PENCALC: a program for penetrance estimation in autosomal dominant diseases

We present a computer program developed for estimating penetrance rates in autosomal dominant diseases by means of family kinship and phenotype information contained within the pedigrees. The program also determines the exact 95% credibility interval for the penetrance estimate. Both executable (PenCalc for Windows) and web versions (PenCalcWeb) of the software are available. The web version enables further calculations, such as heterozygosity probabilities and assessment of offspring risks for all individuals in the pedigrees. Both programs can be accessed and down-loaded freely at the home-page address http://www.ib.usp.br/~otto/software.htm.

Aptidão agrícola e algoritmos genéticos na organização espacial em projetos de reforma agrária

A definição das parcelas familiares em projetos de reforma agrária envolve questões técnicas e sociais. Essas questões estão associadas principalmente às diferentes aptidões agrícolas do solo nestes projetos. O objetivo deste trabalho foi apresentar método para realizar o processo de ordenamento territorial em assentamentos de reforma agrária empregando Algoritmo Genético (AG). O AG foi testado no Projeto de Assentamento Veredas, em Minas Gerais, e implementado com base no sistema de aptidão agrícola das terras.

Fatores de risco para nascimentos pré-termo em Londrina, Paraná, Brasil

Objetivou-se identificar fatores de risco para nascimentos pré-termo por meio de estudo caso-controle populacional que envolve nascidos vivos hospitalares de mães residentes em Londrina, Paraná, Brasil. Os casos foram os 328 nascimentos pré-termo e os controles, uma amostra proporcional de 369 nascimentos com 37 semanas ou mais. Realizou-se análise de regressão logística múltipla hierarquizada. Verificou-se associação (p < 0,05) para as variáveis: sócio-econômicas - moradia em favela e baixa idade do chefe familiar; características maternas: IMC < 19 e > 30kg/m², com filho anterior pré-termo, com tratamento para engravidar; características maternas durante a gestação: com companheiro há no máximo dois anos, preocupações, bebida alcoólica semanal, pré-natal inadequado, prática de caminhada como proteção; agravos na gestação - sangramento, infecção do trato genital, volume alterado do líquido amniótico, hipertensão arterial e internação; gestação múltipla. A identificação de fatores de risco e a melhoria da qualidade da atenção pré-concepcional e pré-natal podem reduzir a prematuridade.

Fatores associados à qualidade da dieta de adultos residentes na Região Metropolitana de São Paulo, Brasil, 2002

Objetivou-se avaliar os fatores demográficos, sócio-econômicos e de estilo de vida associados à qualidade da dieta de adultos residentes na Região Metropolitana de São Paulo, Brasil. Estudo transversal, por meio de inquérito domiciliar, de base populacional, foi realizado no Distrito do Butantã e nos municípios de Itapecerica da Serra, Embu e Taboão da Serra. Utilizaram-se dados de um questionário e um recordatório de 24 horas de 1.840 adultos de 20 anos ou mais, de ambos os sexos, incluídos em um inquérito de saúde (ISA-SP). A qualidade da dieta foi avaliada através do índice de qualidade da dieta (IQD) adaptado para a realidade local. Utilizou-se análise de regressão linear para avaliar a associação entre o IQD e as demais variáveis. A maioria da população (75%) apresentou dieta que necessita de melhora. Observaram-se médias baixas para os componentes: frutas, verduras e legumes, leite e derivados. Número de bens de consumo duráveis, escolaridade do chefe da família e ter 60 anos ou mais se associaram ao IQD em homens. Para as mulheres, a faixa etária se associou ao IQD. Em ambos os modelos, o consumo de calorias se manteve como variável de ajuste.

