High-resolution numerical modelling of flow-vegetation interactions

In this paper, we present and apply a new three-dimensional model for the prediction of canopy-flow and turbulence dynamics in open-channel flow. The approach uses a dynamic immersed boundary technique that is coupled in a sequentially staggered manner to a large eddy simulation. Two different biomechanical models are developed depending on whether the vegetation is dominated by bending or tensile forces. For bending plants, a model structured on the Euler-Bernoulli beam equation has been developed, whilst for tensile plants, an N-pendula model has been developed. Validation against flume data shows good agreement and demonstrates that for a given stem density, the models are able to simulate the extraction of energy from the mean flow at the stem-scale which leads to the drag discontinuity and associated mixing layer.

Detection of promoter activity by flow cytometric analysis of GFP reporter expression.

Low efficiency of transfection is often the limiting factor for acquiring conclusive data in reporter assays. It is especially difficult to efficiently transfect and characterize promoters in primary human cells. To overcome this problem we have developed a system in which reporter gene expression is quantified by flow cytometry. In this system, green fluorescent protein (GFP) reporter constructs are co-transfected with a reference plasmid that codes for the mouse cell surface antigen Thy-1.1 and serves to determine transfection efficiency. Comparison of mean GFP expression of the total transfected cell population with the activity of an analogous luciferase reporter showed that the sensitivity of the two reporter systems is similar. However, because GFP expression can be analyzed at the single-cell level and in the same cells the expression of the reference plasmid can be monitored by two-color fluorescence, the GFP reporter system is in fact more sensitive, particularly in cells which can only be transfected with a low efficiency.

Materials web de fiscalitat enfocats per competències per a fomentar l'aprenentatge autònom

La finalitat principal del projecte consisteix en el disseny d'un material web mitjançant el qual els estudiants puguin anar desenvolupant i perfeccionant les diferents competències de les assignatures que conformen l'àrea de fiscalitat del Grau de Dret. Per a desenvolupar aquest material web s’ha fet servir la plataforma virtual Moodle. Concretament, el projecte s’ha centrat en una assignatura de fiscalitat del Grau de Dret, tot i que els resultats obtinguts són perfectament traslladables a qualsevol assignatura del Grau de Dret o postgrau en matèries jurídiques. El pla de treball del projecte ha consistit en desenvolupar un material web enfocat per competències, mitjançant les eines disponibles a la plataforma Moodle en una assignatura de fiscalitat i analitzar les seves possibilitats i característiques, especialment pel que fa a la planificació docent i l’avaluació de l’aprenentatge, així com comprovar el nivell de satisfacció dels estudiants mitjançant la realització d’unes enquestes.

Consolidació de la Plataforma COMalaWEB com a eina Web d'autoaprenentatge per a l'EEES

La plataforma d’e-learning: COMalaWEB és una eina multimedia de suport a l’estudi, l’experimentació i l’adquisició de tècniques d’autoaprenentatge. COMalaWEB s’ofereix com a punt de trobada entre estudiants, professors i altres professionals relacionats amb el mon de les telecomunicacions i/o de la docència universitària. Mitjançant el present projecte s’ha dut a terme la consolidació de la plataforma COMalaWEB com a eina WWW d'autoaprenentatge per a l'EEES (Estudis de Bachelor i de Màster): Dins de la plataforma s’hi ha integrat un Laboratori Virtual per a comunicacions analògiques i digitals (LaViCAD) que ofereix activitats experimentals amb un gran ventall de possibilitats que van des de les demostracions teòriques fins a l’emulació de sistemes de comunicacions quotidians com per exemple la televisió digital o el sistema Wifi dels sistemes WLAN. L’altre gran component de la plataforma es la base de dades de continguts empaquetada en unitats bàsiques anomenades objectes de coneixement, organitzada en cursos, integren tant continguts teòrics com un conjunt d’exercicis proposats per a aprofundir cadascun dels temes tractats. Amb l’actual projecte s’ha treballat en les següents línies d’actuació: - Integració dels simuladors del laboratori LAVICAD a la plataforma d’autoaprenentatge. - Creació de base de dades de recursos docents basats en paquets SCORM per a oferir materials docents de tipus teòric i col·leccions d’exercicis resolts en el marc de les diferents assignatures participants en el projecte. - Creació de base de dades de tipus qüestionari per a oferir exercicis a treballar en el marc de les diferents assignatures participants en el projecte. - Inserció de metodologies docents basades en els anteriors recursos en diferents assignatures d’estudis d’enginyeria i de màster.

Prognostic accuracy of cerebral blood flow measurement by perfusion computed tomography, at the time of emergency room admission, in acute stroke patients.

