Implementation of filters for image pre-processing for leaf analyses in plantations

In this work an image pre-processing module has been developed to extract quantitative information from plantation images with various degrees of infestation. Four filters comprise this module: the first one acts on smoothness of the image, the second one removes image background enhancing plants leaves, the third filter removes isolated dots not removed by the previous filter, and the fourth one is used to highlight leaves' edges. At first the filters were tested with MATLAB, for a quick visual feedback of the filters' behavior. Then the filters were implemented in the C programming language. At last, the module as been coded in VHDL for the implementation on a Stratix II family FPGA. Tests were run and the results are shown in this paper. © 2008 Springer-Verlag Berlin Heidelberg.

Fusion of fingerprint recognition methods for robust human identification

Biometrics is one of the biggest tendencies in human identification. The fingerprint is the most widely used biometric. However considering the automatic fingerprint recognition a completely solved problem is a common mistake. The most popular and extensively used methods, the minutiae-based, do not perform well on poor-quality images and when just a small area of overlap between the template and the query images exists. The use of multibiometrics is considered one of the keys to overcome the weakness and improve the accuracy of biometrics systems. This paper presents the fusion of a minutiae-based and a ridge-based fingerprint recognition method at rank, decision and score level. The fusion techniques implemented leaded to a reduction of the Equal Error Rate by 31.78% (from 4.09% to 2.79%) and a decreasing of 6 positions in the rank to reach a Correct Retrieval (from rank 8 to 2) when assessed in the FVC2002-DB1A database. © 2008 IEEE.

JSEG-based image segmentation in computer vision for agricultural mobile robot navigation

This project aims to apply image processing techniques in computer vision featuring an omnidirectional vision system to agricultural mobile robots (AMR) used for trajectory navigation problems, as well as localization matters. To carry through this task, computational methods based on the JSEG algorithm were used to provide the classification and the characterization of such problems, together with Artificial Neural Networks (ANN) for pattern recognition. Therefore, it was possible to run simulations and carry out analyses of the performance of JSEG image segmentation technique through Matlab/Octave platforms, along with the application of customized Back-propagation algorithm and statistical methods in a Simulink environment. Having the aforementioned procedures been done, it was practicable to classify and also characterize the HSV space color segments, not to mention allow the recognition of patterns in which reasonably accurate results were obtained.

Compartimentação fisiográfica do município de peruíbe, litoral de São Paulo - uma abordagem metodológica como subsídio à avaliação geotécnica de terrenos

This paper presents a method applied to the seacoast town of Peruibe, São Paulo State, Brazil. The method encompasses the application of remote sensing interpretation techniques and field survey to obtain geotechnical data and thus generate cartographic products composed of easily grouped units that work as database objects and can de used to assist geotechnical zoning. The so-called Compartmentalization Basic Units (CBUs) show the smallest land surface analyzed from its physiographic elements and have in their cores the same geotechnical properties, making it easier to analyze the potentialities and the fragilities of the physical environment and its susceptibility to the action of natural and anthropic processes. In the study area, sixty-eight units were individualized in which geotechnical properties were inferred by photo interpretation criteria, using textural properties of the image adjusted with field observations. The method proved to be easily reproducible, and is especially useful in regions where the absence of basic maps makes it impossible to establish homogeneous zones through traditional overlay of different topic informations.

ANN statistical image recognition method for computer vision in agricultural mobile robot navigation

The main application area in this project, is to deploy image processing and segmentation techniques in computer vision through an omnidirectional vision system to agricultural mobile robots (AMR) used for trajectory navigation problems, as well as localization matters. Thereby, computational methods based on the JSEG algorithm were used to provide the classification and the characterization of such problems, together with Artificial Neural Networks (ANN) for image recognition. Hence, it was possible to run simulations and carry out analyses of the performance of JSEG image segmentation technique through Matlab/Octave computational platforms, along with the application of customized Back-propagation Multilayer Perceptron (MLP) algorithm and statistical methods as structured heuristics methods in a Simulink environment. Having the aforementioned procedures been done, it was practicable to classify and also characterize the HSV space color segments, not to mention allow the recognition of segmented images in which reasonably accurate results were obtained. © 2010 IEEE.

