Paratuberculosis in a dairy Gyr herd in the State of Paraíba, Brazil

This paper describes the clinical, pathological, and microbiologic aspects of paratuberculosis (Johne's disease) in a dairy Gyr herd in the State of Paraíba, northeastern Brazil. An eight years old cow with chronic unresponsive diarrhea was clinically examined and euthanized for pathological evaluation. Fecal samples from all 160 animals over 12 months of age from the herd were collected for isolation of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis. Clinically, the index case cow was severely dehydrated, cachectic, with profuse mucous diarrhea. The main post-mortem findings were emaciation and thickened intestinal wall. Microscopically, the intestinal lamina propria and submucosa were infiltrated by macrophages, epithelioid cells, and Langhans giant cells with numerous alcohol-acid resistant bacilli in the cytoplasm. Two fecal samples displayed growth in slants of Herrold's egg-yolk agar supplemented with mycobactin J, 150 days after incubation. No growth was noticed in slants without mycobactin J. Microscopic examination of the isolated microorganisms stained by Ziehl-Neelsen revealed considerable amounts of alcohol-acid resistant bacilli, morphologically compatible with Mycobacterium spp. Based on the clinical signs, gross and histological lesions, growth time, bacterial morphology in Ziehl-Neelsen staining, and dependence of mycobactin J, the first diagnosis of paratuberculosis in Zebu cattle was made.

Interstitial nephritis of slaughtered pigs in the State of Mato Grosso, Brazil

This study evaluated histological lesions in kidney samples from pigs with nephritis in two slaughterhouses in the State of Mato Grosso, Brazil. Four hundred samples were subjected to histology, anti-porcine circovirus type 2 (PCV2) immunohistochemistry (IHC), anti-Leptospira sp. immunofluorescence (IF), and polymerase chain reaction (PCR) for PCV2, porcine parvovirus (PPV), and Torque teno virus type 1 and 2 (TTV1, TTV2) detection. Histological lesions were found in 81% of the samples, and mononuclear interstitial nephritis was the most frequent lesion (77.50%). A follicular pattern was observed in 40.97% of the interstitial nephritis lesions. PCV2, PPV, TTV1, and TTV2 were identified in the kidneys by PCR in 27.25%, 28.50%, 94%, and 87.5% of the samples, respectively. Leptospira sp. was not detected through IF. Infection by PCV2 (PCR) and the presence of histological lesions (P=0.008) and giant cells (P=0.0016) were significantly associated. An association was observed between the TTV2-TTV1 co-infection (P<0.0001) and the risk for pathogenesis. These findings indicated that PCV2, PPV, TTV1, and TTV2 were widely distributed among pigs in the local farms and that the presence of these agents should be considered in the differential diagnosis of kidneys with interstitial nephritis in pigs.

Primary bone neoplasms in dogs: 90 cases

A retrospective study of necropsy and biopsy cases of 90 primary bone tumors (89 malignant and one benign) in dogs received over a period of 22 years at the Laboratório de Patologia Veterinária, Universidade Federal de Santa Maria, was performed. Osteosarcoma was the most prevalent bone tumor, accounting for 86.7% of all malignant primary bone neoplasms diagnosed. Most cases occurred in dogs of large and giant breeds with ages between 6 and 10-years-old. The neoplasms involved mainly the appendicular skeleton, and were 3.5 times more prevalent in the forelimbs than in the hindlimbs. Osteoblastic osteosarcoma was the predominant histological subtype. Epidemiological and pathological findings of osteosarcomas are reported and discussed.

