User friendly knowledge acquisition system for medical devices actuation

Dissertação para obtenção do Grau de Mestre em Engenharia Biomédica

Framework development for providing accessibility to qualitative spatial calculi

Dissertation submitted in partial fulfillment of the requirements for the Degree of Master of Science in Geospatial Technologies.

Landslide susceptibility assessment in Karanganyar regency - Indonesia - Comparison of knowledge-based and Data-driven Models

Dissertation submitted in partial fulfillment of the requirements for the Degree of Master of Science in Geospatial Technologies.

Culture boundaries in semantic web

Dissertation submitted in partial fulfillment of the requirements for the Degree of Master of Science in Geospatial Technologies.

The significance of Traveler's Route Knowledge for Choice of commuting mode of transport

Dissertation submitted in partial fulfillment of the requirements for the Degree of Master of Science in Geospatial Technologies.

TOXOPLASMOSIS-RELATED KNOWLEDGE AMONG PREGNANT AND POSTPARTUM WOMEN ATTENDED IN PUBLIC HEALTH UNITS IN NITERÓI, RIO DE JANEIRO, BRAZIL

The present study conducted a toxoplasmosis-related knowledge level survey with 400 pregnant and puerperal women attended in public health units in the municipality of Niterói, Rio de Janeiro. Only 111 (27.8%) women claimed to know about the disease. Most of them (n = 289; 72.2%) had never heard about toxoplasmosis nor knew how to prevent the infection by Toxoplasma gondii. A significant difference (p = 0.013) regarding the presence of anti-T. gondii IgG was observed between women who claimed to know about the disease and those who had never heard about it. These results highlight the importance of a systematic serological screening process for toxoplasmosis, as well as the importance of primary prevention by accurate information during prenatal care, an important Public Health action to be implemented.

User Profiling and Knowledge Extraction For Tourism

O sector do turismo é uma área francamente em crescimento em Portugal e que tem desenvolvido a sua divulgação e estratégia de marketing. Contudo, apenas se prende com indicadores de desempenho e de oferta instalada (número de quartos, hotéis, voos, estadias), deixando os indicadores estatísticos em segundo plano. De acordo com o “ Travel & tourism Competitiveness Report 2013”, do World Economic Forum, classifica Portugal em 72º lugar no que respeita à qualidade e cobertura da informação estatística, disponível para o sector do Turismo. Refira-se que Espanha ocupa o 3º lugar. Uma estratégia de mercado, sem base analítica, que sustente um quadro de orientações específico e objetivo, com relevante conhecimento dos mercados alvo, dificilmente é compreensível ou até mesmo materializável. A implementação de uma estrutura de Business Intelligence que permita a realização de um levantamento e tratamento de dados que possibilite relacionar e sustentar os resultados obtidos no sector do turismo revela-se fundamental e crucial, para que sejam criadas estratégias de mercado. Essas estratégias são realizadas a partir da informação dos turistas que nos visitam, e dos potenciais turistas, para que possam ser cativados no futuro. A análise das características e dos padrões comportamentais dos turistas permite definir perfis distintos e assim detetar as tendências de mercado, de forma a promover a oferta dos produtos e serviços mais adequados. O conhecimento obtido permite, por um lado criar e disponibilizar os produtos mais atrativos para oferecer aos turistas e por outro informá-los, de uma forma direcionada, da existência desses produtos. Assim, a associação de uma recomendação personalizada que, com base no conhecimento de perfis do turista proceda ao aconselhamento dos melhores produtos, revela-se como uma ferramenta essencial na captação e expansão de mercado.

Descoberta de Conhecimento em Dádivas de Sangue

Atualmente, são geradas enormes quantidades de dados que, na maior parte das vezes, não são devidamente analisados. Como tal, existe um fosso cada vez mais significativo entre os dados existentes e a quantidade de dados que é realmente analisada. Esta situação verifica-se com grande frequência na área da saúde. De forma a combater este problema foram criadas técnicas que permitem efetuar uma análise de grandes massas de dados, retirando padrões e conhecimento intrínseco dos dados. A área da saúde é um exemplo de uma área que cria enormes quantidades de dados diariamente, mas que na maior parte das vezes não é retirado conhecimento proveitoso dos mesmos. Este novo conhecimento poderia ajudar os profissionais de saúde a obter resposta para vários problemas. Esta dissertação pretende apresentar todo o processo de descoberta de conhecimento: análise dos dados, preparação dos dados, escolha dos atributos e dos algoritmos, aplicação de técnicas de mineração de dados (classificação, segmentação e regras de associação), escolha dos algoritmos (C5.0, CHAID, Kohonen, TwoSteps, K-means, Apriori) e avaliação dos modelos criados. O projeto baseia-se na metodologia CRISP-DM e foi desenvolvido com a ferramenta Clementine 12.0. O principal intuito deste projeto é retirar padrões e perfis de dadores que possam vir a contrair determinadas doenças (anemia, doenças renais, hepatite, entre outras) ou quais as doenças ou valores anormais de componentes sanguíneos que podem ser comuns entre os dadores.