The purpose of this study was to determine the prognostic accuracy of perfusion computed tomography (CT), performed at the time of emergency room admission, in acute stroke patients. Accuracy was determined by comparison of perfusion CT with delayed magnetic resonance (MR) and by monitoring the evolution of each patient's clinical condition. Twenty-two acute stroke patients underwent perfusion CT covering four contiguous 10mm slices on admission, as well as delayed MR, performed after a median interval of 3 days after emergency room admission. Eight were treated with thrombolytic agents. Infarct size on the admission perfusion CT was compared with that on the delayed diffusion-weighted (DWI)-MR, chosen as the gold standard. Delayed magnetic resonance angiography and perfusion-weighted MR were used to detect recanalization. A potential recuperation ratio, defined as PRR = penumbra size/(penumbra size + infarct size) on the admission perfusion CT, was compared with the evolution in each patient's clinical condition, defined by the National Institutes of Health Stroke Scale (NIHSS). In the 8 cases with arterial recanalization, the size of the cerebral infarct on the delayed DWI-MR was larger than or equal to that of the infarct on the admission perfusion CT, but smaller than or equal to that of the ischemic lesion on the admission perfusion CT; and the observed improvement in the NIHSS correlated with the PRR (correlation coefficient = 0.833). In the 14 cases with persistent arterial occlusion, infarct size on the delayed DWI-MR correlated with ischemic lesion size on the admission perfusion CT (r = 0.958). In all 22 patients, the admission NIHSS correlated with the size of the ischemic area on the admission perfusion CT (r = 0.627). Based on these findings, we conclude that perfusion CT allows the accurate prediction of the final infarct size and the evaluation of clinical prognosis for acute stroke patients at the time of emergency evaluation. It may also provide information about the extent of the penumbra. Perfusion CT could therefore be a valuable tool in the early management of acute stroke patients.

Bioinformática: identificar genes en una interfaz gráfica vía web para la comparación de genomas

Este trabajo desarrolla el proceso de diseño e implementación de una interfaz web que permite la exploración en detalle de las relaciones entre genomas completos. La interfaz permite la comparación simultánea de nueve genomas, representando en cada gráfica las relaciones entre cada par de genomas junto los genes identificados de cada uno de ellos. Es capaz de trabajar con genomas del dominio Eukaryota y se adapta a la capacidad de cómputo de la máquina cliente. La información representada son MUMs (Maximal Unique Matching, secuencia máxima y única encontrada en ambos genomas) y SuperMUMs (agrupación de MUMs mediante Approximate String Matching). Los datos son previamente calculados y accesibles desde un servidor web.

Implementación de aplicaciones y herramientas de post-procesamiento de imágenes médicas vía web

Con la creciente generación de resonancias magnéticas, los servicios de radiología necesitan aplicaciones que les faciliten el trabajo de acceso remoto a los datos y a las herramientas que utilicen para la extracción de datos para realizar sus diagnósticos. El objetivo de este proyecto es el de estudiar e integrar en la plataforma web del grupo de Imagen Médica del PIC llamada PICNIC (PIC NeuroImaging Center) un conjunto de aplicaciones para el estudio y procesamiento de neuroimagen con la implementación de herramientas software en la plataforma grid del PIC.

Dawn for the galaxy: creació d'un joc web d'estratègia en temps real, multijugador i massiu

“Dawn or the Galaxy” és un treball de final de carrera que té com a objectiu principal la creació i desenvolupament d’una versió de demostració per a un joc del tipus MMORTS (massive multiplayer online real-time strategy) tractant d’incloure elements innovadors en aquest gènere de jocs i oferint un ampli ventall estratègic des de l’inici del joc. Per tal d’assolir l’objectiu es realitzarà un petit sondeig de mercat inicial i un estudi de models de jocs d’estratègia. El joc estarà integrat per més de seixanta fitxers de codi, una base de dades amb catorze taules interrelacionades no normalitzades i podrà tenir cabuda per a uns cinc-cents jugadors. Un cop programat l’aplicatiu, el joc es provarà en un entorn real, amb usuaris reals. Per a resoldre els problemes durant el transcurs del joc de forma ràpida, la aplicació serà sotmesa a un seguiment exhaustiu. La col·laboració dels jugadors en aquest punt serà fonamental.

Creació d'un framework per aplicacions web amb la plataforma .NET

Hi ha moltes empreses que fan aplicacions de gestió Web. Una d’aquestes empreses és per la que s’ha fet el projecte. El problema és que tenen molts projectes per desenvolupar, per tant van decidir d’implementar un conjunt d’eines amb l’objectiu de facilitar la implementació de les aplicacions als programadors. S’ha desenvolupat una llibreria .dll, que conté aquestes noves eines. També s’ha utilitzat codi JavaScript i CSS per tal d’implementar alguna funcionalitat i donar una presentació amb aquestes noves eines.

