First detection of Leishmania spp. DNA in Brazilian bats captured strictly in urban areas

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

The water effect on allosteric regulation of hemoglobin probed in water glucose and water glycine solutions

We have previously proposed a role of hydration in the allosteric control of hemoglobin based on the effect of varying concentrations of polyols and polyethers on the human hemoglobin oxygen affinity and on the solution water activity (Colombo, M. F., Rau, D. C., and Parsegian, V. A. (1992) Science 256, 655-659). Here, the original analyses are extended to test the possibility of concomitant solute and water allosteric binding and by introducing the bulk dielectric constant as a variable in our experiments. We present data which indicate that glycine and glucose influence HbA oxygen affinity to the same extent, despite the fact that glycine increases and glucose decreases the bulk dielectric constant of the solution. Furthermore, we derive an equation linking changes in oxygen affinity to changes in differential solute and water binding to test critically the possibility of neutral solute heterotropic binding. Applied to the data, these analyses support our original interpretation that neutral solutes act indirectly on the regulation of allosteric behavior of hemoglobin by varying the chemical potential of water in solution. This leads to a displacement of the equilibrium between Hb conformational states in proportion to their differential hydration.

The genome sequence of the plant pathogen Xylella fastidiosa: The Xylella fastidiosa consortium of the organization for nucleotide sequencing and analysis, Sao Paulo, Brazil

Xylella fastidiosa is a fastidious, xylem-limited bacterium that causes a range of economically important plant diseases. Here we report the complete genome sequence of X. fastidiosa clone 9a5c, which causes citrus variegated chlorosis - a serious disease of orange trees. The genome comprises a 52.7% GC-rich 2,679,305-base-pair (bp) circular chromosome and 'two plasmids of 51,158 bp and 1,285 bp. We can assign putative functions to47% of the 2,904 predicted coding regions. Efficient metabolic functions are predicted, with sugars as the principal energy and carbon source, supporting existence in the nutrient-poor xylem sap. The mechanisms associated with pathogenicity and virulence involve toxins, antibiotics and ion sequestration systems, as well as bacterium-bacterium and bacterium-host interactions mediated by a range of proteins. Orthologues of some of these proteins have only been identified in animal and human pathogens; their presence in X. fastidiosa indicates that the molecular basis for bacterial pathogenicity is both conserved and independent of host. At least 83 genes are bacteriophage-derived and include virulence-associated genes from other bacteria, providing direct evidence of phage-mediated horizontal gene transfer.

The manipulation of progesterone profiles during progesterone + estradiol timed ai protocols in dairy cattle: effects on fertility

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Conscientizar para o bem-estar animal: posse responsável

The community awareness on responsible ownership associated with public policies is key to the promotion of animal welfare. Most cities have a large population of dogs and cats wandering causing serious health problems and abuse. This project aimed to guide and inform the population aimed at animal welfare with the simple and direct approach to issues related to responsible ownership, management, nature conservation and zoonoses. The methodology developed to approach the project in two modules: the I and II, along public and private Elementary and High Schools in Araçatuba. Module I (Mod.I) is basedon the use of puppet theater and musicals, considering the target audience children 3-10 years and the second module (Mod 2) consists of presentations of lectures by undergraduate and graduate course of Veterinary Medicine FMVA UNESP campus Araçatuba, being the target audience of High School teenagers. Data collection proceeded by questionnaires, with questions regarding the care and practices to pets. The results revealed that there is a lack of information about animal welfare practice.

Fatores microbiológicos e imunológicos envolvidos no desenvolvimento da cárie precoce da infância

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Teacher-learning process based on an immersive and interactive environment

This paper explores the benefits of using immersive and interactive multiprojection environments (CAVE) to visualize molecules, and how it improves users’ understanding. We have proposed and implemented a tool for teachers to manipulate molecules and another to edit molecules and assist students at home. The contribution of the present research project are these tool that allows investigating structures, properties and dynamics of a molecular system which are extremely complex and comprises millions of atoms. The experience is enriched through multimedia information associated with parts of the model; for example, videos and text can be linked to specific molecule, demonstrating some detail. This solution is based on a teaching-learning process.

