Efeitos do controle de temperatura e da vimpocetina sobre os déficits neurocomportamentais decorrentes do estresse por separação materna em camundongos suíços neonatos

O estresse durante o desenvolvimento está associado com diversas desordens neurocomportamentais, que podem persistir ao longo da vida. A hiperatividade é um dos transtornos comportamentais que, com maior frequência, observa-se em humanos submetidos ao estresse precoce. Esse transtorno pode ser a manifestação clínica predominante, ou mesclar-se com déficit de atenção, impulsividade e retardo da aprendizagem, constituindo o Transtorno de Déficit de Atenção e Hiperatividade (TDAH), com número de casos diagnosticados em ascensão. Diversos protocolos experimentais utilizam a separação materna (SM) de roedores neonatos para mimetizar as consequências do estresse precoce em humanos. Esta predileção por roedores recém-nascidos se deve à sua equivalência aproximada com fetos humanos no terceiro trimestre da gestação em termos de neurodesenvolvimento, quando ocorre o maior crescimento do Sistema Nervoso Central fetal. Neste trabalho, camundongos suíços neonatos foram submetidos a sessões diárias de isolamento com separação materna, entre o 2 e o 10 dias de vida pós-natal (PN2 a PN10), variando-se a temperatura de isolamento dos filhotes, que permaneciam sem aquecimento (na temperatura do biotério, entre 22 e 25C) ou eram mantidos aquecidos a 37C durante essas sessões. Portanto, foram três grupos experimentais: isolamento aquecido com SM; isolamento não aquecido com SM; e controle. Os animais do grupo controle foram pesados em PN2 e PN10 e, prontamente, devolvidos às progenitoras. Todos os animais foram desmamados e sexados em PN21, não sendo perturbados até a realização dos testes neurocomportamentais, a partir de PN30, que incluíram os Testes de Campo Aberto e de Esquiva Inibitória. Num segundo estudo, foram realizadas dosagens séricas da corticosterona basal e dos hormônios tireoidianos nos três grupos experimentais, em PN6, PN10 e PN30. Finalmente, num terceiro estudo, camundongos do grupo controle e do grupo submetido ao isolamento não aquecido com SM foram tratados com vimpocetina (20g/kg), um neuroprotetor potencial, ou com veículo (Dimetilsulfóxido), a fim de avaliar os efeitos da vimpocetina na atividade locomotora. O 1 estudo demonstrou que a temperatura foi um fator crítico para a manifestação de hiperatividade locomotora no Teste do Campo Aberto, que ocorreu, somente, nos animais do grupo submetido ao isolamento não aquecido. Adicionalmente, não houve diferenças entre os grupos experimentais no Teste da Esquiva Inibitória, quanto à memória e à aprendizagem. O 2 estudo demonstrou que a temperatura do isolamento influenciou os níveis da corticosterona basal e dos hormônios tireoidianos em PN10 e em PN30. No 3 estudo, a vimpocetina reduziu a hiperatividade locomotora no grupo de animais submetidos ao isolamento não aquecido com SM. De todo o exposto, conclui-se que o isolamento com SM de camundongos suíços neonatos à temperatura de 22 a 25C aumentou a atividade locomotora nesses animais, e que a vimpocetina foi capaz de atenuar esse comportamento, sem aumento da mortalidade. Finalmente, considerando-se o maior risco de desenvolvimento do TDAH em crianças e adolescentes com históricos de prematuridade, levanta-se a hipótese de que o estresse térmico pelo frio seja um dos fatores envolvidos na fisiopatogenia da hiperatividade nesses casos.

Implications of using On-Farm Flood Flow Capture to recharge groundwater and mitigate flood risks along the Kings River, CA

