882 resultados para trihydrogen cation (H3 )
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Le but de cette thse est d tendre la thorie du bootstrap aux modles de donnes de panel. Les donnes de panel s obtiennent en observant plusieurs units statistiques sur plusieurs priodes de temps. Leur double dimension individuelle et temporelle permet de contrler l 'htrognit non observable entre individus et entre les priodes de temps et donc de faire des tudes plus riches que les sries chronologiques ou les donnes en coupe instantane. L 'avantage du bootstrap est de permettre d obtenir une infrence plus prcise que celle avec la thorie asymptotique classique ou une infrence impossible en cas de paramtre de nuisance. La mthode consiste tirer des chantillons alatoires qui ressemblent le plus possible l chantillon d analyse. L 'objet statitstique d intrt est estim sur chacun de ses chantillons alatoires et on utilise l ensemble des valeurs estimes pour faire de l infrence. Il existe dans la littrature certaines application du bootstrap aux donnes de panels sans justi cation thorique rigoureuse ou sous de fortes hypothses. Cette thse propose une mthode de bootstrap plus approprie aux donnes de panels. Les trois chapitres analysent sa validit et son application. Le premier chapitre postule un modle simple avec un seul paramtre et s 'attaque aux proprits thoriques de l estimateur de la moyenne. Nous montrons que le double rchantillonnage que nous proposons et qui tient compte la fois de la dimension individuelle et la dimension temporelle est valide avec ces modles. Le rchantillonnage seulement dans la dimension individuelle n est pas valide en prsence d htrognit temporelle. Le r-chantillonnage dans la dimension temporelle n est pas valide en prsence d'htrognit individuelle. Le deuxime chapitre tend le prcdent au modle panel de rgression. linaire. Trois types de rgresseurs sont considrs : les caractristiques individuelles, les caractristiques temporelles et les rgresseurs qui voluent dans le temps et par individu. En utilisant un modle erreurs composes doubles, l'estimateur des moindres carrs ordinaires et la mthode de bootstrap des rsidus, on montre que le rchantillonnage dans la seule dimension individuelle est valide pour l'infrence sur les coe cients associs aux rgresseurs qui changent uniquement par individu. Le rchantillonnage dans la dimen- sion temporelle est valide seulement pour le sous vecteur des paramtres associs aux rgresseurs qui voluent uniquement dans le temps. Le double rchantillonnage est quand lui est valide pour faire de l infrence pour tout le vecteur des paramtres. Le troisime chapitre re-examine l exercice de l estimateur de diffrence en dirence de Bertrand, Duflo et Mullainathan (2004). Cet estimateur est couramment utilis dans la littrature pour valuer l impact de certaines poli- tiques publiques. L exercice empirique utilise des donnes de panel provenant du Current Population Survey sur le salaire des femmes dans les 50 tats des Etats-Unis d Amrique de 1979 1999. Des variables de pseudo-interventions publiques au niveau des tats sont gnres et on s attend ce que les tests arrivent la conclusion qu il n y a pas d eet de ces politiques placebos sur le salaire des femmes. Bertrand, Du o et Mullainathan (2004) montre que la non-prise en compte de l htrognit et de la dpendance temporelle entrane d importantes distorsions de niveau de test lorsqu'on value l'impact de politiques publiques en utilisant des donnes de panel. Une des solutions prconises est d utiliser la mthode de bootstrap. La mthode de double r-chantillonnage dveloppe dans cette thse permet de corriger le problme de niveau de test et donc d'valuer correctement l'impact des politiques publiques.
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Individual well-being is multidimensional and various aspects of the quality of life need to be jointly considered in its measurement. The axiomatic literature on the subject has proposed many indices of multidimensional poverty and deprivation and explored the properties that are at the basis of these measures. The purpose of this chapter is to add intertemporal considerations to the analysis of material deprivation. We employ the EU-SILC panel data set, which includes information on different aspects of well-being over time. EU countries are compared based on measures that take this additional intertemporal information into consideration. Journal of Economic Literature Classi cation No.: D63.
