Structure of the K6 capsular polysaccharide from Acinetobacter baumannii isolate RBH4

The structure of the capsular polysaccharide (CPS) from an Acinetobacter baumannii global clone 2 (GC2) clinical isolate RBH4 that carries the KL6 gene cluster was elucidated by means of chemical and spectroscopical methods. The repeating unit of K6 CPS is linear and contains N-acetyl-d-galactosamine (d-GalpNAc), two d-galactose (d-Galp) residues and 5,7-di-N-acetylpseudaminic acid (Pse5Ac7Ac). The synthesis of these sugars could be attributed to genes in the KL6 capsule biosynthesis gene cluster, and the formation of the linkages between the sugars were assigned to glycosyltransferases or the Wzy polymerase encoded in KL6.

A mega-analysis of genome-wide association studies for major depressive disorder

Prior genome-wide association studies (GWAS) of major depressive disorder (MDD) have met with limited success. We sought to increase statistical power to detect disease loci by conducting a GWAS mega-analysis for MDD. In the MDD discovery phase, we analyzed more than 1.2 million autosomal and X chromosome single-nucleotide polymorphisms (SNPs) in 18 759 independent and unrelated subjects of recent European ancestry (9240 MDD cases and 9519 controls). In the MDD replication phase, we evaluated 554 SNPs in independent samples (6783 MDD cases and 50 695 controls). We also conducted a cross-disorder meta-analysis using 819 autosomal SNPs with P<0.0001 for either MDD or the Psychiatric GWAS Consortium bipolar disorder (BIP) mega-analysis (9238 MDD cases/8039 controls and 6998 BIP cases/7775 controls). No SNPs achieved genome-wide significance in the MDD discovery phase, the MDD replication phase or in pre-planned secondary analyses (by sex, recurrent MDD, recurrent early-onset MDD, age of onset, pre-pubertal onset MDD or typical-like MDD from a latent class analyses of the MDD criteria). In the MDD-bipolar cross-disorder analysis, 15 SNPs exceeded genome-wide significance (P<5 x 10(-8)), and all were in a 248 kb interval of high LD on 3p21.1 (chr3:52 425 083-53 822 102, minimum P=5.9 x 10(-9) at rs2535629). Although this is the largest genome-wide analysis of MDD yet conducted, its high prevalence means that the sample is still underpowered to detect genetic effects typical for complex traits. Therefore, we were unable to identify robust and replicable findings. We discuss what this means for genetic research for MDD. The 3p21.1 MDD-BIP finding should be interpreted with caution as the most significant SNP did not replicate in MDD samples, and genotyping in independent samples will be needed to resolve its status.

The conservation status of the world’s reptiles

Effective and targeted conservation action requires detailed information about species, their distribution, systematics and ecology as well as the distribution of threat processes which affect them. Knowledge of reptilian diversity remains surprisingly disparate, and innovative means of gaining rapid insight into the status of reptiles are needed in order to highlight urgent conservation cases and inform environmental policy with appropriate biodiversity information in a timely manner. We present the first ever global analysis of extinction risk in reptiles, based on a random representative sample of 1500 species (16% of all currently known species). To our knowledge, our results provide the first analysis of the global conservation status and distribution patterns of reptiles and the threats affecting them, highlighting conservation priorities and knowledge gaps which need to be addressed urgently to ensure the continued survival of the world’s reptiles. Nearly one in five reptilian species are threatened with extinction, with another one in five species classed as Data Deficient. The proportion of threatened reptile species is highest in freshwater environments, tropical regions and on oceanic islands, while data deficiency was highest in tropical areas, such as Central Africa and Southeast Asia, and among fossorial reptiles. Our results emphasise the need for research attention to be focussed on tropical areas which are experiencing the most dramatic rates of habitat loss, on fossorial reptiles for which there is a chronic lack of data, and on certain taxa such as snakes for which extinction risk may currently be underestimated due to lack of population information. Conservation actions specifically need to mitigate the effects of human-induced habitat loss and harvesting, which are the predominant threats to reptiles.