Paleocorrentes e paleogeografia do Grupo Aerado, cretáceo inferior da Bacia Sanfranciscana

The Areado Group of the Sanfranciscana Basin is a Lower Cretaceous continental sedimentary system that is correlated to the Brazilian Pre-Salt beds. The Aerado Group is composed of Abaeté, Quiricó and Três Barras formations. Paleocurrent data for the Areado Group were previously presented, although not systematically which prevented significative interpretations on the basin paleogeography. This work attempts to systematically evaluate paleocurrent data, aiming to recognize depositional environment and paleogeographic reconstruction, based on the sedimentary facies and paleocurrents measurements along vertical profiles. Fluvial paleocurrents of the Abaeté Formation indicate paleoflows towards NW whereas aeolian palecurrents of the Três Barras Formation show paleowinds towards SW. The depositional systems interpreted for the Areado Group were: braided river, alluvial fan, lacustrine, playa lake, fluvial-deltaic and aeolian. The combined analyses of facies and paleocurrents allowed a reliable paleogeographic reconstruction of the basin, with paleodip towards northwest, paleowinds towards south-southwest and source-area located at southeast. These results indicate that paleowinds were orthogonal to paleostream, but parallel to depositional strike of the basin. The interpreted depositional systems characterize a desert environment during the Abaeté sub-basin times. The association of dunes and wet interdunes followed by large scale dunes and dry interdunes suggests a decrease in humidity towards the top of the Três Barras Formation, with a dry aeolian system onlapping the basement. The observed decrease of humidity in Sanfranciscana Basin may reflect local or regional paleoclimatic changes during the opening of the South Atlantic, but this assumption is only tentative

Avaliação das barreiras à inovação em sistemas de embalagens que visam a redução do desperdício/perda de carne bovina in natura

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Petrogenesis of Cenozoic volcanic rocks in the NW sector of the Gharyan volcanic field, Libya

The north-western sector of the Gharyan volcanic field (northern Libya) consists of trachytic-phonolitic domes emplaced between similar to 41 and 38 Ma, and small-volume mafic alkaline volcanic centres (basanites, tephrites. alkali basalts. hawaiites and rare benmoreites) of Middle Miocene-Pliocene age (similar to 12-2 Ma). Two types of trachytes and phonolites have been recognized on the basis of petrography, mineralogy and geochemistry. Type-1 trachytes and phonolites display a smooth spoon-shaped REE pattern without negative Europium anomalies. Type-2 trachytes and phonolites show a remarkable Eu negative anomaly, higher concentration in HFSE (Nb-Ta-Zr-Hf), REE and Ti than Type-1 rocks. The origin of Type-1 trachytes and phonolites is compatible with removal of clinopyroxene, plagioclase, alkali feldspar, amphibole. magnetite and titanite starting from benmoreitic magmas. found in the same outcrops. Type-2 trachytes and phonolites could be the result of extensive fractional crystallization starting from mafic alkaline magma, without removal of titanite. In primitive mantle-normalized diagrams, the mafic rocks (Mg#= 62-68, Cr up to 514 ppm, Ni up to 425 ppm) show peaks at Nb and Ta and troughs at K. These characteristics, coupled with low Sr-87/Sr-86(i) (0.7033-0.7038) and positive epsilon(Nd) (from +4.2 to + 5.3) features typical of the mafic anorogenic magmas of the northern African plate and of HIMU-OIB-like magma in general. The origin of the mafic rocks is compatible from a derivation from low degree partial melting (3-9%) shallow mantle sources in the spinel/gamet facies. placed just below the rigid plate in the uppermost low-velocity zone. The origin of the igneous activity is considered linked to passive lithospheric thinning related to the development of continental rifts like those of Sicily Channel (e.g.. Pantelleria and Linosa) and Sardinia (e.g., Campidano Graben) in the Central-Western Mediterranean Sea. (C) 2012 Elsevier B.V. All rights reserved.