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Les toxines Cry sont des protines synthtises sous forme de cristaux par la bactrie bacille de Thuringe pendant la sporulation. Elles sont largement utilises comme agents de lutte biologique, car elles sont toxiques envers plusieurs espces dinvertbres, y compris les nmatodes. Les toxines Cry5B sont actives contre certaines espces de nmatodes parasites, y compris Ankylostoma ceylanicum un parasite qui infeste le systme gastro-intestinal des humains. Jusquau prsent, le mode daction des toxines Cry nmaticides reste grandement inconnu, sauf que leurs rcepteurs spcifiques sont des glycolipides et quelles causent des dommages importants aux cellules intestinales. Dans cette tude, on dmontre pour la premire fois que la toxine nmaticide Cry5Ba, membre de la famille des toxines trois domaines et produite par la bactrie bacille de Thuringe, forme des pores dans les bicouches lipidiques planes en absence de rcepteurs. Les pores forms par cette toxine sont de slectivit cationique, pH acide ou alcalin. Les conductances des pores forms sous conditions symtriques de 150 mM de KCl varient entre 17 et 330 pS, pH 6.0 et 9.0. Les niveaux des conductances les plus frquemment observs diffrent les uns des autres par environ 17 18 pS, ce qui est compatible avec lexistence darrangement dun nombre diffrent de pores lmentaires similaires, activs de faon synchronise, ou avec la prsence doligomres de tailles variables et de diffrents diamtres de pores.
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Le 1,1'-bi-2-naphtol ou Binol, prsentant une chiralit axiale, est un ligand trs utilis en catalyse asymtrique. Au cours des vingt dernires annes, le Binol a servi de synthon llaboration de trs nombreux ligands permettant la catalyse asymtrique de tous types de ractions, allant de lhydrognation, lalkylation, en passant par diverses ractions pricycliques. Le grand intrt pour ce ligand vient de sa versatilit et des nombreuses possibilits de fonctionnalisation quil offre, permettant daltrer ses proprits catalytiques volont, aussi bien en modifiant son caractre lectronique, quen introduisant des facteurs striques autour du site catalytique. Paralllement aux dveloppements de la catalyse par des drivs de Binol, le domaine des liquides ioniques a connu un intrt croissant ces dernires annes. Les liquides ioniques, sels dont le point de fusion est infrieur 100C, cumulent de nombreuses qualits convoites : faible pression de vapeur, stabilit thermique et chimique et fort pouvoir de solvatation. D ces proprits, les liquides ioniques ont principalement t tudis dans loptique de dvelopper une gamme de solvants recyclables. Alors que les proprits des liquides ioniques sont facilement modulables en fonction de lanion et du cation choisi, le concept de liquide ionique tche spcifique va plus loin et propose dintroduire directement, sur le cation ou lanion, un groupement confrant une proprit particulire. En suivant cette approche, plusieurs ligands ioniques ont t rapports, par simple couplage dun cation organique un ligand dj connu. tonnamment, le Binol a fait lobjet de trs peu de travaux pour llaboration de ligands ioniques. Dans cette thse, nous proposons ltude dune famille de composs de type Binol-imidazolium dont les units Binol et imidazolium sont spares par un espaceur mthylne. Diffrents homologues ont t synthtiss en variant le nombre dunits imidazolium et leur position sur le noyau Binol, la longueur de la chane alkyle porte par les units imidazolium et la nature du contre-anion. Aprs une tude des proprits thermiques de ces composs, lutilisation des Binol-imidazoliums en tant que ligands dans une raction asymtrique dthylation daldhydes aromatique a t tudie en milieu liquide ionique. La raction a t conduite en solvant liquide ionique dans le but de recycler aussi bien le ligand Binol-imidazolium que le solvant, en fin de raction. Cette tude nous a permis de dmontrer que la slectivit de ces ligands ioniques dpend grandement de leur structure. En effet, seuls les Binols fonctionnaliss en positions 6 et 6 permettent une slectivit de la raction dthylation. Alors que les drivs de Binol fonctionnaliss en positions 3 et 3 ne permettent pas une catalyse nantioslective, il a dj t rapport que ces composs avaient la capacit de complexer des anions. Dautre part, il a dj t rapport par notre groupe, que les composs comportant des units imidazolium pouvaient permettre le transport danions travers des bicouches lipidiques en fonction de leur amphiphilie. Ceci nous a amens la deuxime partie de cette thse qui porte sur les proprits ionophores des Binols fonctionnaliss en positions 3 et 3 par des units imidazoliums. Dans un premier temps, nous nous sommes intresss ltude de la relation structure-activit et au mcanisme de transport de ces composs. Le transport danions tant un processus cl dans la biologie cellulaire, lactivit biologique des composs prsentant une activit ionophore dans des systmes modles (liposomes) a t tudie par la suite. Lactivit antibactrienne des nos composs a t teste sur quatre souches de bactries. Il sest avr que les composs Binol-imidazolium sont actifs uniquement sur les bactries Gram positives. Finalement, la cytotoxicit des composs prsentant une activit antibactrienne a t tudie sur des cellules humaines.
