950 resultados para Copy number variations and polymorphisms


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A tuberculose resistente a múltiplos fármacos (TB MDR) é definida como uma forma de tuberculose (TB) causada por Mycobacterium tuberculosis resistente a pelo menos isoniazida e rifampicina. A TB MDR é um problema mundial crescente resultante da não adesão dos pacientes ao tratamento e pelo gerenciamento ineficaz da doença pelos sistemas de saúde. Este estudo foi realizado com o objetivo de identificar os fatores de risco e os padrões de transmissão da TB MDR no Estado do Rio Grande do Sul, comparando os resultados obtidos com aqueles casos de TB suscetíveis aos fármacos. Durante os anos de 1999 e 2000 foram identificados 60 isolados MDR no Laboratório Central do RS (LACEN) e 202 isolados suscetíveis aos fármacos anti-TB. Estes isolados foram analisados utilizando a técnica de Polimorfismo do Tamanho dos Fragmentos de Restrição (RFLP) baseado no IS6110. Os dados clínicos e demográficos dos pacientes portadores destas linhagens também foram analisados. Nos isolados que apresentaram seis ou menos cópias de IS6110 foi realizada uma segunda técnica de genotipagem, o Spoligotyping. Os pacientes portadores de linhagens de M. tuberculosis com padrões idênticos foram considerados clusters. Foi observado que entre os 262 isolados, 94 (36%) pertenciam a 20 distintos clusters, e após a análise por Spoligotyping, 89 destes isolados (34%) permaneceram em cluster. Os isolados MDR não diferiram estatisticamente dos isolados suscetíveis na proporção de formação de cluster. Foi observada associação significante entre a ocorrência de TB MDR e tratamento prévio (p < 0,001) e falência no tratamento (p < 0,001). No entanto, os pacientes HIV positivos foram associados com TB suscetível (p = 0,024). Também foi identificado que pacientes não casados desenvolveram mais TB devida à transmissão recente (p < 0,005). A introdução da terapia supervisionada de curta duração (DOTS) no RS será importante, pois auxiliará na diminuição das taxas de falência e abandono de tratamento, evitando o desenvolvimento de novas linhagens MDR.

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Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

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Yeasts are attractive hosts for heterologous protein production as they follow the general eukaryotic post-translational modification pattern. The well-known Saccharomyces cerevisiae has been used to produce a large variety of foreign proteins. The proper function of muscle tropomyosin depends on a specific modification at its N-terminus. Although tropomyosin has been produced in different expression systems, only the recombinant protein produced in the yeast Pichia pastoris has native-like functional properties. In this paper we describe the production of functional skeletal muscle tropomyosin in the yeast S. cerevisiae. The recombinant protein was produced in high amounts and production was strongly affected by genetic and environmental factors, including plasmid copy number, promoter strength, and growth media composition. (C) 2003 Elsevier B.V. (USA). All rights reserved.

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Human epidermal growth factor receptor 2 (HER2) has been evaluated in breast cancer patients to identify those most likely to benefit from herceptin-targeted therapy. HER2 amplification, detected in 20-30% of invasive breast tumors, is associated with reduced survival and metastasis. The most frequently used technique for evaluating HER2 protein status as a routine procedure is immunohistochemistry (IHC). HER2 copy number alterations have also been evaluated by fluorescence in situ hybridization (FISH) in moderate immunoexpression (IHC 2+) cases. An alternative procedure to evaluate gene amplification is chromogenic in situ hybridization (CISH), which has some advantages over FISH, including the correlation between HER2 status and morphological features. Other methodologies have also been used, such as silver-enhanced in situ hybridization (SISH) and quantitative real-time RT-PCR, to determine the number of HER2 gene copies and expression, respectively. Here we will present a short and comprehensive review of the current advances concerning HER2 evaluation in human breast cancer.

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Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

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Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

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Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

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Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

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Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

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This study aimed to evaluate the influence of alterations in pluviosity and ecological variables on microphytoplankton (> 20 mu m) structure (composition, richness, diversity, and abundance) and its biomass (chlorophyll-a), comparing different regions in a stretch of the low Igua double dagger u River and in some tributaries. Phytoplankton was sampled in 10 stations (5 in Igua double dagger u River and 5 in tributaries) during a dry period (April/2004) and an atypical rainy period (June/2004). The conductivity showed significant difference among the sampling points. Temperature, dissolved oxygen, pH, silicate, and nitrate showed significant differences between the dry and wet periods. Phytoplankton was composed of 149 taxa, and the most representative class was Chlorophyceae (71 taxa), followed by Bacillariophyceae (35 taxa), and Cyanophyceae (25 taxa). During the rainy period, stations of Igua double dagger u River showed higher taxa number and total density compared to the tributaries, but the values were similar in the dry period. Tributaries presented higher diversity and equitability in both periods. Except by two stations in Igua double dagger u River, the higher taxa number, densities and biomass occurred in the dry period, associated to low levels of suspended matter. The canonical correspondence analysis indicated the dominance of Bacillariophyceae and Chrysophyceae in the rainy period related to nitrate and suspended matter. Two other groups were observed in the dry period: one formed by Cyanophyceae, Dinophyceae, and Rhodophyceae, related to temperature and nitrite and other by Euglenophyceae and Chlorophyceae related to total phosphorus and silicate. The groups suggest adequate conditions of the physical, chemical and climatic factors to the establishment of the algae classes. Phytoplanktonic assemblages responded quickly to the environmental regional variations under strong influence of pluviosity, while in the dry period, homogeneity among stations and environmental variables was observed. The importance of climatic events is relevant in ecological studies in a temporal scale.

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Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

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Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

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Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

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Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

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Programas que visam o controle biológico precisam ser embasados principalmente em liberações de predadores e parasitóides para tentar minimizar efeitos adversos para o ambiente. Os coleópteros da família Histeridae como predam larvas de dípteros sinantrópicos podem auxiliar no controle das moscas que se desenvolvem em fezes acumuladas. Este trabalho teve como objetivo realizar um levantamento das espécies de histerídeos em granja avícola no município de São João da Boa Vista, estado de São Paulo, verificar seu padrão sazonal de ocorrência e investigar possíveis associações entre as mesmas. As coletas foram realizadas de janeiro de 2001 a dezembro de 2002, utilizando-se dois métodos de coleta (armadilhas de solo e o funil de Berlese - Tullgren). As espécies de histerídeos encontradas foram: Euspilostus modestus, Euspilostus (Hesperosaprinus) spp., Carcinops troglodytes e Hololepta quadridentata. O número de cada espécie diferiu entre os métodos utilizados. Na armadilha de solo, E. modestus correspondeu a 87,01% do número total de indivíduos capturados, enquanto que no funil, C. troglodytes obteve maior destaque (84,38%). E. modestus e H. quadridentata apresentaram padrões de variação mensal positivamente correlacionada com a precipitação pluviométrica (P<0,05 e P<0,01, respectivamente).