Impact of the IL-18 gene polymorphism in response to antiviral therapy in chronic HCV genotype 4 patients

^a Introduction Interleukin (IL)-18 is a well-known major proinflammatory cytokine with broad biological effects. The major immunomodulatory functions of IL-18 include enhancing T cell and natural killer cell cytotoxicity. Serum levels of this cytokine were shown to increase in chronic hepatitis C patients compared to non-infected healthy people. An association between IL-18 gene promoter polymorphisms and pegylated interferon (PEG-IFN) and ribavirin treatment outcomes has been reported for individuals with chronic hepatitis C virus genotype 1 (HCV-1). In this study, HCV genotype 4 (HCV-4) patients were assessed for IL-18 gene polymorphisms and treatment outcomes or severity of liver disease because data concerning the impact of IL-18 gene polymorphisms on patients with HCV-4 infections are limited. Methods This study included 123 chronic HCV-4 Egyptian patients and 123 apparently healthy volunteer blood donors who served as a control group. HCV genotyping was performed using the line probe assay. IL-18 genotyping was performed using the TaqMan Real-Time PCR method in all 246 patient and control samples. Results In our study, all patients had HCV-4. IL-18 gene single nucleotide polymorphism (SNP) (-607C/A) genotype distributions and allele frequencies did not differ between HCV patients and normal healthy subjects or between patient groups when compared according to the therapeutic response. Moreover, the presence of an IL-18 SNP was not associated with histological disease severity. We conclude that the presence of the IL-18 SNP rs1946518 does not affect the outcome of chronic HCV-4 treatment in Egyptian patients. Conclusions The IL-18 SNP rs1946518 does not affect response to treatment in chronic HCV-4 patients.

Implementation of a zebrafish health program in a research facility : A 4-year retrospective study

In the past two decades, zebrafish (Danio rerio)-based research has contributed to significant scientific advances. Still, husbandry and health programs did not evolve at the same pace, as evidenced by the absence of general guidelines. Health monitoring is essential to animal welfare, to permit animal exchanges across facilities, to contribute to robust experimental results, and for data reproducibility. In this study, we report a health program implemented in a zebrafish research facility to prevent, monitor, and control pathogen, and disease dissemination. This program includes quarantine, routine health screening of sentinels, and nonroutine screenings of retired animals and sick/moribund individuals. An extensive list of clinical signs, lesions, and pathogens was monitored based on: daily observation of fish, necropsy, histology, and bacterial culture. The results indicate that the combined analysis of sentinels with the evaluation of sick/moribund animals enables a comprehensive description not only of pathogen prevalence but also of clinical and histopathologic lesions of resident animals. The establishment of a quarantine program revealed to be effective in the reduction of Pseudoloma neurophilia frequency in the main aquaria room. Finally, characterization of the colony health status based on this multiapproach program shows a low prevalence of lesions and pathogens in the facility.

Natural transovarial transmission of dengue virus 4 in Aedes aegypti from Cuiabá, State of Mato Grosso, Brazil

INTRODUCTION: Dengue is the most prevalent arboviral disease in tropical areas. In Mato Grosso, outbreaks are reported every year, but studies on dengue in this state are scarce. METHODS: Natural transovarial infection of Aedes aegypti by a flavivirus was investigated in the Jardim Industriário neighborhood of Cuiabá, Mato Grosso. Eggs were collected with ovitraps during the dry, intermediate, and rainy seasons of 2012. After the eggs hatched and the larvae developed to adulthood, mosquitoes (n = 758) were identified and allocated to pools of 1-10 specimens according to the collection location, sex, and climatic period. After RNA extraction, multiplex semi-nested RT-PCR was performed to detect the four dengue virus (DENV) serotypes, yellow fever virus, West Nile virus and Saint Louis encephalitis virus. RESULTS: DENV-4 was the only flavivirus detected, and it was found in 8/50 pools (16.0%). Three of the positive pools contained females, and five contained males. Their nucleotide sequences presented 96-100% similarity with DENV-4 genotype II strains from Manaus, Amazonas. The minimum infection rate was 10.5 per 1000 specimens, and the maximum likelihood estimator of the infection rate was 11.6 (95% confidence interval: 4.8; 23.3). CONCLUSIONS: This study provides the first evidence of natural transovarial infection by DENV-4 in Ae. Aegypti in Mato Grosso, suggesting that this type of infection might serve as a mechanism of virus maintenance during interepidemic periods in Cuiabá, a city where dengue epidemics are reported every year. These results emphasize the need for efficient vector population control measures to prevent arbovirus outbreaks in the state.