Determinantes do consumo de frutas e hortaliças em adolescentes por regressão quantílica

OBJETIVO: Analisar o consumo de frutas, legumes e verduras (FLV) de adolescentes e identificar fatores associados. MÉTODOS: Estudo transversal de base populacional com amostra representativa de 812 adolescentes de ambos os sexos de São Paulo, SP, em 2003. O consumo alimentar foi medido pelo recordatório alimentar de 24 horas. O consumo de FLV foi descrito em percentis e para investigar a associação entre a ingestão de FLV e variáveis explanatórias; foram utilizados modelos de regressão quantílica. RESULTADOS: Dos adolescentes entrevistados, 6,4% consumiram a recomendação mínima de 400 g/dia de FLV e 22% não consumiram nenhum tipo de FLV. Nos modelos de regressão quantílica, ajustados pelo consumo energético, faixa etária e sexo, a renda domiciliar per capita e a escolaridade do chefe de família associaram-se positivamente ao consumo de FLV, enquanto o hábito de fumar associou-se negativamente. Renda associou-se significativamente aos menores percentis de ingestão (p20 ao p55); tabagismo aos percentis intermediários (p45 ao p75) e escolaridade do chefe de família aos percentis finais de consumo de FLV (p70 ao p95). CONCLUSÕES: O consumo de FLV por adolescentes paulistanos mostrou-se abaixo das recomendações do Ministério da Saúde e é influenciado pela renda domiciliar per capita, pela escolaridade do chefe de família e pelo hábito de fumar.

Influência da mídia em universitárias brasileiras de diferentes regiões

A mídia tem impacto na satisfação com a imagem corporal e risco para o desenvolvimento de transtornos alimentares. OBJETIVO: Avaliar a influência da mídia em universitárias e possíveis associações com idade, estado nutricional, renda e escolaridade do chefe da família. MÉTODOS: 2.489 estudantes do sexo feminino das cinco regiões do Brasil responderam à Sociocultural Attitudes Towards Appearance Scale (SATAQ-3). O escore na SATAQ foi comparado entre as regiões por meio de uma análise de variância. Uma análise de covariância foi utilizada para verificar a influência das variáveis estudadas no escore da SATAQ. Uma regressão logística foi realizada para verificar a interferência conjunta das variáveis em relação à influência da mídia. RESULTADOS: Não foram encontradas diferenças regionais na SATAQ total (p = 0,164) e subescalas Internalização atlética (p = 0,293) e Pressão (p = 0,150); houve diferença para as subescalas Internalização geral (p = 0,010) e Informação (p = 0,002). Idade, estado nutricional e renda influenciaram o resultado. CONCLUSÕES: O escore total na SATAQ foi similar entre as regiões, mas o Sul e o Nordeste apresentaram maiores pontuações para subescalas Internalização geral e Informação respectivamente. Estudantes com menos de 25 anos, com excesso de peso e maior renda foram em média mais influenciadas pela mídia.

Fatores associados à qualidade da dieta de adultos, residentes na Região Metropolitana de São Paulo, Brasil, 2002

Objetivou-se avaliar os fatores demográficos, sócio-econômicos e de estilo de vida associados à qualidade da dieta de adultos residentes na Região Metropolitana de São Paulo, Brasil. Estudo transversal, por meio de inquérito domiciliar, de base populacional, foi realizado no Distrito do Butantã e nos municípios de Itapecerica da Serra, Embu e Taboão da Serra. Utilizaram-se dados de um questionário e um recordatório de 24 horas de 1.840 adultos de 20 anos ou mais, de ambos os sexos, incluídos em um inquérito de saúde (ISA-SP). A qualidade da dieta foi avaliada através do índice de qualidade da dieta (IQD) adaptado para a realidade local. Utilizou-se análise de regressão linear para avaliar a associação entre o IQD e as demais variáveis. A maioria da população (75%) apresentou dieta que necessita de melhora. Observaram-se médias baixas para os componentes: frutas, verduras e legumes, leite e derivados. Número de bens de consumo duráveis, escolaridade do chefe da família e ter 60 anos ou mais se associaram ao IQD em homens. Para as mulheres, a faixa etária se associou ao IQD. Em ambos os modelos, o consumo de calorias se manteve como variável de ajuste

Renda familiar, preço de alimentos e aquisição domiciliar de frutas e hortaliças no Brasil

