Structural change of laser-irradiated Ge2Sb2Te5 films studied by electrical property measurement

Sheet resistance of laser-irradiated Ge2Sb2Te5 thin films prepared by magnetron sputtering was measured by the four-point probe method. With increasing laser power the sheet resistance undergoes an abrupt drop from 10(7) to 10(3) Omega/square at about 580 mW. The abrupt drop in resistance is due to the structural change from amorphous to crystalline state as revealed by X-ray diffraction (XRD) study of the samples around the abrupt change point. Crystallized dots were also formed in the amorphous Ge2Sb2Te5 films by focused short pulse laser-irradiated, the resistivities at the crystallized dots and the non-crystallized area are 3.375 x 10(-3) and 2.725 Omega m, sheet resistance is 3.37 x 10(4) and 2.725 x 10(7) Omega/square respectively, deduced from the I-V Curves that is obtained by conductive atomic force microscope (C-AFM). (C) 2008 Elsevier B.V. All rights reserved.

O papel da proteína supressora de tumor p53 na indução de ciclooxigenase-2 em Carcinoma de Pulmão de Células Não Pequenas: aspectos moleculares e clínicos

O Carcinoma de Pulmão de Células Não Pequenas (NSCLC) é uma doença freqüentemente letal e altamente resistente à terapia oncológica convencional, como por exemplo, o tratamento quimioterápico com cisplatina e paclitaxel. A superexpressão de Ciclooxigenase-2 (COX-2) é constantemente observada em pacientes com NSCLC, estando associada ao prognóstico ruim destes pacientes. Acredita-se que a alta expressão de COX-2 produz efeitos anti-apoptóticos, porém pouco é conhecido sobre os mecanismos de regulação desta enzima. Muitos sinais capazes de ativar COX-2 também induzem a proteína supressora de tumor p53, conhecida pelo seu papel fundamental no controle da proliferação celular e apoptose. Dados recentes indicam que a proteína p53 é um importante regulador da expressão de COX-2. O objetivo desta dissertação foi avaliar os efeitos da quimioterapia na expressão da enzima COX-2 em linhagens celulares com diferente status do gene TP53, e ainda, correlacionar a expressão de COX-2 e o status mutacional de TP53, com as características clínico-patológicas de pacientes com NSCLC. Como ferramentas experimentais foram usadas técnicas de biologia celular e molecular como interferência de RNA, PCR em tempo real, análise mutacional e imuno-histoquímica. Com os resultados obtidos, observamos que as linhagens celulares de câncer de pulmão que apresentam p53 na sua forma selvagem, quando expostas ao tratamento com cisplatina, apresentaram indução da expressão de COX-2 (RNAm e proteína), em adição ao aumento da síntese de Prostaglandina E2 (PGE2). Em contrapartida, a expressão de COX-2 não foi alterada após o tratamento com cisplatina nas linhagens celulares que apresentavam mutação no gene TP53. Ao avaliar o tratamento com paclitaxel, foi observado um aumento da expressão de COX-2 nas linhagens A549 e H460 (linhagens celulares do tipo selvagem para p53), entretanto não foi observada alteração nos níveis de PGE2. Em adição, o tratamento com paclitaxel induziu um aumento da expressão de COX-2 na linhagem com deleção em TP53, ACC LC-319. Em seguida, após silenciamento de p53 na linhagem celular A549, por interferência de RNA, a cisplatina passou a não ser mais capaz de induzir o aumento da expressão de COX-2. No tratamento com paclitaxel, o silenciamento de TP53 não mudou a expressão de COX-2, indicando assim um efeito independente de p53. Dessa maneira, sugerimos que a indução de COX-2, por cisplatina, em linhagens celulares NSCLC é dependente de p53. Na análise dos pacientes NSCLC, os resultados demonstram que 54% dos pacientes apresentam expressão positiva de COX-2. Mutações em TP53 foram observadas em 57% dos pacientes, incluindo 56% de fumantes correntes e 37% de ex-fumantes. Uma associação entre a expressão de COX-2 e o status selvagem de TP53 foi observada, entre os pacientes que apresentaram expressão positiva de COX-2, 80% apresentaram TP53 selvagem. Um número maior de pacientes é necessário para aumentar o poder estatístico e confirmar as tendências observadas nesse estudo