Preoperative serum levels of ca 72-4, cea, ca 19-9, and Alpha-fetoprotein in patients with gastric cancer

INTRODUCTION: The clinical importance of preoperative serum levels of CA 72-4, carcinoembryonic antigen (CEA), CA 19-9, and alpha-fetoprotein (AFP) was prospectively evaluated in 44 patients with gastric cancer. METHOD: The serum tumor marker levels were determined by commercial radioimmunoassay kits. Positivity for CA 72-4 (>4 U/mL), CEA (>5 ng/mL), CA 19-9 (>37 U/mL), and AFP (>10 ng/mL) were correlated according to the stage, histology, and lymph node metastasis. RESULTS AND DISCUSSION: CA 72-4 showed a higher positivity rate for gastric cancer (47.7%) than CEA (25%), CA 19-9 (25%), and AFP (0%). The combination of CA 72-4 with CEA and CA 19-9 increased the sensitivity to 61.4%. The positivity rates of CA 72-4 in patients at stages I and II (initial disease) and in patients at stages III and IV (advanced disease) were 9% and 60.6%, respectively (P < 0.005). No correlation was found between CEA and CA 19-9 levels and the stage of gastric cancer. There was a tendency of positivity for CA 72-4 to suggest lymph node involvement, but it was not significant (P = 0.075). Serum levels of tumor markers did not show a correlation with the histological types of gastric cancer. CONCLUSION: Preoperative serum levels of CA 72-4 provided a predictive value in indicating advanced gastric cancer.

Diffuse panbronchiolitis: an underdiagnosed disease? Study of 4 cases in Brazil

BACKGROUND: Diffuse panbronchiolitis is a clinical pathologic condition characterized by chronic inflammation of respiratory bronchioles, with clinical features that position it as a differential diagnosis among the sinopulmonary syndromes. METHODS AND RESULTS: We present 4 cases (1 Black, 2 Japanese descendants, and 1 Japanese), living in Brazil, in which the diagnosis was made by the clinical and radiological features and confirmed by transbronchial biopsy. The clinical findings included chronic sinusitis, productive cough, rhonchi, and wheezes. The pulmonary function tests showed an obstructive pattern. High resolution computerized tomography showed a diffuse nodular pattern, airway ectasia, and airway wall thickening. The biopsy showed interstitial accumulation of foam cells and lymphoid cells in the walls of respiratory bronchioles: 2 of our cases had bronchus-associated lymphoid tissue hyperplasia. We searched for the HLA Bw54 in all of our patients, but only 1 was positive. A low dose macrolide treatment was introduced, resulting in with clinical and functional improvement. A score that rated the extent of nodules, airway ectasia, mucus plugging, and airway wall thickening was applied on pre- and post-treatment High resolution computerized tomography results, revealing an improvement in tomographic pattern related to that observed in the pulmonary function tests. CONCLUSION: We conclude that diffuse panbronchiolitis is a systemic disease that is not exclusive to the Asian population, whose clinical and radiological features should be better known by occidental pulmonary physicians.

Aplicação do modelo HDM-4 na previsão do IRI para pavimentos rodoviários da rede nacional

