Rhapsody in fractional

This paper studies several topics related with the concept of “fractional” that are not directly related with Fractional Calculus, but can help the reader in pursuit new research directions. We introduce the concept of non-integer positional number systems, fractional sums, fractional powers of a square matrix, tolerant computing and FracSets, negative probabilities, fractional delay discrete-time linear systems, and fractional Fourier transform.

Schistosoma mansoni: the effect of dexamethasone on the cercaria-schistosomulum transformation, in vivo

Treatment with dexamethasone (DMS) in the early phases of the experimental Schistosoma mansoni infection causes an indirect effect on the cercaria-schistosomulum transformation process. This is observed when naive albino mice are treated with that drug (50 mg/Kg, subcutaneously) and infected intraperitonealy 01 hour later with about 500 S. mansoni cercariae (LE strain). An inhibition in the host cell adhesion to the larvae, with a simultaneous delay in the cercaria-schistosomulum transformation, is observed. This effect is probably due to a blockade of the neutrophil migration to the peritoneal cavity of mice, by an impairment of the release of chemotactic substances. Such delay probably favors the killing of S. mansoni larvae, still in the transformation process, by the vertebrate host defenses, as the complement system.

Lean applied to logistics: a case study

This project aims to study the implementation of Lean principles and tools in several levels of logistics, from internal logistics to interface with distribution center and suppliers, in an industrial plant. The main focus of all efforts is to create the conditions to approach the continuous flow scenario in the manufacturing processes. The subject of improvement actions is a company whose core activity is car seat production, more specifically the car seat cover production and assembly. This focuses the assembly process, which requires the usage of a considerable variety of components and therefore is an important obstacle to the implementation of continuous flow. The most salient issues are related with inefficient interaction between sections and late supply of components in assembly lines, forcing the operator to abandon his work station and leading to production interruption. As an operational methodology, actions from Lean philosophy and optimization were implemented according to project management principles.

Production optimization of rotavirus-like particles: a system biology approach

Dissertation presented to obtain a Ph.D. degree in Engineering and Technology Sciences, Systems Biology at the Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Universidade Nova de Lisboa

The hamster cheek pouch: an immunologically privileged site suitable to the study of granulomatous infections

The hamster check pouch is an invagination of oral mucosa, characterized histologically as skin-like. In this paper we describe anatomical, histological and embriological features of the pouch and coment on the pouch as an immunologically privileged site since it lacks lymphatic drainage and has few Langerhans cells. We present the review from literature and our observations after inoculation in the pouch of mycobacteriae (BCG, Mycobacterium tuberculosis and Mycobacterium leprae) and a fungus (Paracoccidioides brasiliensis). Lesions in the pouch were granulomatous but smaller and long lasting; even granulomatous, the reaction was inefficient to control the proliferation of agents compared with inoculation in other sites, except for BCG. Appearance of immunity was also delayed or absent and, when it was detected, a sharp decrease in number of agents in pouch lesions was observed. These observations make the pouch an interesting site for the study of the role of immune system in infeccious diseases and in granuloma formation.

RealCrono –sistema de difusão de resultados em tempo real na web

A velocidade de difusão de conteúdos numa plataforma web, assume uma elevada relevância em serviços onde a informação se pretende atualizada e em tempo real. Este projeto de Mestrado, apresenta uma abordagem de um sistema distribuído de recolher e difundir resultados em tempo real entre várias plataformas, nomeadamente sistemas móveis. Neste contexto, tempo real entende-se como uma diferença de tempo nula entre a recolha e difusão, ignorando fatores que não podem ser controlados pelo sistema, como latência de comunicação e tempo de processamento. Este projeto tem como base uma arquitetura existente de processamento e publicação de resultados desportivos, que apresentava alguns problemas relacionados com escalabilidade, segurança, tempos de entrega de resultados longos e sem integração com outras plataformas. Ao longo deste trabalho procurou-se investigar fatores que condicionassem a escalabilidade de uma aplicação web dando ênfase à implementação de uma solução baseada em replicação e escalabilidade horizontal. Procurou-se também apresentar uma solução de interoperabilidade entre sistemas e plataformas heterogêneas, mantendo sempre elevados níveis de performance e promovendo a introdução de plataformas móveis no sistema. De várias abordagens existentes para comunicação em tempo real sobre uma plataforma web, adotou-se um implementação baseada em WebSocket que elimina o tempo desperdiçado entre a recolha de informação e sua difusão. Neste projeto é descrito o processo de implementação da API de recolha de dados (Collector), da biblioteca de comunicação com o Collector, da aplicação web (Publisher) e sua API, da biblioteca de comunicação com o Publisher e por fim a implementação da aplicação móvel multi-plataforma. Com os componentes criados, avaliaram-se os resultados obtidos com a nova arquitetura de forma a aferir a escalabilidade e performance da solução criada e sua adaptação ao sistema existente.