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Les liquides ioniques connaissent depuis quelques dcennies un essor particulier en raison de leurs nombreuses proprits physico-chimiques intressantes, telles quune faible pression de vapeur saturante, une viscosit limite, une faible miscibilit avec la plupart des solvants communs, ou encore des proprits dagencement supramolculaire, qui en font des outils puissants dans de nombreux domaines de la chimie. Les sels dimidazolium reprsentent la plus grande famille de liquides ioniques ce jour. Leur modulabilit leur permet dtre drivs pour de nombreuses applications spcifiques, notamment en synthse organique, o ils sont utiliss majoritairement comme solvants, et plus rcemment comme catalyseurs. Les travaux prsents dans cette thse se concentrent sur leur utilisation en synthse organique, la fois comme solvants et principalement comme catalyseurs chiraux, catalyseurs pour lesquels lanion du sel est lespce catalytique, permettant dajouter de la flexibilit et de la mobilit au systme. En tirant parti de la tolrance des liquides ioniques envers la majorit des macromolcules naturelles, lobjectif principal des travaux prsents dans cette thse est le dveloppement dun nouveau type de catalyseur bio-hybride reposant sur lencapsulation dun sel dimidazolium dans une protine. Par le biais de la technologie biotine-avidine, linclusion supramolculaire de sels dimidazolium biotinyls portant des contre-anions catalytiques dans lavidine a t ralise et exploite en catalyse. Dans un premier temps, le dveloppement et ltude de deux sels de 1-butyl-3-mthylimidazolium possdant des anions chiraux drivs de la trans-4-hydroxy-L-proline sont rapports, ainsi que leur comportement dans des ractions nantioslectives daldol et daddition de Michael. Ces types de composs se sont rvls actifs et performants en milieu liquide ionique. Dans un second temps, la prparation de sels dimidazolium dont le cation est biotinyl et portant un contre-anion achiral, a t ralise. Le comportement de lavidine en milieu liquide ionique et son apport en termes de chiralit sur le systme bio-hybride ont t tudis. Les rsultats montrent le rle crucial des liquides ioniques sur la conformation de la protine et lefficacit du catalyseur pour des ractions daldol. Dans un dernier temps, linfluence de la structure du cation et de lanion sur le systme a t tudie. Diffrents espaceurs ont t introduits successivement dans les squelettes cationiques et anioniques des sels dimidazolium biotinyls. Dans le cas du cation, les rsultats ne rvlent aucune influence majeure sur lefficacit du catalyseur. La structure de lanion se montre cependant beaucoup plus importante : la prparation de diffrents catalyseurs bio-hybrides possdant des anions aux proprits physico-chimiques diffrentes a permis dobtenir de plus amples informations sur le mode de fonctionnement du systme bio-hybride et de la cooprativit entre lavidine et lanion du sel dimidazolium.La nature ionique de la liaison cation-anion offrant une libert de mouvement accrue lanion dans la protine, la tolrance diffrents substrats a galement t aborde aprs optimisation du systme.