The sublime, affective process + architectural production

A year before Kate Nesbitt’s Theorising a New Agenda For Architecture (1996), the author penned a chapter on the significance of the sublime and its contribution to post-modern architecture via the uncanny or disturbing through the theories of Vidler and Eisenman (Nesbit, 1995). Twenty years on, we see its ongoing presence within the contemporary works of artists Kapoor, Ellison and Viola. Eisenmann and Libeskind aside, explicit reference to the Sublime whether through architectural praxis or theory appears to have been trumped by ecological derivatives and associated transactions, as catalyst for new architecture and architectural thinking. For Edmund Burke (1757), the Sublime was seen as a leading, an overpowering of self to a state of intense self-presence, often leading to a state of otherness. To experience the sublime is to experience affect, physiologically overwhelming the mental faculties through intensities of astonishment, terror, obscurity, magnificence, and reverence. Key here is Burke’s articulation of the stages of the sublime encounter, particularly so, its implications for the process of production which architectural theorists appear to have overstepped in their valorisation of the sublime object. This paper seeks to resituate the sublime within the context of architectural production. Through concepts such as material thinking, bodies and making strange, the paper explores a shift in focus toward affective processes traced from Burke’s inquiry. Rather than proposing strategies solely for affect within the work itself, the focus lies upon the designing experience, where blockage and desirous forces are critical partners in the process of production, as revealed through recent studio programs entitled Strange Space.

Worldwide outdoor round robin study of organic photovoltaic devices and modules

Accurate characterization and reporting of organic photovoltaic (OPV) device performance remains one of the important challenges in the field. The large spread among the efficiencies of devices with the same structure reported by different groups is significantly caused by different procedures and equipment used during testing. The presented article addresses this issue by offering a new method of device testing using “suitcase sample” approach combined with outdoor testing that limits the diversity of the equipment, and a strict measurement protocol. A round robin outdoor characterization of roll-to-roll coated OPV cells and modules conducted among 46 laboratories worldwide is presented, where the samples and the testing equipment were integrated in a compact suitcase that served both as a sample transportation tool and as a holder and test equipment during testing. In addition, an internet based coordination was used via plasticphotovoltaics.org that allowed fast and efficient communication among participants and provided a controlled reporting format for the results that eased the analysis of the data. The reported deviations among the laboratories were limited to 5% when compared to the Si reference device integrated in the suitcase and were up to 8% when calculated using the local irradiance data. Therefore, this method offers a fast, cheap and efficient tool for sample sharing and testing that allows conducting outdoor measurements of OPV devices in a reproducible manner.

Expected Performance of the ATLAS Experiment - Detector, Trigger and Physics

A detailed study is presented of the expected performance of the ATLAS detector. The reconstruction of tracks, leptons, photons, missing energy and jets is investigated, together with the performance of b-tagging and the trigger. The physics potential for a variety of interesting physics processes, within the Standard Model and beyond, is examined. The study comprises a series of notes based on simulations of the detector and physics processes, with particular emphasis given to the data expected from the first years of operation of the LHC at CERN.

How Does the Spacer Length of Cationic Gemini Lipids Influence the Lipoplex Formation with Plasmid DNA? Physicochemical and Biochemical Characterizations and their Relevance in Gene Therapy

Lipoplexes formed by the pEGFP-C3 plasmid DNA (pDNA) and lipid mixtures containing cationic gemini surfactant of the 1,2-bis(hexadecyl dimethyl ammonium) Acmes family referred to as C16CnC16, where n = 2 3, 5, or 12, and the zwitterionic helper lipid, 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphatidylethanolamine (DOPE) have been studied from a wide variety of physical, chemical, and biological standpoints. The study has been carried out using several experimental methods, such as zeta potential, gel electrophoresis, small-angle X-ray scattering (SAXS), cryo-TEM, gene transfection, cell viability/cytotoxicity, and confocal fluorescence microscopy. As reported recently in a communication (J. Am. Chem. Soc. 2011, 133, 18014), the detailed physicochemical and biological studies confirm that, in the presence of the studied series lipid mixtures, plasmid DNA is compacted with a large number of its associated Na+ counterions. This in turn yields a much lower effective negative charge, q(pDNA)(-), a value that has been experimentally obtained for each mixed lipid mixture. Consequently, the cationic lipid (CL) complexes prepared with pDNA and CL/DOPE mixtures to be used in gene transfection require significantly less amount of CL than the one estimated assuming a value of q(DNA)(-) = -2. This drives to a considerably lower cytotoxicity of the gene vector. Depending on the CL molar composition, alpha, of the lipid mixture, and the effective charge ratio of the lipoplex, rho(eff), the reported SAXS data indicate the presence of two or three structures in the same lipoplex, one in the DOPE-rich region, other in the CL-rich region, and another one present at any CL composition. Cryo-TEM and SAXS studies with C16CnC16/DOPE-pDNA lipoplexes indicate that pDNA is localized between the mixed lipid bilayers of lamellar structures within a monolayer of similar to 2 nm. This is consistent with a highly compacted supercoiled pDNA conformation compared with that of linear DNA. Transfection studies were carried out with HEK293T, HeLa, CHO, U343, and H460 cells. The alpha and rho(eff) values for each lipid mixture were optimized on HEK293T cells for transfection, and using these values, the remaining cells were also transfected in absence (-FBS-FBS) and presence (-FBS+FBS) of serum. The transfection efficiency was higher with the CLs of shorter gemini spacers (n = 2 or 3). Each formulation expressed GFP on pDNA transfection and confocal fluorescence microscopy corroborated the results. C16C2C16/DOPE mixtures were the most efficient toward transfection among all the lipid mixtures and, in presence of serum, even better than the Lipofectamine2000, a commercial transfecting agent Each lipid combination was safe and did not show any significant levels of toxicity. Probably, the presence of two coexisting lamellar structures in lipoplexes synergizes the transfection efficiency of the lipid mixtures which are plentiful in the lipoplexes formed by CLs with short spacer (n = 2, 3) than those with the long spacer (n = 5, 12).