A Leishmaniose visceral em Portugal Continental : 1999-2009

RESUMO - As alterações climáticas alteraram a incidência e distribuição mundial de zoonoses, ao modificarem o perfil epidemiológico dos seus vectores. A leishmaniose visceral é reemergente na bacia mediterrânica, sendo o seu impacto real subestimado. Em Portugal, é endémica em três regiões, de declaração obrigatória desde 1948 e o reservatório é o canídeo. O aumento da incidência da doença no cão e a escassez de informação epidemiológica tornou pertinente investigar a realidade nacional. A partir das bases de dados das notificações e dos grupos de diagnósticos homogéneos hospitalares, foram identificados todos os casos e, consultados todos os processos clínicos dos doentes com episódios de internamento nos hospitais do continente entre 1999-2009. Ocorreram 730 internamentos para 375 indivíduos na maioria: homens, eurocaucasianos, com em média, 27 anos e, residência em Lisboa e Vale do Tejo. A sintomatologia e comorbilidades dos doentes vão de encontro ao descrito internacionalmente. A doença foi subnotificada, com uma demora média de 19 dias. A letalidade foi de 5%. A taxa de incidência média do continente foi de 0,294/100000 habitantes, sem padrão de sazonalidade. O corredor endémico de Bortman construído apresentou picos com amplitudes de 2-3 anos. O mapeamento dos doentes evidenciou casos em regiões não endémicas acompanhando a distribuição da leishmaniose canina. Seria pertinente que futuras investigações construíssem uma modelação matemática que confirmasse a tendência do corredor endémico (pico em 2011?) para accionar um sistema de alerta nos Serviços de Saúde. Seria também útil a avaliação das condições geoclimáticas das localidades com casos para evidenciar possíveis similitudes no território. -------ABSTRACT - Climate changed the incidence and worldwide distribution of zoonosis while the epidemiological profile of their vectors was changing. Visceral leishmaniasis is reemerging in the Mediterranean basin and its real impact underestimated. In Portugal, it’s endemic in three regions; the notification occurs since 1948 and dog is the reservoir. The increased incidence of the canines’ disease and the scarcity of epidemiological information relevant investigate the national reality. From Notifications and Homogeneous’ Diagnostics Groups system databases, all cases were identified and also analyze all clinical processes of inpatients’ hospitals in 1999- 2009 in Portugal. 730 admissions occurred for 375 patients. In most they were men, Caucasians, with an average of 27 years and residency in Lisboa e Vale do Tejo. The symptoms and comorbilidades patient go against described internationally. The disease was under notified, with an average delay of 19 days. Lethality was 5%. The incidence rate was 0,294/100000 inhabitants, without seasonality. The endemic’s Bortman corridor presents peak amplitudes of 2-3 years. Mapping patient’s residency shows that cases’ distribution is similar to endemic canine leishmaniasis. It would be appropriate a research to build a mathematical modeling up to confirm the trend of corridor endemic (peak in 2011?), to trigger an alert system for health services. It would also be useful to evaluate the geo-climatics conditions of localities with cases to highlight possible similarities in the territory.