980 nm 抽运下Yb-Tm-Ho 三掺氟磷酸盐玻璃的2 μm 荧光性质

The thermal stability, 2 μm fluorescence properties and energy transfer mechanism in Ho³⁺ doped fluorophosphate glass sensitized by Yb³⁺ and Tm³⁺ were investigated. The characteristic temperatures, absorption spectrum and fluorescence spectrum of the glass sample were measured. ΔT calculated from the characteristic temperatures shows that the thermal stability of fluorophosphate glass is better than fluoride glass. According to the absorption spectrum, several spectroscopic parameters of the glass sample, such as Judd-Ofelt parameters and spontaneous transition probability were calculated and compared with other glass hosts. The largest spontaneous transition probability for Ho³⁺:⁵ I7&rarr⁵I8 transition in fluorophosphate glass which is 78.48 s^-1 indicates that fluorophosphate glass is an appropriate base glass to achieve 2 m fluorescence. From the fluorescence spectrum of the glass sample, the extremely strong 2.0 μm fluorescence intensity is observed, which is higher than the intensity of 1.8 μm fluorescence, showing that Ho³⁺ ions sensitized by Yb³⁺ and Tm³⁺ is efficient. Meanwhile, the absorption sections and emission sections of Yb³⁺, Tm³⁺ and Ho³⁺ were calculated and the pumping scheme and energy transfer mechanism among Yb³⁺, Tm³⁺ and Ho³⁺ are discussed. The study indicates that Yb-Tm-Ho tri-doped fluorophosphate glass is a significant sensitization glass system under 980 nm excitation for 2 μm applications.

808 nm 抽运的Ho3+，Tm3+及Er3+掺杂的氟磷酸盐 玻璃的2.0 μm 光谱性质研究

2.0 μm spectroscopic properties of Er³⁺/Tm³⁺/Ho³⁺ triply-doped fluorophosphate glasses pumped by 808 nm and the energy transfer mechanisms between the three rare earth ions were investigated. J-O theory was used to calculate the parameters of Ho³⁺ in fluorophosphate glasses. Absorption and emission cross-sections and the gain coefficients were calculated. The obtained lifetime r and spontaneous transition probability Ar of Ho³⁺:⁵I7 level were 10.64 ms and 93.95 s^-1 respectively. The calculated maximum emission cross-section of 2.0 μm was 9.26×10^-21 cm². The energy transfer analysis indicated that the cross-relaxation of Tm³⁺ was important and the resonent energy transfer in Er³⁺&rarrHo³⁺, Tm³⁺&rarrHo³⁺, Er³⁺&rarrTm³⁺&rarrHo³⁺ process was the main channel. The study revealed that the Er³⁺/Tm³⁺/Ho³⁺ triply-doped fluorophosphate glass would be a potential material for 2.0 μm emission because of the efficient sensitization of Er³⁺ and Tm³⁺ to Ho³⁺.

Doses efficaces en glyphosate et en 2,4-D pour le contrôle chimique des laitue d'eau (Pistia stratiotes, Linn.) et toxicité du glyphosate vis-à-vis des tilapias (Sarotherodon melanotheron)

The toxic effects of two herbicides Round up (gliphosate) and 2,4-D (herbazol) were tested on Pistia stratiotes (Linn. Araceae) samples cultivated in glass aquariums. The gliphosate appears to be more toxic on Pistia Stratiotes than 2,4-D. It was then tested on tilapia Sarotherodon melanotheron juveniles. The lethal dose for tilapia (CL50 = 13.25 mg.l -1) is about 18, 37 and 74 times higher than the glyphosate toxic dose for plants at 1, 2 and 4 meters water depth respectively.

Efeito da dieta hipocalórica no perfil metabólico e composição corporal de mulheres com e sem Síndrome Metabólica e genótipo Pro12Pro do gene PPAR^7;^7;2