Effects of a Delocalizable Cation on the Headgroup of Gemini Lipids on the Lipoplex-Type Nanoaggregates Directly Formed from Plasmid DNA

Lipoplex-type nanoaggregates prepared from pEGFP-C3 plasmid DNA (pDNA) and mixed liposomes, with a gemini cationic lipid (CL) 1,2-bis(hexadecyl imidazolium) alkanes], referred as (C(16)Im)(2)C-n (where C-n is the alkane spacer length, n = 2, 3, 5, or 12, between the imidazolium heads) and DOPE zwitterionic lipid, have been analyzed by zeta potential, gel electrophoresis, SAXS, cryo-TEM, fluorescence anisotropy, transfection efficiency, fluorescence confocal microscopy, and cell viability/cytotoxicity experiments to establish a structure-biological activity relationship. The study, carried out at several mixed liposome compositions, alpha, and effective charge ratios, rho(eff), of the lipoplex, demonstrates that the transfection of pDNA using CLs initially requires the determination of the effective charge of both. The electrochemical study confirms that CLs with a delocalizable positive charge in their headgroups yield an effective positive charge that is 90% of their expected nominal one, while pDNA is compacted yielding an effective negative charge which is only 10-25% than that of the linear DNA. SAXS diffractograms show that lipoplexes formed by CLs with shorter spacer (n = 2, 3, or 5) present three lamellar structures, two of them in coexistence, while those formed by CL with longest spacer (n = 12) present two additional inverted hexagonal structures. Cryo-TEM micrographs show nanoaggregates with two multilamellar structures, a cluster-type (at low alpha value) and a fingerprint-type, that coexist with the cluster-type at moderate alpha composition. The optimized transfection efficiency (TE) of pDNA, in HEK293T, HeLa, and H1299 cells was higher using lipoplexes containing gemini CLs with shorter spacers at low a value. Each lipid formulation did not show any significant levels of toxicity, the reported lipoplexes being adequate DNA vectors for gene therapy and considerably better than both Lipofectamine 2000 and CLs of the 1,2-bis(hexadecyl ammnoniun) alkane series, recently reported.

Estudio preliminar de la cria de gallinas de patio en el municipio de Nindirí, Masaya

