Optimization of peptide nucleic acid fluorescence in situ hybridization (PNA-FISH) for the detection of bacteria: the effect of pH, dextran sulfate and probe concentration

Fluorescence in situ hybridization (FISH) is a molecular technique widely used for the detection and characterization of microbial populations. FISH is affected by a wide variety of abiotic and biotic variables and the way they interact with each other. This is translated into a wide variability of FISH procedures found in the literature. The aim of this work is to systematically study the effects of pH, dextran sulfate and probe concentration in the FISH protocol, using a general peptide nucleic acid (PNA) probe for the Eubacteria domain. For this, response surface methodology was used to optimize these 3 PNA-FISH parameters for Gram-negative (Escherichia coli and Pseudomonas fluorescens) and Gram-positive species (Listeria innocua, Staphylococcus epidermidis and Bacillus cereus). The obtained results show that a probe concentration higher than 300 nM is favorable for both groups. Interestingly, a clear distinction between the two groups regarding the optimal pH and dextran sulfate concentration was found: a high pH (approx. 10), combined with lower dextran sulfate concentration (approx. 2% [w/v]) for Gram-negative species and near-neutral pH (approx. 8), together with higher dextran sulfate concentrations (approx. 10% [w/v]) for Gram-positive species. This behavior seems to result from an interplay between pH and dextran sulfate and their ability to influence probe concentration and diffusion towards the rRNA target. This study shows that, for an optimum hybridization protocol, dextran sulfate and pH should be adjusted according to the target bacteria.

Oxygen therapy, continuous positive airway pressure, or noninvasive bilevel positive pressure ventilation in the treatment of acute cardiogenic pulmonary edema

OBJECTIVE: To compare the effects of 3 types of noninvasive respiratory support systems in the treatment of acute pulmonary edema: oxygen therapy (O2), continuous positive airway pressure, and bilevel positive pressure ventilation. METHODS: We studied prospectively 26 patients with acute pulmonary edema, who were randomized into 1 of 3 types of respiratory support groups. Age was 69±7 years. Ten patients were treated with oxygen, 9 with continuous positive airway pressure, and 7 with noninvasive bilevel positive pressure ventilation. All patients received medicamentous therapy according to the Advanced Cardiac Life Support protocol. Our primary aim was to assess the need for orotracheal intubation. We also assessed the following: heart and respiration rates, blood pressure, PaO2, PaCO2, and pH at begining, and at 10 and 60 minutes after starting the protocol. RESULTS: At 10 minutes, the patients in the bilevel positive pressure ventilation group had the highest PaO2 and the lowest respiration rates; the patients in the O2 group had the highest PaCO2 and the lowest pH (p<0.05). Four patients in the O2 group, 3 patients in the continuous positive pressure group, and none in the bilevel positive pressure ventilation group were intubated (p<0.05). CONCLUSION: Noninvasive bilevel positive pressure ventilation was effective in the treatment of acute cardiogenic pulmonary edema, accelerated the recovery of vital signs and blood gas data, and avoided intubation.

Determination of the importance of iron acquisition for Staphylococcus epidermidis biofilm survival in human blood

Dissertação de mestrado em Bioengenharia

Activity of carvacrol against Coagulase-negative Staphylococci biofilm related infections

Dissertação de mestrado em Bioengenharia

Characterization of microbial populations in a wastewater treatment plant focusing on Staphylococcus aureus and Pseudomonas aeruginosa

Dissertação de mestrado em Bioengenharia

Frecuencia de aislamiento de los géneros Clostridium y Staphylococcus de leche cruda bovina y leches en polvo

El uso del término Intoxicaciones Alimentarias está aplicado en forma genérica a todas aquellas enfermedades que se adquieren por consumo de alimentos o aguas contaminadas. Este término incluye las intoxicaciones causadas, entre otras, por toxinas elaboradas por proliferación bacteriana por S. aureus; C. perfringens; V. parahaemolyticus; E. coli; C. botulinum entre otras. La intoxicación alimentaria tiene una etiología predominante en su frecuencia de aislamiento. Generalmente se deben a cepas de estafilococos enterotóxicos, transmitida por consumo de leche cruda o productos lácteos. En cambio no existe mucha información relacionada con aquellas intoxicaciones alimentarias producidas por C. perfringens. De acuerdo a las observaciones preliminares es posible aislar C. perfringens de leche cruda bovina. (...) Este proyecto tiene como Objetivo General observar, desde el punto de vista epidemiológico, la frecuencia de aislamiento de los géneros Clostridium y Staphylococcus de dos productos lácteos importantes en la alimentación humana como son leche cruda de vaca y leche en polvo, expendida en forma comercial en los supermercados.

Estudio de los mecanismos inmunosupresores involucrados en la cronicidad de la infección intramamaria por staphylococcus aureus en bovinos. Immunosuppressive mechanisms involved in intrammary chronic infection by staphylococcus aureus in bovine.