A obesidade é uma doença crônica não transmissível, caracterizada pelo excesso de gordura corporal. Então, a gordura acumulada na região abdominal promove resistência à insulina e conseqüentemente alterações metabólicas as quais em conjunto configuram o quadro de síndrome metabólica (SM). O genótipo Pro12Pro parece estar relacionado à menor sensibilidade à insulina, desencadeando o processo fisiopatológico da SM. Então, o objetivo deste trabalho foi avaliar o efeito de uma dieta hipocalórica sobre o perfil metabólico e composição corporal de mulheres com e sem SM com genótipo Pro12Pro no gene PPAR^7;2. O presente estudo trata-se de um ensaio clínico, onde mulheres entre 30 e 45 anos, obesas grau I, sem SM (n=23) e com SM (n=7) foram submetidas à dieta hipocalórica por 90 dias. A identificação do genótipo foi realizada por reação em cadeia da polimerase (PCR). No início e nos dias 30, 60 e 90 foram avaliados peso corporal, massa magra (MM), massa gorda (MG), componentes da SM, uricemia, insulinemia, leptinemia, adiponectinemia, os índices HOMA-IR e QUICKI. O consumo energético foi avaliado nas 12 semanas de tratamento. Foi utilizado o teste t de Student para amostras independentes foi utilizado para comparar os grupos entre si, e o modelo pareado para comparar a evolução dentro de cada grupo em relação ao início do estudo. Todas as mulheres apresentaram genótipo Pro12Pro. O grupo com SM apresentou menor HDL-c (44,43,2 vs. 56,82,4 mg/dL, p=0,013), e maior triglicerídeo (180,926,7 vs. 89,76,6mg/dL, p=0,014) e VLDL-c (36,25,3 vs. 17,91,3mg/dL, p=0,014) no início do estudo. Ambos os grupos apresentaram redução ponderal (-3,30,7% grupo sem SM e - 4,20,9% grupo com SM) e da circunferência da cintura (-2,40,5% grupo sem SM e - 5,91,4% grupo com SM) significativas. O grupo sem SM reduziu da MG progressivamente até os 90 dias (37,00,8 para 36,60,5%, p=0,02), e com isso aumentou MM (62,00,5 para 63,40,5%, p=0,01), o grupo com SM também reduziu MG ao longo do estudo (32,62,3 para 29,62,4%, p<0,01) e aumentou MM significativamente (62,21,0 para 64,31,3%). A pressão arterial sistólica reduziu no primeiro mês de tratamento no grupo sem SM (de 120,41,8 para 112,32,1 mmHg, p<0,01). No que diz respeito aos parâmetros metabólicos, o grupo sem SM mostrou redução da insulinemia (32,54,2 para 25,92,4U/mL, p=0,05) e aumento da adiponectinemia (4,70,6 para 5,10,8 ng/mL, p=0,02) aos 30 dias, do colesterol total (180,25,8 para 173,85,4 mg/dL, p=0,04), e da leptina (27,01,9 para 18,21,4 ng/mL, p<0,01) aos 60 dias, porém, houve redução do QUICKI aos 90 dias (0,390,03 para 0,350,01, p=0,01). No grupo com SM, a leptinemia reduziu aos 60 dias (20,31,9 para 14,71,1 ng/mL, p=0,01) e a adiponectinemia aos 90 dias (5,71,2 para 7,11,4 ng/mL, p<0,01), também houve remissão de 57,1% dos casos de SM. Sugerimos que, a dieta hipocalórica foi eficaz na redução do peso corporal e da MG, principalmente a localizada na região abdominal. Conseqüentemente, houve melhora considerável do perfil metabólico relacionado à obesidade no grupo sem SM, e também dos marcadores de sensibilidade à insulina e cardioprotetores relacionados à SM, além da remissão dos casos de SM.

Anisotropic crystallographic properties, strain, and their effects on band structure of m -plane GaN on LiAlO2 (100)

The m-plane GaN films grown on LiAlO2(100) by metal-organic chemical vapor deposition exhibit anisotropic crystallographic properties. The Williamson-Hall plots point out they are due to the different tilts and lateral correlation lengths of mosaic blocks parallel and perpendicular to GaN[0001] in the growth plane. The symmetric and asymmetric reciprocal space maps reveal the strain of m-plane GaN to be biaxial in-plane compress epsilon(xx)=-0.79% and epsilon(zz)=-0.14% with an out-of-plane dilatation epsilon(yy)=0.38%. This anisotropic strain further separates the energy levels of top valence band at Gamma point. The energy splitting as 37 meV as well as in-plane polarization anisotropy for transitions are found by the polarized photoluminescence spectra at room temperature. (c) 2008 American Institute of Physics.

