Tethered DNA scaffolds on optical sensor platforms for detection of hipO gene from Campylobacter jejuni

DNA biosensors have gained increased attention over traditional diagnostic methods due to their fast and responsive operation and cost-effective design. The specificity of DNA biosensors relies on single-stranded oligonucleotide probes immobilized to a transduction platform. Here, we report the development of biosensors to detect the hippuricase gene (hipO) from Campylobacter jejuni using direct covalent coupling of thiol- and biotin-labeled single-stranded DNA (ssDNA) on both surface plasmon resonance (SPR) and diffraction optics technology (DOT, dotLab) transduction platforms. This is the first known report of the dotLab to detect targeted DNA. Application of 6-mercapto-1-hexanol as a spacer thiol for SPR gold surface created a self-assembled monolayer that removed unbound ssDNA and minimized non-specific detection. The detection limit of SPR sensors was shown to be 2.5 nM DNA while dotLab sensors demonstrated a slightly decreased detection limit of 5.0 nM (0.005 μM). It was possible to reuse the SPR sensor due to the negligible changes in sensor sensitivity (∼9.7 × 10 -7 ΔRU) and minimal damage to immobilized probes following use, whereas dotLab sensors could not be reused. Results indicated feasibility of optical biosensors for rapid and sensitive detection of the hipO gene of Campylobacter jejuni using specific ssDNA as a probe. © 2011 Elsevier B.V.

An optimised electrochemical biosensor for the label-free detection of C-reactive protein in blood

C-reactive protein (CRP) is an acute phase protein whose levels are increased in many disorders. There exists, in particular, a great deal of interest in the correlation between blood serum levels and the severity of risk for cardiovascular disease. A sensitive, label-free, non-amplified and reusable electrochemical impedimetric biosensor for the detection of CRP in blood serum was developed herein based on controlled and coverage optimised antibody immobilization on standard polycrystalline gold electrodes. Charge transfer resistance changes were highly target specific, linear with log. CRP. concentration across a 0.5-50. nM range and associated with a limit of detection of 176. pM. Significantly, the detection limits are better than those of current CRP clinical methods and the assays are potentially cheap, relatively automated, reusable, multiplexed and highly portable. The generated interfaces were capable not only of comfortably quantifying CRP across a clinically relevant range of concentrations but also of doing this in whole blood serum with interfaces that were, subsequently, reusable. The importance of optimising receptor layer resistance in maximising assay sensitivity is also detailed. © 2012.

The effects of water molecules on the electronic and structural properties of peptide nanotubes

The self-assembly of short amino acid chains appears to be one of the most promising strategies for the fabrication of nanostructures. Their solubility in water and the possibility of chemical modification by targeting the amino or carboxyl terminus give peptide-based nanostructures several advantages over carbon nanotube nanostructures. However, because these systems are synthesized in aqueous solution, a deeper understanding is needed on the effects of water especially with respect to the electronic, structural and transport properties. In this work, the electronic properties of l-diphenylalanine nanotubes (FF-NTs) have been studied using the Self-Consistent Charge Density-Functional-based Tight-Binding method augmented with dispersion interaction. The presence of water molecules in the central hydrophilic channel and their interaction with the nanostructures are addressed. We demonstrate that the presence of water leads to significant changes in the electronic properties of these systems decreasing the band gap which can lead to an increase in the hopping probability and the conductivity. © the Owner Societies 2013.

Equivalente teleparalelo de algumas soluções da relatividade geral

Pós-graduação em Física - IFT

Portadores quentes: modelo browniano

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Caracterização e estudo do comportamento térmico dos adutos flunixina-meglumina e diclofenaco-meglumina

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Desenvolvimento de sensor biomimético para detecção de resíduos de pesticidas organofosforados e carbamatos em alimentos

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Espécies moleculares e supramoleculares de Pd(II) contendo ligantes N,S doadores: síntese e caracterização

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Ensaios sobre a contribuição do ar nos resultados da modelagem do modo transverso-elétrico do método magnetotelúrico

Apresentamos a solução numérica do modelo da falha infinita para o modo TE utilizando o método dos elementos finitos para investigar o efeito do ar na solução TE. A comparação de nossa solução para o campo elétrico normalizado com a solução de Weaver evidenciou uma discrepância esperada devido ao efeito do ar, que foi intencionalmente negligenciado por Weaver, com o intento de facilitar a solução do problema. O problema analítico, levando em conta a presença do ar, é substancialmente mais difícil. Uma solução do problema real, parcialmente analítica e parcialmente numérica, foi apresentada por Sampaio. Devido a uma discrepância inesperada entre a nossa solução por elementos finitos e a solução exata de Sampaio, recalculamos a sua solução. Iterando a parte numérica da solução de Sampaio até ordens mais altas pudemos verificar que esta apresenta comportamento divergente. Para examinar o efeito do ar na resistividade aparente, comparamos três perfis de resistividade aparente obtidos a partir de nossa solução por elementos finitos com os mesmos perfis obtidos pela solução de Weaver. A discrepância encontrada entre estas soluções foi muito pequena, situando-se na faixa de erro instrumental de campo.

Construção de genossensor amperométrico para diagnóstico da hepatite C baseado em monocamadas auto montadas e detecção não marcada

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Espécies moleculares e supramoleculares de 'PD'(II)' com ligantes mono, bi e polidentados : caracterização estrutural e atividades biológicas

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Espécies metalo-supramoleculares discretas polinucleares: sínteses e caracterização

Pós-graduação em Química - IQ

Comparing label free electrochemical impedimetric and capacitive biosensing architectures

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Melanin as an active layer in biosensors

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Disorder induced interface states and their influence on the AI/Ge nanowires Schottky devices

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)