Patterns of evolution of host proteins involved in retroviral pathogenesis.

BACKGROUND: Evolutionary analysis may serve as a useful approach to identify and characterize host defense and viral proteins involved in genetic conflicts. We analyzed patterns of coding sequence evolution of genes with known (TRIM5alpha and APOBEC3G) or suspected (TRIM19/PML) roles in virus restriction, or in viral pathogenesis (PPIA, encoding Cyclophilin A), in the same set of human and non-human primate species. RESULTS AND CONCLUSION: This analysis revealed previously unidentified clusters of positively selected sites in APOBEC3G and TRIM5alpha that may delineate new virus-interaction domains. In contrast, our evolutionary analyses suggest that PPIA is not under diversifying selection in primates, consistent with the interaction of Cyclophilin A being limited to the HIV-1M/SIVcpz lineage. The strong sequence conservation of the TRIM19/PML sequences among primates suggests that this gene does not play a role in antiretroviral defense.

Métodos pedagógicos que influenciaram o planejamento das ações educativas dos enfermeiros: revisão bibliográfica

Este trabalho busca identificar, em cinco períodos da História do Brasil, o uso, pelos enfermeiros, de metodologias pedagógicas nas ações educativas de saúde em enfermagem. Esta revisão procura resgatar a historicidade do processo educativo trilhado pela Enfermagem e propõe a incorporação, no planejamento das práticas educativas do enfermeiro, do uso de metodologias pedagógicas problematizadoras, concordando com os enfermeiros pesquisadores e assistenciais que defendem aplicação de ações educativas que permitam ao aprendiz apropriar-se de conhecimento técnico aliado à conscientização política de si e do mundo, permitindo-lhe criar e recriar ações cotidianas.

[Archives de la parole]. , Impressions rêverie / Ladoux, comp. ; Mr Audoin [i.e.] Audouin], vlc

Enregistrement : Paris, Université de Paris, La Sorbonne, 22-04-1913

Lettres en forme de bref de N. S. P. le pape Benoit XIV, par lesquels de son propre mouvement, il établit et constitue l'éminentissime et reverendissime François de Soldanha... visiteur et réformateur des clercs réguliers de la compagnie de Jésus...

[Acte pontifical. 1758-04-01]

Can we continue to neglect genomic variation in introgression rates when inferring the history of speciation? A case study in a Mytilus hybrid zone.

The use of molecular data to reconstruct the history of divergence and gene flow between populations of closely related taxa represents a challenging problem. It has been proposed that the long-standing debate about the geography of speciation can be resolved by comparing the likelihoods of a model of isolation with migration and a model of secondary contact. However, data are commonly only fit to a model of isolation with migration and rarely tested against the secondary contact alternative. Furthermore, most demographic inference methods have neglected variation in introgression rates and assume that the gene flow parameter (Nm) is similar among loci. Here, we show that neglecting this source of variation can give misleading results. We analysed DNA sequences sampled from populations of the marine mussels, Mytilus edulis and M. galloprovincialis, across a well-studied mosaic hybrid zone in Europe and evaluated various scenarios of speciation, with or without variation in introgression rates, using an Approximate Bayesian Computation (ABC) approach. Models with heterogeneous gene flow across loci always outperformed models assuming equal migration rates irrespective of the history of gene flow being considered. By incorporating this heterogeneity, the best-supported scenario was a long period of allopatric isolation during the first three-quarters of the time since divergence followed by secondary contact and introgression during the last quarter. By contrast, constraining migration to be homogeneous failed to discriminate among any of the different models of gene flow tested. Our simulations thus provide statistical support for the secondary contact scenario in the European Mytilus hybrid zone that the standard coalescent approach failed to confirm. Our results demonstrate that genomic variation in introgression rates can have profound impacts on the biological conclusions drawn from inference methods and needs to be incorporated in future studies.

Guidelines for the use and interpretation of assays for monitoring autophagy.

In 2008 we published the first set of guidelines for standardizing research in autophagy. Since then, research on this topic has continued to accelerate, and many new scientists have entered the field. Our knowledge base and relevant new technologies have also been expanding. Accordingly, it is important to update these guidelines for monitoring autophagy in different organisms. Various reviews have described the range of assays that have been used for this purpose. Nevertheless, there continues to be confusion regarding acceptable methods to measure autophagy, especially in multicellular eukaryotes. A key point that needs to be emphasized is that there is a difference between measurements that monitor the numbers or volume of autophagic elements (e.g., autophagosomes or autolysosomes) at any stage of the autophagic process vs. those that measure flux through the autophagy pathway (i.e., the complete process); thus, a block in macroautophagy that results in autophagosome accumulation needs to be differentiated from stimuli that result in increased autophagic activity, defined as increased autophagy induction coupled with increased delivery to, and degradation within, lysosomes (in most higher eukaryotes and some protists such as Dictyostelium) or the vacuole (in plants and fungi). In other words, it is especially important that investigators new to the field understand that the appearance of more autophagosomes does not necessarily equate with more autophagy. In fact, in many cases, autophagosomes accumulate because of a block in trafficking to lysosomes without a concomitant change in autophagosome biogenesis, whereas an increase in autolysosomes may reflect a reduction in degradative activity. Here, we present a set of guidelines for the selection and interpretation of methods for use by investigators who aim to examine macroautophagy and related processes, as well as for reviewers who need to provide realistic and reasonable critiques of papers that are focused on these processes. These guidelines are not meant to be a formulaic set of rules, because the appropriate assays depend in part on the question being asked and the system being used. In addition, we emphasize that no individual assay is guaranteed to be the most appropriate one in every situation, and we strongly recommend the use of multiple assays to monitor autophagy. In these guidelines, we consider these various methods of assessing autophagy and what information can, or cannot, be obtained from them. Finally, by discussing the merits and limits of particular autophagy assays, we hope to encourage technical innovation in the field.