Florística e fitossociologia em parcelas permanentes da Mata Atlântica do sudeste do Brasil ao longo de um gradiente altitudinal

Este trabalho resume os dados de florística e fitossociologia de 11, das 14 parcelas de 1 ha, alocadas ao longo do gradiente altitudinal da Serra do Mar, São Paulo, Brasil. As parcelas começam na cota 10 m (Floresta de Restinga da Praia da Fazenda, município de Ubatuba) e estão distribuídas até a cota 1100 m (Floresta Ombrófila Densa Montana da Trilha do rio Itamambuca, município de São Luis do Paraitinga) abrangendo os Núcleos Picinguaba e Santa Virgínia do Parque Estadual da Serra do Mar. Na Restinga o solo é Neossolo Quartzarênico francamente arenoso, enquanto que na encosta o solo é um Cambisolo Háplico Distrófico argilo-arenoso, sendo que todas as parcelas apresentaram solo ácido (pH 3 – 4) com alta diluição de nutrientes e alta saturação de alumínio. Na Restinga e no sopé da encosta o clima é Tropical/Subtropical Úmido (Af/Cfa), sem estação seca, com precipitação média anual superior a 2.200 mm e temperatura média anual de 22 °C. Subindo a encosta mantêm-se a média de precipitação, mas há um gradativo resfriamento, de forma que a 1.100 m o clima é Subtropical Úmido (Cfa/Cfb), sem estação seca, com temperatura média anual de 17 °C. Destaca-se ainda que, quase diariamente, a parte superior da encosta, geralmente acima de 400 m, é coberta por uma densa neblina. Nas 14 parcelas foram marcados, medidos e amostrados 21.733 indivíduos com DAP ≥ 4,8 cm, incluindo árvores, palmeiras e fetos arborescentes. O número médio de indivíduos amostrados nas 14 parcelas foi de 1.264 ind.ha–1 (± 218 EP de 95%). Dentro dos parâmetros considerados predominaram as árvores (71% FOD Montana a 90% na Restinga), seguidas de palmeiras (10% na Restinga a 25% na FOD Montana) e fetos arborescentes (0% na Restinga a 4% na FOD Montana). Neste aspecto destaca-se a FOD Terras Baixas Exploradas com apenas 1,8% de palmeiras e surpreendentes 10% de fetos arborescentes. O dossel é irregular, com altura variando de 7 a 9 m, raramente as árvores emergentes chegam a 18 m, e a irregularidade do dossel permite a entrada de luz suficiente para o desenvolvimento de centenas de espécies epífitas. Com exceção da FOD Montana, onde o número de mortos foi superior a 5% dos indivíduos amostrados, nas demais fitofisionomias este valor ficou abaixo de 2,5%. Nas 11 parcelas onde foi realizado o estudo florístico foram encontradas 562 espécies distribuídas em 195 gêneros e 68 famílias. Apenas sete espécies – Euterpe edulis Mart. (Arecaceae), Calyptranthes lucida Mart. ex DC. e Marlierea tomentosa Cambess (ambas Myrtaceae), Guapira opposita (Vell.) Reitz (Nyctaginaceae), Cupania oblongifolia Mart. (Sapindaceae) e as Urticaceae Cecropia glaziovii Snethl. e Coussapoa microcarpa (Schott) Rizzini – ocorreram da Floresta de Restinga à FOD Montana, enquanto outras 12 espécies só não ocorreram na Floresta de Restinga. As famílias com o maior número de espécies são Myrtaceae (133 spp), Fabaceae (47 spp), 125 Fitossociologia em parcelas permanentes de Mata Atlântica http://www.biotaneotropica.org.br/v12n1/pt/abstract?article+bn01812012012 http://www.biotaneotropica.org.br