CHRONIC CHAGASIC CARDIOPATHY: THE PRODUCT OF A TURBULENT HOST-PARASITE RELATIONSHIP

The pathogenesis of chronic chagasic cardiopathy is still a debated matter. In this review, the main theories raised about it since the first description of the disease in 1909 by Carlos Chagas, are considered. The scarcity of T.cruzi parasites into the myocardium and the apparent lack of correlation between their presence and the occurrence of myocardial inflammatory infiltrate, have originated many theories indicating that chronic Chagas' cardiopathy is an autoimmune disease. Recently however, papers using immunohistochemical technique or PCR have demonstrated a strong association between moderate or severe myocarditis and presence of T.cruzi Ags, indicating a direct participation of the parasite in the genesis of chronic chagasic myocarditis. Different patterns of cytokine production seem to have important role in the outcome of the disease. Participation of the microcirculatory alterations and fibrosis as well as the relationship with the parasite are also emphasized. Finally, the author suggests that the indeterminate form of the disease occurs when the host immunological response against the parasite is more efficient while the chronic cardiopathy occurs in patients with hyperergic and inefficient immune response

The role of molecular imaging in modern drug development

Drug development represents a highly complex, inefficient and costly process. Over the past decade, the widespread use of nuclear imaging, owing to its functional and molecular nature, has proven to be a determinant in improving the efficiency in selecting the candidate drugs that should either be abandoned or moved forward into clinical trials. This helps not only with the development of safer and effective drugs but also with the shortening of time-to-market. The modern concept and future trends concerning molecular imaging will assumedly be hybrid or multimodality imaging, including combinations between high sensitivity and functional (molecular) modalities with high spatial resolution and morphological techniques.

Eficiência Energética na Iluminação Pública

A utilização pouco eficiente da energia representa um elevado encargo para qualquer país, seja do ponto de vista económico, social ou ambiental. Em Portugal a iluminação pública tem um importante peso nas despesas correntes dos municípios. Deste modo, torna-se imperativo agir de modo a aumentar a sustentabilidade energética e diminuir os gastos com a iluminação pública. Os municípios precisam de encontrar soluções que permitam reduzir os consumos, mantendo níveis de segurança e conforto necessários às populações. Neste sentido, este trabalho propõe-se estudar esta problemática, apresentando soluções, de modo a obter-se uma maior eficiência energética desta para as instalações e, consequentemente, conduzir a uma diminuição das emissões de CO2 durante o período de utilização das mesmas.

FEVER OF UNDETERMINED ORIGIN IN PATIENTS WITH THE ACQUIRED IMMUNODEFICIENCY SYNDROME IN BRAZIL: REPORT ON 55 CASES

The medical records of patients with AIDS admitted to a general hospital in Brazil from 1989 to 1997 were reviewed retrospectively with the aim at defining the frequency and etiology of fever of undetermined origin (FUO) in HIV-infected patients of a tropical country and to evaluate the usefulness of the main diagnostic procedures. 188 (58.4%) out of 322 patients reported fever at admission to hospital and 55 (17.1%) had FUO. Those with FUO had a mean CD4+ cell count of 98/ml. A cause of fever was identified for 45 patients (81.8%). Tuberculosis (32.7%), Pneumocystis carinii pneumonia (10.9%), and Mycobacterium avium complex (9.1%) were the most frequent diagnoses. Other infectious diseases are also of note, such as cryptococcal meningitis (5.5%), sinusitis (3.6%), Salmonella-S. mansoni association (3.6%), disseminated histoplasmosis (3.6%), neurosyphilis (1.8%), and isosporiasis (1.8%). Four patients had non-Hodgkin's lymphoma (7.3%). We conclude that an initial aggressive diagnostic approach should be always considered because biopsies (lymph node, liver and bone marrow) produced the highest yield in the diagnosis of FUO and the majority of the diagnosed diseases are treatable. The association of diseases is common and have contributed to delay the final diagnosis of FUO in most cases. In our study area the routine request of hemocultures for Salmonella infection and the investigation of cryptococcal antigen in the serum should be considered.