Vieraslajien torjunta Lounais-Suomessa : Hyvät käytännöt

Puutarhoista karanneet jättiputket, jättipalsami ja kurtturuusu ovat levinneet laajalti luontoon koko Suomessa. Nämä lajit ovat luonnon monimuotoisuutta ja elinympäristöjen viihtyisyyttä uhkaavia vieraslajeja. Jättiputket uhkaavat myös suoraan ihmisen terveyttä. Lounais-Suomessa aloitettiin näiden lajien järjestelmällinen kartoitus ja käytännön torjunta jo vuodesta 2008 alkaen. Aiemmista vieraslajihankkeista vuosina 2008-2010 on saatu merkittävästi tietoa jättiputkien, jättipalsamin ja kurtturuusun torjunnasta. Hankkeissa testattiin erilaisia torjuntamenetelmiä, kuten kasvien kitkentää, kaivamista juurineen, peittämistä pressuilla ja kemiallista käsittelyä. Hankkeissa seurattiin eri torjuntatapojen tehokkuutta ja laskettiin niiden kustannuksia. Myös torjuntatyön järjestämisen eri tapoja, kuten urakointi, torjuntatiimi ja talkoot, on seurattu ja niiden kustannuksia arvioitu. Tämä raportti esittää Varsinais-Suomen ELY-keskuksen toiminta-alueella saatuja kokemuksia ja paikallisesti hyväksi havaittuja toimia jättiputkien, jättipalsamin ja kurtturuusun leviämisen estämisessä, myös vieraslajien torjunnasta aiheutuneita kustannuksia. Toivomme, että raportti antaa eväitä vieraskasvilajien torjunnan suunnitteluun muilla alueilla ja auttaa arvioimaan toimintaan liittyviä kustannuksia. Raportti on osa Maa- ja metsätalousministeriön rahoittamaa ja useamman organisaation yhteistyönä toteuttamaa Havina-hanketta (Haitallisten vieraslajien hallinta ja tietoisuuden lisääminen).

Survival analysis of female dogs with mammary tumors after mastectomy: epidemiological, clinical and morphological aspects

Abstract: Mammary gland tumors are the most common type of tumors in bitches but research on survival time after diagnosis is scarce. The purpose of this study was to investigate the relationship between survival time after mastectomy and a number of clinical and morphological variables. Data was collected retrospectively on bitches with mammary tumors seen at the Small Animal Surgery Clinic Service at the University of Brasília. All subjects had undergone mastectomy. Survival analysis was conducted using Cox's proportional hazard method. Of the 139 subjects analyzed, 68 died and 71 survived until the end of the study (64 months). Mean age was 11.76 years (SD=2.71), 53.84% were small dogs. 76.92% of the tumors were malignant, and 65.73% had both thoracic and inguinal glands affected. Survival time in months was associated with age (hazard rate ratios [HRR] =1.23, p-value =1.4x10-4), animal size (HRR between giant and small animals =2.61, p-value =0.02), nodule size (HRR =1.09, p-value =0.03), histological type (HRR between solid carcinoma and carcinoma in a mixed tumor =2.40, p-value =0.02), time between diagnosis and surgery (TDS, with HRR =1.21, p-value =2.7x10-15), and the interaction TDS*follow-up time (HRR =0.98, p-value =1.6x10-11). The present study is one of the few on the subject matter. Several important covariates were evaluated and age, animal size, nodule size, histological type, TDS and TDS*follow up time were identified as significantly associated to survival time.

Microcracks and Vortices in Superconducting Thin Films

In this work, superconducting YBa₂ Cu₃O_6+x (YBCO) thin films have been studied with the experimental focus on the anisotropy of BaZrO₃ (BZO) doped YBCOthin films and the theoretical focus on modelling flux pinning by numerically solving Ginzburg- Landau equations. Also, the structural properties of undoped YBCO thin films grown on NdGaO₃ (NGO) and MgO substrates were investigated. The thin film samples were made by pulsed laser ablation on single crystal substrates. The structural properties of the thin films were characterized by X-ray diffraction and atomic force microscope measurements. The superconducting properties were investigated with a magnetometer and also with transport measurements in pulsed magnetic field up to 30 T. Flux pinning was modelled by restricting the value of the order parameter inside the columnar pinning sites and then solving the Ginzburg-Landau equations numerically with the restrictions in place. The computations were done with a parallel code on a supercomputer. The YBCO thin films were seen to develop microcracks when grown on NGO or MgO substrates. The microcrack formation was connected to the structure of the YBCO thin films in both cases. Additionally, the microcracks can be avoided by careful optimization of the deposition parameters and the film thickness. The BZO doping of the YBCO thin films was seen to decrease the effective electron mass anisotropy, which was seen by fitting the Blatter scaling to the angle dependence of the upper critical field. The Ginzburg-Landau simulations were able to reproduce the measured magnetic field dependence of the critical current density for BZO doped and undoped YBCO. The simulations showed that in addition to the large density also the large size of the BZO nanorods is a key factor behind the change in the power law behaviour between BZO doped and undoped YBCO. Additionally, the Ginzburg-Landau equations were solved for type I thin films where giant vortices were seen to appear depending on the film thickness. The simulations predicted that singly quantized vortices are stable in type I films up to quite large thicknesses and that the size of the vortices increases with decreasing film thickness, in a way that is similar to the behaviour of the interaction length of Pearl vortices.