Ontologies for the interoperability of multiagent electricity markets simulation platforms

Electricity markets worldwide are complex and dynamic environments with very particular characteristics. These are the result of electricity markets’ restructuring and evolution into regional and continental scales, along with the constant changes brought by the increasing necessity for an adequate integration of renewable energy sources. The rising complexity and unpredictability in electricity markets has increased the need for the intervenient entities in foreseeing market behaviour. Market players and regulators are very interested in predicting the market’s behaviour. Market players need to understand the market behaviour and operation in order to maximize their profits, while market regulators need to test new rules and detect market inefficiencies before they are implemented. The growth of usage of simulation tools was driven by the need for understanding those mechanisms and how the involved players' interactions affect the markets' outcomes. Multi-agent based software is particularly well fitted to analyse dynamic and adaptive systems with complex interactions among its constituents, such as electricity markets. Several modelling tools directed to the study of restructured wholesale electricity markets have emerged. Still, they have a common limitation: the lack of interoperability between the various systems to allow the exchange of information and knowledge, to test different market models and to allow market players from different systems to interact in common market environments. This dissertation proposes the development and implementation of ontologies for semantic interoperability between multi-agent simulation platforms in the scope of electricity markets. The added value provided to these platforms is given by enabling them sharing their knowledge and market models with other agent societies, which provides the means for an actual improvement in current electricity markets studies and development. The proposed ontologies are implemented in MASCEM (Multi-Agent Simulator of Competitive Electricity Markets) and tested through the interaction between MASCEM agents and agents from other multi-agent based simulators. The implementation of the proposed ontologies has also required a complete restructuring of MASCEM’s architecture and multi-agent model, which is also presented in this dissertation. The results achieved in the case studies allow identifying the advantages of the novel architecture of MASCEM, and most importantly, the added value of using the proposed ontologies. They facilitate the integration of independent multi-agent simulators, by providing a way for communications to be understood by heterogeneous agents from the various systems.

Guia de desenvolvimento de jogos para programadores independentes

Os vídeo jogos ou jogos de computador têm vindo a crescer na sua relação com o público ganhando terreno e credibilidade nos benefícios que os jogadores obtêm quando usam este tipo de software, indo esses benefícios para além do divertimento associado à palavra jogo no seu sentido etimológico. Nos últimos anos cada vez mais o mercado e algumas das mais reputadas instituições de ensino têm dedicado especial atenção a este tipo de software, englobando nesses estudos diversas áreas desde a engenharia à saúde, incluindo ainda, estudos de cariz psicológico e sociológico reveladores de que estas experiências de entretenimento, cada vez mais disponíveis a todos, têm influência na sua envolvente de integração e relação com outros fenómenos de cariz social. Apreciado o estado da arte esta tese tem como principal objetivo servir de guia de iniciação a individuais ou pequenas equipas da área de desenvolvimento de software no caminho para o desenvolvimento de jogos de vídeo independentes, apresentando uma análise cuidada capaz de apoiar as equipas desde o momento zero, estando o mesmo estruturado de forma a refletir o entendimento das bases teóricas em que o desenvolvimento deste tipo de software assenta, o estado da arte sobre plataformas, análise de mercado e indústria, metodologias de desenvolvimento e equipas, e ainda analisadas algumas das mais relevantes ferramentas de desenvolvimento e criação de conteúdos. Como prova de conceito e componente de caráter experimental, este trabalho compreende ainda o desenvolvimento de um jogo de vídeo guiado pelas orientações e lições apreendidas durante o processo de estudo de forma a ser representativo da aplicação dessa aprendizagem, e ainda capaz de detalhar passo a passo cada fase do processo, com o objetivo de apoiar a preparação de pessoas interessadas em iniciar a aventura de desenvolver os seus próprios jogos e quem sabe dar início aos seus próprios negócios e empresas. O jogo desenvolvido replica um recente êxito, o jogo 2048, que apesar da sua mecânica simples revela-se um excelente desafio do ponto de vista da sua implementação, bem como o processo criativo adjacente no transformar algo tão simples e experimentado numa experiência nova capaz de atrair antigos jogadores e interesse de novos. O desenvolvimento e publicação da aplicação experimental, e após análise dos dados recolhidos, mostram-se reveladores de que é de fato possível a programadores independentes entrar num mercado de alto potencial, e que adquiridas as bases de conhecimento expostas no documento estarão em condições mais favoráveis para ultrapassar algumas das mais comuns barreiras no atingir desse objetivo.