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Le centromre est le site chromosomal o le kinetochore se forme, afin dassurer une sgrgation fidles des chromosomes et ainsi maintenir la plodie approprie lors de la mitose. Lidentit du centromere est hrite par un mcanisme pigntique impliquant une variante de lhistone H3 nomme centromere protein-A (CENP-A), qui remplace lhistone H3 au niveau de la chromatine du centromre. Des erreurs de propagation de la chromatine du centromre peuvent mener des problmes de sgrgation des chromosomes, pouvant entraner laneuplodie, un phnomne frquemment observ dans le cancer. De plus, une expression non-rgule de CENP-A a aussi t rapporte dans diffrentes tumeurs humaines. Ainsi, plusieurs tudes ont cherches lucider la structure et le rle de la chromatine contenant CENP-A dans des cellules en prolifration. Toutefois, la nature molculaire de CENP-A en tant que marqueur pigntique ainsi que ces dynamiques l'extrieur du cycle cellulaire demeurent des sujets dbat. Dans cette thse, une nouvelle mthode de comptage de molcules uniques l'aide de la microscopie rflexion totale interne de la fluorescence (TIRF) sera dcrite, puis exploite afin d'lucider la composition molculaire des nuclosomes contenant CENP-A, extraits de cellules en prolifration. Nous dmontrons que les nuclosomes contenant CENP-A marquent les centromres humains de faon pigntique travers le cycle cellulaire. De plus, nos donnes dmontrent que la forme prnuclosomale de CENP-A, en association avec la protine chaperon HJURP existe sous forme de monomre et de dimre, ce qui reflte une tape intermdiaire de l'assemblage de nuclosomes contenant CENP-A. Ensuite, des analyses quantitatives de centromres lors de diffrenciation myognique, et dans diffrents tissus adultes rvlent des changements globaux qui maintiennent la marque pigntique dans une forme inactive suite la diffrentiation terminale. Ces changements incluent une rduction du nombre de points focaux de CENP-A, un rarrangement des points dans le noyau, ainsi qu'une rduction importante de la quantit de CENP-A. De plus, nous dmontrons que lorsqu'une ddiffrenciation cellulaire est induite puis le cycle cellulaire r-entam, le phnotype "diffrenci" dcrit ci-haut est rcupr, et les centromres reprennent leur phnotype "prolifratif". En somme, cet oeuvre dcrit la composition structurale sous-jacente l'identit pigntique des centromres de cellules humaines lors du cycle cellulaire, et met en lumire le rle de CENP-A l'extrieur du cycle cellulaire.
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Le centromre est la rgion chromosomique o le kintochore s'assemble en mitose. Contrairement certaines caractristiques gniques, la squence centromrique n'est ni conserve entre les espces ni suffisante la fonction centromrique. Il est donc bien accept dans la littrature que le centromre est rgul pigntiquement par une variante de l'histone H3, CENP-A. KNL-2, aussi connu sous le nom de M18BP1, ainsi que ces partenaires Mis18 et Mis18 sont des protines essentielles pour l'incorporation de CENP-A nouvellement synthtis aux centromres. Des vidences exprimentales dmontrent que KNL-2, ayant un domaine de liaison l'ADN nomm Myb, est la protine la plus en amont pour l'incorporation de CENP-A aux centromres en phase G1. Par contre, sa fonction dans le processus d'incorporation de CENP-A aux centromres n'est pas bien comprise et ces partenaires de liaison ne sont pas tous connus. De nouveaux partenaires de liaison de KNL-2 ont t identifis par des expriences d'immunoprcipitation suivies d'une analyse en spectromtrie de masse. Un rle dans l'incorporation de CENP-A nouvellement synthtis aux centromres a t attribu MgcRacGAP, une des 60 protines identifies par l'essai. MgcRacGAP ainsi que les protines ECT-2 (GEF) et la petite GTPase Cdc42 ont t dmontres comme tant requises pour la stabilit de CENP-A incorpor aux centromres. Ces diffrentes observations ont men l'identification d'une troisime tape au niveau molculaire pour l'incorporation de CENP-A nouvellement synthtis en phase G1, celle de la stabilit de CENP-A nouvellement incorpor aux centromres. Cette tape est importante pour le maintien de l'identit centromrique chaque division cellulaire. Pour caractriser la fonction de KNL-2 lors de l'incorporation de CENP-A nouvellement synthtis aux centromres, une technique de microscopie haute rsolution couple une quantification d'image a t utilise. Les rsultats gnrs dmontrent que le recrutement de KNL-2 au centromre est rapide, environ 5 minutes aprs la sortie de la mitose. De plus, la structure du domaine Myb de KNL-2 provenant du nmatode C. elegans a t rsolue par RMN et celle-ci dmontre un motif hlice-tour-hlice, une structure connue pour les domaines de liaison l'ADN de la famille Myb. De plus, les domaines humain (HsMyb) et C. elegans (CeMyb) Myb lient l'ADN in vitro, mais aucune squence n'est reconnue spcifiquement par ces domaines. Cependant, il a t possible de dmontrer que ces deux domaines lient prfrentiellement la chromatine CENP-A-YFP comparativement la chromatine H2B-GFP par un essai modifi de SIMPull sous le microscope TIRF. Donc, le domaine Myb de KNL-2 est suffisant pour reconnatre de faon spcifique la chromatine centromrique. Finalement, l'lment reconnu par les domaines Myb in vitro a potentiellement t identifi. En effet, il a t dmontr que les domaines HsMyb et CeMyb lient l'ADN simple brin in vitro. De plus, les domaines HsMyb et CeMyb ne colocalisent pas avec CENP-A lorsqu'exprims dans les cellules HeLa, mais plutt avec les corps nuclaires PML, des structures nuclaires composes d'ARN. Donc, en liant potentiellement les transcrits centromriques, les domaines Myb de KNL-2 pourraient spcifier l'incorporation de CENP-A nouvellement synthtis uniquement aux rgions centromriques.