OBJETIVO: Analisar a influência da renda familiar e do preço de alimentos sobre a participação de frutas e hortaliças dentre os alimentos adquiridos pelas famílias brasileiras. MÉTODOS: Foram utilizados dados da Pesquisa de Orçamentos Familiares realizada pelo Instituto Brasileiro de Geografia e Estatística, com amostra probabilística de 48.470 domicílios brasileiros entre 2002 e 2003. A participação de frutas e hortaliças no total de aquisições de alimentos foi expressa como percentual do total de calorias adquiridas e como calorias provenientes desses alimentos ajustadas para o total de calorias adquirido. Empregaram-se técnicas de análise de regressão múltipla para estimação de coeficientes de elasticidade, controlando-se variáveis sociodemográficas e preço dos demais alimentos. RESULTADOS: Observou-se aumento da participação de frutas e hortaliças no total de aquisições de alimentos com a diminuição de seu próprio preço ou com o aumento da renda. A diminuição do preço de frutas e hortaliças em 1 por cento aumentaria sua participação em 0,79 por cento do total calórico; o aumento de 1 por cento na renda familiar aumentaria essa participação no total calórico em 0,27 por cento. O efeito da renda tendeu a ser menor nos estratos de maior renda. CONCLUSÕES: A redução do preço de frutas e hortaliças, tanto pelo apoio à cadeia de produção dos alimentos quanto por medidas fiscais, é um promissor instrumento de política pública capaz de aumentar a participação desses alimentos na dieta brasileira

Vidas arriscadas: uma reflexão sobre a relação entre o número de gestações e mortalidade materna

Este estudo teve por objetivo identificar o risco e os fatores associados à mortalidade materna de multigestas (cinco ou mais gestações). Descreve a tendência da Taxa de Fecundidade Total (TFT) e da Razão de Mortalidade Materna (RMM) de 1998 a 2004 no Paraná. Apresenta uma análise dos 822 óbitos maternos deste período, o cálculo da Razão de Mortalidade Materna Específica, o Risco Relativo, a freqüência e o Odds Ratio para algumas variáveis segundo número de gestações. Analisa também as causas e a evitabilidade dos óbitos maternos. Os resultados apontaram TFT baixa (1,8 filhos por mulher) e a RMM elevada (69,7/100.000 nascidos vivos) no Paraná em 2004. Um quarto dos 822 óbitos maternos (206) era de multigestas (cinco ou mais gestações), o risco relativo de morte materna foi seis vezes superior do que para as mulheres com até duas gestações, e os perfis sociodemográfico e o reprodutivo foram mais desfavoráveis para aquele grupo de mulheres. A baixa escolaridade, a idade igual ou acima de 30 anos e o pré-natal com menos de quatro consultas apresentaram associação com o maior número de gestações. A proporção de mortes por causas obstétricas indiretas, hemorragias e aborto, foi maior entre as multigestas, e cerca de 90% dos óbitos deste grupo foi considerado evitável. Concluiu-se que o monitoramento das multigestas com idade avançada e em desvantagem social, bem como ações efetivas de planejamento familiar, e serviços obstétricos qualificados para gestação de alto risco são medidas que podem contribuir para a redução da mortalidade materna

COOP/WONCA Charts as a Screen for Mental Disorders in Primary Care

PURPOSE most people with mental disorders receive treatment in primary care. The charts developed by the Dartmouth Primary Care Cooperative Research Network (COOP) and the World Organization of National Colleges, Academies, and Academic Associations of General Practitioners/Family Physicians (WONCA) have not yet been evaluated as a screen for these disorders, using a structured psychiatric interview by an expert or considering diagnoses other than depression. We evaluated the validity and feasibility of the COOP/WONCA Charts as a mental disorders screen by comparing them both with other questionnaires previously validated and with the assessment of a mental health specialist using a structured diagnostic interview. METHODS We trained community health workers and nurse assistants working in a collaborative mental health care model to administer the COOP/WONCA Charts, the 20-item Self-Reporting Questionnaire (SRQ-20), and the World Health Organization Five Well-Being Index (WHO-5) to 120 primary care patients. A psychiatrist blinded to the patients' results on these questionnaires administered the SCID, or Structured Clinical Interview for the DSM-IV (Diagnostic and Statistical Manual of Mental Disorders, Fourth Edition). RESULTS The area under the receiver operating characteristic curve was at least 0.80 for single items, a 3-item combination, and the total score of the COOP/WONCA Charts, as well as for the SRQ-20 and the WHO-5, for screening both for all mental disorders and for depressive disorders. The accuracy, sensitivity, specificity, and positive and negative predictive values of these measures ranged between 0.77 and 0.92. Community health workers and nurse assistants rated the understandability, ease of use, and clinical relevance of all 3 questionnaires as satisfactory. CONCLUSIONS One-time assessment of patients with the COOP/WONCA Charts is a valid and feasible option for screening for mental disorders by primary care teams.