Pattern recognition structured heuristics methods for image processing in mobile robot navigation

In this project, the main focus is to apply image processing techniques in computer vision through an omnidirectional vision system to agricultural mobile robots (AMR) used for trajectory navigation problems, as well as localization matters. To carry through this task, computational methods based on the JSEG algorithm were used to provide the classification and the characterization of such problems, together with Artificial Neural Networks (ANN) for pattern recognition. Therefore, it was possible to run simulations and carry out analyses of the performance of JSEG image segmentation technique through Matlab/Octave platforms, along with the application of customized Back-propagation algorithm and statistical methods as structured heuristics methods in a Simulink environment. Having the aforementioned procedures been done, it was practicable to classify and also characterize the HSV space color segments, not to mention allow the recognition of patterns in which reasonably accurate results were obtained. ©2010 IEEE.

Classification of masses in mammographic image using wavelet domain features and polynomial classifier

Breast cancer is the most common cancer among women. In CAD systems, several studies have investigated the use of wavelet transform as a multiresolution analysis tool for texture analysis and could be interpreted as inputs to a classifier. In classification, polynomial classifier has been used due to the advantages of providing only one model for optimal separation of classes and to consider this as the solution of the problem. In this paper, a system is proposed for texture analysis and classification of lesions in mammographic images. Multiresolution analysis features were extracted from the region of interest of a given image. These features were computed based on three different wavelet functions, Daubechies 8, Symlet 8 and bi-orthogonal 3.7. For classification, we used the polynomial classification algorithm to define the mammogram images as normal or abnormal. We also made a comparison with other artificial intelligence algorithms (Decision Tree, SVM, K-NN). A Receiver Operating Characteristics (ROC) curve is used to evaluate the performance of the proposed system. Our system is evaluated using 360 digitized mammograms from DDSM database and the result shows that the algorithm has an area under the ROC curve Az of 0.98 ± 0.03. The performance of the polynomial classifier has proved to be better in comparison to other classification algorithms. © 2013 Elsevier Ltd. All rights reserved.

Desenvolvimento de uma base de dados para fatores de transcrição de seres humanos e suas redes de interação: Human Transcriptional Regulation Interaction Database (HTRIDB 2.0)

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Análise das concepções de professores de biologia em formação inicial acerca da relação entre ciência e valores

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Informação e segurança pública: modelo de banco de dados para a gestão de informações em Moçambique

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Estudos de imagens provenientes de membranas de borracha natural com aditivos metálicos utilizando técnicas de Fourier, Gabor e Wavelets

Pós-graduação em Ciência e Tecnologia de Materiais - FC

Uma abordagem pedagógica baseada na análise de modelos para alunos de biologia: qual o papel do software?

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Carcinoma hepatocelular e as infecções pelos vírus das hepatites B e C na Amazônia Oriental: estudo clínico-sorológico e de biologia molecular