Os modelos de previsão da degradação dos pavimentos são um elemento-chave para os sistemas de gestão dos pavimentos sendo utilizados para prever a evolução das suas condições de circulação. O presente trabalho tem como objetivo estabelecer um modelo de previsão da evolução do indice de irregularidade longitudinal (IRI), principal indicador da qualidade funcional de um pavimento. Para tal, foram utilizados dados da base de dados da empresa Infraestrutruras de Portugal (IP). Esta mantém um programa de monitorização da rede com o objetivo de controlar a qualidade de serviço e gerir de forma consciente os recursos disponíveis. O modelo HDM-4 foi implementado em código do programa Matlab com o objetivo de apoiar este estudo. Primeiro, procedeu-se à avaliação da forma com que os parâmetros do modelo HDM-4 atuam sobre o valor do IRI no modelo HDM-4. Posteriormente, procurou-se ajustar os resultados obtidos efetuando calibrações, com o intuito de minimizar o erro entre os valores calculados e os valores medidos pela IP. Concluiu-se que é possível estabelecer modelos com base no modelo HDM-4, em pavimentos flexíveis, ajustados à rede rodoviária nacional. No entanto, para serem incluidos fatores que deveriam ser contabilizados no modelo, deverão ser realizadas algumas alterações na base de dados a utilizar.

DESENVOLVIMENTO DE ÁRVORES NATIVAS EM ENSAIOS DE ESPÉCIES. 4. CASTANHA-DO-BRASIL (Bertholletia excelsa Η. B. K.), DEZ ANOS APÓS O PLANTIO

Três parcelas experimentais de Bertholletia excelsa (Castanha-do- Brasil) foram implantadas na Estação Experimental de Silvicultura Tropical do INPA/Manaus, em 1980, com o objetivo de obter dados sobre o crescimento da espécie com fins de produção de madeira e frutos. O sistema de plantio adotado foi em plena abertura, sobre Latossolo vermelho-amarelo, no espaçamento de 3,0 x 3,0 m. Foram observados, aos 10 anos, os seguintes resultados, diâmetro médio (DAP) de 13,9 cm e a altura total média de 15,41 m; os valores máximos de diâmetros e alturas encontrados foram de 21,7 cm e 23,0 m. respectivamente; a área basal média por hectare foi de 11,7098 nr. correspondendo a um volume médio de 117391 m3/ha; a espécie apresentou ótima desrama natural, boa adaptação ao Latossolo vermelho - amarelo, 69,44% de sobrevivência média, boa forma de fuste, não tendo sido verificadas doenças ou pragas.

DETERMINAÇÃO DO CICLO REPRODUTIVO DA CUTIA (Dasypwcta prymnolopha) ATRAVÉS DO DIAGNÓSTICO COLPOCITOLÓGICO

Foram realizadas análises colpocitológicas das diferentes fases do ciclo estral em 20 fêmeas adultas de cutias (Dasyprocta prymnolopha), assim como a determinação da duração da gestação em outros seis animais. As cutias foram mantidas em regime de cativeiro, nas condições climatológicas encontradas no trópico úmido da Amazônia. Os animais apresentaram reprodução do tipo poliestral continua, portanto não foi observada estação reprodutiva. A duração média dos ciclos estrais de 30,69 ± 4,65 dias e período médio de gestação de 104,33 + 0,57 dias. Com relação ao estudo da citologia esfoliativa, notou-se que no proestro houve frequência maior de células superficiais anucleadas, intermediárias e parabasals; no estro observou-se em número elevado, as células superficiais (anucleadas e nucleadas) e ausência de leucócitos; na fase de metaestro houve aumento de células intermediárias e leucócitos; no diestro, as células parabasals foram observadas em número maior de vezes.

BIOLOGIA DE Conotrachelus humeropictus, FIEDLER, 1940 (COLEOPTERA: CURCULIONIDAE), PRAGA DO CACAUEIRO E DO CUPUAÇUZEIRO NA AMAZÔNIA BRASILEIRA.