La presente investigación se realizó dentro del marco de la FUNDACION NAKAWE con el objetivo de realizar un estudio preliminar de la cría de gallinas de patio y la influencia que ejerce la dedicación de las productoras sobre el aspecto productivo y reproductivo de las gallinas. El estudio se hizo en las comarcas de Veracruz y El Portillo. Se utilizaron para este estudio las parvadas de gallinas de patio sin alterar su manejo y mantenidas en evaluación durante un periodo de 10 meses. Las productoras que participaron en este estudio estaban interesadas en conocer el comportamiento productivo y reproductivo de sus gallinas. Entre los indicadores sociales-técnicos encontrados en la zona según resultado de la Encuesta estática, se determinó que las gallinas son importante para las mujeres: autoconsumo 93%, ahorro 74%, comercio y prolificidad un 71% respectivamente, ventajas de las gallinas para las mujeres: pagan su comida un 50% y producción diaria un 36%, grupos raciales ( porrocas 100%, chiricanas 64.28%, finas 57.14% e híbridas 35.71%), experiencia en la actividad de 3 a 20 años, la edad de la primera postura es 5.5 y 7.5 meses, número de huevos por postura es de 10 a 15, número de huevos echados por nido de 9 a 13, número de postura por ave/ano es 4 a 7 veces, duración de la crianza de 1.5 a 2.5 meses. Entre los índices técnicos-económicos encontrados en la cría de gallinas de patio, según resultados de las Encuestas de seguimiento por un periodo de 10 meses son: parvadas de 28 a 119 aves y con un promedio de 55 aves, la entradas de aves a la parvada fueron: cambios positivos 51%, nacimiento 45% y compra 4%; salidas de aves fueron: cambios negativos 42.5%, muerte 18.8%, pérdidas 17.6%, venta 12.5%, consumo 8.6%, el incremento fue negativo en un 19.31%, la cantidad huevos por gallina fue de 44 a 120 y un promedio de 85, porcentaje de producción de 26.76% en invierno, 28.72% en verano y el promedio fue de 27.76%, destino huevos: consumo 57%, venta 26%, huevos echados 10%, regalo 5%, compra 1 %, pérdida 1%, el número de huevos echados por nido osciló de 8 a 13 y su promedio fue 11, número de veces echada por gallina oscila de 0.44 a 1.4 veces y su promedio fue de 0.81 veces, incubabilidad obtenida en invierno fue de 46.63% y en verano fue de 58.55% para un promedio de 52.59%, cantidad de pollos nacidos por gallina oscila de 2.51 a 8 con un promedio de 4.68 pollos, el 69.47% del alimento suplementado proviene de la parcela y 30.53% proviene de la compra, el consumo por unidad ave fue de 13.72 a 44.44 libras con un promedio de 31.55 libras, cargas de parásitos internos leves, los costos de alimentación oscilan de 88 a 91% y los costos de salud del 9 a 12% del total de costos variables y la utilidad bruta oscila de 1715.3 córdobas a (86.65) córdobas y con una utilidad promedio para todas las familias estudiadas de 512 córdobas.

Inclusión de vaina espino negro en raciones de terneras destetadas

La investigación se realizó en la finca San Francisco propiedad del Zootecnista Martín A Palacios Wells, ubicada en la Comarca Sisle N° 2 a 30 kilóme1ros al norte del Municipio de Jinotega, a los 13° 10' latitud norte y 86° 00' longitud oeste. El experimento inició el día 29 de julio de 1997 y concluyó el 17 de octubre de 1997. Se usaron ocho terneras de 9 a 12 meses de edad, de raza 3/4 Pardo- 1/4 Brahman, con un peso promedio de 164 kilogramos. Se aplicaron dos tratamientos, siendo estos: tratamiento A (0% inclusión de vaina de espino negro en la ración), tratamiento B (50% inclusión de vaina de espino negro en la ración). La variable estudiada fue: ganancia media diaria en kilogramos/día, para cada uno de los periodos evaluados. Los datos que se registraron fueron evaluados a través del diseño cruzado, el cual requiere el uso de dos periodos de evaluación para las mismas unidades experimentales. Con el análisis estadístico no se encontraron diferencias significativas entre tratamientos a los niveles de significancia de 5% y 1% en ganancias de peso. El análisis financiero indicó que el tratamiento B resultó más barato que el tratamiento A por kilogramo de aumento.

Efectos de retirar los aditivos del alimento finalizador en broilers sobre los principales índices productivos