Two large hydrologic issues face the Kings Basin, severe and chronic overdraft of about 0.16M ac-ft annually, and flood risks along the Kings River and the downstream San Joaquin River. Since 1983, these floods have caused over $1B in damage in today’s dollars. Capturing flood flows of sufficient volume could help address these two pressing issues which are relevant to many regions of the Central Valley and will only be exacerbated with climate change. However, the Kings River has high variability associated with flow magnitudes which suggests that standard engineering approaches and acquisition of sufficient acreage through purchase and easements to capture and recharge flood waters would not be cost effective. An alternative approach investigated in this study, termed On-Farm Flood Flow Capture, involved leveraging large areas of private farmland to capture flood flows for both direct and in lieu recharge. This study investigated the technical and logistical feasibility of best management practices (BMPs) associated with On-Farm Flood Flow Capture. The investigation was conducted near Helm, CA, about 20 miles west of Fresno, CA. The experimental design identified a coordinated plan to determine infiltration rates for different soil series and different crops; develop a water budget for water applied throughout the program and estimate direct and in lieu recharge; provide a preliminary assessment of potential water quality impacts; assess logistical issues associated with implementation; and provide an economic summary of the program. At check locations, we measured average infiltration rates of 4.2 in/d for all fields and noted that infiltration rates decreased asymptotically over time to about 2 – 2.5 in/d. Rates did not differ significantly between the different crops and soils tested, but were found to be about an order of magnitude higher in one field. At a 2.5 in/d infiltration rate, 100 acres are required to infiltrate 10 CFS of captured flood flows. Water quality of applied flood flows from the Kings River had concentrations of COC (constituents of concern; i.e. nitrate, electrical conductivity or EC, phosphate, ammonium, total dissolved solids or TDS) one order of magnitude or more lower than for pumped groundwater at Terranova Ranch and similarly for a broader survey of regional groundwater. Applied flood flows flushed the root zone and upper vadose zone of nitrate and salts, leading to much lower EC and nitrate concentrations to a depth of 8 feet when compared to fields in which more limited flood flows were applied or for which drip irrigation with groundwater was the sole water source. In demonstrating this technology on the farm, approximately 3,100 ac-ft was diverted, primarily from April through mid-July, with about 70% towards in lieu and 30% towards direct recharge. Substantial flood flow volumes were applied to alfalfa, wine grapes and pistachio fields. A subset of those fields, primarily wine grapes and pistachios, were used primarily to demonstrate direct recharge. For those fields about 50 – 75% of water applied was calculated going to direct recharge. Data from the check studies suggests more flood flows could have been applied and infiltrated, effectively driving up the amount of water towards direct recharge. Costs to capture flood flows for in lieu and direct recharge for this project were low compared to recharge costs for other nearby systems and in comparison to irrigating with groundwater. Moreover, the potentially high flood capture capacity of this project suggests significant flood avoidance costs savings to downstream communities along the Kings and San Joaquin Rivers. Our analyses for Terranova Ranch suggest that allocating 25% or more flood flow water towards in lieu recharge and the rest toward direct recharge will result in an economically sustainable recharge approach paid through savings from reduced groundwater pumping. Two important issues need further consideration. First, these practices are likely to leach legacy salts and nitrates from the unsaturated zone into groundwater. We develop a conceptual model of EC movement through the unsaturated zone and estimated through mass balance calculations that approximately 10 kilograms per square meter of salts will be flushed into the groundwater through displacing 12 cubic meters per square meter of unsaturated zone pore water. This flux would increase groundwater salinity but an equivalent amount of water added subsequently is predicted as needed to return to current groundwater salinity levels. All subsequent flood flow capture and recharge is expected to further decrease groundwater salinity levels. Second, the project identified important farm-scale logistical issues including irrigator training; developing cropping plans to integrate farming and recharge activities; upgrading conveyance; and quantifying results. Regional logistical issues also exist related to conveyance, integration with agricultural management, economics, required acreage and Operation and Maintenance (O&M).

Qual é o risco do consumo combinado de bebidas energéticas e etanol? Efeitos comportamentais em camundongos adolescentes