Com o objetivo de contribuir para um melhor conhecimento do eventual envolvimento das infecções pelos vírus das hepatites B e C, na etiopatogenia do carcinoma hapatocelular (CHC) na Amazônia Oriental, estudaram-se 36 pacientes internados em três hospitais públicos em Belém (PA), de janeiro de 1992 a março de 1999. Os critérios de inclusão adotados foram: o clínico, associado à imagenologia compatível, níveis séricos de alfafetoproteína (AFP) acima de 400ng/ml e/ou histopatologia compatível. Foram avaliados os aspectos clínicos, exames bioquímicos e hematológicos, imagenologia, histopatologia, níveis séricos de AFP e exames sorológicos das hepatites B e C. A presença dos ácidos nucléicos virais, o HBV-DNA e o HCV-RNA, foi avaliada a partir da detecção no soro pela reação em cadeia da polimerase. Observou-se um predomínio do sexo masculino (p<0.01), com reação M/F de 6,2: 1. Média e medianas gerais de idade foram, respectivamente, 50,8 e 53,0 anos, com amplitude de 6-81 anos. A maioria dos pacientes (52,7%) era procedente da zona rural, sendo a profissão de lavrador a mais freqüente (p<0,01). Etilismo foi encontrado em 33,3% dos casos. Dor abdominal e hepatomegalia, presentes em 94,4% dos casos, foram os sintomas e sinais mais freqüentes. Observou-se a presença de cirrose em 83,3% dos casos, sendo 80% enquadrados nas classes B e C (child-pugh). Cinqüenta por cento apresentaram complicações durante o diagnóstico, sendo as mais freqüentes a encefalopatia hepática e a hemorragia digestiva alta, relacionadas à doença hepática crônica de base. Marcadores sorológicos de infecção pelo HBV e pelo HCV foram encontrados em, respectivamente, 88,9% e 8,3% da casuística. Em 11,1% não se encontrou marcador sorológico. O HbsAg foi encontrado em 58, 3%. Anti-HBc foi encontrado em 86%, estando associado ao anti- HBs em 25%. Entre os HbsAg positivos: o anti- Hbe foi encontrado em 85%; o antiHBc IgM em 57,1%; e o anti-HD não foi detectado. O HBV- DNA foi encontrado em 37,7% do total de casos e em 65% dos HbsAG positivos. O HCV-RNA foi encontrado em 8,5% da amostra estudada e em 100% dos casos anti-HCV positivos. Não foi observada positividade para o HBV-DNA e para o HCV-RNA em soros de pacientes HbsAG ou anti- HCV negativos. A AFP esteve acima da normalidade em 88,9% dos casos, estando acima de 400 ng/ml em 75% e em 27,8% a titulações foi superior a 70.000 ng/ml. A ultrassonografia abdominal mostrou tumores com múltiplos nódulos em 63,9% e, nódulo único em 36,1% dos casos. O tipo histológico predominante foi carcinoma bem diferenciado do tipo trabecular (p<0,05). Os casos HbsAg positivos apresentaram menor média de idade e níveis de AFP mais elevados (p<0,01). A maioria dos pacientes se encontravam em fase avançada de doenças com uma taxa de óbito durante o diagnóstico de 38,9%. Conclui-se que, na Amazônia Oriental, a infecção pelo HBV parece exercer importância na etiologia do CHC, ressaltando-se a necessidade de incrementação de medidas preventivas, como vacinação e programa de detecção precoce do tumor em populações de risco. São necessários estudos adicionais controlados ou direcionados, para os possíveis co-fatores de importância na região, o que pode contribuir para um melhor entendimento dos mecanismos envolvidos na hepatocarcinogênese.

Determinação de alguns parâmetros da biologia reprodutiva e produtiva da paca fêmea (Agouti paca Linnaeus, 1744) criada em cativeiro