A stable and 40Ar/39Ar isotope study of a major thrust in the Helvetic nappes (Swiss Alps) - Evidence for fluid-flow and constraints on nappe kinematics

Stable isotope and Ar-40/Ar-39 measurements,were made on samples associated with a major tectonic discontinuity in the Helvetic Alps, the basal thrust of the Diablerets nappe (external zone of the Alpine Belt) in order to determine both the importance of fluids in this thrust zone and the timing of thrusting. A systematic decrease in the delta(18)O values (up to 6 parts per thousand) of calcite, quartz, and white mica exists within a 10- to 70-m-wide zone over a distance of 37 km along the thrust, and they become more pronounced toward the root of the nappe. A similar decrease in the delta(13)C values of calcite is observed only in the deepest sections (up to 3 parts per thousand). The delta D-SMOW (SMOW = standard mean ocean water) values of white mica are -54 parts per thousand +/- 8 parts per thousand (n = 22) and are independent of the distance from the thrust. These variations are interpreted to reflect syntectonic solution reprecipitation during fluid passage along the thrust. The calculated delta(18)O and delta D values (versus SMOW) for the fluid in equilibrium with the analyzed minerals is 12 parts per thousand to 16 parts per thousand and -30 parts per thousand to +5 parts per thousand, respectively, for assumed temperatures of 250 to 450 degrees C. The isotopic and structural data are consistent with fluids derived from the deep-seated roots of the Helvetic nappes where large volumes of Mesozoic sediments were metamorphosed to the amphibolite facies, It is suggested that connate and metamorphic waters, overpressured by rapid tectonic burial in a subductive system escaped by upward infiltration along moderately dipping pathways until they reached the main shear zone at the base of the moving pile, where they were channeled toward the surface, This model also explains the mechanism by which large amounts of fluid were removed from the Mesozoic sediments during Alpine metamorphism. White mica Ar-49/Ar-39 ages vary from 27 Ma far from the Diablerets thrust to 15 Ma along the thrust. An older component is observed in micas far from the thrust, interpreted as a detrital signature, and indicates that regional metamorphic temperatures were less than about 350 degrees C. The;plateau and near plateau ages nearest the thrust are consistent with either neocrystallization of white mica or argon loss by recrystallization during thrusting, which may have been enhanced in the zones of highest fluid flow. The 15 Ma Ar-40/Ar-39 age plateau measured on white mica sampled exactly on the thrust surface dates the end of both fluid flow and tectonic transport.

Inversion prepared coronary MR angiography: direct visualization of coronary blood flow.

PURPOSE: Visualization of coronary blood flow by means of a slice-selective inversion pre-pulse in concert with bright-blood coronary MRA. MATERIALS AND METHODS: Coronary magnetic resonance angiography (MRA) of the right coronary artery (RCA) was performed in eight healthy adult subjects on a 1.5 Tesla MR system (Gyroscan ACS-NT, Philips Medical Systems, Best, NL) using a free-breathing navigator-gated and cardiac-triggered 3D steady-state free-precession (SSFP) sequence with radial k-space sampling. Imaging was performed with and without a slice-selective inversion pre-pulse, which was positioned along the main axis of the coronary artery but perpendicular to the imaging volume. Objective image quality parameters such as SNR, CNR, maximal visible vessel length, and vessel border definition were analyzed. RESULTS: In contrast to conventional bright-blood 3D coronary MRA, the selective inversion pre-pulse provided a direct measure of coronary blood flow. In addition, CNR between the RCA and right ventricular blood pool was increased and the vessels had a tendency towards better delineation. Blood SNR and CNR between right coronary blood and epicardial fat were comparable in both sequences. CONCLUSION: The combination of a free-breathing navigator-gated and cardiac-triggered 3D SSFP sequence with a slice-selective inversion pre-pulse allows for direct and directional visualization of coronary blood flow with the additional benefit of improved contrast between coronary and right ventricular blood pool.

Transmisión de datos PDA - servidor web

En aquest projecte es visualitza la trajectòria d'un vehicle (aeri o terrestre) en una pàgina web. Per això es disposa d'una PDA (Personal Digital Assistant), en la qual es té informació actualitzada de la posició i de la velocitat d’aquest vehicle. Aquestes dades són obtingudes d'un sistema que combina la navegació inercial i el GPS (Global Position System), els quals estimen de manera precisa la trajectòria del vehicle. A fi d'oferir una visualització en temps real, versàtil, accessible i amigable a l'usuari de la trajectòria del vehicle, s'ha desenvolupat un sistema de visualització on-line que proporciona un millor rendiment en comparació amb la qual es venia fent en la PDA. Per a dur-lo a terme s'implementa una interfície d'usuari en la PDA que ens permet transmetre aquesta informació via WIFI a la pàgina web, d'igual forma al servidor web es crea una interfície que interpreta i gestiona aquestes dades per a posteriorment ser graficats a Google Maps.