The bias in reversing the Box-Cox transformation in time series forecasting: An empirical study based on neural networks

The Box-Cox transformation is a technique mostly utilized to turn the probabilistic distribution of a time series data into approximately normal. And this helps statistical and neural models to perform more accurate forecastings. However, it introduces a bias when the reversion of the transformation is conducted with the predicted data. The statistical methods to perform a bias-free reversion require, necessarily, the assumption of Gaussianity of the transformed data distribution, which is a rare event in real-world time series. So, the aim of this study was to provide an effective method of removing the bias when the reversion of the Box-Cox transformation is executed. Thus, the developed method is based on a focused time lagged feedforward neural network, which does not require any assumption about the transformed data distribution. Therefore, to evaluate the performance of the proposed method, numerical simulations were conducted and the Mean Absolute Percentage Error, the Theil Inequality Index and the Signal-to-Noise ratio of 20-step-ahead forecasts of 40 time series were compared, and the results obtained indicate that the proposed reversion method is valid and justifies new studies. (C) 2014 Elsevier B.V. All rights reserved.

Temporal analysis of prostaglandin F2 alpha receptor, caspase 3, and cyclooxygenase 2 messenger RNA expression and prostaglandin F2 alpha receptor and cyclooxygenase 2 protein expression in endometrial tissue from multiparous Nelore (Bos taurus indicus) cows treated with cloprostenol sodium during puerperium

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Evaluation of Toll-Like Receptor 2 and 4 RNA Expression and the Cytokine Profile in Postmenopausal Women with Metabolic Syndrome

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Geração de vacinas antitumorais de células dendríticas humanas sensibilizadas com RNA de células tumorais pré-tratadas com agentes antineoplásicos

O câncer colorretal (CCR) é a terceira causa mais comum de câncer no mundo em ambos os sexos e a segunda causa em países desenvolvidos. Seu tratamento convencional é baseado na cirurgia associada à radioterapia e à quimioterapia em dose máxima tolerável, para tentativa de eliminação massiva das células tumorais. Tal abordagem, no entanto, pode causar efeitos colaterais importantes, entre eles as alterações hematopoiéticas e a supressão da resposta imune. As vacinas de células dendríticas mostram-se como opção terapêutica promissora para muitos tipos de câncer, havendo diferentes protocolos de preparação e sensibilização dessas células para dirigir a resposta antitumoral específica. Alguns agentes antineoplásicos em doses ultrabaixas mostraram modular positivamente as células dendríticas (DCs) e, na célula tumoral, promover alterações na transcrição de vários genes imunologicamente relevantes. Considerando que, em estudos prévios, tais mudanças transcricionais resultaram em aumento de imunogenicidade das células tumorais, hipotetizamos que o RNA das células pré-tratadas deve ser mais eficiente do que o RNA das células originais para preparação de vacinas de células dendríticas. Assim, objetivamos avaliar se o tratamento de células do tumor de cólon humano (HT-29) com PAC ou 5-FU/LEUCO torna seu RNA mais eficiente para preparação dessas vacinas. Para essa investigação, DCs humanas geradas a partir de monócitos de sangue periférico foram transfectadas com RNA total das células tumorais pré-tratadas e, a seguir, testadas quanto à capacidade de apresentação de antígenos e indução de células T citolíticas específicas. Apesar da baixa viabilidade celular pós eletroporação, os resultados obtidos sugerem que o tratamento de células tumorais com concentrações não tóxicas de 5-FU ou PAC promove alteração de expressão... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo)

Análise funcional das proteínas desacopladas mitocondriais de plantas utilizando RNA-seq e mutantes de inserção

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Estudos funcionais da rgs-CaM, uma calmodulina envolvida na supressão de silenciamento por RNA

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Aplicação de conjugado de microesferas de poliestireno para preparo de RNA no diagnóstico da cinomose canina por RT-qPCR

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Efeito protetor in vivo de vacinas de células dendríticas sensibilizadas com RNA de células MC-38 pré-tratadas com agentes antineoplásticos em concentrações efetivas minímas

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Alterações epigenéticas do gene RASSF1 e investigação de modulação gene-específica por non-coding RNA em linhagens celulares derivadas de carcinomas mamários

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Análise do método suvrel na expressão diferencial a partir da matriz de contagens gerada com dados de RNA-SEQ

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Lycopene-rich tomato oleoresin modulates plasma adiponectin concentration and mRNA levels of adiponectin, SIRT1, and FoxO1 in adipose tissue of obese rats

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Diabetes reduces mesenchymal stem cells in fracture healing through a TNF alpha-mediated mechanism

Diabetes interferes with bone formation and impairs fracture healing, an important complication in humans and animal models. The aim of this study was to examine the impact of diabetes on mesenchymal stem cells (MSCs) during fracture repair.Fracture of the long bones was induced in a streptozotocin-induced type 1 diabetic mouse model with or without insulin or a specific TNF alpha inhibitor, pegsunercept. MSCs were detected with cluster designation-271 (also known as p75 neurotrophin receptor) or stem cell antigen-1 (Sca-1) antibodies in areas of new endochondral bone formation in the calluses. MSC apoptosis was measured by TUNEL assay and proliferation was measured by Ki67 antibody. In vitro apoptosis and proliferation were examined in C3H10T1/2 and human-bone-marrow-derived MSCs following transfection with FOXO1 small interfering (si)RNA.Diabetes significantly increased TNF alpha levels and reduced MSC numbers in new bone area. MSC numbers were restored to normal levels with insulin or pegsunercept treatment. Inhibition of TNF alpha significantly reduced MSC loss by increasing MSC proliferation and decreasing MSC apoptosis in diabetic animals, but had no effect on MSCs in normoglycaemic animals. In vitro experiments established that TNF alpha alone was sufficient to induce apoptosis and inhibit proliferation of MSCs. Furthermore, silencing forkhead box protein O1 (FOXO1) prevented TNF alpha-induced MSC apoptosis and reduced proliferation by regulating apoptotic and cell cycle genes.Diabetes-enhanced TNF alpha significantly reduced MSC numbers in new bone areas during fracture healing. Mechanistically, diabetes-enhanced TNF alpha reduced MSC proliferation and increased MSC apoptosis. Reducing the activity of TNF alpha in vivo may help to preserve endogenous MSCs and maximise regenerative potential in diabetic patients.

Comparative clinical sample preparation of DNA and RNA viral nucleic acids for a commercial deep sequencing system (Illumina MiSeq (R))

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)