Biota Neotrop., vol. 12, no. 1 Introdução A Mata Atlântica sensu lato (Joly et al. 1999) é a segunda maior floresta tropical do continente americano (Tabarelli et al. 2005). A maior parte dos Sistemas de Classificação da vegetação brasileira reconhece que no Domínio Atlântico (sensu Ab’Saber 1977) esse bioma pode ser dividido em dois grandes grupos: a Floresta Ombrófila Densa, típica da região costeira e das escarpas serranas com alta pluviosidade (Mata Atlântica – MA – sensu stricto), e a Floresta Estacional Semidecidual, que ocorre no interior, onde a pluviosidade, além de menor, é sazonal. Na região costeira podem ocorrer também Manguezais (Schaeffer-Novelli 2000), ao longo da foz de rios de médio e grande porte, e as Restingas (Scarano 2009), crescendo sobre a planície costeira do quaternário. No topo das montanhas, geralmente acima de 1500 m, estão os Campos de Altitude (Ribeiro & Freitas 2010). Em 2002, a Fundação SOS Mata Atlântica em parceria com o INPE (Instituto..., 2002) realizaram um levantamento que indica que há apenas 7,6% da cobertura original da Mata Atlântica (s.l.). Mais recentemente Ribeiro et al. (2009) refinaram a estimativa incluindo fragmentos menores, que não haviam sido contabilizados, e concluíram que resta algo entre 11,4 e 16% da área original. Mesmo com esta fragmentação, o mosaico da Floresta Atlântica brasileira possui um dos maiores níveis de endemismos do mundo (Myers et al. 2000) e cerca da metade desses remanescentes de grande extensão estão protegidos na forma de Unidades de Conservação (Galindo & Câmara 2005). Entre os dois centros de endemismo reconhecidos para a MA (Fiaschi & Pirani 2009), o bloco das regiões sudeste/sul é o que conserva elementos da porção sul de Gondwana (Sanmartin & Ronquist 2004), tido como a formação florestal mais antiga do Brasil (Colombo & Joly 2010). Segundo Hirota (2003), parte dos remanescentes de MA está no estado de São Paulo, onde cerca de 80% de sua área era coberta por florestas (Victor 1977) genericamente enquadradas como Mata Atlântica “sensu lato” (Joly et al. 1999). Dados de Kronka et al. (2005) mostram que no estado restam apenas 12% de área de mata e menos do que 5% são efetivamente florestas nativas pouco antropizadas. Nos 500 anos de fragmentação e degradação das formações naturais, foram poupadas apenas as regiões serranas, principalmente a fachada da Serra do Mar, por serem impróprias para práticas agrícolas. Usando o sistema fisionômico-ecológico de classificação da vegetação brasileira adotado pelo IBGE (Veloso et al. 1991), a Floresta Ombrófila Densa, na área de domínio da Mata Atlântica, foi subdividida em quatro faciações ordenadas segundo a hierarquia topográfica, que refletem fisionomias de acordo com as variações das faixas altimétricas e latitudinais. No estado de São Paulo, na latitude entre 16 e 24 °S temos: 1) Floresta Ombrófila Densa das Terras Baixas - 5 a 50 m de altitude; 2) Floresta Ombrófila Densa Submontana – no sopé da Serra do Mar, com cotas de altitude variando entre 50 e 500 m; 3) Floresta Ombrófila Densa Montana – recobrindo a encosta da Serra do Mar propriamente dita, em altitudes que variam de 500 a 1.200 m; 