Molecular risk assessment of BIG 1-98 participants by expression profiling using RNA from archival tissue.

Background: The purpose of the work reported here is to test reliable molecular profiles using routinely processed formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) tissues from participants of the clinical trial BIG 1-98 with a median follow-up of 60 months. Methods: RNA from fresh frozen (FF) and FFPE tumor samples of 82 patients were used for quality control, and independent FFPE tissues of 342 postmenopausal participants of BIG 1-98 with ER-positive cancer were analyzed by measuring prospectively selected genes and computing scores representing the functions of the estrogen receptor (eight genes, ER_8), the progesterone receptor (five genes, PGR_5), Her2 (two genes, HER2_2), and proliferation (ten genes, PRO_10) by quantitative reverse transcription PCR (qRT-PCR) on TaqMan Low Density Arrays. Molecular scores were computed for each category and ER_8, PGR_5, HER2_2, and PRO_10 scores were combined into a RISK_25 score. Results: Pearson correlation coefficients between FF- and FFPE-derived scores were at least 0.94 and high concordance was observed between molecular scores and immunohistochemical data. The HER2_2, PGR_ 5, PRO_10 and RISK_25 scores were significant predictors of disease free-survival (DFS) in univariate Cox proportional hazard regression. PRO_10 and RISK_25 scores predicted DFS in patients with histological grade II breast cancer and in lymph node positive disease. The PRO_10 and PGR_ 5 scores were independent predictors of DFS in multivariate Cox regression models incorporating clinical risk indicators; PRO_10 outperformed Ki-67 labeling index in multivariate Cox proportional hazard analyses. Conclusions: Scores representing the endocrine responsiveness and proliferation status of breast cancers were developed from gene expression analyses based on RNA derived from FFPE tissues. The validation of the molecular scores with tumor samples of participants of the BIG 1-98 trial demonstrates that such scores can serve as independent prognostic factors to estimate disease free survival (DFS) in postmenopausal patients with estrogen receptor positive breast cancer.

Interest of qualitative and quantitative profiling of endocannabinoids for evaluation of their implication in drug addiction process

Introduction: In the middle of the 90's, the discovery of endogenous ligands for cannabinoid receptors opened a new era in this research field. Amides and esters of arachidonic acid have been identified as these endogenous ligands. Arachidonoylethanolamide (anandamide or AEA) and 2-Arachidonoylglycerol (2-AG) seem to be the most important of these lipid messengers. In addition, virodhamine (VA), noladin ether (2-AGE), and N-arachidonoyl dopamine (NADA) have been shown to bind to CB receptors with varying affinities. During recent years, it has become more evident that the EC system is part of fundamental regulatory mechanisms in many physiological processes such as stress and anxiety responses, depression, anorexia and bulimia, schizophrenia disorders, neuroprotection, Parkinson disease, anti-proliferative effects on cancer cells, drug addiction, and atherosclerosis. Aims: This work presents the problematic of EC analysis and the input of Information Dependant Acquisition based on hybrid triple quadrupole linear ion trap (QqQLIT) system for the profiling of these lipid mediators. Methods: The method was developed on a LC Ultimate 3000 series (Dionex, Sunnyvale, CA, USA) coupled to a QTrap 4000 system (Applied biosystems, Concord, ON, Canada). The ECs were separated on an XTerra C18 MS column (50 × 3.0 mm i.d., 3.5 μm) with a 5 min gradient elution. For confirmatory analysis, an information-dependant acquisition experiment was performed with selected reaction monitoring (SRM) as survey scan and enhanced produced ion (EPI) as dependant scan. Results: The assay was found to be linear in the concentration range of 0.1-5 ng/mL for AEA, 0.3-5 ng/mL for VA, 2-AGE, and NADA and 1-20 ng/mL for 2-AG using 0.5 mL of plasma. Repeatability and intermediate precision were found less than 15% over the tested concentration ranges. Under non-pathophysiological conditions, only AEA and 2-AG were actually detected in plasma with concentration ranges going from 104 to 537 pg/mL and from 2160 to 3990 pg/mL respectively. We have particularly focused our scopes on the evaluation of EC level changes in biological matrices through drug addiction and atherosclerosis processes. We will present preliminary data obtained during pilot study after administration of cannabis on human patients. Conclusion: ECs have been shown to play a key role in regulation of many pathophysiological processes. Medical research in these different fields continues to growth in order to understand and to highlight the predominant role of EC in the CNS and peripheral tissues signalisation. The profiling of these lipids needs to develop rapid, highly sensitive and selective analytical methods.

TFC Redes de computadores : filtro de páginas web

Aquest treball final de carrera consisteix en la creació d'un complement que afegeix noves característiques a un navegador conegut com Firefox produït i proporcionat pel Projecte Mozilla. Aquest projecte desenvolupa, implementa i promou el programari lliure. El complement consisteix en un filtre de pàgines web a nivell de contingut.