BAMoL Formalização da linguagem e validação sintática de modelos

A BAMoL (Business Application Modeling Language) é uma linguagem de domínio específico utilizada para o desenvolvimento de soluções para a plataforma myMIS, no âmbito dos sistemas de informação para a gestão. Esta linguagem carecia de dois aspetos, nomeadamente a sua formalização e a existência de mecanismos de validação sintática das soluções desenvolvidas. Estes problemas identificados tornam impossível a validação sintática das soluções desenvolvidas utilizando esta linguagem, aumentando assim a probabilidade de existência de erros, podendo fazer com que as mesmas sejam mais ineficientes e podendo até trazer um aumento de custos de manutenção da plataforma. De forma a resolver os problemas enunciados, foi realizada, para o primeiro, uma descrição textual de todos os constituintes da linguagem e criada uma gramática representativa da mesma, em que constam todos os seus elementos e regras. No caso do segundo problema, a sua resolução passou pela criação de uma ferramenta que utiliza a gramática criada e que permite validar sintaticamente e encontrar as falhas das soluções desenvolvidas. Desta forma, passa a ser possível detetar os erros existentes nas soluções, permitindo assim à equipa de desenvolvimento ter maior controlo sobre as mesmas, podendo torná-las mais corretas, na perspetiva das regras da linguagem.

Biomphalaria tenagophila (Orbigny, 1835) (Mollusca): adaptation to desiccation and susceptibility to infection with Schistosoma mansoni Sambon, 1907

Experiments were carried out to test the susceptibility of Biomphalaria tenagophila to the infection with strain SJ of Schistosoma mansoni in the F1, F2 and non-selected parental generation. The potential adaptation of B. tenagophila to desiccation, in healthy mollusks and those exposed to the larvae of S. mansoni of the F1, F2 and non-selected parental generations was also studied. The presence of mucus and soil, at the shell opening, protected the snails against desiccation, favoring survival. The healthy mollusks performed more attempts against desiccation than those exposed to the larvae of the parasite. The mortality rate, during desiccation, was higher among mollusks that remained buried and with the shell opening unobstructed. During the desiccation period the stage of development of the parasite was influenced by the weight loss and the survival of the snails. The longer the period of desiccation, the greater was the weight loss observed, abbreviating survival. The non-selected parental generation was more sensitive to desiccation than the F1 and F2 generations, both in healthy mollusks and in those exposed to S. mansoni larvae. Healthy mollusks were more resistant to desiccation than those exposed to the larvae of the S. mansoni. Desiccation did not interrupt the development of S. mansoni larvae in mollusks, causing a delay in the cercariae elimination. The susceptibility of B. tenagophila to the SJ strain of S. mansoni, in mollusks maintained in water during the larvae incubation period, was similar in all three generations.

Selection Constructive based Hyper-heuristic for Dynamic Scheduling

A função de escalonamento desempenha um papel importante nos sistemas de produção. Os sistemas de escalonamento têm como objetivo gerar um plano de escalonamento que permite gerir de uma forma eficiente um conjunto de tarefas que necessitam de ser executadas no mesmo período de tempo pelos mesmos recursos. Contudo, adaptação dinâmica e otimização é uma necessidade crítica em sistemas de escalonamento, uma vez que as organizações de produção têm uma natureza dinâmica. Nestas organizações ocorrem distúrbios nas condições requisitos de trabalho regularmente e de forma inesperada. Alguns exemplos destes distúrbios são: surgimento de uma nova tarefa, cancelamento de uma tarefa, alteração na data de entrega, entre outros. Estes eventos dinâmicos devem ser tidos em conta, uma vez que podem influenciar o plano criado, tornando-o ineficiente. Portanto, ambientes de produção necessitam de resposta imediata para estes eventos, usando um método de reescalonamento em tempo real, para minimizar o efeito destes eventos dinâmicos no sistema de produção. Deste modo, os sistemas de escalonamento devem de uma forma automática e inteligente, ser capazes de adaptar o plano de escalonamento que a organização está a seguir aos eventos inesperados em tempo real. Esta dissertação aborda o problema de incorporar novas tarefas num plano de escalonamento já existente. Deste modo, é proposta uma abordagem de otimização – Hiper-heurística baseada em Seleção Construtiva para Escalonamento Dinâmico- para lidar com eventos dinâmicos que podem ocorrer num ambiente de produção, a fim de manter o plano de escalonamento, o mais robusto possível. Esta abordagem é inspirada em computação evolutiva e hiper-heurísticas. Do estudo computacional realizado foi possível concluir que o uso da hiper-heurística de seleção construtiva pode ser vantajoso na resolução de problemas de otimização de adaptação dinâmica.

Dissecting neuronal development deficits by inflammation: from morphology to cytoskeleton dynamics

Dissertação para obtenção do Grau de Mestre em Genética Molecular e Biomedicina