Colonization and risk factors for Brachyspira aalborgi and Brachyspira pilosicoli in humans and dogs on tea estates in Assam, India

The prevalence of colonization with the anaerobic intestinal spirochaetes Brachyspira aalborgi and Brachyspira pilosicoli was investigated in humans (n = 316) and dogs (n = 101) living on three tea estates in Assam, India. Colonization was detected using PCR on DNA from faeces. Nineteen (6%) human faecal samples contained B. aalborgi DNA, 80 (25.3%) contained B. pilosicoli DNA, and 10 (3.2%) contained DNA from both species. One canine sample contained DNA from B. pilosicoli. Significant factors for B. aalborgi colonization in logistic regression were: infection of family members with B. aalborgi (P < 0.001), being a resident of Balipara (P = 0.03), and use of water treatment (P = 0.03). For B. pilosicoli, significant factors were: other family members being positive for B. pilosicoli (P < 0.001), water obtained from a well (P = 0.006), water treatment (P = 0.03), and not having visited a doctor in the previous 12 months (P = 0.03).

Novel Heterozygous Nonsense GLI2 Mutations in Patients with Hypopituitarism and Ectopic Posterior Pituitary Lobe without Holoprosencephaly

Context: GLI2 is a transcription factor downstream in Sonic Hedgehog signaling, acting early in ventral forebrain and pituitary development. GLI2 mutations were reported in patients with holoprosencephaly (HPE) and pituitary abnormalities. Objective: The aim was to report three novel frameshift/nonsense GLI2 mutations and the phenotypic variability in the three families. Setting: The study was conducted at a university hospital. Patients and Methods: The GLI2 coding region of patients with isolated GH deficiency (IGHD) or combined pituitary hormone deficiency was amplified by PCR using intronic primers and sequenced. Results: Three novel heterozygous GLI2 mutations were identified: c. 2362_2368del p. L788fsX794 (family 1), c. 2081_2084del p. L694fsX722 (family 2), and c. 1138 G > T p. E380X (family 3). All predict a truncated protein with loss of the C-terminal activator domain. The index case of family 1 had polydactyly, hypoglycemia, and seizures, and GH, TSH, prolactin, ACTH, LH, and FSH deficiencies. Her mother and seven relatives harboring the same mutation had polydactyly, including two uncles with IGHD and one cousin with GH, TSH, LH, and FSH deficiencies. In family 2, a boy had cryptorchidism, cleft lip and palate, and GH deficiency. In family 3, a girl had hypoglycemia, seizures, excessive thirst and polyuria, and GH, ACTH, TSH, and antidiuretic hormone deficiencies. Magnetic resonance imaging of four patients with GLI2 mutations and hypopituitarism showed a hypoplastic anterior pituitary and an ectopic posterior pituitary lobe without HPE. Conclusion: We describe three novel heterozygous frameshift or nonsense GLI2 mutations, predicting truncated proteins lacking the activator domain, associated with IGHD or combined pituitary hormone deficiency and ectopic posterior pituitary lobe without HPE. These phenotypes support partial penetrance, variable polydactyly, midline facial defects, and pituitary hormone deficiencies, including diabetes insipidus, conferred by heterozygous frameshift or nonsense GLI2 mutations. (J Clin Endocrinol Metab 95: E384-E391, 2010)

How can and do Australian doctors promote physical activity?