Desenvolupament d'un videojoc 3D basat en OpenGL

En aquest treball es presenta una aplicació gràfica per a desenvolupar un videojoc de tema lliure, amb premisses senzilles però fermes i amb la utilització d'unes eines el funcionament de les qual s'ha assolit durant la carrera i s?ha aprofundit durant el temps que ha durat la confecció d'aquest projecte.

Implementació d'un esquema criptogràfic per gestionar de forma segura els historials mèdics dels pacients a traves d'una xarxa de comunicacions

Aquest treball presenta una solució basada en criptosistemes de clau pública, certificats i signatures digitals, emprant Java com a llenguatge de programació. Per a estendre la funcionalitat quant a seguretat del Java Developer Kit (JDK) s'utilitza la llibreria criptogràficaIAIK (Institute for Applied Information Processing and Communication).

Una extensió de LaCOLLA : abstracció de processament

En aquest PFC s'estudia la possibilitat d'estendre LaCOLLA dotant-la d'abstracció de processament: es tracta d?oferir a les aplicacions la possibilitat d'utilitzar els recursos del grup per a executar processos de la manera més eficient i segura possible, sense que les aplicacions s'hagin de preocupar d'on i quan s'executen aquests processos.

Xat segur

L'objectiu d'aquest treball de final de carrera és crear un programari de missatgeria instantània deslligada de qualsevol servidor, de manera que cada usuari tingui un programa client/servidor amb el qual pugui rebre 'trucades' o fer-ne, en aquest últim cas indicant prèviament l'adreça IP del destinatari.

Estudi d'eines CASE que suporten OCLper a la generació automàtica de codi Java

Es tracta d'una recerca d'eines CASEque actualment suporten OCL en la generació automàtica de codi Java per estudiar-les ianalitzar-les a través d'un model de proves consistent en un diagrama de classes del modelestàtic de l'UML i una mostra variada d'instruccions OCL, amb l'objectiu de detectar lesseves mancances, analitzant el codi obtingut i determinar si controla o no cada tipus derestricció, i si s'han implementat bé en el codi.

Analitzador del tràfic de Xarxa per entorn Linux 'Sniff All'

L'objectiu d'aquest treball de final de carrera és clar pel que fa a la funcionalitat: es tracta de fer un analitzador de xarxa (vulgarment conegut com a detector) que funcioni en entorns Linux i amb interfícies d'usuari gràfiques.

Generació automàtica de l'esquema de bases de dades objectes-relacional d'una aplicació a partir del seu diagrama de dades

L'objectiu d'aquest projecte de fi de carrera és obtenir una aplicació en llenguatge JAVA amb capacitat de generar, a partir d'un diagrama de classes, la representació corresponent en un esquema d'una base de dades orientada a objectes Oracle 9i.

Avaluació de SQL : 1999 respecte les característiques orientades a objectes que suporta i la seva implementació en sistemes de gestió de Bases de Dades

El treball realitzat analitza la manera com l'estàndard SQL:1999 ha incorporat a la seva especificació una sèrie de característiques pròpies de la tecnologia d'orientació a l'objecte. D'aquesta manera, l'estàndard mira de proporcionar als sistemes de gestió de bases de dades algunes de les funcionalitats exigides als sistemes de tercera generació. Aquests sistemes han d'incorporar altres característiques, que estan recollides a l'article Third Generation Database System Manifesto.

Disseny d'un sistema de log genèric per a la implementació de sistemes operacionals.

Aquest projecte permetrà aprofundir en el coneixement de l'estructura de funcionament del PL/SQL d'Oracle (crides a procediments i, especialment, tractament d'excepcions), en la utilització de JDBC com a mecanisme de comunicació entre JAVA i Oracle, i en l'ús de les classes de generació d'interfícies gràfiques d'usuari (swing) i, a més, permetrà posar en pràctica funcionalitats d'Oracle que no havia tingut oportunitat d'emprar, com ara tipus genèrics de dades, objectes persistents o transaccions autònomes.

MisListas : aplicació per a la creació de llistes

El projecte "MisListas" està dissenyat especialment per a usuaris domèstics, permetent a aquests construir llistes amb diferents continguts com: Llista de la compra, de tasques, cites, aniversaris, reunions, arbres genealògics i en definitiva qualsevol tipus de llista jeràrquica que desitgin guardar nostra aplicació.

Disseny i implementació d'un esquema criptogràfic d'enquesta electrònica remota

Amb aquest projecte es vol proposar un esquema criptogràfic que permeti realitzar una enquesta de forma electrònica. La solució es basa en criptografia de clau pública, que en la actualitat es fa servir de manera habitual tant en el comerç electrònic com en altres aplicacions criptogràfiques.

Diseño de un Sistema Operacional

Aquest treball de final de carrera permet aprofundir en els coneixements en la gestió de projectes informàtics, el disseny de sistemes i procediments SQL i la definició de jocs de proves. La recerca de solucions com ara l'aplicació de la generació de dades aleatòries i el disseny d'una base de dades consistent han estat les meves principals aportacions en aquest projecte.