Application of Carbon Nanotubes in Rotating Electrical Machines

Demand for increased energy efficiency has put an immense need for novel energy efficient systems. Electrical machines are considered as a much matured technology. Further improvement in this technology needs of finding new material to incorporate in electrical machines. Progress of carbon nanotubes research over the latest decade can open a new horizon in this aspect. Commonly known as ‘magic material’, carbon nanotubes (CNTs) have promising material properties that can change considerably the course of electrical machine design. It is believed that winding material based on carbon nanotubes create the biggest hope for a giant leap of modern technology and energy efficient systems. Though carbon nanotubes (CNTs) have shown amazing properties theoretically and practically during the latest 20 years, to the best knowledge of the author, no research has been carried out to find the future possibilities of utilizing carbon nanotubes as conductors in rotating electrical machines. In this thesis, the possibilities of utilizing carbon nanotubes in electrical machines have been studied. The design changes of electrical machine upon using carbon nanotubes instead of copper have been discussed vividly. A roadmap for this carbon nanotube winding machine has been discussed from synthesis, manufacturing and operational points of view.

Dynamical and Chemical Structure of Galactic Halos

This doctoral dissertation presents studies of the formation and evolution of galaxies, through observations and simulations of galactic halos. The halo is the component of galaxies which hosts some of the oldest objects we know of in the cosmos; it is where clues to the history of galaxies are found, for example, by how the chemical structure is related to the dynamics of objects in the halo. The dynamical and chemical structure of halos, both in the Milky Way’s own halo, and in two elliptical galaxies, is the underlying theme in the research. I focus on the density falloff and chemistry of the two external halos, and on the dynamics, density falloff, and chemistry of the Milky Way halo. I first study galactic halos via computer simulations, to test the long- term stability of an anomalous feature recently found in kinematics of the Milky Way’s metal-poor stellar halo. I find that the feature is transient, making its origin unclear. I use a second set of simulations to test if an initially strong relation between the dynamics and chemistry of halo glob-ular clusters in a Milky Way-type galaxy is affected by a merging satellite galaxy, and find that the relation remains strong despite a merger in which the satellite is a third of the mass of the host galaxy. From simulations, I move to observing halos in nearby galaxies, a challenging procedure as most of the light from galaxies comes from the disk and bulge components as opposed to the halo. I use Hubble Space Tele scope observations of the halo of the galaxy M87 and, comparing to similar observations of NGC 5128, find that the chemical structure of the inner halo is similar for both of these giant elliptical galaxies. I use Very Large Telescope observations of the outer halo of NGC 5128 (Centaurus A) and, because of the difficultly in resolving dim extragalac- tic stellar halo populations, I introduce a new technique to subtract the contaminating background galaxies. A transition from a metal-rich stellar halo to a metal-poor has previously been discovered in two different types of galaxies, the disk galaxy M31 and the classic elliptical NGC 3379. Unexpectedly, I discover in this third type of galaxy, the merger remnant NGC 5128, that the density of metal-rich and metal-poor halo stars falls at the same rate within the galactocentric radii of 8 − 65 kpc, the limit of our observations. This thesis presents new results which open opportunities for future investigations.