O uso combinado de etanol e bebidas energéticas tem aumentado entre adolescentes. Além disso, estudos epidemiológicos indicam que o co-uso aumenta a probabilidade de consumo abusivo e dependência de etanol. Apesar disso, pouco se sabe sobre as consequências neurocomportamentais da co-exposição no cérebro adolescente. Este estudo tem como objetivo avaliar o curso temporal dos efeitos agudos da exposição à bebida energética e/ou etanol na atividade motora e ansiedade no teste de campo aberto, como também, os efeitos agudos ou prolongados sobre aprendizagem/memória e coordenação motora em camundongos adolescentes. Camundongos Suíços foram divididos em 4 grupos: bebidas energéticas e etanol, bebida energética, etanol e água. Três estudos separados foram conduzidos para avaliar cada um dos objetivos específicos deste trabalho. No primeiro estudo, realizado em PN40, os animais receberam a administração de bebida energética (8 ml/kg) e/ou etanol (4 g/kg) por gavagem e após 55 minutos foram submetidos ao teste do campo aberto (sessão 1). Outras duas sessões foram realizadas em sequência usando a metade da dose inicial (sessão 2 e 3). Nos estudos 2 e 3, estudamos os efeitos agudos (PN40) e crônicos (exposição de PN30-40) sobre o teste de esquiva passiva (0,3 mA, 3 s) e sobre o desempenho no teste do cilíndro giratório (sessão de treinamento e após 1 e 3 horas da gavagem das drogas). Em ambos os casos, a dose de bebida energética (8 ml/kg) e/ou etanol (4 g/kg) foi administrada. No teste da esquiva passiva, as sessões de treino e retenção foram realizadas 1 e 24 horas após a administração da droga, respectivamente. No teste do Rotarod, cada sessão foi constituída por 5 tentativas em modelo de aceleramento contínuo (4 a 40 rpm/min em uma tentativa de 2 min). Os nossos dados indicam que a exposição concomitante a bebida energética potencializa o efeito de hiperatividade induzido pelo etanol, como também, gera uma resposta ansiogênica no teste do campo aberto. A exposição aguda ao etanol induz déficit de memória/aprendizagem que não é revertida pela BE. A co-exposição aguda a bebida energética e etanol prolongou incoordenação motora induzida pelo etanol. No entanto, a bebda energética reverteu o comprometimento da coordenação motora gerada pela exposição crônica de etanol em camundongos fêmeas. O presente estudo fornece evidência experimental de que bebida energética e etanol interagem durante a adolescência, resultando em padrões de comportamento que poderiam aumentar o risco de desenvolvimento de abuso ou dependência de etanol. Além disso, os dados indicaram que a exposição aguda à bebida energética não atenuou as consequências negativas geradas pela etanol no desempenho do motor e cognitivo.

Papel do bloqueio dos receptores NMDA e da ativação dos receptores GABAA na manifestação dos déficits neurocomportamentais decorrentes da exposição ao etanol durante o período equivalente ao terceiro trimestre de gestação

A exposição gestacional ao etanol produz um amplo espectro de defeitos neurocomportamentais que podem persistir ao longo da vida. Dentre os distúrbios mais comumente observados estão o transtorno do déficit de atenção e hiperatividade (TDAH) e os déficits de aprendizado e memória. Apesar da grande quantidade de estudos, os mecanismos envolvidos com a manifestação destes transtornos permanecem pouco conhecidos. Estudos em roedores vêm demonstrando que o período equivalente ao terceiro trimestre de gestação é critico para o aparecimento destas alterações comportamentais. Durante este período, que é caracterizado por intensa sinaptogênese, a neurotoxicidade do etanol vem sendo atribuída ao bloqueio dos receptores glutamatérgicos do tipo N-metil-D-aspartato (NMDA) e hiperativação dos receptores do ácido gama-aminobutírico do subtipo A (GABAA). Tendo em vista que ao longo do desenvolvimento estes receptores diferem em relação a função e distribuição espaço-temporal, neste estudo avaliamos a contribuição relativa do bloqueio dos receptores NMDA e hiperativação dos receptores GABAA durante o período equivalente ao terceiro trimestre de gestação para a manifestação da hiperatividade locomotora e para os distúrbios de aprendizado e memória de camundongos pré-púberes. Para tanto, este estudo foi realizado em duas etapas. Na primeira, investigamos os efeitos da exposição isolada ao bloqueador NMDA MK801 (MK) e ao agonista GABAA muscimol (MU). Para tanto, em dias alternados do segundo dia pós-natal (PN2) a PN8, os animais receberam uma injeção intraperitoneal de Salina (SAL), MK nas doses de 0,1, 0,3 ou 0,5 mg/kg ou de MU nas doses de 0,1 0,3 ou 0,5 mg/kg. Na segunda etapa investigamos os efeitos da administração simultânea de MK (0,1mg/kg) e MU (doses 0,02, 0,1 ou 0,5 mg/kg). Em PN25, a atividade locomotora foi automaticamente avaliada por 15 min no teste de campo aberto. Em PN31 e PN32, o aprendizado e memória foi avaliado no teste da esquiva passiva inibitória. Em relação aos resultados da exposição isolada a cada uma das drogas, apenas o tratamento com MK promoveu um aumento dose dependente na atividade locomotora. No teste da esquiva passiva inibitória, os animais expostos as maiores doses de MK e MU apresentaram déficits de aprendizado e memória. Em relação aos resultados da exposição combinada de MK e MU, não foram observadas diferenças significativas entre os grupos na atividade locomotora. Na esquiva passiva inibitória, a administração simultânea de MK e MU, em doses que administradas isoladamente não tiveram efeito, promoveu prejuízos de aprendizado e memória. Nossos resultados sugerem que, enquanto a hiperatividade locomotora está associada apenas com o bloqueio dos receptores NMDA, os déficits de aprendizado e memória podem ser produto de uma ação sinergista do etanol nos dois receptores.