O presente estudo teve o propósito de determinar as características reprodutivas básicas de pacas criadas em cativeiro, tais como: duração do ciclo estral, duração do período gestacional, intervalo do parto ao primeiro cio pós-parto, duração do intervalo entre partos, além do número de produtos por parto e da proporção sexual. Foram utilizados treze animais, todos criados em cativeiro no Biotério da Universidade Federal do Pará sendo que os dados foram obtidos através de técnicas colpocitológicas, exceto aqueles relacionados à determinação do produto por parto e à proporção sexual, os quais foram observados diretamente após o parto. O período médio encontrado para o ciclo estral foi de 32,5 ± 3,69 (n = 20) dias sendo classificado em quatro fases: proestro, estro, metaestro e diestro. Estes resultados indicam que esta espécie tem poliestxo com reprodução contínua. Quanto ao período gestacional, dois resultados foram obtidos: a) 147,5 ± 2,83 (n = 2) dias para fêmeas cujo último cio foi confirmado com a presença de espermatozóides na lâmina e b) 146,7 ± 6,43 (n = 3) dias para fêmeas que tiveram a confirmação do início da gestação apenas pelas características clínicas do último cio antes do parto, confirmado através da caracterização da lâmina. Os filhotes apresentaram, ao nascer, olhos abertos, corpo completamente coberto de pêlos, movimentos ativos e capacidade de comer alimentos sólidos dentro de dois dias. O peso médio foi de 605,9 ± 87,47 g (n = 12) para as fêmeas e de 736,7 ± 108,41 g (n = 14) para os machos. Dos 38 nascimentos ocorridos no Biotério, nenhum foi gemelar, embora a paca seja capaz de produzir gêmeos. O intervalo entre partos foi de 187,3 ± 8,48 (n = 15) dias e dentro de 35,6 ± 5,22 (n = 5) dias ocorreu o primeiro cio pós-parto. Estes resultados podem servir de base para futuros trabalhos que tenham como objetivo o estudo de parâmetros reprodutivos de animais silvestres através da biotecnologia. Além disso, criatórios bem manejados de pacas podem tornar-se, no futuro, fonte de alimentação com qualidade e fonte de renda acarretando, desta maneira, a garantia da preservação da espécie.

O instituido e o vivido na formação docente para educação inclusiva: representações sociais de professores egressos do Curso de Licenciatura em Biologia do IFPA

Este estudo tem por objeto as Representações Sociais de egressos do curso de Licenciatura em Biologia do Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia do Pará – IFPA acerca de sua formação docente na perspectiva da inclusão escolar de alunos com deficiências. A problemática se orientou com foco nas representações sociais anunciadas pelos professores sobre sua formação para a inclusão. O Objetivo principal do estudo foi Analisar o processo de construção das Representações Sociais de egressos de licenciaturas do IFPA sobre sua formação docente com vistas à inclusão. A Metodologia seguiu a abordagem qualitativa – descritiva – interpretativa – analítica com a intenção de ouvir o que esses professores têm a dizer sobre a inclusão de alunos especiais, assim como essas representações se constroem e qual o reflexo delas na ação do indivíduo. Trata-se de uma pesquisa de campo e teve como finalidade aprofundar nosso conhecimento sobre o assunto estudado. Os sujeitos da pesquisa foram 10 professores egressos oriundos do campo das ciências naturais que aceitaram participar desse estudo. Os dados da pesquisa foram coletados por meio do questionário para a realização do levantamento socioeconômico, da entrevista na modalidade semi-estruturada com a intenção de apreender os discursos verbais dos professores que foram tomados como a fonte reveladora das representações sociais; e Técnica da Associação Livre de Palavras que teve como objetivo destacar imagens relevantes das possíveis representações dos docentes. Para a compreensão dos dados foi utilizada a técnica de análise de conteúdo categorial na perspectiva de Bardin. Ao analisarmos os dados que os sujeitos entrevistados apresentaram considerando as unidades de sentido sobre determinados aspectos que permeiam a Formação Docente e Educação Inclusiva, destacamos questões dialéticas como as relações entre inclusão e exclusão, afetividade e conhecimento, teoria e prática, assim como apontamentos conflitantes que sinalizam determinadas angústias profissionais. Desta forma os resultados mostram que as representações dos professores acerca do objeto de estudo apresentam-se de forma variada, revelando a necessidade de redimensionamento de ações pedagógicas, profissionais e estruturais e estão aliadas às crenças, às convenções e à tradição que ao longo da história e da cultura educacional vem reforçando a imagem do aluno com necessidades educacionais especiais, associada à concepção de deficiência e de aluno que foge ao modelo estabelecido pela sociedade. A pesquisa ainda revela representações sociais que permeiam as construções psicossociais sobre formação e Educação Inclusiva, indicando que entre os valores e os conhecimentos priorizados para pensar e, conseqüentemente agir estão fortemente vinculados aceitação das diferenças a partir de ações solitárias, ou seja, de um protagonismo individual.