Immunohistochemical demonstration of TGF-ß and decorin in paracoccidioidal granulomas

Different patterns of granulomas have been observed in 6- to 8-week-old mice after ip inoculation with 5 x 10(6) yeast cells of Paracoccidioides brasiliensis. Transforming growth factor-ß (TGF-ß) is a cytokine that has been shown to participate in fibrosis and granuloma formation; its activities seem to be modulated by the small proteoglycan decorin. In the present study, TGF-ß and decorin expression in epiploon granulomas was assessed by immunohistochemistry in susceptible (B10.A) and resistant (A/J) mice after 15, 30, 120 and 150 days of P. brasiliensis ip infection. The epiploon was collected, fixed in Methacarn solution and embedded in paraffin, and 5-µm thick sections were used for immunohistochemical analysis employing the streptavidin-biotin-peroxidase technique. The former mouse strain developed fatal disease with many disseminated lesions increasing in size and number during the infection and the latter developed mild disease with the presence of encapsulated granulomas. In the epiploon, TGF-ß was present on macrophages, giant cells, lymphocytes and fibroblasts, and absent on neutrophils. It was also detected in areas of fibrosis and necrosis, as well as disperse in amorphous extracellular matrix, mostly in resistant mice. Decorin was present circumscribing macrophages and giant cells containing fungi, but absent on these cells. In both mouse strains, decorin was found at the periphery of the lesions, and markedly in milky spot granulomas. In resistant mice, positivity was found around fibrotic and necrotic areas of encapsulated and residual lesions containing lysed fungi. Decorin was found associated with thick fibers around encapsulated lesions. In susceptible mice, the size and number of lesions increased with the progression of the disease and were correlated with the weaker expression of decorin. We suggest an association of decorin with the fibrogenic process observed in paracoccidioidal granulomas.

Study of carbohydrates present in the cladodes of Opuntia ficus-indica (fodder palm), according to age and season

Types and content of carbohydrates were evaluated by chemical (spectrophotometric assay) and physicochemical (Thin Layer Chromatography - TLC and High Performance Liquid Chromatography - HPLC) methods in some Opuntia ficus-indica varieties according to age and season. The samples comprised four varieties of palm (giant, copena F1, clone 20, and round palm). The results demonstrated that the four varieties of palm contain a good quantity of neutral and acid sugars in both summer and winter seasons. However, samples collected in the summer presented a higher content of carbohydrates specially glucose, fructose, galactose, xylose, and arabinose. The tertiary cladode (old cladode) presented almost the double content of sugar found in the quaternary cladodes (young cladodes). Pectic polysaccharides were sequentially extracted with water at 60 ºC, and EDTA at 60 ºC solution resulting in Water-Soluble Pectin (WSP) and a Chelating-Soluble Pectin (CSP) respectively. Galacturonic acid was detected in the fractions WSP and CSP. However, the fraction CSP presented the highest content of sugar acid.

Aquatic Centre Pillars

Work on the giant concrete pillars found in the Eleanor Misener Aquatic Centre.

La IIIe République et Bismarck : le rôle des opportunistes dans le compromis franco-allemand

Le concert européen est souvent perçu, du moins pour les années 1871 à 1890, comme l’œuvre indéniable du Chancelier allemand Otto von Bismarck et des grands hommes politiques de son temps. La politique dite bismarckienne a effectivement connoté la plupart des interactions entre pays rivaux de l’époque, particulièrement entre la France et l’Allemagne. Son incidence sur la politique française est telle qu’elle en affecte les politiques intérieure et extérieure. Les républicains opportunistes adopteront vis-à-vis de la politique bismarckienne une attitude pragmatique leur permettant, de 1878 à 1885, de recouvrer leur rôle d’antan, ainsi que d’encadrer un fort sentiment nationaliste. S’il est souvent reproché aux opportunistes d’avoir préféré le momentané au planifié, il nous semble que la politique des gouvernements Ferry, Gambetta, Waddington et Freycinet réussit au contraire à tirer habilement son épingle du jeu bismarckien. Familiers du caractère éphémère de ce jeu, les opportunistes ont su y trouver des avantages, assurer à la France le recouvrement d’une position diplomatique de choix et l’acquisition de nouveaux territoires coloniaux, tout en préservant une certaine indépendance face au Chancelier.