Length-weight relationships of demersal fishes from the Gulf of Salamanca, Colombia: [part 2]

The parameters a and b of the length-weight relationship of the form W=aL super(b) are presented for 37 fish species, belonging to 17 families, caught during a demersal trawl survey over the period December 1995 to March 1998 in the Gulf of Salamanca, Colombia

PICES Press, Vol. 19, No. 2, Summer 2011

•The 2011 Inter-sessional Science Board Meeting: A Note from Science Board Chairman (pp. 1-4) •Indicators for Status and Change within North Pacific Marine Ecosystems: A FUTURE Workshop (pp. 5-8) •PICES Calendar (p. 8) •2011 ESSAS Open Science Meeting (pp. 9-13) •The 5th Zooplankton Production Symposium (pp. 14-17) •Workshop on "Individual-Based Models of Zooplankton” (pp. 18-21) •New Book Release on the 100th Anniversary of the T/S Osharu Maru (p. 21) •Workshop on “Advances in Genomic and Molecular Studies of Zooplankton” (pp. 22-24) •Workshop on “Updates and Comparisons of Zooplankton Time Series” (pp. 25-27) •Workshop on “Impacts of Ocean Acidification on Zooplankton” (pp. 28-29) •Workshop on “Automated Visual Plankton Identification” (p. 30) •Professor Plum in the Dining Room with a Knife (p. 31) •PICES and ICES on the River Elbe (p. 32) •The State of the Western North Pacific in the Second Half of 2010 (pp. 33-34) •The Bering Sea: Current Status and Recent Events (pp. 35-37) •Northeast Pacific News (pp. 38-39) •PICES Advice on Marine Ecology at a Canadian Judicial Inquiry (p. 40)

PICES Press, Vol. 20, No. 2, Summer 2012

•The 2012 Inter-sessional Science Board Meeting: A Note from Science Board Chairman (pp. 1-4) ◾PICES Interns (p. 4) ◾2012 Inter-sessional Workshop on a Roadmap for FUTURE (pp. 5-8) ◾Second Symposium on “Effects of Climate Change on the World’s Oceans” (pp. 9-13) ◾2012 Yeosu Workshop on “Framework for Ocean Observing” (pp. 14-15) ◾2012 Yeosu Workshop on “Climate Change Projections” (pp. 16-17) ◾2012 Yeosu Workshop on “Coastal Blue Carbon” (pp. 18-20) ◾Polar Comparisons: Summary of 2012 Yeosu Workshop (pp. 21-23) ◾2012 Yeosu Workshop on “Climate Change and Range Shifts in the Oceans" (pp. 24-27) ◾2012 Yeosu Workshop on “Beyond Dispersion” (pp. 28-30) ◾2012 Yeosu Workshop on “Public Perception of Climate Change” (pp. 31, 50) ◾PICES Working Group 20: Accomplishments and Legacy (pp. 32-33) ◾The State of the Western North Pacific in the Second Half of 2011 (pp. 34-35) ◾Another Cold Winter in the Gulf of Alaska (pp. 36-37) ◾The Bering Sea: Current Status and Recent Events (pp. 38-40) ◾PICES/ICES 2012 Conference for Early Career Marine Scientists (pp. 41-43) ◾Completion of the PICES Seafood Safety Project – Indonesia (pp. 44-46) ◾Oceanography Improves Salmon Forecasts (p. 47) ◾2012 GEOHAB Open Science Meeting (p. 48-50) ◾Shin-ichi Ito awarded 2011 Uda Prize (p. 50)

PICES Press, Vol. 21, No. 2, Summer 2013

•The 2013 Inter-sessional Science Board Meeting: A Note from the Science Board Chairman (pp. 1-4) •ICES/PICES Workshop on Global Assessment of the Implications of Climate Change on the Spatial Distribution of Fish and Fisheries (pp. 5-8) •PICES participates in a Convention on Biological Diversity Regional Workshop (pp. 9-11) •Social and Economic Indicators for Status and Change within North Pacific Ecosystems (pp. 12-13) •The Fourth International Jellyfish Bloom Symposium (pp. 14-15) •Workshop on Radionuclide Science and Environmental Quality in the North Pacific (pp. 16-17) •PICES-MAFF Project on Marine Ecosystem Health and Human Well-Being: Indonesia Workshop (pp. 18-19) •Socioeconomic Indicators for United States Fisheries and Fishing Communities (pp. 20-23) •Harmful Algal Blooms in a Changing World (pp. 24-25, 27) •Enhancing Scientific Cooperation between PICES and NPAFC (pp. 26-27) •Workshop on Marine Biodiversity Conservation and Marine Protected Areas in the Northwest Pacific (pp. 28-29) •The State of the Western North Pacific in the Second Half of 2012 (pp. 30-31) •Stuck in Neutral in the Northeast Pacific Ocean (pp. 32-33) •The Bering Sea: Current Status and Recent Trends (pp. 34-36) •For your Bookshelf (p. 37) •Howard Freeland takes home Canadian awards (p. 38)