Foram determinados diversos parâmetros da biologia de Conotrachelus hutneropictus Fiedler, importante praga do cacaueiro, Theobroma cacao L. e do cupuaçuzeiro, T. grandiflorum (Will, ex Spreng.) Schum na Amazônia brasileira. A pesquisa foi realizada em laboratório, com fotofase natural de 12 horas, sob condições controladas de temperatura (27 ± 2eC) e umidade relativa (80 ± 10%). C. hutneropictus alimentado com folhas novas e frutos novos de cacueiros, apresentou em média, um ciclo de ovo a emergência do adulto do solo de 79 a 151 dias e em média, 108,80 ± 9,44 dias (Χ ±Εχ95) para machos e 156,87 ±16,19 dias para fêmeas. O período de pré-oviposição foi de 16,20 ± 0,49 dias. O periodo de oviposição foi de 80,50 ± 5,58 dias, colocando cada fêmea, de 55 a 153 ovos, em média 108,45 ± 6,21 ovos, sendo as posturas diárias e constituídas em média por 1,29 ± 0,03 ovos. No interior dos frutos de cacau, o inseto necessitou de 4,73 ± 0,06 dias e 26,64 ±0,17 dias, para o desenvolvimento embrionário e larval, respectivamente. Após esse período, um total de 20,25 ± 1,50 dias se passaram no solo, para o desenvolvimento das fases de pré-pupa (6,07 ± 0,06 dias), pupa (9,62 ±0,10 dias) e completa formação fisiológica do adulto (4,56 ±0,11 dias). Neste interim, C. humeropictus torna-se mais vulnerável ao ataque de seus inimigos naturais, principalmente fungos, dentre os quais Metarhiziutn anisopliae (Metsch.) Sorok. e Beauveria bassiana (Bals.) Vuill., únicos inimigos constatados para a espécie no decorrer da pesquisa.

EFEITO RESIDUAL DE CALAGEM Ε MICRONUTRIENTES EM LATOSSOLO AMARELO SOB ROTAÇÃO DE CULTURAS.

O ensaio de campo foi conduzido por um período de três anos, num Latossolo Amarelo da Amazônia Central cultivado com soja (1985), arroz (1986), caupi (1987) e caupi (1988), em rotação, visando estudar o efeito residual da calagem e interação com micronutrientes. Os tratamentos foram 0,2,3 e 5 t/h de calcário calcítico e 2,3 e 5 t/ha de calcário calcítico + micronutrientes (5 kg/ha Cu; 7,5 kg/ha Mn; 0,5 kg/ha Mo; 4,5 kg/ha Zn; 2,0 kg/ha B). Não houve acréscimo significativo na produção de soja e arroz com doses crescentes de calcário: soja variou de 260 a 732 kg/ha e arroz de 557 a 919 kg/ha. No entanto, com calcário + micronutrientes foram obtidos aumentos significativos de produção com relação aos tratamentos só com calagem e à testemunha: soja variou de 1986 a 2357 kg/ha e arroz de 1471 a 2133 kg/ ha. No terceiro ano (caupi) ainda houve uma pequena resposta à aplicação de micronutrientes, enquanto que no quarto ano de cultivo a produção do caupi foi bem menor que a do ano anterior e não houve r-esposta aos tratamentos estudados. A análise do solo nos dois primeiros anos de cultivo mostrou que a maioria dos micronutrientes analisados encontravam-se acima dos níveis críticos; somente o Cu e o Mn apresentaram baixos teores, principalmente nos tratamentos só com calagem. As produções dos dois primeiros cultivos apresentaram alta correlação positiva com os teores de Cu e Mn no solo. Ε possível que nos dois primeiros cultivos a calagem tenha induzido deficiências de Cu e Mn nos tratamentos sem micronutrientes.

SELEÇÃO DE CARACTERES CORRELACIONADOS EM CUBIU (Solatium sessiliflorum Dunal) EMPREGANDO A ANÁLISE DE TRILHA

Vinte e nove populações naturais de cubiu (Solatium sessiliflorum Dunal) da coleção do Programa de Melhoramento Genético de Hortaliças do Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia-INPA, foram avaliadas na região Nordeste do Brasil. O experimento foi conduzido na Estação Experimental da Empresa Pernambucana de Pesquisa Agropecuária-IPA, em Vitória de Santo Antão, Estado de Pernambuco. Adotou-se o delineamento experimental em blocos casualizados com 4 repetições. A unidade experimental foi constituída de uma área de 7,5m2 contendo 5 plantas úteis. Coletaram-se dados referentes ao diâmetro do caule (DC), altura da planta (AP), área da folha (AF), largura do fruto (LF), comprimento do fruto (CF), número de lóculos (NL), espessura da polpa (EP),número total médio de frutos por planta (NMF), peso médio dos frutos (PMF), peso total de frutos (PEF) e teor de sólidos solúveis totais (BRIX). Empregou-se a Analise de Trilha para desdobrar os coeficientes de correlação genotíptea, e observar a inlfuência dos efeitos destes caracteres, na produção de frutos de cubiu. Verificou-se que o maior número de associações positiva e significativa entre os pares de caracteres avaliados ocorreu com a espessura da polpa (EP). A Análise de Trilha desenvolvida sobre os dez caracteres, mostrou que o número total médio de frutos por planta (NMF) e a espessura da polpa (EP) foram os caracteres que mais influenciaram direta e positivamente sobre a produção estimada de frutos de cubiu.