Bodies, Saracen giants, and the medieval romance : transgression, difference, and assimilation

Bodies, Saracen Giants, and the Medieval Romance: Transgression, Difference, and Assimilation explore le traitement des corps de trois géants Sarasins dans les romances de Roland and Vernagu (c. 1330), Sir Beues of Hamtoun (c. 1330), et The Taill of Rauf Coilyear (c. 1513-42).Grâce à une étude de la représentation de ces trois géants Sarasin, la signification du corps humain au Moyen Age, et des pratiques de la Chrétienté an accord avec les discours et idéologies envers le Proche-Orient qui existaient dans l’Occident médiéval, ce mémoire de maîtrise juxtapose le géant Sarasin et le héros de la romance pour indiquer une similarité apparente entre leur deux corps et leur religion respective. La romance démontre avec hésitation un désir d’assimiler le géants Sarasin dans le code héroïque ainsi que dans la religion chrétienne, mais souvent rejette avec suspicion le corps du géant par sa mort sur le champ de bataille. Malgré sa mort ou son assimilation dans le code héroïque et la Chrétienté, le corps du géant Sarasin demeure toujours important dans le contexte de la Romance, puisqu’il contribue à la construction de l’identité du héros, de sa foi, et de sa société.

Réponse auditive oscillatoire chez le non-voyant : investigation par magnétoencéphalographie