Understanding the relationship between central metabolism and virulence in the human pathogen Streptococcus pneumoniae

Dissertation presented to obtain the Ph.D. degree in Biochemistry

ANTIBIOTIC RESISTANCE PATTERNS OF URINARY TRACT INFECTIONS IN A NORTHEASTERN BRAZILIAN CAPITAL

Urinary tract infection is a common problem worldwide. Its clinical characteristics and susceptibility rates of bacteria are important in determining the treatment of choice and its duration. This study assessed the frequency and susceptibility to antimicrobials of uropathogens isolated from community-acquired urinary tract infections in the city of Natal, Rio Grande do Norte State capital, northeastern Brazil, from 2007 to 2010. A total of 1,082 positive samples were evaluated; E. coli was the most prevalent pathogen (60.4%). With respect to the uropathogens susceptibility rates, the resistance of enterobacteria to ciprofloxacin and sulfamethoxazole-trimethoprim was 24.4% and 50.6%, respectively. Susceptibility was over 90% for nitrofurantoin, aminoglycosides and third-generation cephalosporins. High resistance rates of uropathogens to quinolones and sulfamethoxazole-trimethoprim draws attention to the choice of these drugs on empirical treatments, especially in patients with pyelonephritis. Given the increased resistance of community bacteria to antimicrobials, local knowledge of susceptibility rates of uropathogens is essential for therapeutic decision making regarding patients with urinary tract infections.

PREVALENCE, RISK FACTORS AND SYMPTOMS ASSOCIATED TO INTESTINAL PARASITE INFECTIONS AMONG PATIENTS WITH GASTROINTESTINAL DISORDERS IN NAHAVAND, WESTERN IRAN

We studied the prevalence of intestinal parasites (IPs), their risk factors and associated symptoms among patients with gastrointestinal disorders. A total of 1,301 participants aged 22 days-90 years were enrolled in this study. We used a structured questionnaire to obtain socio-demographic and stool examination to investigate intestinal parasite infections. Data analysis was performed using SPSS16. The overall prevalence of intestinal parasites (IPs) was 32.2% (419/1,301). Three hundred and fifty nine cases/1,301 (27.6%) were infected with a single parasite and 60/1,301 cases (4.6%) presented polyparasitism. The most common IP was Blastocystis sp. 350/1,301 (26.9%), followed by Entamoeba coli 38/1,301 (2.92%), Giardia lamblia 30/1,301 (2.3%) and Cryptosporidium spp. 17/1,301 (1.3%). Regarding the socio-demographic variables, educational status (p = 0.001), contact with domestic animals and soil (p = 0.02), age above 15 years (p = 0.001) and seasons (p = 0.001) were significantly associated to intestinal parasitic infections. Concerning clinical characteristics, the presence of IPs was significantly associated to diarrhea (OR = 1.57; CI 95% = 1.24-1.98; p < 0.001) and dysentery (OR = 1.94; CI 95% = 1.03-3.66; p < 0.04). Our findings suggest that IPs are one of the main causal agents of gastrointestinal disorders. Improving the knowledge on local risk factors such as poverty, low level of education, poor sanitation, contact with soil and contact with domestic animal is warranted.

Vascular Malformation and Common Keratinocytic Nevus of the Soft Type: Phacomatosis Pigmentovascularis Revisited

Phacomatosis pigmentovascularis is a rare syndrome characterized by the coexistence of a pigmented nevus and a cutaneous vascular malformation. We report a 5-year-old boy with all the typical findings of phacomatosis pigmentovascularis type Ia. Although its existence according to the traditional classification has been questioned, this case represents a very rare association of a capillary vascular malformation and a common keratinocytic nevus of the soft type.

Thoracic Manifestations of Connective Tissue Diseases

Connective tissue diseases (CTDs) comprise several immunologic systemic disorders, each of which associated with a particular set of clinical manifestations and autoimmune profile. CTDs may cause numerous thoracic abnormalities, which vary in frequency and pattern according to the underlying disorder. The CTDs that most commonly involve the respiratory system are progressive systemic sclerosis, systemic lupus erythematosus, rheumatoid arthritis, Sjögren syndrome, polymyositis, dermatomyositis, and mixed connective tissue disease. Pulmonary abnormalities in this group of patients may result from CTD-related lung disease or treatment complications, namely drug toxicity and opportunistic infections. The most important thoracic manifestations of CTDs are interstitial lung disease and pulmonary arterial hypertension, with nonspecific interstitial pneumonia being the most common pattern of interstitial lung disease. High-resolution computed tomography is a valuable tool in the initial evaluation and follow-up of patients with CTDs. As such, general knowledge of the most common high-resolution computed tomographic features of CTD-related lung disease allows the radiologist to contribute to better patient management.