Background. Physical inactivity is recognized as an important public health issue. Yet little is known about doctors' knowledge, attitude, skills, and resources specifically relating to the promotion of physical activity. Our survey assessed the current practice, perceived desirable practice, confidence, and barriers related to the promotion of physical activity in family practice, Methods. A questionnaire was developed and distributed to all 1,228 family practitioners in Perth, Western Australia. Results. We received a 71% response (n = 789). Family practitioners are most likely to recommend walking to sedentary adults to improve fitness and they are aware of the major barriers to patients participating in physical activity. Doctors are less confident at providing specific advice on exercise and may require further skills, knowledge, and experience, Although they promote exercise to patients through verbal advice in the consultation, few use written materials or referral systems, Conclusions. There are significant differences between self-reports of current practice and perceived desirable practice in the promotion of physical activity by doctors, Future strategies need to address the self-efficacy of family physicians and involve resources of proven effectiveness. The potential of referral systems for supporting efforts to increase physical activity by Australians should be explored. (C) 1997 Academic Press.

A new FOXL2 gene mutation in a woman with premature ovarian failure and sporadic blepharophimosis-ptosis-epicanthus inversus syndrome

Objective: To describe a new FOXL2 gene mutation in a woman with sporadic blepharophimosis-ptosis-epicanthus inversus syndrome (BPES) and hypergonadotropic hypogonadism. Design: Case report. Setting: University medical center. Patient(s): A 28-year-old woman. Intervention(s): Clinical evaluation, hormone assays, gene mutation research. Main Outcome Measure(s): FOXL2 gene mutation. Result(s): The patient with hypergonadotropic hypogonadism was diagnosed with BPES due to a new FOXL2 gene mutation. Conclusion(s): Blepharophimosis-ptosis-epicanthus inversus syndrome is a rare disorder associated with premature ovarian failure (POF). The syndrome is an autosomal dominant trait that causes eyelid malformations and POF in affected women. Mutations in FOXL2 gene, located in chromosome 3, are related to the development of BPES with POF (BPES type I) or without POF (BPES type II). This report demonstrates a previously undescribed de novo mutation in the FOXL2 gene-a thymidine deletion, c. 627delT (g. 864delT)-in a woman with a sporadic case of BPES and POF. This mutation leads to truncated protein production that is related to a BPES type I phenotype. This report shows the importance of family history and genetic analysis in the evaluation of patients with POF and corroborates the relationship between mutations on the FOXL2 gene and ovarian insufficiency. (Fertil Steril (R) 2010; 93: 1006.e3-e6. (C) 2010 by American Society for Reproductive Medicine.)

Familial neuromyelitis optica

Background: Detection of aquaporin-4-specific immunoglobulin G (IgG) has expanded the spectrum of neuromyelitis optica (NMO). Rare reports of familial aggregation have suggested a component of genetic susceptibility but these reports mostly antedated the discovery of the NMO-IgG biomarker and recently updated diagnostic criteria. Methods: We report a case series describing the demographic, clinical, neuroimaging, and NMO-IgG serologic status of 12 multiplex NMO pedigrees with a total of 25 affected individuals. Results: Twenty-one patients (84%) were women. Families were Asian (n = 5), Latino (n = 4), white (n = 1), or African (n = 2). Apparent transmission was either maternal (n = 5) or paternal (n = 2). In 1 family, 3 individuals had NMO; in the others, 2 individuals were affected. Sibling pairs (n = 6), parent-child (n = 4), and aunt-niece (n = 3) pairs were observed. Nineteen patients (76%) were NMO-IgG positive. Twelve (48%) had clinical or serologic evidence of another autoimmune disease. Familial occurrence of NMO occurs in approximately 3% of patients with well-established diagnosis of NMO. Conclusions: A small proportion of patients with NMO have relatives with this condition, but familial occurrence is more common than would be expected from its frequency in the general population. Familial NMO is indistinguishable from sporadic NMO based on clinical symptoms, age at onset, sex distribution, and frequency of NMO-IgG detection. One or 2 generations were affected and affected individuals represented a small fraction of family members. Taken together, these data suggest complex genetic susceptibility in NMO. Neurology (R) 2010;75:310-315