水稻OsMYB3R-2 基因对逆境响应的功能研究

低温威胁水稻的生产，其中苗期和生殖阶段对寒害是最敏感的时期。在苗期，阶段性冷害使水稻幼苗生长延迟，甚至造成烂秧现象；在生殖阶段，无法预测的突然降温会导致水稻花粉不育，并致使水稻大幅减产。因此，对水稻逆境胁迫调控的分子机制的深入研究在理论和实践上具有重要的意义。本研究从东乡野生稻、栽培稻及其杂交后代的低温芯片中筛选对低温响应基因的分析着手，对其中一个受低温诱导上调的基因OsMYB3R-2 作进一步研究。生物信息学的分析表明OsMYB3R-2 编码一个R1R2R3 MYB 蛋白，利用基因枪瞬时转化法、酵母GAL4 系统和电泳迁移率变动分析发现OsMYB3R-2 蛋白能够定位在细胞核中、具有转录激活和DNA 结合特性，表现为MYB 转录因子的典型特征。 超表达OsMYB3R-2 的转基因水稻呈现幼苗的矮化和生长相对滞后的表型，对低温胁迫具有耐受性。盐抑制水稻种子的萌发，与野生型和反义的株系相比，OsMYB3R-2 超表达株系的萌发对盐敏感，表现为萌发过程及萌发之后幼苗的生长更加滞后。而OsMYB3R-2 转基因株系对干旱处理敏感。为了进一步寻找OsMYB3R-2 蛋白的靶序列及其调控的靶基因，我们利用电泳迁移率变动分析发现OsMYB3R-2 能够与有丝分裂特异的激活子（mitosis-specific activator）元件特异结合。在低温条件下，OsMYB3R-2 超表达能够激活水稻G2/M 期特异基因的表达，主要包括OsCycB1;1、OsCycB2;1、OsCycB2;2 和OsCDC20.1 等。另一方面，OsMYB3R-2 超表达能够增加根尖细胞的有丝分裂指数，这进一步说明OsMYB3R-2 参与了水稻细胞周期调控。EMSA、RT-PCR 和流式细胞仪分析的结果表明OsMYB3R-2 通过激活其靶基因OsCycB1;1 的表达参与水稻对低温胁迫的调控，该过程由细胞周期介导。 为了研究OsMYB3R-2 与水稻DREB/CBF 途径的关系，我们分析了转基因水稻中DREB/CBF 类基因及其可能调控的下游基因与OsMYB3R-2 的关系，RT-PCR 的结果表明超表达转基因植物中DREB 表达未见明显变化，而其下游基因OsCPT1 在低温条件下被激活表达。同时，转基因植物在低温条件下脯氨酸水平显著提高。这说明OsMYB3R-2 可能在水稻DREB/CBF 途径的下游参与调控。 总之，OsMYB3R-2 基因的超表达赋予转基因水稻在苗期对低温胁迫具有耐受性，并呈现矮化和生长滞后的表型。OsMYB3R-2 蛋白行使R1R2R3 MYB 转录因子的功能，在体外能够结合OsCycB1;1 和OsKNOLLE2 基因启动子中有丝分裂特异的激活子元件，在低温条件下激活了G2/M 期特异基因的表达，这些基因包括OsCycB1;1、OsCycB2;1、OsCycB2;2 和OsCDC20.1。低温条件下，在OsMYB3R-2 转基因超表达株系中OsCPT1 基因的转录被激活，细胞的游离脯氨酸的含量也显著增高。这些结果都表明OsMYB3R-2 基因在水稻的冷胁迫信号途径中起重要的作用，该过程受细胞周期及DREB/CBF 途径介导。 我们的实验结果暗示水稻对低温的耐受是通过分生组织细胞周期调控完成的，这个过程由OsMYB3R-2 等关键基因控制。