Moradia como Liberdade

A habitação de interesse social decorre da existência do déficit habitacional que não é passível de ser enfrentado pela lógica do mercado imobiliário. Conforme aponta omainstreamda economia regional, a cidade é foco do crescimento mundial devido ao fluxo de informações e conhecimento; é nas cidades que o déficit habitacional se concentra e por isso o acesso a ela se torna tão relevante. O déficit habitacional urbano confirma a teoria de que habitar no centro urbano é algo que se valorize, deste modo o acesso à cidade é significativo para a expansão da liberdade. Não obstante, nossas observações confirmam que a maioria dos investimentos do Minha Casa Minha Vida do município do Rio de Janeiro são nas periferias urbanas, com infraestrutura precária, o que dificulta o acesso à cidade e ao trabalho, o pode ser um entrave para o desenvolvimento socioeconômico do Brasil. Desse modo, este trabalho analisa a moradia pela abordagem seniana das capacidades. Esta abordagem se faz relevante por considerar fatores sociológicos importantes para a superação da condição de privação econômica e social dos cidadãos. A pesquisa consiste na mensuração do déficit habitacional com a utilização dos dados do Censo Demográfico 2010 do IBGE. O trabalho consiste num esforço para delinear a satisfação e do acesso a cidade dos moradores do Rio de Janeiro que foram beneficiados pelo Programa Minha Casa Minha Vida. Este trabalho ressalta a importância do acesso à cidade bem como da moradia para a expansão das liberdades e para o desenvolvimento do país.

Scientific assessment of hypoxia in U.S. coastal waters

The occurrence of hypoxia, or low dissolved oxygen, is increasing in coastal waters worldwide and represents a significant threat to the health and economy of our Nation’s coasts and Great Lakes. This trend is exemplified most dramatically off the coast of Louisiana and Texas, where the second largest eutrophication-related hypoxic zone in the world is associated with the nutrient pollutant load discharged by the Mississippi and Atchafalaya Rivers. Aquatic organisms require adequate dissolved oxygen to survive. The term “dead zone” is often used in reference to the absence of life (other than bacteria) from habitats that are devoid of oxygen. The inability to escape low oxygen areas makes immobile species, such as oysters and mussels, particularly vulnerable to hypoxia. These organisms can become stressed and may die due to hypoxia, resulting in significant impacts on marine food webs and the economy. Mobile organisms can flee the affected area when dissolved oxygen becomes too low. Nevertheless, fish kills can result from hypoxia, especially when the concentration of dissolved oxygen drops rapidly. New research is clarifying when hypoxia will cause fish kills as opposed to triggering avoidance behavior by fish. Further, new studies are better illustrating how habitat loss associated with hypoxia avoidance can impose ecological and economic costs, such as reduced growth in commercially harvested species and loss of biodiversity, habitat, and biomass. Transient or “diel-cycling” hypoxia, where conditions cycle from supersaturation of oxygen late in the afternoon to hypoxia or anoxia near dawn, most often occurs in shallow, eutrophic systems (e.g., nursery ground habitats) and may have pervasive impacts on living resources because of both its location and frequency of occurrence.

Lobster trap debris in the Florida Keys National Marine Sanctuary: distribution, abundance, density, and patterns of accumulation

The fishery for spiny lobster Panulirus argus in the Florida Keys National Marine Sanctuary is well chronicled, but little information is available on the prevalence of lost or abandoned lobster traps. In 2007, towed-diver surveys were used to identify and count pieces of trap debris and any other marine debris encountered. Trap debris density (debris incidences/ha) in historic trap-use zones and in representative benthic habitats was estimated. Trap debris was not proportionally distributed with fishing effort. Coral habitats had the greatest density of trap debris despite trap fishers’ reported avoidance of coral reefs while fishing. The accumulation of trap debris on coral emphasizes the role of wind in redistributing traps and trap debris in the sanctuary. We estimated that 85,548 ± 23,387 (mean ± SD) ghost traps and 1,056,127 ± 124,919 nonfishing traps or remnants of traps were present in the study area. Given the large numbers of traps in the fishery and the lack of effective measures for managing and controlling the loss of gear, the generation of trap debris will likely continue in proportion to the number of traps deployed in the fishery. Focused removal of submerged trap debris from especially vulnerable habitats such as reefs and hardbottom, where trap debris density is high, would mitigate key habitat issues but would not address ghost fishing or the cost of lost gear.