4) Floresta Ombrófila Densa Altimontana – ocorrendo no topo da Serra do Mar, acima dos limites estabelecidos para a formação montana, onde a vegetação praticamente deixa de ser arbórea, pois predominam os campos de altitude. Nas últimas três décadas muita informação vem sendo acumulada sobre a composição florística e a estrutura do estrato arbóreo dos remanescentes florestais do estado, conforme mostram as revisões de Oliveira-Filho & Fontes (2000) e Scudeller et al. (2001). Em florestas tropicais este tipo de informação, assim como dados sobre a riqueza de espécies, reflete não só fatores evolutivos e biogeográficos, como também o histórico de perturbação, natural ou antrópica, das respectivas áreas (Gentry 1992, Hubbell & Foster 1986). A síntese dessas informações tem permitido a definição de unidades fitogeográficas com diferentes padrões de riqueza de espécies e apontam para uma diferenciação, entre as florestas paulistas, no sentido leste/oeste (Salis et al. 1995, Torres et al. 1997, Santos et al. 1998). Segundo Bakker et al. (1996) um método adequado para acompanhar e avaliar as mudanças na composição das espécies e dinâmica da floresta ao longo do tempo é por meio de parcelas permanentes (em inglês Permanent Sample Plots –PSPs). Essa metodologia tem sido amplamente utilizada em estudos de longa duração em florestas tropicais, pois permite avaliar a composição e a estrutura florestal e monitorar sua mudança no tempo (Dallmeier 1992, Condit 1995, Sheil 1995, Malhi et al. 2002, Lewis et al. 2004). Permite avaliar também as consequências para a floresta de problemas como o aquecimento global e a poluição atmosférica (Bakker et al. 1996). No Brasil os projetos/programas que utilizam a metodologia de Parcelas Permanentes tiveram origem, praticamente, com o Projeto Rubiaceae (49) e Lauraceae (49) ao longo de todo gradiente da FOD e Monimiaceae (21) especificamente nas parcelas da FOD Montana. Em termos de número de indivíduos as famílias mais importantes foram Arecaceae, Rubiaceae, Myrtaceae, Sapotaceae, Lauraceae e na FOD Montana, Monimiaceae. Somente na parcela F, onde ocorreu exploração de madeira entre 1960 e 1985, a abundância de palmeiras foi substituída pelas Cyatheaceae. O gradiente estudado apresenta um pico da diversidade e riqueza nas altitudes intermediárias (300 a 400 m) ao longo da encosta (índice de Shannon-Weiner - H’ - variando de 3,96 a 4,48 nats.indivíduo–1). Diversas explicações para este resultado são apresentadas neste trabalho, incluindo o fato dessas altitudes estarem nos limites das expansões e retrações das diferentes fitofisionomias da FOD Atlântica durante as flutuações climáticas do Pleistoceno. Os dados aqui apresentados demonstram a extraordinária riqueza de espécies arbóreas da Floresta Ombrófila Densa Atlântica dos Núcleos Picinguaba e Santa Virgínia do Parque Estadual da Serra do Mar, reforçando a importância de sua conservação ao longo de todo o gradiente altitudinal. A diversidade desta floresta justifica também o investimento de longo prazo, através de parcelas permanentes, para compreender sua dinâmica e funcionamento, bem como monitorar o impacto das mudanças climáticas nessa vegetação.

