en los que la restauración resultaría más eficaz. ABSTRACT Salmonid populations in the Iberian Peninsula (brown trout, Salmo trutta; and Atlantic salmon, Salmo salar) are close to the southern limit of their natural ranges, and therefore they are of great importance for the conservation of the species. In the present dissertation, some aspects of spawning and habitat management have been investigated, in order to improve the knowledge on these southern salmonid populations. Brown trout spawning have been studied in the river Castril (Andalusia, southern Spain), and it has been observed that spawning occurs from December until April with the maximum activity in February. This finding represents one of the most belated and protracted spawning periods within the natural range of the species. Furthermore, it is now known that the rest of Andalusian populations show similar (belated and extended) spawning periods. Broad-scale analyses throughout the brown trout natural range showed that latitude partly explained both spawning mean time (R2 = 62.8%) and spawning duration (R2 = 24.4%) by negative relationships: the lower the latitude, the later the spawning time and the longer the spawning period. It is plausible that a long spawning period would be an advantage for survival of trout populations in unpredictable habitats, and thus the following hypothesis has been proposed, which is yet to be tested: spawning duration is longer in unpredictable than in predictable habitats. High rate of redd superimposition observed in the river Castril was not only caused by high density of spawners. Trout females chose specific sites for redd construction instead of randomly dispersing over the suitable spawning habitat. These observations suggest that female spawners have some kind of preference for superimposing redds. Moreover, in limestone streams such as Castril, unused gravels can be very cohesive and hard to dig, and thus redd superimposition may be an advantage for female, because digging may require less energy expenditure in already used redd sites than in cohesive and embedded unused sites. Hence, the following hypothesis has been proposed, which is yet to be tested: females have a higher preference for superimposing redds in streambeds with cohesive and embedded substrates than in rivers with loose gravels. Within the topic of habitat management, two different approaches have been used for physical habitat assessment, in order to quantify the potential change in habitat availability, prior to the actual implementation of proposed habitat measures. Firstly, physical habitat for Atlantic salmon in the river Pas (Cantabria, northern Spain) has been assessed at the microhabitat scale, using the IFIM approach along with a two dimensional hydraulic model (River2D). Proposed habitat enhancement actions have been simulated and potential habitat change has been quantified. Results showed a very small increasing in habitat availability and therefore it is not worth to implement these measures in this stream reach. Secondly, physical habitat for brown trout in the river Tajuña (Guadalajara, central Spain) has been assessed at the mesohabitat scale, using the MesoHABSIM approach. The river Tajuña is currently impacted by surrounding agricultural uses, and thus restoration was designed to mitigate these impacts and to drive the river to a more natural state. Habitat availability after the planned restoration has been quantified, and the results have permitted to identify in which sites the restoration will be more effective.

Transport of uncharged organic solutes in Xenopus oocytes expressing red cell anion exchangers (AE1s)

When expressed in Xenopus oocytes, the trout red cell anion exchanger tAE1, but not the mouse exchanger mAE1, elicited a transport of electroneutral solutes (sorbitol, urea) in addition to the expected anion exchange activity. Chimeras constructed from mAE1 and tAE1 allowed us to identify the tAE1 domains involved in the induction of these transports. Expression of tAE1 (but not mAE1) is known to generate an anion conductance associated with a taurine transport. The present data provide evidence that (i) the capacity of tAE1 and tAE1 chimeras to generate urea and sorbitol permeability also was associated with an anion conductance; (ii) the same inhibitors affected both the permeability of solutes and anion conductance; and (iii) no measurable water transport was associated with the tAE1-dependent conductance. These results support the view that fish red blood cells, to achieve cell volume regulation in response to hypotonic swelling, activate a tAE1-associated anion channel that can mediate the passive transport of taurine and electroneutral solutes.

Intracellular coexistence of methano- and thioautotrophic bacteria in a hydrothermal vent mussel.

The coexistence of two phylogenetically distinct symbiont species within a single cell, a condition not previously known in any metazoan, is demonstrated in the gills of a Mid-Atlantic Ridge hydrothermal vent mussel (family Mytilidae). Large and small symbiont morphotypes within the gill bacteriocytes are shown to be separate bacterial species by molecular phylogenetic analysis and fluorescent in situ hybridization. The two symbiont species are affiliated with thioautotrophic and methanotrophic symbionts previously found in monospecific associations with closely related mytilids from deep-sea hydrothermal vents and hydrocarbon seeps.

La integració conceptual o blending i l’arc de Sant Martí: vers una semàntica cognitiva diacrònica i cultural

Aquest article fa un estudi onomasiològic de les denominacions de l’arc de Sant Martí en una perspectiva diacrònica, de contacte de llengües (català, occità, aragonès, etc.) i segons la teoria de la integració conceptual o blending. Planteja la necessitat que la semàntica diacrònica cognitiva faça pròpia l’orientació cultural (fonamentalment, antropològica, històrica social i cultural) i semiòtica.

Variations in coastal fish species composition captured by traps in Romsdalsfjord, Western Norway

Fish traps are widely used in Norwegian fjords, especially those designed for monitoring salmonid populations in the marine environment, although many other marine fish species are also captured. The composition and spatio-temporal variations of fish species captured by fish traps were monitored in five different coastal locations throughout the Romsdalsfjord region, Western Norway, from May to August during the three consecutive years (2011–2013). Twenty-three fish species were captured by traps in coastal waters, both resident and migratory fishes. The most common fish and with greater catchability were saithe (Pollachis virens) and sea trout (Salmo trutta), followed by cod (Gadus morhua), pollack (P. pollachius), herring (Clupea harengus) and mackerels (Trachurus trachurus and Scomber scombrus). However, the captured assemblage presented great spatial and seasonal variations, in terms of mean daily catch, probably associated with hydrographical conditions and migrational patterns. Information obtained in this study will help us to better understand the compositions and dynamic of coastal fish populations inhabiting Norwegian coastal waters. In addition, traps are highly recommended as a management tool for fish research (e.g. fish-tagging experiments, mark and recapture) and conservation purposes (coastal use and fisheries studies).

Catharine Waugh McCullouch papers in the Mary Earhart Dillon collection, 1869-1945

Collection primarily documents McCulloch's research on women's legal status, and her work with the Illinois Equal Suffrage Association, the National American Woman Suffrage Association, and the League of Women Voters. There is also documentation of women in the legal profession, of McCulloch's friendships with the other women suffragists and lawyers, and some biographical material. The papers contain little information about her family or social life.

Multiple imputation of missing blood alcohol concentration (BAC) values in FARS.

National Highway Traffic Safety Administration, Washington, D.C.