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La microscopie par fluorescence de cellules vivantes produit de grandes quantits de donnes. Ces donnes sont composes dune grande diversit au niveau de la forme des objets dintrts et possdent un ratio signaux/bruit trs bas. Pour concevoir un pipeline dalgorithmes efficaces en traitement dimage de microscopie par fluorescence, il est important davoir une segmentation robuste et fiable tant donn que celle-ci constitue ltape initiale du traitement dimage. Dans ce mmoire, je prsente MinSeg, un algorithme de segmentation dimage de microscopie par fluorescence qui fait peu dassomptions sur limage et utilise des proprits statistiques pour distinguer le signal par rapport au bruit. MinSeg ne fait pas dassomption sur la taille ou la forme des objets contenus dans limage. Par ce fait, il est donc applicable sur une grande varit dimages. Je prsente aussi une suite dalgorithmes pour la quantification de petits complexes dans des expriences de microscopie par fluorescence de molcules simples utilisant lalgorithme de segmentation MinSeg. Cette suite dalgorithmes a t utilise pour la quantification dune protine nomme CENP-A qui est une variante de lhistone H3. Par cette technique, nous avons trouv que CENP-A est principalement prsente sous forme de dimre.
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Pour analyser les images en tomodensitomtrie, une mthode stchiomtrique est g- nralement utilise. Une courbe relie les units Hounseld dune image la densit lectronique du milieu. La tomodensitomtrie double nergie permet dobtenir des informations supplmentaires sur ces images. Une mthode stchiomtrique a t d- veloppe pour permettre de dterminer les valeurs de densit lectronique et de numro atomique effectif partir dune paire dimages dun tomodensitomtre double nergie. Le but de cette recherche est de dvelopper une nouvelle mthode didentication de tissus en utilisant ces paramtres extraits en tomodensitomtrie double nergie. Cette nouvelle mthode est compare avec la mthode standard de tomodensitomtrie simple nergie. Par ailleurs, limpact dosimtrique de bien identier un tissu est dtermin. Des simulations Monte Carlo permettent dutiliser des fantmes numriques dont tous les paramtres sont connus. Les diffrents fantmes utiliss permettent dtalonner les mthodes stchiomtriques, de comparer la polyvalence et la robustesse des mthodes didentication de tissus double nergie et simple nergie, ainsi que de comparer les distributions de dose dans des fantmes uniformes de mmes densits, mais de compo- sitions diffrentes. La mthode utilisant la tomodensitomtrie double nergie fournit des valeurs de densi- ts lectroniques plus exactes, quelles que soient les conditions tudies. Cette mthode savre galement plus robuste aux variations de densit des tissus. Limpact dosim- trique dune bonne identication de tissus devient important pour des traitements aux nergies plus faibles, donc aux nergies dimagerie et de curiethrapie.