Con el objetivo de reducir los costos de alimentación en broilers se le retiró al alimento finalizador los aditivos más caros y se evaluaron los principales índices productivos. Durante un período de 42 días los pollos de engorde fueron evaluados en la granja avícola "Buenos Aires" propiedad de la empresa Tip-Top industrial S.A., se utilizaron 800 pollos de engorde de un día de edad de la estirpe Peterson x Arbor Acres (sin sexar), se realizó un DCA con cuatro tratamientos y cuatro réplicas cada uno y fueron sometidos a la prueba de Duncan para determinar la superioridad por tratamiento y a la vez se le efectúo Análisis de Costo por alimentación. Los pollos del TI (12 días), T2 (nueve días) y T3 (seis días) de retiro, consumieron al final del período de crianza 3.44, 3.44 y 3.47 kg, mientras que para T4 (tres días) fue de 3.52 kg. El peso vivo final hasta las seis semanas fue de 1.87, 1.87, 1.89 y 1.90 kg. Para los TI, T2, T3 y T4 respectivamente. La ganancia media de peso a los 28-42 días fue de 0.81, 0.79, 0.84 y 0.80 kg para los tratamientos TI, T2, T3 y T4 respectivamente. La conversión alimenticia por tratamiento fue de 1.84 (TI, T2 y T3) y 1.85 (T4). El rendimiento en la canal fue de 82.00, 83.00, 85.00, y 85.00 para los tratamientos 1, 2, 3 y 4 respectivamente. No se encontró diferencia significativa (P<0.05) para las variables mencionadas en estudio sometidas al diseño estadístico, la mortalidad total acumulada fue de 2.37%. Usando el alimento de retiro seis días antes de la matanza se disminuyeron los costos alimenticios en $ 0.016 por kg de carne procesada.

Estudio epidemiológico de la prevalencia de brucelosis bovina en la zona seca del municipio de San Pedro de Lóvago, Chontales

Con el objetivo de determinar la prevalencia de Brucelosis bovina en condiciones tradicionales en batos de diferentes comarcas del municipio de San Pedro de Lóvago. Se realizó un estudio en 170 fincas, con un total de 13915 bovinos muestreados de los cuales se tornaron 1047 muestras correspondientes a la zona seca del municipio siendo analizadas en el laboratorio regional del MAG-FOR de Juigalpa. Se utilizó la prueba de Rosa de Bengala para la detección de anticuerpos contra Brucella sp. seguida por la prueba confirmativa de Rivanol. La prueba Rosa de Bengala es una prueba de campo de simple realización y se recomienda para estudios de prevalencia en lugares donde no se practica la vacunación contra la brucelosis como es el caso de Nicaragua. El periodo de muestreo fue de Abril hasta Octubre del 2005. La información fue proporcionada por los productores, los cuales evidencian la existencia de problemas reproductivos como los abortos o retenciones de placenta, que son los signos clínicos más importantes de la brucelosis. Los resultados demuestran una baja prevalencia global de brucelosis bovina de 0.19% de las comarcas ubicadas en la zona seca.

Respuesta al tratamiento super ovulatorio, con Folltropin-V (analogo sintetico de la hormona foliculoestimulante-FSH), en hembras bovinas donantes, de las razas Pardo Suizo y Reyna, en fincas de la Universidad Nacional Agraria, Managua

El presente trabajo investigativo fue realizado en las fincas Las Mercedes y Santa Rosa, ambas propiedad de la Universidad Nacional Agraria, ubicadas en el departamento de Managua-Nicaragua. El objetivo de la presente investigación fué conocer si hay influencia del factor raza en la respuesta súper ovulatoria una vez aplicado el tratamiento hormonal súper ovulatorio FOLLTROPIN-V (análogo sintético de la hormona foliculoestimulante-FSH) en hembras bovinas donantes de las razas Pardo Suizo y Reyna. El tamaño requerido de la muestra fue de 10 hembras donantes para cada raza en estudio; las cuales fueron previamente seleccionadas según la calidad genética de cada hembra, la edad comprendida entre 3-5 años y los resultados del examen clínico y ginecológico que se les realizó para saber si cumplían con los requisitos ó parámetros de salud estimados para esta técnica de mejoramiento productivo. Los datos se obtuvieron mediante el conteo de cuerpos lúteos y folículos a través de palpación rectal de los ovarios; el mismo día en que se realizó la recolecta de los embriones; los cuales fueron llevados al laboratorio para ser clasificados según su estado de desarrollo y calidad, posteriormente fueron transferidos ó congelados. Los resultados obtenidos a ravés del análisis de la respuesta superovulatoria, indican que no existe una diferencia significativa del factor raza, sin embargo se observó que la raza Reyna se comportó mejor que la raza Pardo Su izo al dar mayor cantidad de cuerpos lúteos (R: 14.75 - PS: 11.5) y embriones (R: 9.25 – PS: 5.6), pero sí se atribuye a la raza, la calidad y el estado de desarrollo embrionario que se obtuvieron, siendo la raza Reyna la que obtuvo mejor calidad de embriones aunque por ser la que más embriones dió, también fue la que brindó mayor cantidad de embriones degenerados y oocitos infértiles que son intransferibles.