Development of an operational substrate for ZapA, a metalloprotease secreted by the bacterium Proteus mirabilis

The protease ZapA, secreted by Proteus mirabilis, has been considered to be a virulence factor of this opportunistic bacterium. The control of its expression requires the use of an appropriate methodology, which until now has not been developed. The present study focused on the replacement of azocasein with fluorogenic substrates, and on the definition of enzyme specificity. Eight fluorogenic substrates were tested, and the peptide Abz-Ala-Phe-Arg-Ser-Ala-Ala-Gln-EDDnp was found to be the most convenient for use as an operational substrate for ZapA. A single peptide bond (Arg-Ser) was cleaved with a Km of 4.6 µM, a k cat of 1.73 s-1, and a catalytic efficiency of 376 (mM s)-1. Another good substrate for ZapA was peptide 6 (Abz-Arg-Pro-Pro-Gly-Phe-Ser-Pro-Phe-Arg-Gln-EDDnp) which was cleaved at a single bond (Phe-Ser) with a Km of 13.6 µM, a k cat of 3.96 s-1 and a catalytic efficiency of 291 (mM s)-1. The properties of the amino acids flanking the scissile bonds were also evaluated, and no clear requirement for the amino acid residue at P1 was found, although the enzyme seems to have a preference for a hydrophobic residue at P2.

Characterization of operational safety in offshore oil wells

The main concern of activities developed in oil and gas well construction is safety. But safety during the well construction process is not a trivial subject. Today risk evaluation approaches are based in static analyses of existent systems. In other words, those approaches do not allow a dynamic analysis that evaluates the risk for each alteration of the context. This paper proposes the use of Quantitative and Dynamic Risk Assessment (QDRA) to assess the degree of safety of each planned job. The QDRA can be understood as a safe job analysis approach, developed with the purpose of quantifying the safety degree in entire well construction and maintenance activities. The QDRA is intended to be used in the planning stages of well construction and maintenance, where the effects of hazard on job sequence are important unknowns. This paper also presents definitions of barrier, and barriers integrated set (BIS), and a modeling technique showing their relationships. (c) 2006 Elsevier B.V. All rights reserved.

Advances and Developments in Strategies to Improve Strains of Saccharomyces cerevisiae and Processes to Obtain the Lignocellulosic Ethanol-A Review

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Evaluation of Lubricating Oil Preparation Procedures for the Determination of Al, Ba, Mo, Si and V by High-Resolution Continuum Source FAAS

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Extração por fluido supercrítico de alguns inseticidas carbamatos em amostras de batata, com determinação por HPLC/fluorescência e confirmação por HPLC/espectrometria de massas

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Effects of oral environment stabilization procedures on Streptococcus mutans counts in pregnant women

O objetivo desta pesquisa foi determinar o efeito da adequação do meio bucal sobre a contagem de Streptococcus mutans em gestantes de alto risco à cárie, participantes de um programa de prevenção em uma instituição de ensino público, antes e após adequação do meio bucal. Amostras de saliva de 30 gestantes (18 a 43 anos) que procuraram atendimento na Clínica de Odontologia Preventiva da FOAr-UNESP foram coletadas antes e após procedimentos de adequação do meio bucal, e examinadas para observação e contagem das UFCs de S. mutans. Foi demonstrado que houve diminuição na quantidade das UFCs (p<0,0001) entre as amostras. em relação à faixa etária, 70,0% das gestantes tinham entre 18 e 30 anos de idade e 30,0% pertenciam à faixa etária de 31 a 43 anos. Dados relativos ao período da gestação revelaram que 73,4% estavam no 2º trimestre e 13,3% estavam igualitariamente no 1º e 3º trimestres. A adequação do meio bucal se mostrou eficaz na diminuição das UFCs de S. mutans presentes na saliva de gestantes de alto risco de cárie. Este procedimento é simples e extremamente efetivo, atendendo às necessidades de tratamento básico de gestantes que procuram atendimento odontológico no serviço público de saúde.

Orthogonal projections and bootstrap resampling procedures in the study of infraspecific variation

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Conhecimentos de professores sobre perda auditiva e suas atitudes frente á inclusão

OBJETIVOS: verificar os conhecimentos dos professores sobre a perda auditiva, suas opiniões sobre a educação de alunos com esse tipo de privação sensorial e também conhecer suas atitudes frente à proposta da inclusão. MÉTODOS: participaram desta pesquisa quatro grupos de professores do ensino fundamental, com e sem experiência com aluno com perda auditiva. Os instrumentos utilizados na coleta de dados foram a Escala Lickert de Atitudes Sociais em Relação à Inclusão (ELASI) e um questionário. Comparações entre os resultados de diferentes grupos, por meio de provas estatísticas apropriadas, foram feitas, sempre que a natureza dos dados o recomendava. RESULTADOS: os professores de 1ª a 4ª séries, com e sem experiência com alunos com perda auditiva, apresentaram respostas semelhantes com referência às atitudes sociais acerca da inclusão, tanto na dimensão ideológica quanto na operacional. Professores de 5ª a 8ª séries, com e sem experiência com alunos com perda auditiva, apresentaram respostas semelhantes nos itens ideológicos, porém divergiram nos itens operacionais. em relação aos conhecimentos, os grupos de professores com experiência não apresentaram conhecimentos diferenciados sobre aspectos relativos à perda auditiva, quando comparados com os grupos de professores sem experiência, e todos os grupos enfatizaram os aspectos comunicativos. CONCLUSÃO: a análise revela que os dados provenientes de diferentes instrumentos se complementam e sugerem que os professores são ideologicamente favoráveis à inclusão, entretanto, não têm conhecimentos suficientes para operacionalizar tal proposta.

Design of a simplified neuro-fuzzy system based on CMAC Architectures

This work presents the design of a fuzzy controller with simplified architecture that use an artificial neural network working as the aggregation operator for several active fuzzy rules. The simplified architecture of the fuzzy controller is used to minimize the time processing used in the closed loop system operation, the basic procedures of fuzzification are simplified to maximum while all the inference procedures are computed in a private way. As consequence, this simplified architecture allows a fast and easy configuration of the simplified fuzzy controller. The structuring of the fuzzy rules that define the control actions is previously computed using an artificial neural network based on CMAC Cerebellar Model Articulation Controller. The operational limits are standardized and all the control actions are previously calculated and stored in memory. For applications, results and conclusions several configurations of this fuzzy controller are considered.

Comparative procedures for the sample decomposition of rocks used in organic agriculture and the determination of Cu, Fe, Mn, and Zn by FAAS

The aim of this work was to develop an appropriate sample preparation procedure for the flame atomic absorption spectrometry determination of Cu, Fe, Mn, and, Zn in rocks used in organic agriculture as a source of macro- and micronutrients.Six different procedures were evaluated and are classified into three groups: (a) pressure digestion system with Teflon bombs, (b) conventional wet digestion in a digester heating block, and (c) closed microwave system with pressure and temperature control.Two standard reference materials and two commercial samples were analyzed. It was found that the closed microwave system required low reagent consumption, less time, and resulted in low contamination.