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La chromatine possde une plasticit complexe et essentielle pour rpondre diffrents mcanismes cellulaires fondamentaux tels la rplication, la transcription et la rparation de lADN. Les histones sont les constituants essentiels de la formation des nuclosomes qui assurent le bon fonctionnement cellulaire do lintrt de cette thse dy porter une attention particulire. Un dysfonctionnement de la chromatine est souvent associ lmergence du cancer. Le chapitre II de cette thse focalise sur la rpression transcriptionnelle des gnes dhistones par le complexe HIR (HIstone gene Repressor) en rponse au dommage l'ADN chez Saccharomyces cerevisiae. Lors de dommage lADN en dbut de phase S, les kinases du point de contrle Mec1, Tel1 et Rad53 sassurent de bloquer les origines tardives de rplication pour limiter le nombre de collisions potentiellement mutagniques ou cytotoxiques entre les ADN polymrases et les lsions persistantes dans l'ADN. Lorsque la synthse totale dADN est soudainement ralentie par le point de contrle, laccumulation d'un excs d'histones nouvellement synthtises est nfaste pour les cellules car les histones libres se lient de manire non-spcifique aux acides nucliques. L'un des mcanismes mis en place afin de minimiser la quantit dhistones libres consiste rprimer la transcription des gnes d'histones lors d'une chute rapide de la synthse d'ADN, mais les bases molculaires de ce mcanisme taient trs mal connues. Notre tude sur la rpression des gnes dhistones en rponse aux agents gnotoxiques nous a permis didentifier que les kinases du point de contrle jouent un rle dans la rpression des gnes dhistones. Avant le dbut de mon projet, il tait dj connu que le complexe HIR est requis pour la rpression des gnes dhistones en phase G1, G2/M et lors de dommage lADN en phase S. Par contre, la rgulation du complexe HIR en rponse au dommage l'ADN n'tait pas connue. Nous avons dmontr par des essais de spectromtrie de masse (SM) que Rad53 rgule le complexe HIR en phosphorylant directement une de ses sous-units, Hpc2, de multiples rsidus in vivo et in vitro. La phosphorylation dHpc2 est essentielle pour le recrutement aux promoteurs de gnes dhistones du complexe RSC (Remodels the Structure of Chromatin) dont la prsence sur les promoteurs des gnes d'histones corrle avec leur rpression. De plus, nous avons mis jour un nouveau mcanisme de rgulation du complexe HIR durant la progression normale travers le cycle cellulaire ainsi qu'en rponse aux agents gnotoxiques. En effet, durant le cycle cellulaire normal, la protine Hpc2 est trs instable durant la transition G1/S afin de permettre la transcription des gnes dhistones et la production d'un pool d'histones no-synthtises juste avant l'initiation de la rplication de lADN. Toutefois, Hpc2 n'est instable que pour une brve priode de temps durant la phase S. Ces rsultats suggrent qu'Hpc2 est une protine clef pour la rgulation de l'activit du complexe HIR et la rpression des gnes dhistones lors du cycle cellulaire normal ainsi qu'en rponse au dommage lADN. Dans le but de poursuivre notre tude sur la rgulation des histones, le chapitre III de ma thse concerne lanalyse globale de lactylation des histones induite par les inhibiteurs dhistone dsactylases (HDACi) dans les cellules normales et cancreuses. Les histones dsactylases (HDACs) sont les enzymes qui enlvent lactylation sur les lysines des histones. Dans plusieurs types de cancers, les HDACs contribuent loncogense par leur fusion aberrante avec des complexes protiques oncogniques. Les perturbations causes mnent souvent un tat silencieux anormal des suppresseurs de tumeurs. Les HDACs sont donc une cible de choix dans le traitement des cancers engendrs par ces protines de fusion. Notre tude de leffet sur lactylation des histones de deux inhibiteurs d'HDACs de relevance clinique, le vorinostat (SAHA) et lentinostat (MS-275), a permis de dmontrer une augmentation leve de lactylation globale des histones H3 et H4, contrairement H2A et H2B, et ce, autant chez les cellules normales que cancreuses. Notre quantification en SM de l'actylation des histones a rvl de faon inattendue que la stchiomtrie d'actylation sur la lysine 56 de lhistone H3 (H3K56Ac) est de seulement 0,03% et, de manire surprenante, cette stchiomtrie n'augmente pas dans des cellules traites avec diffrents HDACi. Plusieurs tudes de H3K56Ac chez lhumain prsentes dans la littrature ont rapport des rsultats irrconciliables. Qui plus est, H3K56Ac tait considr comme un biomarqueur potentiel dans le diagnostic et pronostic de plusieurs types de cancers. Cest pourquoi nous avons port notre attention sur la spcificit des anticorps utiliss et avons dtermin quune grande majorit danticorps utiliss dans la littrature reconnaissent dautres sites d'actylation de lhistone H3, notamment H3K9Ac dont la stchiomtrie d'actylation in vivo est beaucoup plus leve que celle d'H3K56Ac. De plus, le chapitre IV fait suite notre tude sur lactylation des histones et consiste en un rapport spcial de recherche dcrivant la fonction de H3K56Ac chez la levure et lhomme et comporte galement une valuation dun anticorps supposment spcifique d'H3K56Ac en tant qu'outil diagnostic du cancer chez lhumain.