Les personnes non-voyantes montrent dans les différents aspects de leurs vies qu’elles sont capables de s’adapter à la privation visuelle en utilisant les capacités intactes comme l’ouï ou le toucher. Elles montrent qu’elles peuvent bien évoluer dans leur environnement en absence de vision et démontrent même des fois des habiletés supérieures à celles des personnes voyantes. La recherche de ces dernières décennies s’est beaucoup intéressée aux capacités adaptatives des non-voyants surtout avec l’avènement des nouvelles techniques d’imagerie qui ont permis d’investiguer des domaines qui ne l’étaient pas ou l’étaient difficilement avant. Les capacités supérieures des non voyants dans l’utilisation plus efficace des informations auditives et tactiles semblent avoir leur base neuronale dans le dans le cortex visuel désafférenté, qui continu à être fonctionnel après la privation sensorielle et s’en trouve recruté pour le traitement de stimulations dites intermodales : auditives, tactiles et même montre une implication dans des processus de plus haut niveau, comme la mémoire ou le langage. Cette implication fonctionnelle intermodale résulte de la plasticité du cortex visuel c'est-à-dire sa capacité à changer sa structure, sa fonction et d’adapter ses interactions avec les autres systèmes en l’absence de vision. La plasticité corticale n’est pas exclusive au cortex visuel mais est un état permanent de tout le cerveau. Pour mesurer l’activité du cortex visuel des non voyants, une mesure d’excitabilité de ses neurones consiste à mesurer le temps de recouvrement de l’onde N1 en potentiels évoqués, qui est plus rapide chez les non voyants dans la modalité auditive. En effet, les réponses en potentiels et champs évoqués ont été utilisés en EEG/MEG pour mettre en évidence des changements plastiques dans le cortex visuel des non-voyants pour le traitement de stimuli dans les modalités auditives et tactiles. Ces réponses étaient localisées dans les régions postérieures chez les non voyants contrairement aux contrôles voyants. Un autre type de réponse auditive a reçu moins d’intérêt dans la recherche concernant la réorganisation fonctionnelle en relation avec la privation sensorielle, il s’agit de la réponse auditive oscillatoire (Auditory Steady-State Response ASSR). C’est une réponse qui a l’avantage d’osciller au rythme de stimulation et d’être caractérisé par une réponse des aires auditives étiquetée à la fréquence de stimulation. Cette étiquette se présente sous la forme qu’un pic d’énergie spectrale important qui culmine aux fréquences présentes dans la stimulation. Elle a également l’avantage d’être localisée dans les régions auditives primaires, de là tout changement de localisation de cette réponse chez des non voyants en faveur des régions visuelles pourrait être considéré comme une évidence de la réorganisation fonctionnelle qui s’opère après une privation sensorielle précoce. Le but de cette thèse est donc d’utiliser la réponse oscillatoire à l’écoute des sons modulés en amplitude (MA) pour mettre en évidence les corrélats de la réorganisation fonctionnelle dans le cortex visuel des non-voyants précoces. La modulation de la réponse auditive dans les régions visuelles nous permettra de montrer qu’une réorganisation est possible chez les non-voyants pour ce traitement intermodal. La première étude est une validation du paradigme expérimental «frequency tagged sounds». Il s’agit de montrer qu’une tâche de détection de changement dans la stimulation, permet de moduler la réponse ASSR aux sons modulés en amplitude en vue de l’utiliser dans les études chez les non voyants et dans les conditions d’une privation visuelle transitoire (avec les yeux bandés). Un groupe de sujets voyants ont réalisé une tâche de détection de changement dans la stimulation les yeux ouverts dans deux conditions : écoute active qui consiste à détecter un changement dans la fréquence porteuse de la modulation en appuyant avec l’index droit sur un bouton de réponse et une condition d’écoute passive. Les sons étaient présentés en écoute monaurale et dichotique. Les résultats ont montré une différence significative à l’occurrence du changement dans la stimulation en écoute dichotique seulement. Les schémas de plus grande réponse controlatérale et de suppression binaurale décrit dans la littérature ont été confirmés. La deuxième étude avait pour but de mettre en évidence une réorganisation rapide de la réponse ASSR chez un groupe de sujets voyants dans les conditions de privation visuelle transitoire de courte durée, par bandage des yeux pendant six heures. Le même protocole expérimental que la première étude a été utilisé en écoute active seulement. Les résultats montrent que dans ces conditions une modulation de la réponse corticale en écoute dichotique dans les régions visuelles est possible. Ces sources d’activité occipitale adoptent une propriété du cortex auditif qui est le battement binaural, c'est-à-dire l’oscillation de la réponse ASSR à la différence des fréquences présentées dans chaque oreille. Cet effet est présent chez la moitié des sujets testés. La représentation corticale des sources occipitales évolue durant la période de privation et montre un déplacement des sources d’activité dans la direction antéropostérieure à la fin de la période de privation. La troisième étude a permis de comparer le traitement de la réponse ASSR dans un groupe de non-voyants congénitaux à un groupe de voyants contrôles, pour investiguer les corrélats de la réorganisation fonctionnelle de cette réponse après une privation sensorielle de longue durée c'est-à-dire chez des non voyants congénitaux. Les résultats montrent des différences significatives dans la représentation spectrale de la réponse entre les deux groupes avec néanmoins des activations temporales importantes aussi bien chez les non voyants que chez les contrôles voyants. Des sources distribuées ont été localisées dans les régions associatives auditives dans les deux groupes à la différence des non voyants où il y avait en plus l’implication des régions temporales inférieures, connues comme étant activées par la vision des objets chez les voyants et font partie de la voie visuelle du quoi. Les résultats présentés dans le cadre de cette thèse vont dans le sens d’une réorganisation rapide de la réponse auditive oscillatoire après une privation visuelle transitoire de courte durée par l’implication des régions visuelles dans le traitement de la réponse ASSR par l’intermédiaire du démasquage de connections existantes entre le cortex visuel et le cortex auditif. La privation visuelle de longue durée, elle conduit à des changements plastiques, d’une part intra modaux par l’extension de l’activité aux régions temporales supérieures et médianes. D’autre part, elle induit des changements inter modaux par l’implication fonctionnelle des régions temporales inférieures visuelles dans le traitement des sons modulés en amplitude comme objets auditifs alors qu’elles sont normalement dédiées au traitement des objets visuels. Cette réorganisation passe probablement par les connections cortico-corticales.

Identification des bases génétiques des myopathies à multi-minicores avec ou sans cardiomyopathie

Thèse réalisée en cotutelle avec l'Université Pierre et Marie Curie, Paris 6(UPMC, Paris, France).