中国古牡丹资源调查及衰老相关研究

牡丹（Paeonia suffruticosa Andr.）是芍药科芍药属牡丹组植物，花大、色艳、型美、香郁、药用范围广、文化内涵丰富，被尊为“国色天香”、“花中之王”。我国植牡丹、赏牡丹有1600多年的历史，培育了许多价值高的品种，遗憾的是个别黄色、鲜红色、绿色等珍贵品种不断消失，而且现有的一些文化价值与观赏价值极高的古牡丹、著名的牡丹园的老牡丹均出现了衰弱现象，有的已奄奄一息。为了探索传统牡丹品种消失及牡丹衰老的原因，本研究在充分调查、整理国内品种资源的基础上，总结了牡丹品种的传承和消失情况，掌握了古牡丹的资源状况。通过连作土壤栽培试验证明了牡丹连作障碍的存在，并选定了生长在同一区域的5、10、15、20、25、30年生6个株龄的‘洛阳红（Luo Yang Hong）’为研究对象，从形态指标的调查、生理指标的测定、根际土壤及根系浸提液的化感成分分析三个方面着手，确定了牡丹开始衰老的时期;揭示了牡丹衰老机理;总结了古牡丹保留、复壮、养护办法;为牡丹专类园的管理及可持续性发展提供了理论和技术指导。本研究主要结果如下： 1、牡丹品种和古牡丹资源 通过对中国牡丹品种资源的文献查阅和实地考察，系统整理了我国不同时代的品种状况，调查结果表明：宋、元、明、清共有品种1109种，目前仅存143种，品种资源消失十分严重。收集整理了49处古牡丹资料，并据此绘制了我国目前古牡丹分布图;实地调查了17处24株古牡丹，详细介绍了部分品种的来历传说、生长状况和衰亡原因。5个优良传统品种在中国科学院植物研究所牡丹种质资源圃内得以保存，其中潞城古牡丹，植株最大（高2.3 m，冠径5.6 m），且生长旺盛;西溪牡丹属丰花品种，40年植株可开花811朵。 2、牡丹连作障碍 利用牡丹连作根际土壤及其浸出液栽培牡丹，结果表明，播种苗及分株苗的生长均受到了抑制;连作年限越久的处理抑制作用越强;根际土壤浸出液对牡丹生长的影响较大，对前期地下部和后期地上部都有很强的抑制作用，而且还抑制了上胚轴休眠的解除;根际土壤对后期株高和展叶幅的影响较大，对播种苗前期生根影响不大。牡丹存在连作障碍现象，连作障碍是牡丹衰弱的重要原因。 3、牡丹衰老时间及机理 通过对6 个株龄‘洛阳红’的形态、生理指标及根际土壤化感成分的比较得出，牡丹在同一地方大约栽植15 年后开始衰弱，20 年以内应该采取复壮措施。利用气相色谱—质谱联用技术（Gas Chromatograph-Mass Spectrometer, GC-MS）检测到根际土壤及根系浸提液中主要存在：烷烃、烯烃、芳香烃、醇、醚、酚醌、有机酸、醛、酮、酯、苯、胺等12 类有机物。对比分析得出有12 种物质可能是根系分泌物，根际土壤中可能具毒害作用的物质有40 种，栽植牡丹使土壤中增加的物质有24 种。 4、古牡丹复壮技术及应用 栽培基质中添加活性炭、沙子、麦饭石等均能有效的促进牡丹的生长，以活性炭的效果最好。对“汉牡丹”实施了综合复壮措施，效果明显。

Effects of morphine and its withdrawal on Y-maze spatial recognition memory in mice

Effects of morphine on acquisition and retrieval of memory have been proven in the avoidance paradigms. In present study, we used a two-trial recognition Y-maze to test the effects of acute morphine and morphine withdrawal on spatial recognition memory. T

Prolonged cardiac allograft survival in presensitized rats after a high activity Yunnan-cobra venom factor therapy