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Les positions des vnements de recombinaison sagrgent ensemble, formant des hotspots dtermins en partie par la protine volution rapide PRDM9. En particulier, ces positions de hotspots sont dtermines par le domaine de doigts de zinc (ZnF) de PRDM9 qui reconnait certains motifs dADN. Les allles de PRDM9 contenant le ZnF de type k ont t pralablement associs avec une cohorte de patients affects par la leucmie aige lymphoblastique. Les allles de PRDM9 sont difficiles identifier partir de donnes de squenage de nouvelle gnration (NGS), en raison de leur nature rptitive. Dans ce projet, nous proposons une mthode permettant la caractrisation dallles de PRDM9 partir de donnes de NGS, qui identifie le nombre dallles contenant un type spcifique de ZnF. Cette mthode est base sur la corrlation entre les profils reprsentant le nombre de squences nuclotidiques uniques chaque ZnF retrouvs chez les lectures de NGS simules sans erreur dune paire dallles et chez les lectures dun chantillon. La validit des prdictions obtenues par notre mthode est confirme grce analyse base sur les simulations. Nous confirmons galement que la mthode peut correctement identifier le gnotype dallles de PRDM9 qui nont pas encore t identifis. Nous conduisons une analyse prliminaire identifiant le gnotype des allles de PRDM9 contenant un certain type de ZnF dans une cohorte de patients atteints de glioblastomes multiforme pdiatrique, un cancer du cerveau caractris par les mutations rcurrentes dans le gne codant pour lhistone H3, la cible de lactivit pigntique de PRDM9. Cette mthode ouvre la possibilit didentifier des associations entre certains allles de PRDM9 et dautres types de cancers pdiatriques, via lutilisation de bases de donnes de NGS de cellules tumorales.
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L'arthrose (OA) est une maladie articulaire dgnrative, classe comme la forme la plus frquente au monde. Elle est caractrise par la dgnrescence du cartilage articulaire, linflammation de la membrane synoviale, et le remodelage de los sous-chondral. Ces changements structurels et fonctionnels sont dues de nombreux facteurs. Les cytokines, les prostaglandines (PG), et les espces ractives de l'oxygne sont les principaux mdiateurs impliqus dans la pathophysiologie de l'OA. L'interleukine-1 (IL-1) est une cytokine pro-inflammatoire majeure qui joue un rle crucial dans l'OA. L'IL-1 induit l'expression de la cyclooxygnase-2 (COX-2), la microsomale prostaglandine E synthase-1 (mPGES-1), la synthase inductible de l'oxyde nitrique (iNOS), ainsi que leurs produits la prostaglandine E2 (PGE2) et l'oxyde nitrique (NO). Ce sont des mdiateurs essentiels de la rponse inflammatoire au cours de l'OA qui contribuent aux mcanismes des douleurs, de gonflement, et de destruction des tissus articulaires. Les modifications pigntiques jouent un rle trs important dans la rgulation de lexpression de ces gnes pro-inflammatoires. Parmi ces modifications, la mthylation/ dmthylation des histones joue un rle critique dans la rgulation des gnes. La mthylation/ dmthylation des histones est mdie par deux types d'enzymes: les histones mthyltransfrases (HMT) et les histones dmthylases (HDM) qui favorisent lactivation et/ou la rpression de la transcription. Il est donc ncessaire de comprendre les mcanismes molculaires qui contrlent lexpression des gnes de la COX-2, la mPGES-1, et liNOS. L'objectif de cette tude est de dterminer si la mthylation/dmthylation des histones contribute la rgulation de lexpression des gnes COX-2, mPGES-1, et iNOS dans des chondrocytes OA humains induits par l'IL-1. Nous avons montr que la mthylation de la lysine K4 de l'histone H3 (H3K4) par SET-1A contribue lactivation des gnes COX-2 et iNOS dans les chondrocytes humains OA induite par l'IL-1. Nous avons galement montr que la lysine K9 de lhistone H3 (H3K9) est dmthyle par LSD1, et que cette dmthylation contribue lexpression de la mPGES-1 induite par IL-1 dans les chondrocytes humains OA. Nous avons aussi trouv que les niveaux d'expression des enzymes SET-1A et LSD1 sont levs au niveau du cartilage OA. Nos rsultats montrent, pour la premire fois, l'implication de la mthylation/ dmthylation des histones dans la rgulation de lexpression des gnes COX-2, mPGES-1, et iNOS. Ces donnes suggrent que ces mcanismes pourraient tre une cible potentielle pour une intervention pharmacologique dans le traitement de la physiopathologie de l'OA.