Concepções dos alunos de graduação em enfermagem sobre o envelhecimento

Este estudo teve como objetivo identificar as concepções do aluno de graduação em enfermagem sobre o envelhecimento. Pesquisa qualitativa foi realizada na Universidade Cidade de São Paulo, com 49 alunos que escreveram uma dissertação com o tema "O que é ser velho?". Foi realizada análise de conteúdo, nas quais foram identificadas três unidades temáticas: Representações do ser velho, Como percebe o velho na sociedade e família e Necessidade de mudança de opinião pública. Os resultados mostraram que o aluno traz em sua concepção muitas imagens negativas do envelhecimento e evidencia a necessidade de mudanças na sociedade e na família.

Crenças que influenciam adolescentes na doação de órgãos

Foram objetivos do estudo identificar conhecimento, crenças comportamentais e normativas de estudantes de nível médio sobre transplante e doação de órgãos, à luz da Teoria da Ação Racional (TRA), em duas escolas da rede pública do município de São Paulo. A amostra foi constituída por 94 alunos que responderam um questionário baseado nos pressupostos da TRA e as respostas foram submetidas à análise estatística. O resultado mostra baixo conhecimento sobre doação de órgãos, pois 45,8% desconhecem o conceito de morte encefálica; 37,2% não sabem quando a morte ocorre e 70,3% não sabem quando uma pessoa se torna potencial doador. Foram evidenciadas dez crenças positivas relativas ao comportamento de ser doador de órgãos. Salientaram-se, também, sete crenças negativas sobre doação de órgãos. Foram evidenciadas oito crenças positivas e cinco crenças negativas relativas à doação de órgãos. Conclui-se ser necessário desenvolver estudos e implementar programas educativos de esclarecimento sobre o tema.

Controle de vacinação de crianças matriculadas em escolas municipais da cidade de São Paulo

A matrícula de alunos, nas Escolas Municipais de Educação Infantil de São Paulo, está vinculada à apresentação da caderneta de vacinação, para incentivar os pais a manterem atualizado o calendário de imunizações das crianças. Não há, porém, controles periódicos para verificar se as vacinações estão atualizadas. Para sanar tal deficiência, foi elaborado um projeto com objetivo de facilitar o controle da imunização infantil, por meio da criação de um programa de computador, para realizar esse controle, testado em uma Escola Municipal de Educação Infantil, durante três meses. Foram cadastrados nesse sistema 286 alunos, dos quais, 236 (82,5%) receberam notificações por estar com seu quadro de vacinação incompleto. Dentre os alunos que receberam as notificações, 21,2% atualizaram a vacinação, 2,5% devolveram suas cadernetas inalteradas e os demais ainda estavam providenciando a atualização. O programa foi capaz de identificar falhas, reduzindo as chances da propagação de doenças transmissíveis no ambiente escolar.

The E3 ubiquitin ligase Itch regulates sorting nexin 9 through an unconventional substrate recognition domain.

The level of intracellular proteins is mainly regulated through modifications by ubiquitin ligases that target them for degradation. Members of the NEDD4 family of E3 ubiquitin ligases, such as Itch (atrophin-1 interacting protein 4), possess up to four WW domains for specific association with PY motif-containing substrates. We have identified sorting nexin 9 (SNX9), a protein involved in endocytic processes, as a new substrate of Itch. Itch ubiquitylates SNX9 and regulates intracellular SNX9 levels. Using truncated proteins, we found that the interaction with SNX9 is mediated by the proline-rich domain (PRD) of Itch, a domain distinct from the conventional WW recognition domain, and the SH3 domain of SNX9. Interaction with the PRD of Itch is essential for SNX9 ubiquitylation and degradation. Furthermore, this effect is specific for Itch, as NEDD4, a related PRD-containing E3 ligase, does not bind SNX9. SNX18, a second member of the SNX family containing an SH3 domain, was also found to bind to Itch. Our results indicate that the pool of substrates of NEDD4 family E3 ubiquitin ligases extends beyond proteins containing PY motifs.

F-1, Food Stamp Program State Summary, August 2002

The Food Assistance Monthly Participation Report is a monthly summary of Food Assistance program participation, Statewide and for each Iowa county. Breakouts are reported for participants also in the FIP program, those only receiving Food Assistance, and those that are receiving economic assistance under other programs (primarily Medicaid). This report may also be known as the F-1 Report.

ABD e-News August 20, 2004

Weekly newsletter for the State of Iowa Alcoholic Beverages Division

Tradução e adaptação para a língua portuguesa do In-hospital Utstein Style

A parada cardiorrespiratória (PCR) é um evento potencialmente letal e a qualidade do atendimento prestado depende da agilidade, conhecimento e habilidade de toda a equipe envolvida. Desenvolvido em 1997, o In-hospital Utstein Style é um relatório padrão para coleta de dados significativos em PCR. O estudo objetivou realizar a tradução e adaptação à língua portuguesa do instrumento. O instrumento foi submetido ao processo de tradução e adaptação cultural. O resultado deste processo gerou um instrumento aplicado em fase de pré-teste a 20 pacientes vítimas de PCR. As variáveis de resultado não foram coletadas, pois pressupõe o acompanhamento destes pacientes ao longo do tempo. O ritmo de PCR mais comum foi atividade elétrica sem pulso (65%); o tempo médio para desfibrilar foi de 1,25 minutos. Houve itens sem resposta. Podemos concluir que o instrumento é aplicável à realidade brasileira, buscando melhor atendimento ao evento da PCR.