Complement-dependent antibody-mediated acute humoral rejection is the major obstacle of clinical transplantation across ABO incompatibility and human leukocyte antigen presensitization. We previously demonstrated that Yunnan-cobra venom factor (Y-CVF) cou

Detour behavior changes associated with prenatal morphine exposure in 11-day-old chicks

The central nervous system exhibits remarkable plasticity in early life. Prenatal morphine exposure may induce adverse behavioral effects on the neonate and the developing offspring. In the present study, we investigated the effect of prenatal morphine exposure (daily from embryonic days 12-16, 20 mg/kg) on 11-day-old chicks using two forms of spatial paradigms: one trial detour behavior task in which animals must bypass an obstacle to reach the desired goal without any training and detour learning task which required several trials of training to reach the detour criterion. The results showed that, on the condition that chicks could successfully detour in the first trial, morphine exposed chicks exhibited longer detour latency to finish the task, coupled by a preference for turning right versus turning left. In contrast, no significant difference in learning and memory was found in detour learning task between morphine exposed chicks and saline chicks. These findings suggest specific behavioral changes associated with prenatal exposure to opioids during mid to late gestation, also raise attention to the possible health hazard from pregnancy drug use in everyday life. (C) 2010 ISDN. Published by Elsevier Ltd. All rights reserved.

Offshore geology of Pakistan and non-living resource prospects

Offshore geology of Pakistan is characterized by active and passive continental margins. These continental margins show very unique features such as an active Makran subduction zone in the west and the Indus delta and a submarine fan in the east. The geology of these features of Pakistan EEZ is inadequately known. This is a major obstacle in exploring mineral resources. Detailed study of coastal and shelf geology is needed for better understanding of the geology of the area and comprehensive evolution of its non-living resource potential. An understanding of the geological events including tectonic movements, sedimentation processes and geochemical history that comprise the geological history is very important to help in identification and estimation of resources. In Pakistan EEZ applying the current technology and undertaking research work to understand the seafloor features and mineral deposits associated with it will be very fruitful.

The local and global stability of confined planar wakes at intermediate Reynolds number

At high Reynolds numbers, wake flows become more globally unstable when they are confined within a duct or between two flat plates. At Reynolds numbers around 100, however, global analyses suggest that such flows become more stable when confined, while local analyses suggest that they become more unstable. The aim of this paper is to resolve this apparent contradiction by examining a set of obstacle-free wakes. In this theoretical and numerical study, we combine global and local stability analyses of planar wake flows at $\mathit{Re}= 100$ to determine the effect of confinement. We find that confinement acts in three ways: it modifies the length of the recirculation zone if one exists, it brings the boundary layers closer to the shear layers, and it can make the flow more locally absolutely unstable. Depending on the flow parameters, these effects work with or against each other to destabilize or stabilize the flow. In wake flows at $\mathit{Re}= 100$ with free-slip boundaries, flows are most globally unstable when the outer flows are 50 % wider than the half-width of the inner flow because the first and third effects work together. In wake flows at $\mathit{Re}= 100$ with no-slip boundaries, confinement has little overall effect when the flows are weakly confined because the first two effects work against the third. Confinement has a strong stabilizing effect, however, when the flows are strongly confined because all three effects work together. By combining local and global analyses, we have been able to isolate these three effects and resolve the apparent contradictions in previous work.

Embedded Model Predictive Control (MPC) using a FPGA

Model Predictive Control (MPC) is increasingly being proposed for application to miniaturized devices, fast and/or embedded systems. A major obstacle to this is its computation time requirement. Continuing our previous studies of implementing constrained MPC on Field Programmable Gate Arrays (FPGA), this paper begins to exploit the possibilities of parallel computation, with the aim of speeding up the MPC implementation. Simulation studies on a realistic example show that it is possible to implement constrained MPC on an FPGA chip with a 25MHz clock and achieve MPC implementation rates comparable to those achievable on a Pentium 3.0 GHz PC. Copyright © 2007 International Federation of Automatic Control All Rights Reserved.

The relation between translation speed and protein secondary structure

Based on the statistical analysis of 119 human and 92 E. coli proteins it was found that for both human and E. coli, the mRNA sequences consisting of tri-codon and tetra-codon with high translation speed preferably code for alpha helices more than for coils. For beta strand, the preference/ avoidance oscillates with the translation speed. Moreover, the non-homogeneous usages of tri-codon and tetra-codon with different translation speeds in a given secondary structure have also been found. These results cannot be simply explained by the effect of stochastic fluctuation.