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The present study on the preparation , characterization and microwave dielectric properties of AnBn-1O3n (N=5,6,8) type perovskite compounds. The explored ceramics show dielectric constant between 11 and 54,quality factor in the range 2400 to 88900 GHz and Tf in the range -73 to +231ppm/0C.Most of the investigated cation deficient hexagonal perovskites show intermediate dielectric constant with high quality factors. This study gives a general introduction about material, scientific and technological aspects of DRs.Three important ,r ,Q and Tf, used for the DR characterization are described. The relationship of the above parameters with the fundamental material characteristics is discussed. Different modes are excited when a DR is excited with suitable microwave spectrum of frequencies .A description of analytical determination of frequencies and construction of mode charts used for sample design and mode identification are also discussed. In this study several ceramics are developed for DR purposes, very little attention has been paid to grow the single crystals. It might be due to the fact that the difficulties and time involved in the growth of single crystals, big enough to function as microwave resonators make them expensive .However single crystals of these materials may have very high Q values. It is also possible that a better understanding of the dielectric properties in relation to the structure can be arrived using single crystals. Hence one of the future directions of dielectric resonator research should be to grow good quality single crystals of the above materials.
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Vacuum-ultraviolet (VUV) irradiation (kexc: 172 12 nm) of polystyrene films in the presence of oxygen produced not only oxidatively functionalized surfaces, but generated also morphological changes. Whereas OH- and C=O-functionalized surfaces might be used for e.g. secondary functionalization, enhanced aggregation or printing, processes leading to morphological changes open new possibilities of microstructurization. Series of experiments made under different experimental conditions brought evidence of two different reaction pathways: introduction of OH- and C=O-groups at the polystyrene pathways is mainly due to the reaction of reactive oxygen species (hydroxyl radicals, atomic oxygen, ozone) produced in the gas phase between the VUV-radiation source and the substrate. However, oxidative fragmentation leading to morphological changes, oxidation products of low molecular weight and eventually to mineralization of the organic substrate is initiated by electronic excitation of the polymer leading to CC-bond homolysis and to a complex oxidation manifold after trapping of the C-centred radicals by molecular oxygen. The pathways of oxidative functionalization or fragmentation could be differentiated by FTIR-ATR analysis of irradiated polystyrene surfaces before and after washing with acetonitrile and microscopic fluorescence analysis of the surfaces secondarily functionalized with the N,N,N-tridodecyl-triaza-triangulenium (TATA) cation. Ozonization of the polystyrene leads to oxidative functionalization of the polymer surface but cannot initiate the fragmentation of the polymer backbone. Oxidative fragmentation is initiated by electronic excitation of the polymer (contact-mode AFM analysis), and evidence of the generation of intermediate C-centred radicals is given e.g. by experiments in the absence of oxygen leading to cross-linking (solubility effects, optical microscopy, friction-mode AFM) and disproportionation (fluorescence).
Resumo:
In recent years considerable advances have been achieved in the study of the surface structure and mechanism of action of environmentally benign heterogeneous catalysts. The study entitled as surface properties and catalytic activity of manganese ferrospinels. In the present study we have prepared manganese ferrospinels of general formula Mn(1-x)BxFe2O4 via low temperature controlled co-precipation method. The study employed low temperature co-precipitation method for the preparation ofMn(1-x)BxFe2O4 specimens, where B is a metal cation such as Cr,Co, Ni,Cu and Zn. The catalytic activities of the systems were investigated for liquid-phase benzoylation of aromatic compounds and phenol hydroxylation and for vapour-phase reactions such as aniline alkylation, phenol methylation and ODH of ethylbenzene. The different series of manganese ferrites are proved to be excellent catalysts for various industrially important reactions such as Friedel-crafts benzoylation of aromatic compounds, methylation of aniline and phenol, hydroxylation of phenol and oxidative dehydrogenation of ethylbenzene. Due to the tightening of the environmental regulations, production of diphenols from phenol hydroxylation and reduction of phenolic pollutants in waste waters using these catalysts can be a promising approach because it demands only simple techniques and produce little environmental pollution.