SOLOS GERADOS A PARTIR DO INTEMPERISMO DE CROSTAS LATERÍTICAS SÍLICO-FERRUGINOSAS

A porção superior de dois perfis lateriticos localizados nos balneáreos de Outeiro e Mosqueiro, no município de Belém (Pará-Brasil), é constituída pela crosta sílico-ferruginosa e seus fragmentos de crosta, com material areno-argiloso sobreposto formando o solo. A estrutura colunar preservada, o grau de arredondamento crescente dos fragmentos e a composição mineralógica e química demonstram que há uma passagem gradacional entre a crosta, fragmentos e o solo dos dois perfis. Assim, é possível considerar o solo desses perfis como derivado do intemperismo da crosta laterítica subjacente em condições predominantemente úmidas, superimpostas ao processo laterítico que se desenvolveu na Amazônia ate então.

AS ESPÉCIES DE ELMOHARDYIA RAFAEL (DIPTERA, PIPUNCULIDAE, EUDORYLINI) DA AMAZÔNIA BRASILEIRA

Vinte e duas espécies de Elmohardyia Rafael são assinaladas para a Amazônia brasileira, incluindo um registro novo c onze espécies novas: E. amazona (Hardy); Ε. aquinoi sp.n; Ε. argyrogaster (Rafael); Ε. carrerai (Hardy); E. concava sp.n.; E. conckulata (Menezes & Rafael); E. echinata sp.n.; E. hispida sp.n.; E. immaculate sp.n.; E. lanei lanei (Hardy); Ε. manaos (Menezes & Rafael); Ε. oriximinaensis sp.n.; E. papaveroi (Rafael); E. parva sp.n.: £. praecipua (Rafael & Rosa); E. replicata (Hardy); E. roraimensis (Rafael & Rosa); E. rosalyae sp.n; E. subtilis sp.n.; E. tricuspis sp.n.; E. trinidadensis (Hardy) e E. valida sp.n. Uma chave para identificação das espécies da Amazônia brasileira é apresentada e novos dados sobre registros geográficos são fornecidos.

Avaliação de técnicas de segmentação e classificação automática de imagens landsat-tm no mapeamento do uso do solo na Amazônia1

O mapeamento do uso da terra é fundamental para o entendimento dos processos de mudanças globais, especialmente em regiões como a Amazônia que estão sofrendo grande pressão de desenvolvimento. Tradicionalmente estes mapeamentos têm sido feitos utilizando técnicas de interpretação visual de imagens de satélites, que, embora de resultados satisfatórios, demandam muito tempo e alto custo. Neste trabalho é proposta uma técnica de segmentação da imagens com base em um algoritmo de crescimento de regiões, seguida de uma classificação não-supervisionada por regiões. Desta forma, a classificação temática se refere a um conjunto de elementos (pixels da imagem), beneficiando-se portanto da informação contextual e minimizando as limitações das técnicas de processamento digital baseadas em análise pontual (pixel-a-pixel). Esta técnica foi avaliada numa área típica da Amazônia, situada ao norte de Manaus, AM, utilizando imagens do sensor "Thematic Mapper" - TM do satélite Landsat, tanto na sua forma original quanto decomposta em elementos puros como vegetação verde, vegetação seca (madeira), sombra e solo, aqui denominada imagem misturas. Os resultados foram validados por um mapa de referência gerado a partir de técnicas consagradas de interpretação visual, com verificação de campo, e indicaram que a classificação automática é viável para o mapeamento de uso da terra na Amazônia. Testes estatísticos indicaram que houve concordância significativa entre as classificações automáticas digitais e o mapa de referência (em tomo de 95% de confiança).