La producción de productos lácteos conforma un complejo productivo de larga trayectoria en Argentina, con grandes transformaciones en el sector lechero en los últimos años. La provincia de Córdoba es una de las principales áreas de producción lechera, participando del 34.5 por ciento de la producción nacional. Esta provincia cuenta con un alto número de industrias, principalmente localizadas en la cuenca de Villa María, y concentra el 35 por ciento de los establecimientos lecheros del país. La Mastitis bovina (MB) es la principal causa de pérdidas económicas para el productor y la industria láctea a nivel mundial y regional, por lo cual se plantea la necesidad de mejorar la calidad higiénica y sanitaria de la leche a través de un mayor control de la mastitis. La MB es una inflamación de la glándula mamaria (GM) asociada a una infección bacteriana. Es la enfermedad más común y de mayor incidencia en el ganado lechero, siendo la principal causa de pérdidas económicas para la industria láctea a nivel mundial. Las medidas actuales de control de MB están basadas en prácticas de higiene apropiadas, reducción de la exposición ambiental al patógeno y terapia antibiótica del ganado, las cuales no son totalmente efectivas en el control de la infección. La defensa de la GM contra los patógenos causantes de MB depende de factores anatómicos, celulares y solubles, siendo la eficiencia de esos mecanismos la que determina la resistencia a nuevas infecciones. Los mediadores inmunes innatos y adquiridos de los tejidos y secreciones de la GM actúan en forma coordinada en la protección de la glándula contra enfermedades contagiosas. Staphylococcus aureus es el agente etiológico más importante en la mastitis. Esta bacteria evade la respuesta inmune inflamatoria mediante la inducción de mecanismos inmunosupresores, llevando a la patología a un curso crónico. S. aureus además puede colonizar el tejido epitelial y formar películas bacterianas conocidas como biofilms. Así, S. aureus adquiere más resistencia a la terapia antibiótica y a la acción del sistema inmunológico determinando la persistencia de la enfermedad. Nuestra hipótesis es que una respuesta inmune desarrollada en un microambiente particular de citoquinas, quimioquinas y células, podría contribuir a la evasión del patógeno y al desarrollo de una infección crónica. El polisacárido Quitosano (Q) presenta un efecto antibacteriano e inmunoestimulante en cultivos de células inmunes de ganado bovino, un efecto protectivo en modelos murinos de mastitis y actividad anti-biofilms de distintas cepas bacterianas. Por sus propiedades intrínsecas, este polisacárido es un candidato ideal en la regulación de las respuestas inmunológicas. El objetivo de este proyecto es caracterizar el microambiente local y sistémico, las señales inducidas por el microorganismo que promueven una falla inmunológica y caracterizar el efecto de Q sobre las respuestas generadas en la GM, mediante la realización de numerosos estudios in vivo e in vitro. Las estrategias para controlar la MB por S. aureus y disminuir el impacto de esta patología en la industria láctea, podrían orientarse a la manipulación del sistema inmunológico de la GM bovina a fin de incrementar los mecanismos de defensa naturales del huésped. Los resultados que se desprendan del proyecto permitirán adquirir conocimiento para el desarrollo de nuevas estrategias de inmunointervención a fin de controlar la MB por S. aureus y disminuir el impacto de esta patología en la industria láctea. Siendo la MB una patología relevante no solo en lo que hace a status sanitario animal, línea prioritaria definida en el Plan Estratégico Nacional de Ciencia, Tecnología e Innovación "Bicentenario 2006-2010", sino también a las implicancias económicas de esta problemática, y dado el desarrollo de la actividad lechera en la región y en el país, los resultados obtenidos podrían tener un importante impacto socioeconómico.

Untersuchungen zur Taxonomie, Epidemiologie, Genotypisierung und Immunpathologie von klinischen Staphylococcus-Isolaten

Magdeburg, Univ., Fak. für Naturwiss., Diss., 2009

Untersuchungen zu agr-Genotypen, Biofilmbildung und SCCmec-Typen von klinischen Staphylococcus epidermidis-Isolaten am Universitätsklinikum Magdeburg

Magdeburg, Univ., Med. Fak., Diss., 2013

Phäno- und genotypische Untersuchungen von Methicillin-sensiblen und -resistenten Staphylococcus aureus-Isolaten aus Panama

Magdeburg, Univ., Med. Fak., Diss., 2015

A pesquisa bacteriológica post-mortem

The A. A. made bacteriological invesigations in 145 cases of autopsy. These investigations were carried out on the blood and spleen. The cultures were positive in 67 cases and in 21 of these there was body contamination. In the other cases the isolated bacteria were the proved or probable cause of the disease. For the Staphylococcus alone (isolated in 9 cases) we cannot give a definite opinion. We think that presence of bacteria in the blood and in the spleem implies bacteriemia at the moment of death, according to the observations of Hunt and co-workers. In our cases such presence was related to that of anatomical lesions of bacterial origin. When the bacteria were present only in the spleen we think that there had been bacteriemia, not present at the moment of the death. We only observed the contamination by contiguity when the bacteria were present in the blood of the heart. The isolated bacteria were always related to the presence of anatomical lesions. In only 4 cases was this not observed. We were impressed by the great number of negative results even in bodies kept for more than 24 hours. In only 21 cases was body contamination present. In rare cases the bacteria were isolated from the lesions and not from the blood and spleen. We think that apart from the interest of invesigaion, the bacteriological examinations in body material will be able to clear up the diagnosis of many obscure and unnoticed infections. In almost all our cases we obtained that result.

Growth of positive words and lower bounds of the growth rate for Thompson's group (F)p

Vegeu el resum a l'inici del document del fitxer adjunt.

Sensibilidade dos estafilococos coagulase positivos e negativos a certos antibióticos

Estudou-se a sensibilidade de estafilococos coagulase positivos e negativos á ampicilina, à dicloxacilina, à feneticilina, hetacilina e á oxacilina. Fez-se também estudo comparativo dos diferentes graus de sensibilidade dos estafilococos coagulase positivos com os coagulase negativos. Conforme demonstram os QUADROS I e II, há diferença significativa de sensibilidade para alguns antibióticos. O QUADRO III, entretanto, não permite concluir com segurança se os estafilococos coagulase positivos são ou não mais sensíveis entre si, do que os coagulase negativos frente ás amostras testadas.