Voxelwise evaluation of white matter volumes in first-episode psychosis

The occurrence of white matter (WM) abnormalities in psychotic disorders has been suggested by several studies investigating brain pathology and diffusion tensor measures, but evidence assessing regional WM morphometry is still scarce and conflicting. In the present study, 122 individuals with first-episode psychosis (FEP) (62 fulfilling criteria for schizophrenia/schizophreniform disorder, 26 psychotic bipolar I disorder, and 20 psychotic major depressive disorder) underwent magnetic resonance imaging, as well as 94 epidemiologically recruited controls. Images were processed with the Statistical Parametric Mapping (SPM2) package, and voxel-based morphometry was used to compare groups (t-test) and subgroups (ANOVA). Initially, no regional WM abnormalities were observed when both groups (overall FEP group versus controls) and subgroups (i.e., schizophrenia/schizophreniform, psychotic bipolar I disorder, psychotic depression, and controls) were compared. However, when the voxelwise analyses were repeated excluding subjects with comorbid substance abuse or dependence, the resulting statistical maps revealed a focal volumetric reduction in right frontal WM, corresponding to the right middle frontal gyral WM/third subcomponent of the superior longitudinal fasciculus, in subjects with schizophrenia/schizophreniform disorder (n = 40) relative to controls (n = 89). Our results suggest that schizophrenia/schizophreniform disorder is associated with right frontal WM volume decrease at an early course of the illness. (c) 2012 Elsevier Ireland Ltd. All rights reserved.

Functional Limitation and Intermittent Claudication: Impact of Blood Pressure Measurements

Background: Arterial hypertension is an important risk factor for Lower-Limb Occlusive Arterial Disease (LLOAD). However, the correlation between blood pressure and pulse pressure (PP) with LLOAD severity and functional impairment resulting from this disease is not well established in the Brazilian population. Objective: To verify whether there is a correlation between blood pressure, PP, LLOAD severity and functional capacity in patients with symptomatic LLOAD. Methods: A total of 65 patients (62.2 + 8.1 years, 56.9% males) were evaluated. They were divided into two groups: normal (A) and high (B) blood pressure. LLOAD severity was assessed using the ankle-brachial index (ABI) and functional capacity by the total and pain-free walking distance at the 6-minute walking test (6MWT). Results: Group A consisted of 17 (26.1%) patients. The systolic (SBP), diastolic blood pressure (DBP), and PP were, respectively, 125.4 +/- 11.7, 74.5 +/- 9.1 and 50.9 +/- 10.0 mmHg in group A and 160.7 +/- 19.6, 90.0 +/- 12.2 and 70.7 +/- 20.2 mmHg in group B. The ABI was significantly lower in group B (0.66 +/- 0.12 vs. 0.57 +/- 0.13, p < 0.05). SBP and PP correlated with LLOAD severity and the distances walked at the 6MWT. Patients with PP > 40 mmHg walked shorter distances. Conclusion: SBP and PP significantly correlated with the distances walked in the 6MWT, suggesting they are clinical markers of functional capacity impairment in patients with symptomatic LLOAD. (Arq Bras Cardiol 2012; 98(2): 161-166)

Magmatism and fenitization in the Cretaceous potassium-alkaline-carbonatitic complex of Ipanema So Paulo State, Brazil

The Ipanema alkaline-carbonatitic complex is part of the Meso-Cenozoic alkaline magmatism located within the southeastern part of the Brazilian Platform. Drill-core and field sampling have indicated the occurrence of glimmerites, with subordinate shonkinites (mela-syenites), clinopyroxene-bearing glimmerites, diorites and syenites. The glimmerites are cross-cut by lamprophyric dykes and calciocarbonatites. Fenitization has deeply affected the country rocks, originating dioritic and syenitic rocks. The Ipanema rocks show a distinct potassic affinity. The initial Sr-Nd- isotopic composition of the Ipanema rocks ((87)Sr/(86)Sr = 0.70661-0.70754 and (143)Nd/(144)Nd = 0.51169-0.51181) is similar to that of tholeiitic and potassium-rich-alkaline rocks of the Eastern Paraguay. Stable isotope data for the Ipanema calciocarbonatite suggest interaction with fluids at temperatures typical of hydrothermal stages, as hypothesized for other carbonatite complexes from southeastern Brazil. The chemical differences between the lamprophyre, glimmerites, carbonatites, apatitites and magnetitites, and the absence of marked REE enrichment in the evolved lithologies, all indicate that fractional crystallization and accumulus of liquidus phases in a magma reservoir, likely coupled with liquid immiscibility processes, may have played an important role in the genesis of the Ipanema rocks.